Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Phan (2010)
Title Characterization of HIV type 1 genotypes and drug resistance mutations among drug-naive HIV type 1-infected patients in northern Vietnam.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 155
NumPts 155
Subtype CRF01_AE

 
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Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 155 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
NB01 NB01 None None   E6D, K11T, V35T, T39A, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S  
NB02 NB02 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, R172K, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
NB03 NB03 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207G, R211N  
NB05 NB05 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211K  
NB08 NB08 None None   E6D, K11T, V35T, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, D192N, T200A, Q207S, R211S  
NB09 NB09 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162Y, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207N, R211S  
NB10 NB10 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, T139A, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S  
NB12 NB12 None None   E6D, V35T, T39N, V111I, V118C, K122E, D123S, S162Y, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207S, R211S  
NB14 NB14 None None A62V  I5V, E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123N, S162C, E169D, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S  
NB15 NB15 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207N, R211S  
NB18 NB18 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162Y, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S  
NB21 NB21 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, T107S, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
NB23 NB23 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173A, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
NB24 NB24 None None   E6D, V35T, T39K, E40K, V60I, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, G196E, Q207S  
NB25 NB25 None None   K11T, V35T, T39K, V90I, V111I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207T, R211S  
NB26 NB26 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
NB27 NB27 None None   K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S  
NB30 NB30 None None   E6D, V35T, T39N, K122E, D123S, S162Y, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S  
NB31 NB31 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
NB33 NB33 None None   E6D, T27S, V35T, T39K, K122E, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S  
NB35 NB35 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, F171Y, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S  
NB36 NB36 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S  
NB37 NB37 None None V75M  E6D, K11T, V35T, T39K, K73M, V90I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207S, R211S  
NB38 NB38 None None  V106I E6D, V35T, T39E, T69N, V118I, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
NB40 NB40 None None   E6D, K11T, V35T, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207H, R211S  
NB42 NB42 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207N, R211S  
NB43 NB43 None None   E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S  
NB44 NB44 None None   E6D, V35T, T39E, K64R, K122E, D123S, I135V, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
NB45 NB45 None None   E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, I135R, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207S, R211K  
ND06 ND06 None None M184V K103N E6D, K11T, K20R, E28K, V35T, T39E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207N, R211S  
ND08 ND08 None None   E6D, K11T, K32E, V35T, T39K, K122E, D123S, I135K, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, L210M, R211S  
ND10 ND10 None None   E6D, K11T, V35T, T39A, K122E, D123S, I135M, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200I, Q207S, R211S  
ND11 ND11 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, V60I, T107S, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, Q207S, R211S  
ND14 ND14 None None   E6D, K11T, V35T, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
ND16 ND16 None None   E6N, V35T, T39K, K43R, S68G, K122E, D123S, I135R, S162Y, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S  
ND22 ND22 None None K65R, V75M, Q151M, M184V Y181C E6D, I31L, V35T, T39E, S68G, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
ND23 ND23 None None   E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
ND24 ND24 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, N137I, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
ND26 ND26 None None   E6D, K11T, V35T, T69N, K122E, D123S, S162C, K173M, Q174K, D177E, I202V, Q207S, R211S  
ND29 ND29 None None  V179D E6D, V35T, T39E, V111I, K122E, D123N, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S  
ND30 ND30 None None   E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
ND38 ND38 None None   I5V, E6D, K11T, K20R, V35T, E40D, K102Q, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178L, Q207S, R211S  
ND39 ND39 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, S162C, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S  
ND40 ND40 None None   K11T, V21I, V35T, T39N, V60I, D121H, K122E, D123S, I135T, T165I, K173T, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211S  
ND41 ND41 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, I142V, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
ND42 ND42 None None   E6D, V35T, T39N, K122E, D123N, S162C, K173M, Q174K, D177E, Q207A, R211N  
ND43 ND43 None None   E6D, V35T, T39E, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211T  
ND47 ND47 None None K65R, V75M, Q151M, M184V Y181C E6D, I31L, V35T, T39E, S68G, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207T, R211S  
ND49 ND49 None None   E6D, K11T, V35S, T39S, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, I195L, T200L, E203K, Q207N, R211S  
ND50 ND50 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S  
O901 O901 None None   E6D, K11T, V35I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S  
O902 O902 None None  G190E K11T, V35T, E36D, K122E, D123N, S162C, K173R, Q174K, D177E, D192N, E194K, G196R, R206K, Q207S, R211S G213K 
O903 O903 None None   E6D, K11A, V35T, T39E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211S  
O905 O905 None None  V106I E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207G, R211S  
O906 O906 None None  V106I E6D, K11T, V35T, T39K, T69N, D121Y, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S  
O907 O907 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, I167V, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
O908 O908 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
O909 O909 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43Q, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207N, R211S  
O910 O910 None None   E6D, E28K, V35T, T39E, K122E, D123S, I142T, S162C, K173M, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S  
O911 O911 None None  V179D E6D, V35T, T39K, V111I, K122E, D123S, S162Y, K173T, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
O912 O912 None None   E6D, K11T, V35T, T39Q, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
O913 O913 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, V111I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, T200A, Q207S, R211S  
O914 O914 None None K70Q  E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S V8P 
O915 O915 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S  
O916 O916 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I202V, Q207S, R211S  
O917 O917 None None   E6D, K11T, V35T, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207G, R211S  
O918 O918 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, V60I, T107S, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207S, R211S  
O919 O919 None None   E6D, K11T, T27S, V35T, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S  
O920 O920 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
O921 O921 None None   E6D, V35I, V111I, K122E, D123S, S162G, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, F214L  
O922 O922 None None  V106I E6D, K11T, V35T, T39N, D123S, T139A, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S  
O923 O923 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S  
O924 O924 None None   E6D, V35I, K122E, D123S, S162C, K173A, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
O925 O925 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, K43Q, V60I, S68G, D121H, K122E, I135T, T139A, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S  
O926 O926 None None   E6D, K11T, T27S, V35T, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207N, R211S, F214L  
O927 O927 None None  V106I E6D, K11T, V35T, D121H, K122E, D123E, I142V, S162C, K173T, D177E, Q207S, R211S  
O928 O928 None None  Y181C E6D, K22R, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207G, R211S  
O929 O929 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K49R, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
O930 O930 None None   E6D, V35I, T39E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207N, R211S  
O931 O931 None None   K11T, V35T, T39Q, K122E, D123S, S162C, K173V, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
O932 O932 None None T215S  E6D, V35T, K122E, D123E, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207N, R211S F214W 
O933 O933 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, E40D, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207S, R211S  
O934 O934 None None   K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
O935 O935 None None   E6D, K11T, V35T, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S  
O936 O936 None None  V106I I2N, E6D, K11T, V35T, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S  
O937 O937 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
O938 O938 None None   E6D, K11A, V35T, K122E, D123S, S162G, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S, F214L  
O939 O939 None None   E6D, V35T, T39L, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, Q207S, R211S  
O941 O941 None None   E6N, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, T165I, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
O942 O942 None None  V106I E6D, K11T, V35T, T39K, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S  
O943 O943 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S  
O944 O944 None None   E6D, V35T, T39E, K64R, K122E, D123S, I135V, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
O945 O945 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, M184L, Q207S, R211S  
O946 O946 None None   E6D, K11T, G18D, V35T, T39N, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178L, V189I, Q207K, R211T  
O947 O947 None None   E6D, K11T, E28K, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S  
O948 O948 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S  
O949 O949 None None  V106I E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207K, R211S  
O950 O950 None None L74I V179D E6D, K11T, E28K, K32E, V35T, T39K, V111I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
O951 O951 None None  V106I E6D, K11T, V35T, T39K, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S  
O952 O952 None None   E6D, E28K, K32E, V35T, T39E, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S  

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