Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Zhang (2010)
Title Surveillance of transmitted HIV type 1 drug resistance in newly diagnosed HIV type 1-infected patients in Shandong province, China.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 47
NumPts 47
Subtype CRF01_AE, B, CRF07_BC, C, CRF08_BC, A, B + C

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
0501 CNsd0501 None None  V106I K102R, D121Y, K122E, I135T, E169D, I202V, F214L, V245M  
05105 CNsd05105 None None   K32R, V35T, E36A, T39D, V60I, D121Y, K122E, S162C, I178L, T200I, R211K, V245Q  
05107 CNsd05107 None None   K20R, K122KE, I135IR, S162C, E169D, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
05175 CNsd05175 None None   D123N, I135V, S162C, Q174H, T200A, Q207K, R211S  
05176 CNsd05176 None None   E6D, K11KT, V35T, T39K, K43E, S68SG, D121H, K122E, I135IT, K173I, Q174K, I178IM, Q207AT, R211S, K238R, V245K  
05178 CNsd05178 None None   E6N, K11T, V35T, T39K, K43E, K101R, T107S, K122E, D123S, T139TA, S162Y, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
05179 CNsd05179 None None   E6D, V35T, T39K, K173I, Q174K, V179I, Q207A, R211N, K238R, V245E  
0518 CNsd0518 None None   E6D, V8VI, K11T, V35T, T39K, K43E, V111I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, V245E  
05188 CNsd05188 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, K122E, D123DE, Q207E, R211RK, V245Q  
05208 CNsd05208 None None  V106I K11KR, D121H, K122E, I135T, E169D, I178L, I195M, T200TA, I202V, E204K, F214L, V245I  
0521 CNsd0521 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
05220 CNsd05220 None None   K20R, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K101R, S162Y, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
05235 CNsd05235 None None  V106I D121Y, K122E, I135T, E169D, I202V, F214L  
0525 CNsd0525 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K101R, K122E, D123S, I135R, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
0554 CNsd0554 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, T200A, V245Q  
0556 CNsd0556 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K166R, T200A, V245Q  
0558 CNsd0558 None None   K22R, I135V, S162C, Q174QHR, Q197E, Q207L, R211K  
0579 CNsd0579 None None   V8I, V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, V60I, K102R, D121Y, K122E, T200A, Q207E, E224K, V245Q  
0604 CNsd0604 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
06110 CNsd06110 None None   E6D, K82R, V118I, K122E, I135T, K166R, F171Y, G196E, F214L, V245M  
06112 CNsd06112 None None   E6D, K11A, V35T, T39K, K43E, D121DH, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
06113 CNsd06113 None None   E6D, K11A, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
06116 CNsd06116 None None   K82KR, V118I, K122A, I135T, F171Y, R211RK, F214L  
06119 CNsd06119 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
06121 CNsd06121 None None  V106I E6D, K11T, K32R, V35T, T39K, K43E, T107A, D123N, S162C, K173A, Q174K, D177E, V179T, I180V, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
0613 CNsd0613 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D177E, V245Q  
06133 CNsd06133 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245K  
06134 CNsd06134 None None  V179VD E6D, K11T, V35T, T39KR, K43E, S68SG, K102KR, K122E, D123S, I135R, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
06145 CNsd06145 None None   E6D, V8I, K11T, K20KR, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, I142V, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
06149 CNsd06149 None None   E6D, V35T, T39E, K101R, K122E, D123S, I135R, S162C, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
06155 CNsd06155 None None   K11Q, V35L, D121Y, K122E, S162C, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
06157 CNsd06157 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, T165I, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R  
0616 CNsd0616 None None   K11R, V35T, T39D, S48T, V60I, K122E, D123N, T165I, K173I, Q174K, D177E, G196E, I202V, Q207A, R211S, K238R, V245Q  
06161 CNsd06161 None None   V35T, E36EA, T39DN, S48T, K49KR, V60I, K104KR, K122E, K166KR, V245Q  
06168 CNsd06168 None None   K22R, I135V, S162C, Q174QHR, Q197E, Q207L, R211K  
06169 CNsd06169 None None  E138A V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, E53D, V60I, S162C, Q207E, R211K, V245Q, D250E  
06173 CNsd06173 None None  V179D V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
06178 CNsd06178 None None   E6D, K11T, V35T, T39D, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, L210F, R211S, K238R, V245E, E248D  
06179 CNsd06179 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, V189I, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
0643 CNsd0643 None None   V35T, K122E, D123N, T139TA, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200TA, Q207A, R211S, K238R, V245EK  
0650 CNsd0650 None None  V106I K104R, V118I, D121Y, K122E, I135T, E169D, T200L, I202V, F214L, V245I  
0654 CNsd0654 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
0656 CNsd0656 None None  K101E, E138A V35T, T39N, S48T, E53D, V60I, I135V, S162C, Q207K, R211T, V245H  
0691 CNsd0691 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207RS, R211S, K238R, V245E, E248D  
0692 CNsd0692 None None   E6D, K22R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, V245Q  
0695 CNsd0695 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200R, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245D  
0699 CNsd0699 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, T165I, V245Q  

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