Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Castelbranco (2010)
Title Frequency of primary resistance to antiretroviral drugs and genetic variability of HIV-1 among infected pregnant women recently diagnosed in Luanda-Angola.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 35
NumPts 35
Subtype F, A, C, B, H, G, D, G + Unknown, CRF11_cpx, A + G


Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
090002A 090002A None None   T39N, K49R, V60I, V90I, K122E, D123S, I135V, K173A, Q174K, D177E, T200TA, Q207D, R211K, V245Q  
090004A 090004A None None   T39E, S48T, K122E, D123S, T139V, K173A, D177E, T200A, Q207A, V245Q  
090005A 090005A None None   T39E, S48T, K122E, D123N, I135T, F171Y, K173I, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245Q L210L* 
090006A 090006A None None   T39A, T69S, K122E, D123N, I135T, I142T, S162C, K173T, Q174D, D177E, T200E, I202V, Q207K, V245Q  
090008A 090008A None None   K49R, D121DY, K122E, T165I, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245T  
090009A 090009A None None   V60I, K102Q, T107S, D123NT, S162Y, D177E, V179I, Q207A, R211K, I244V, V245K V189VE 
090010A 090010A None None   T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, I142T, K166R, K173A, D177E, I178L, G196K, T200A, Q207G, R211K, V245Q  
090011A 090011A None None M184V K101E, G190A E40D, V60I, K122E, D123E, I135V, S162F, K173T, D177E, G196K, T200A, Q207E, V245E  
090012A 090012A None None  E138A K49R, V60VI, D123E, I135L, S162C, Q174K, D177E, V179I, T200E, I202V, Q207D, R211RK, V245H  
090014A 090014A None None  V106I T39A, V60I, S68G, V118M, D121Y, K122E, I135T, T165IV, E169D, D177E, I178V, G196GE, T200A, I202V, E204K, Q207E, R211K, F214L, V245T  
090015A 090015A None None   T39L, E40D, V60I, D121Y, K122E, I135L, N175H, D177E, I178V, Q197QH, E204Q, R206K, Q207E, R211K, F214L, L228H, I244V  
090016A 090016A None None   D123E, S162C, K173A, Q174K, P176Q, T200A, Q207N, R211K, V245Q  
090017A 090017A None None   T39R, E40D, K43Q, K49R, V60I, K102E, K122E, D123N, I135T, E169D, D177E, I178M, Q207A, R211K, V241I, I244V, V245K  
090018A 090018A None None   T39R, K122E, I142V, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
090019A 090019A None None   V60I, K122E, D123N, I135V, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200V, Q207EG, R211K, F214L, V245Q  
090020A 090020A None None   D123E, I135V, S162C, K173I, Q174K, D177E, V189VI, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
090021A 090021A None None   T39D, K122E, I135IV, A158AS, S162SC, K173A, D177E, Q197K, T200A, Q207E, R211RK, K238KR, P243T, V245Q  
090024A 090024A None None  E138EA I135V, S162C, K173IM, Q174K, T200A, Q207D, R211K, P243A, V245Q  
090025A 090025A None None  K238T K49R, K122E, D123E, S162C, K173T, Q174E, D177N, T200A, Q207K, R211A, V245Q C38CW 
090026A 090026A None None  V106I, E138A V60I, V118I, I135V, I142V, S162C, K173T, Q174K, D177G, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
090028A 090028A None None   T39TA, I135T, S162C, F171Y, K173T, Q174K, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
090031A 090031A None None  G190A T39I, E40D, K49R, I50V, V60I, D121C, K122E, T165I, Q174R, D177E, I178L, V179I, T200TA, E204Q, Q207E, R211K, F214L, I244V, V245K  
090032A 090032A None None   T39R, E40D, K43Q, D121Y, K122E, I135T, S162C, D177E, Q207T, R211K, I244V, V245K  
090033A 090033A None None   T39R, K122E, S162C, K173S, D177E, Q207A, R211S, F214FL, V245H  
090034A 090034A None None   T39D, V60I, A98S, D123E, I135V, S162SN, D177K, I178L, T200A, Q207D, R211K, V245K F160FI 
090035A 090035A None None   T39A, E40D, K49R, V60I, T107S, D121Y, K122E, D123G, D177E, Q207E, R211K, I244IV, V245M  
090036A 090036A None None   T39R, S48T, K122E, D123N, I142V, A158S, K173S, D177E, Q207A, R211S  
090037A 090037A None None   T39A, V60I, D123E, I142V, K173NS, D177E, I178IM, Q207E, V245K  
090038A 090038A None None   T39K, K122E, D123S, I142IT, S162C, K173A, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207E, V245Q  
090040A 090040A None None   T39E, K49KR, D121Y, K122E, S162C, K173V, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
090043A 090043A None None   T39L, V60I, K122E, D123S, I142V, K173I, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E, V245Q  
090044A 090044A None None  E138A T39M, I135V, Q145E, S162C, Q174K, I178M, T200A, Q207D, P243A, V245Q  
090045A 090045A None None   T39E, D123DN, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
090052A 090052A None None   K49R, V60I, K122E, D123N, I135T, I142IV, E169D, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207A, F214L, V245Q  
090057A 090057A None None   K43KR, V60I, D121HY, K122E, K173I, D177DE, I178IL, G196E, T200E, Q207G, R211K, V245Q Q174IK