Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Lindstrom (2006)
Title HIV-1 transmission cluster with M41L 'singleton' mutation and decreased transmission of resistance in newly diagnosed Swedish homosexual men.
Citation Antivir Ther
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 199
NumPts 199
Subtype B, A, CRF01_AE, C

 
  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 199 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
SIIDC0101 SIIDC0101 None None   V35I, R83K, I135T, A158S, V179A, E194D, G196E, I202V, R211K, F214L  
SIIDC0110 SIIDC0110 None None T215FY  R83K, K166KR, I178L, Q207G, R211K, V245E  
SIIDC0111 SIIDC0111 None None  A98G V35I, R83K, K102Q, S162C, I178L, Q207E, R211K, V245Q, S251Q  
SIIDC0112 SIIDC0112 None None   D123E, S162C  
SIIDC0113 SIIDC0113 None None   E6ED, K122E, D123DG, I142T, T200TI, R211K  
SIIDC0114 SIIDC0114 None None T215CG  R83K, R211K, V245K  
SIIDC0115 SIIDC0115 None None K70R  E6G, K122Q, I135IT, K173Q, Q207E, R211K, V245M  
SIIDC0116 SIIDC0116 None None   E6ED, K11KR, K122E, Q207E, R211RK  
SIIDC0117 SIIDC0117 None None M41L, D67N, K70KR, L210W, T215Y  K104N, K122P, I142V, T165TI, R211K, V245M  
SIIDC0118 SIIDC0118 None None   K122E, D123S  
SIIDC0119 SIIDC0119 None None   K64R, D123E, A158S  
SIIDC0200 SIIDC0200 None None   K64R, D123E, A158S, K166R, I178IL, I195T, F214L  
SIIDC0201 SIIDC0201 None None   I135T, I202V, R211K, F214L  
SIIDC0202 SIIDC0202 None None   K122E, D177E, I178M, D192DN, G196E, R211K  
SIIDC0203 SIIDC0203 None None   K20R, V35T, K122E, I135T, I142T, I178V, T200TA, Q207QKR  
SIIDC0204 SIIDC0204 None None   V35T, E40D, V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245R, D250E  
SIIDC0205 SIIDC0205 None None   I2ILV, K122E, S162C, T200TA, R211K  
SIIDC0206 SIIDC0206 None None   K122E, S162C, R211K  
SIIDC0207 SIIDC0207 None None   K20KR, S68G, V90I, K166R, D177DE, T200TA, R211RK  
SIIDC0208 SIIDC0208 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D123N, I135V, K166R, K173A, D177E, V189I, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
SIIDC0209 SIIDC0209 None None M41L, T215S  K20R, T39A, K122E, Q207E  
SIIDC0210 SIIDC0210 None None M41L, T215C  E6K, V8I, K104R, K122E, I195IV, G196E, T200I, R211K, V245K  
SIIDC0211 SIIDC0211 None None   D121H, K122KE, I135T, I202IV, F214FL, V245M, E248EK  
SIIDC0212 SIIDC0212 None None   V35I, R83K, K122Q, I135T  
SIIDC0213 SIIDC0213 None None L210W, T215D  S68G, K122KE, D123X, A158S, Q174H, D177E, T200A, E203K, Q207E, R211K, V245K  
SIIDC0214 SIIDC0214 None None   I135T, R211K  
SIIDC0215 SIIDC0215 None None   V35I, R83K, K122KQ, I135T  
SIIDC0216 SIIDC0216 None None   A98AS, D123E, I178L, V179VI, Q207E, R211K, V245I  
SIIDC0217 SIIDC0217 None None   V35I, R83K, D123E, E169D, D177E, T200A, Q207H, R211K  
SIIDC0218 SIIDC0218 None None M41L  T39K, V60I, K102KR, K104R, K122E, S162A  
SIIDC0219 SIIDC0219 None None   D123E, I142IV, R211K  
SIIDC0220 SIIDC0220 None None   V35I, T39TA, K82KR, R83K, I135T, T165X, I202IV, F214L  
SIIDC0221 SIIDC0221 None None   D123DE, R211K, S251H  
SIIDC0222 SIIDC0222 None None   K46Q, K122E, D123E, I135T, T139L, I178M, T200A  
SIIDC0223 SIIDC0223 None None   K102Q, I142T, R211RK  
SIIDC0224 SIIDC0224 None None   K122Q, D177E, T200I, R211G, F214L  
SIIDC0225 SIIDC0225 None None   V35I, K122E, I135L, S162SC, G196E, T200I, R211K  
SIIDC0226 SIIDC0226 None None   T7P, R83K, D121DH, D123E, S162A, E169ED, D177E, Q207E, R211RK  
SIIDC0227 SIIDC0227 None None   T39A, R83K, I135T, R172RK, Q174R, E194D, G196GE, I202V, R211K  
SIIDC0228 SIIDC0228 None None   D123E, K166R, I180V, T200A, R211K  
SIIDC0229 SIIDC0229 None None   K102Q, I135T, R211K  
SIIDC0230 SIIDC0230 None None   E6EG, I50V, R83K, D123E, I135T, D177E, T200X, Q207EG, R211K, V245E I5IF 
SIIDC0232 SIIDC0232 None None   K20KR, K32Q, V60VI, K122KE, I135K, F171Y, T200I, R211K, L228LP  
SIIDC0233 SIIDC0233 None None   K32Q, V60I, I135K, F171Y, T200I, R211K  
SIIDC0234 SIIDC0234 None None   V60I, R83K, I178L, T200A, V245X, D250A A129G 
SIIDC0235 SIIDC0235 None None   K11R, R83K, T200A  
SIIDC0236 SIIDC0236 None None   V245VL, E248EA  
SIIDC0237 SIIDC0237 None None   D123E, T165I, D177E, Q197E, T200A, R211K, V245M  
SIIDC0238 SIIDC0238 None None   S162C, R211Q G190W 
SIIDC0239 SIIDC0239 None None  Y188YH V35VA, I142IV, S162A, R211RK, V245L  
SIIDC0240 SIIDC0240 None None   D123E, R211K S156SL 
SIIDC0241 SIIDC0241 None None   R83K, D123E, S162C, I178L, T200I, R211K  
SIIDC0242 SIIDC0242 None None   K20KR, D123E, T165I, D177E, Q197E, T200A, R211K, V245M  
SIIDC0243 SIIDC0243 None None   K11KR, R83RK, A98AS, T200A, R211RK  
SIIDC0244 SIIDC0244 None None   D123E, A158S, D177E, R211K, V245K  
SIIDC0245 SIIDC0245 None None   V8I, R211Q, V245E  
SIIDC0246 SIIDC0246 None None   K22N, D123E, A158S, K173R, D177E, R211K, V245K  
SIIDC0247 SIIDC0247 None None  E138A A98S, K102Q, D123E, S162C, Q174H, D177E, R211K  
SIIDC0248 SIIDC0248 None None   K102Q, I135V, S162C, E204EQ, R211Q  
SIIDC0249 SIIDC0249 None None   K20R, V35T, V60I, Q145QE, T200D, I202IV, E204ED, R211RK, V245E  
SIIDC0250 SIIDC0250 None None   V60VI, K122E, I135R, S162C, V189VI, R211K  
SIIDC0251 SIIDC0251 None None K219R  P4H, V35T, T39I, K49R, V60I, K64KR, D121H, I135T, K173V, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245E, D250E  
SIIDC0252 SIIDC0252 None None   V35I, R83K, E194D, G196E, Q197K, I202V, R211Q, F214L  
SIIDC0254 SIIDC0254 None None   K20KR, D123E, T165I, D177E, Q197E, T200A, Q207QR, R211KQ, F214FL, V245M  
SIIDC0255 SIIDC0255 None None  E138A A98S, K102Q, D123E, S162C, Q174H, D177E, R211K  
SIIDC0256 SIIDC0256 None None   D177E, T200A  
SIIDC0257 SIIDC0257 None None  E138A A98S, K102Q, D123E, S162C, Q174H, D177E, R211K  
SIIDC0258 SIIDC0258 None None   K49R, R83K, I135V, T165I, R211K  
SIIDC0259 SIIDC0259 None None   K20R  
SIIDC0260 SIIDC0260 None None   D123E, I159IV, T165TI, D177E, Q197E, T200A, R211K, V245M  
SIIDC0261 SIIDC0261 None None   R83K, K101KQ, K122P, I135T, S162C, I178L, S251SN  
SIIDC0262 SIIDC0262 None None   I135T, T200I, V245E  
SIIDC0263 SIIDC0263 None None   I142V, K166R, V189VI, T200I, V245E  
SIIDC0264 SIIDC0264 None None T215S  R83K, D123E, I202V, R211K, F214FL, V245K  
SIIDC0265 SIIDC0265 None None   V35MR, T39ADE, V60VI, D121H, K122E, I132IV, I142T, D177EQ, I178ILV, V179VI, G196E  
SIIDC0266 SIIDC0266 None None   D123E, I135T, S162A, D177E, Q197K, T200I, F214L  
SIIDC0267 SIIDC0267 None None   V35T, D123E, I135S, R211K, E248D  
SIIDC0268 SIIDC0268 None None   K101R, I142V, K166R, R211K  
SIIDC0269 SIIDC0269 None None  E138A A98S, K102Q, D123E, S162C, Q174H, D177E, R211K  
SIIDC0270 SIIDC0270 None None   R83K, K122E, A158S, I202V, R211K  
SIIDC0271 SIIDC0271 None None   L34X, V118I, I135T, S162A, T165I, E169D, F171Y, T200A, F214L  
SIIDC0272 SIIDC0272 None None   V35I, R83K, I135T, I202V, Q207E, R211K, V245I  
SIIDC0273 SIIDC0273 None None   E6D, T69S, K102Q, I135V, S162C, I178IM, V179VI, T200I, R211T, V245Q  
SIIDC0274 SIIDC0274 None None   R83K, K103R, T165TI, D250E  
SIIDC0275 SIIDC0275 None None   V35M, R83K, D123E, E169D, K173KN, Q174K, T200A, Q207A, L210F, R211K, E248Q  
SIIDC0276 SIIDC0276 None None   K11R, K49KR, R83K, T200A, R211RK  
SIIDC0277 SIIDC0277 None None   V118I, E169D, I202V, R211K, F214L  
SIIDC0278 SIIDC0278 None None   I135V, T165I, R211K  
SIIDC0279 SIIDC0279 None None   K11KR, K20R, R83K, D123E, I135T, S162C, T165TI, I178L, Q207E, R211K, V245E  
SIIDC0280 SIIDC0280 None None K219R  V35I, D121DY, K122KE, I135R, S162C, E204D, R211K  
SIIDC0281 SIIDC0281 None None   V35I, K122E, I135R, S162C, R211K  
SIIDC0282 SIIDC0282 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135M, S162SC, K173IR, Q174K, D177E, I178V, G196E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SIIDC0283 SIIDC0283 None None   E6D, S162C, L210LM, R211Q  
SIIDC0284 SIIDC0284 None None   D123E, I135T, I178M, Q207E, R211K  
SIIDC0285 SIIDC0285 None None   V35L, K64R, I135T, S162C, R211K, F214L  
SIIDC0286 SIIDC0286 None None M41L, D67N, T69D  T39TA, V60I, K102KQ, K122P, I135T, I142IV, K173R, Q174K, Q207E, R211K, T215X  
SIIDC0287 SIIDC0287 None None   A98S, K122E, R211KQ  
SIIDC0288 SIIDC0288 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
SIIDC0289 SIIDC0289 None None T215S  K20R, K122E, S162C, Q207E, V245Q  
SIIDC0290 SIIDC0290 None None   R83RK, T165TI, R211RK  

Database

Resources

Team