Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Chamberland (2012)
Title Transmission of HIV-1 drug resistance in Benin could jeopardise future treatment options.
Citation Sex Transm Infect
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 127
NumPts 127
Subtype CRF02_AG, G, A, CRF18_cpx, H, CRF45_cpx, CRF09_cpx

 
  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 127 Clinical PR Isolates


SubjectIsolatePIsWksPIMajorPIMinorCommonUnusual
C401S C401S None    L10I, T12K, I13V, K14R, G17E, K20I, M36I, R41K, L63I, C67Y, H69K, L89M  
C404S C404S None    L10I, I13V, I15IV, M36I, R41K, Q61H, L63S, H69Q, I72IT, L89M  
C405S C405S None    I13V, G17E, K20I, E35G, M36I, N37S, R41K, I62V, H69K, I72M, V77I, L89M  
C406S C406S None    I13V, G16E, K20I, E35K, M36I, R41K, H69K, L89M  
C407S C407S None    I13V, K20I, E35D, M36I, R41K, D60E, L63P, C67S, H69K, V82I, L89I  
C409S C409S None    I13V, L19P, K20I, M36I, R41K, L63P, H69K, L89M  
C411S C411S None    L10I, I13V, G16E, K20I, E35D, M36I, R57K, Q61D, I64IL, H69N, K70KQ, I72IV, L89M  
C412S C412S None   L33F V11I, I13V, K14R, K20I, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
C413S C413S None    I13V, K14R, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, H69K, I72R, L89M K70M 
C415S C415S None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, H69K, K70R, L89M  
C417S C417S None    I13V, K14R, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, H69K, K70KR, I72T, L89M Q18T 
C418S C418S None    V11VI, I13V, K20I, M36I, R41RK, C67E, H69KR, K70R, I72IV, V82I, L89M  
C421S C421S None    I13V, K14R, G17E, K20I, M36I, N37ND, P39S, L63P, I64M, H69K, L89M  
C422S C422S None    L10V, T12A, I13V, K14R, I15V, G16E, K20I, E35N, M36I, R41K, I62IV, L63S, H69K, I72T, L89M  
C423S C423S None    L10IV, I13V, K14R, L19P, K20I, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
C424S C424S None    I13V, I15V, K20I, E35G, M36I, N37S, R41K, L63P, H69K, V77I, P79S, L89M  
C425S C425S None    V11I, I13V, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, H69K, K70R, L89M  
C427S C427S None    L10I, I13V, G16E, K20R, M36I, R41K, D60E, I62V, L63V, I64V, E65D, C67G, H69K  
C428S C428S None    I13V, G16E, K20I, E35K, M36I, R41K, H69K, L89M  
C429S C429S None    I13V, K14R, G16E, K20I, M36I, R41K, L63S, H69K, K70R, L89M  
C430S C430S None    T12TI, I13V, G16E, K20I, M36I, P39S, R41K, I62K, H69K, L89M  
C431S C431S None    I13V, K14R, L19P, K20IM, E35D, M36I, R41K, H69K, K70R, L89I  
C432S C432S None    I13V, K14R, I15V, K20I, E35D, M36I, N37E, R41K, I64M, H69K, K70R, L89M  
C434S C434S None    I13A, K14R, K20I, M36I, R41K, L63H, H69K, K70R, L89I, I93IM  
C435S C435S None    L10I, I13V, K14R, E35D, M36I, R41K, H69K, V77I, L89M  
C436S C436S None    I13A, K20I, M36I, N37E, R41K, L63P, H69K, L89M  
C437S C437S None    I13V, K14R, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, I64L, H69K, K70R, L89M  
C438S C438S None    Q7QH, I13V, G16GR, K20I, M36I, N37E, R41K, H69K, K70R, I72T, L89M  
C440S C440S None    T12S, I13V, K14R, I15V, K20I, E35D, M36I, R41K, I64M, H69K, L89M  
C441S C441S None    I13V, K14R, K20I, M36I, P39L, R41K, I62V, L63H, H69K, L89M  
C442S C442S None   L89V I13A, K14R, K20I, M36I, R41K, Q61H, H69K, K70R  
C443S C443S None    Q7D, I13A, K20I, M36I, N37D, H69K, K70R, I72M, L89I  
C444S C444S None    I13V, K20I, E35Q, M36I, R41K, R57K, C67E, H69R, V82I, L89M  
C446S C446S None    I13V, I15V, G17E, K20I, E35K, M36V, N37D, R41K, I64M, H69K, V77I, L89M  
C447S C447S None    I13V, K20I, M36I, N37T, P39V, R41K, L63P, H69K, V82I, L89M  
C450S C450S None    I13V, K20I, E35G, M36I, N37S, R41K, R57K, I62V, G68E, H69R, V77I, L89M  
C453S C453S None    I13V, K20I, E35D, M36I, N37ND, R41RK, L63P, I64L, C67S, H69K, V82I, L89M  
C454S C454S None    I13V, I15L, L19I, K20I, E35D, M36I, R41K, L63A, I64M, H69K, L89M  
C455S C455S None    I13V, K14R, G16E, K20R, E35D, M36I, R41K, H69K, I72V, L89M  
C456S C456S None    I13V, I15V, L19I, K20I, E35D, M36I, R41K, L63P, H69K, K70R, I72M, L89M  
C458S C458S None    I13A, G16E, K20I, A22V, M36I, R41K, Q61H, L63N, I64IM, E65D, H69K, K70R, L89I  
C459S C459S None    T12A, I13V, K14R, K20I, E35Q, M36I, R41K, R57K, L63P, C67E, H69K, V82I, L89M  
C460S C460S None    L10I, I13V, K14R, K20I, E35G, M36I, N37S, R41K, L63P, C67D, H69K, P79S, L89M G16GW 
C461S C461S None    I13V, K14R, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63P, I64M, H69K, L89M  
C464S C464S None    I13V, K14R, G16E, K20I, M36I, N37ST, R41K, L63PS, H69K, K70R, L89M  
C465S C465S None    I13V, I15V, L19I, K20I, M36I, N37D, R41K, L63Q, C67S, H69R, I72L, V82I, L89M  
C467S C467S None    I13V, K20I, E35Q, M36I, N37D, R41K, R57K, L63S, I64M, C67E, H69K, V82I, L89M  
C469S C469S None    I13V, I15V, L19LI, K20I, E35D, M36I, L63P, H69K, L89M  
C470S C470S None    I13V, K20I, E35D, M36I, R41K, L63P, H69K, L89M  
C473S C473S None    I13V, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, H69K, K70KR, L89M  
C475S C475S None    I13V, K14R, K20I, E35D, M36I, R41K, L63S, E65D, H69K, V82I, L89M  
C476S C476S None    T12A, I13V, K14R, I15V, K20I, E35D, M36I, R41K, L63P, I64IM, E65EQ, H69K, K70KR, L89M  
C480S C480S None    L10IV, I13V, G16GE, K20I, E35K, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, K70R, L89M  
C481S C481S None    T12A, I13V, K20I, E35D, M36I, N37S, L38I, R41K, L63P, H69K, L89M  
C482S C482S None    I13V, K14R, I15V, K20I, E35D, M36I, R41K, L63P, G68E, H69K, L89M  
C483S C483S None    T12R, I13V, L19I, K20I, E35D, M36I, R41K, H69K, L89I  
C486S C486S None    I13V, L19P, K20I, M36I, R41K, H69R, L89M  
C495S C495S None    L10V, I13A, K14R, G16E, K20I, M36I, N37D, R41K, L63ST, H69K, K70R, L89M  
C497S C497S None    L10I, T12A, I13V, K14R, I15V, K20I, E35D, M36I, N37S, R41K, R57K, H69Q, K70R, P79A, L89M  
C498S C498S None    I13V, G16E, K20I, E35K, M36I, P39S, R41K, L63P, H69K, V77I, L89M  
C503S C503S None    I13V, K14R, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, I64M, H69K, L89M  
C505S C505S None    I13A, K14R, K20I, M36I, R41K, I62V, L63P, H69K, L89M  
C506S C506S None    L10V, I13V, K14R, G16E, K20I, M36I, R41K, H69K, K70R, L89M  
C507S C507S None    I13V, K14R, I15V, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
C509S C509S None    I13V, L19PS, K20I, E35K, M36I, N37D, R41K, I62IV, I64M, H69K, L89M  
C510S C510S None    T12M, I13V, L19S, K20I, E35D, M36I, L63P, H69K, L89M  
C511S C511S None    I13V, K14R, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, K43R, H69K, L89M  
C512S C512S None   G73D, L89V T12A, I13V, I15V, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, K45R, Q61N, L63T, I64L, E65D, H69K, I72T  
C513S C513S None    I13V, K14R, K20I, M36I, N37D, L63P, I64L, H69K, L89M  
C514S C514S None    I13V, K14R, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63LP, H69K, L89M  
C515S C515S None    I13V, K14R, G17E, K20I, M36I, R41K, L63AP, H69K, K70R, L89M  
C517S C517S None    I13V, K14KR, K20R, M36I, N37D, R41K, H69K, K70R, L89M  
D301T D301T None    T12TI, I13V, K14KR, L19P, K20I, M36I, R41K, L63P, I64IM, H69K, K70R, L89M  
D303T D303T None    I13V, K14R, K20I, E35Q, M36I, N37D, R41K, R57K, C67E, H69K, V82I, L89M  
D304T D304T None    T12K, I13V, K20I, E35D, M36I, R41K, C67S, H69R, V82I, L89M  
D305T D305T None    I13V, G16E, G17E, K20I, E35D, M36I, L63H, H69K, L89M  
D307T D307T None   L89MV I13V, G16E, K20I, M36L, I62IV, L63P, H69K  
D309T D309T None    I13V, K14R, K20I, M36I, R41K, H69K, I72M, L89M  
D311T D311T None    L10V, I13V, L19P, K20I, M36I, N37D, H69K, L89M  
D312T D312T None    I13V, K14R, K20I, L33V, E35D, M36I, R41K, L63P, H69K, V77I  
D313T D313T None    I13V, K20IR, M36I, N37ND, H69K, L89M  
D315T D315T None    I13V, K14R, I15V, K20V, E35N, M36I, P39S, R41K, H69K, V77I, L89M Q2QL 
D316T D316T None    I13V, K14R, K20I, M36I, R41K, L63S, I64L, H69K, L89M A28V 
D317T D317T None    I13V, K14R, K20I, E35Q, M36I, N37D, R41K, L63LP, C67E, H69K, V82I, L89M  
D318T D318T None    P9X, I13A, G16E, K20I, M36I, I62V, L63S, I64M, H69K, L89I  
D319T D319T None    I13V, K14R, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
D321T D321T None    I13V, K14R, I15V, G16E, G17E, K20I, M36I, R41K, L63S, I64L, H69K, L89M  
D324T D324T None    L10I, I13V, K14R, K20I, R41K, L63P, C67S, H69K, K70R, I72IM, L89M  
D325T D325T None    L10V, I13V, I15V, L19P, K20I, M36I, R41K, H69K, L89M  
D326T D326T None    I13V, K14R, K20I, E35D, M36I, R41K, K43R, L63S, I64L, H69K, L89M Q58QP 
D327T D327T None    I13V, G17E, K20I, E35D, M36I, N37ND, R41K, H69K, K70R, T74S, L89M  
D329T D329T None    T12A, I13A, K14R, K20I, A22V, E35D, M36I, R41K, L63P, H69K, K70R, L89I, T91I  
D330T D330T None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35K, M36I, N37D, R41K, R57RK, H69K, K70R, L89M  
D331T D331T None    I13V, G16E, L19I, K20I, E35N, M36I, R41K, K43R, L63S, H69K, L89M  
D332T D332T None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, H69K, K70R, L89M  
D334T D334T None    V11I, T12TA, I13V, K14R, K20I, E35D, M36I, R41K, H69K, V82I, L89M  
D335T D335T None    I13V, K20I, M36I, R41K, L63P, C67S, H69K, V82I, L89M  
D337T D337T None    I13V, G17E, K20I, E35Q, M36I, R41K, R57K, C67E, H69R, V82I, L89M  
D338T D338T None    I13V, K14R, K20X, M36I, R41K, K43KR, L63H, H69K, L89I  
D339T D339T None    I13V, K14R, I15V, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, H69K, K70R, L89M  

Database

Resources

Team