Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Gonsalez (2007)
Title Drug resistance among chronic HIV-1-infected patients naive for use of anti-retroviral therapy in Sao Paulo city.
Citation Virus Res
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 105
NumPts 105
Subtype B, F

 
  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 105 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
01 HIV_01 None None   K20R, V35VI, K122E, I135T, T165TI, E169D, G196GE  
02 HIV_02 None None   S48T, K122E, D123E, I135V, S162C, I178M, R211K  
03 HIV_03 None None   V35VI, S68SG, K122P, D123E, I135T, K166R, I178M, R211K, E224D, F227Y  
04 HIV_04 None None  V179D K20R, K122E, I135T, I142V, R211K, F214L  
05 HIV_05 None None   E6D, V8I, K20R, K22R, V35T, K122E, I135IV, K173T, Q174K, Q197E, Q207E, R211K, F214L, W239X, V245Q, E248D  
06 HIV_06 None None   V35I, V118I, D123E, K173I, Q174K, Q207E, R211K, F214L  
07 HIV_07 None None   V35T, D123E, I135V, D177E, R211K  
08 HIV_08 None None   K20R, I202V  
09 HIV_09 None None   E6K, K122E, I142V, I178M, I202V  
10 HIV_10 None None   K49R, I135T, I178IL, G196E, I202V, E204Q, Q207E, F214L  
100 HIV_100 None None   V35I, V60I, I135L, E138T, I142V, S163T, T165I, D177E, I178L, I195L, Q197QK, T200A, R211K  
101 HIV_101 None None  V106VI T69TA, K122KE, D177N, I202V, R211RK  
11 HIV_11 None None   K20R, V21I, D123E, I135T, S162C, I178M, T200I, R211G  
13 HIV_13 None None   V35I, K122E, I135T, S162C, I178M, G196E, R211K  
14 HIV_14 None None   K102Q, D123E, I135T, K166R, D177E, R211K  
15 HIV_15 None None   V35T, K49R, K122E, D123N, E169D, D177E, I178M  
16 HIV_16 None None  V106I E53D, D123E, S162Y, Q174N, I178M, V179I  
17 HIV_17 None None   K122E, I135T, I142T, E169D, T200A  
18 HIV_18 None None   K20R, K49R, K122E, I135T  
19 HIV_19 None None   V35T, K49R, D123E, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211K  
20 HIV_20 None None   V35I, S48T, K49KR, D121H, K122E, V245E  
21 HIV_21 None None   K104R, V118I, D121H, K122E, I135T, I142L, D177E, G196E, E204N, R211K, F214L  
22 HIV_22 None None   V35T, D123E, F171Y, Q174K, D177E, Q207E, R211K, F214L  
23 HIV_23 None None   K122E, D123E, I135T, D177E, I178M, R211K, V245E, E248D  
24 HIV_24 None None   V35T, D123E, F171Y, Q174K, D177E, Q207E, R211K, F214L  
25 HIV_25 None None  K103N D121Y, K122E, I135T, T139A, I178M, T200E  
26 HIV_26 None None   K173E, D177E, I178M, Q207N, R211K  
27 HIV_27 None None   I135T, A158S, R211K  
28 HIV_28 None None   P4S, T27S, S68G, I135T, Q174K, R211K D177HY 
29 HIV_29 None None   I135T, D177E  
30 HIV_30 None None   K20R, V35L, R83K, D123E, D177N, V245M, E248D  
31 HIV_31 None None   V60I, D121Y, K122E, I135T, D177E, I178M, V179I, T200I, R211K, V245M  
32 HIV_32 None None   K122E, I135T  
33 HIV_33 None None   K20R, K49R, I135T, S162C, Q197P, T200A  
34 HIV_34 None None   K122E, D123N, I142V, E169D, D177DE, I178IL, T200A, R211RK  
35 HIV_35 None None  V106I V35I, I135T, D177E, R211K, F214L  
36 HIV_36 None None  E138A K49R, I50V, V60I, E169D, F171Y, Q174K, I178M, R211K  
37 HIV_37 None None   P4H, S68G, I135T, R211K  
38 HIV_38 None None   S68G, K122E, D123N, I135T, T200A, Q207E  
39 HIV_39 None None   V60I, D123E, I180IV, Q207E, R211K  
40 HIV_40 None None   D123E, I135T, K166KI, E169D, D177E, G196E, I202V  
41 HIV_41 None None   K122E, I135T, D177E, I202V  
42 HIV_42 None None   K20KR, V35T, T39TI, K49R, K122E, D123A, I135T, S162C, E169D, K173A, Q174K, I178IV, G196E, Q207E, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297K, V317A, S322T  
43 HIV_43 None None   K11R, S68SG, D121Y, K122E, I135T, K166KR, E169D, R211K, A272P, I293V, E297EA  
44 HIV_44 None None  V106I E6D, K20R, K122E, I135T, S162C, K173T, I178M, F214L, V245K, I293V, E297Q, I329L  
45 HIV_45 None None   K64KR, V90I, D121HY, K122E, I135IT, S162A, I178M, V179I, T200A, Q207E, A288AS, V292I, I293V, E297K, I329V  
46 HIV_46 None None   V10VA, K32R, V35M, K173R, Q174K, I178M, Q207E, R211E, A272P, K277R, V292I, I293V, E297R, L301I, R307K, Q334Y  
47 HIV_47 None None   V118I, D123E, I159V, T165I, K173Q, F214L, A272P, V292I, I293V  
48 HIV_48 None None   E6D, I135T, R211X  
49 HIV_49 None None   D123E, A158S  
50 HIV_50 None None   D123E, I135T, S162C, R211K, V245E  
51 HIV_51 None None   I135T, I142T, D177E, R211K  
52 HIV_52 None None   E6K, V35T, K49R, K122E, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, Q207E, R211K  
53 HIV_53 None None   D123E, I135T, I142V, T165I, D177E, R211K  
54 HIV_54 None None   I135T, D177E, I178M, Q197E, I202V, E204D, R211S, V245Q  
55 HIV_55 None None   E53D, K122E, I135T, D177E, G196E, R211K  
56 HIV_56 None None   A98S, K122E, I135T, K166R, Q174E, T200A, I202IV, Q207E, E248D  
57 HIV_57 None None   S68G, K122KE, I135T, D177E, I178V, G196Q, Q197L, T200A, E204N, R211K  
58 HIV_58 None None   A98S, K122E, I135T, K166R, Q174E, T200A, I202IV, Q207AE  
59 HIV_59 None None   K122E, D123E, I135V, S162C  
60 HIV_60 None None   K102Q, D123E, I178M, R211K  
61 HIV_61 None None   D123E, I202V, R211K  
62 HIV_62 None None   A98S, Q174K, G196E, F214L  
63 HIV_63 None None   K11R, S68SG, D121H, K122E, I135T, E169D, R211K  
64 HIV_64 None None   K20R, T39A, I135T, S162Y, Q174H, V179I, G196E, V245M  
65 HIV_65 None None   K20R, S48T, K122E, I135T, G196E, I202V, R211K  
66 HIV_66 None None   V35A, E36A, T39A, K49R, V60I, D123E, I135V, S162C, E169D, K173AT, Q174K, D177E, T200A  
67 HIV_67 None None   K122E, I135T, G196GE  
68 HIV_68 None None   V35I, I135T, R211K, F214L  
69 HIV_69 None None   K122E, I135T, I178M, R211Q, F214L  
70 HIV_70 None None   K11R, I135T, Q207R, V245M, E297A, Q334L  
71 HIV_71 None None   V35M, K122E, I135T, K166R, D177E, I178M, G196E  
72 HIV_72 None None   K20R, S48T, K102KR, K122E, I135T, G196E, I202V, R211K, V245M  
73 HIV_73 None None   A98S, K102KR, K122E, I135T, T200I, R211K  
74 HIV_74 None None   E6D, V35T, T39K, E40Q, K43E, V60I, I135T, K166R, D177E, Q197K, I202V, L210IM  
75 HIV_75 None None   K49R, D123E, I135T, S162C, E169D, T200A, V245A  
76 HIV_76 None None   K122E, I142V, S162D, I178M  
77 HIV_77 None None   K122E, I135T, I142T, I178L, T200A, R211RK  
78 HIV_78 None None   K166R, D177E, R211K  
79 HIV_79 None None   E6K, V35T, T39K, V118I, K122E, I135V, S162C, D177E, T200I, E204K, Q207E, F214L, V245Q, E248D  
80 HIV_80 None None   K101Q, K122E, D123E, I142V, K166R, V179I, T200AE  
81 HIV_81 None None   P4S, E6D, V35T, I135T, S162C  
82 HIV_82 None None  V106VI K20R, K49R, K122V, I135T, D177E, R211K  
83 HIV_83 None None   K122E, I135T, R211KQ, F214L  
84 HIV_84 None None   I135T, T200TA, R211K  
85 HIV_85 None None   V35I, K122E, D123E, I135T, Q174H, R211K, F214L  
86 HIV_86 None None   D123E, S162C, Q207A, R211K, V245K  
87 HIV_87 None None  E138A R83K, D123E, I135T, S162A, T200A, R211K  
88 HIV_88 None None   S48T, K122E, S162C, D177E, I178M, T200A, Q207K, R211EK  
89 HIV_89 None None   K49R, K122E, D123G, I135IT, E169D, D177E, R211K  
90 HIV_90 None None M184V K103N, P225H E6D, K11R, K101Q, I135T, I178M, T200I, R211K, L228N, V245M  
91 HIV_91 None None   V35I, V60I, D121H, K122E, I135T, I142V, E169D, D177E, I178L, R211K  
92 HIV_92 None None   K20R, E42K, G51X, W71*, R72K, D113N, D123E, I135T, V179I, T200A, K201R, I202V  
93 HIV_93 None None   V8VI, V35M, T39S, K122Q, I132V, I135V, S162C, R211K, I244V  
94 HIV_94 None None   V35A, I135R, I178M, T200I, Q207A, R211A  
95 HIV_95 None None   I135T, D177E, I178M, R211K, V245K  
96 HIV_96 None None   V35I, S48T, D123E, I135T, D177N, Q207E, V245T Y127S 
97 HIV_97 None None   D123E, S162C, D177E, V179VI, I180IV, G196E, R211K  
98 HIV_98 None None   I50V, K122E, I135T, K173T, I202V, E204Q, Q207E  
99 HIV_99 None None   I50V, K122E, I135T, Q174H, I202V, E204Q, Q207E  

Database

Resources

Team