Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Varella (2007)
Title Human immunodeficiency virus type 1 protease and reverse transcriptase mutation patterns among treatment-naive patients in different stages of infection in Rio de Janeiro, Brazil.
Citation J Med Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 50
NumPts 50
Subtype B, F, C

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
10ini 10ini None None   I5V, K103R, K122E, I135T, V245T, I293V, E297K  
11ini 11ini None None   I135T, S162C, R211K, A272S, K281R, T286A, E297T, V317A, I329L  
12ini 12ini None None   A272S, E297K, V314A  
13ini 13ini None None   V35K, K49R, V60I, D123E, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P, T286A, E291D  
14ini 14ini None None   K32I, V35T, T39K, K49R, D123E, S162C, E169D, Q174K, D177E, T200R, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E, S251D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A  
15ini 15ini None None  E138A I47N, K122E, I135T, I142V, K173Q, D177N, F214L, E248D, D250G, A272P, V276T, K277R, L283I V148A 
16ini 16ini None None   K32R, S163R, I178M, T200I, V245M, A272P, K281R, I293V, E297K  
17ini 17ini None None   V35T, E40D, K49R, K122P, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291A, V292I, I293V, E297A, V317G  
18ini 18ini None None   D121H, K122E, I135T, I142V, D177E, I202V, A272S, K277R, A288S, V292I, I293V, E297Q, I329V  
19ini 19ini None None   K122E, I135T, Q197K, T200E, E203D, V245M, A272P, K277R, I293V, E297Q  
1ini 1ini None None   E6D, K22N, I135T, T165I, T200I, I202V, F214L, V245M, V292I, I293V  
20ini 20ini None None   S48T, I135T, I202V, R211K, F214L, A272P, K275Q, V276I, K277R, L283I, I293V, I326V  
21ini 21ini None None   V60I, K122E, I142V, S162C, R211K, I329L  
23ini 23ini None None   S48T, K49R, K122E, D123N, E169D, I202V, Q207H, R211K, V245M, A272P, K277R, I293V, K311R  
24ini 24ini None None   V35I, R83K, I135T, I178L, G196E, Q207E, A272P, K277R, I293V, E297A, I326V  
25ini 25ini None None   D121H, K122E, I142V, D177E, T200A, K277R, A288S, I293V, E297A, I329L  
26ini 26ini None None   V35I, R83K, I135T, G196E, F214L, V245K, T286A, E297K, K323E, D324R  
27ini 27ini None None   E6K, K20R, V35T, V60I, K122E, I135T, I142M, S162Y, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211T, F214L, V245Q, E248D, A272P, E291D, V292I, I293V, E297T  
28ini 28ini None None  V106I P4T, D121Y, K122E, V245R, A272P, K277R, I293V, D324E  
29ini 29ini None None   K49R, K64R, T165I, E169D, D177E, I178L, I202V, E248D, A272P, T286A, V292I, I293V, E297P, D324E  
30ini 30ini None None   V35T, D123E, S162C, E169D, K173T, Q174K, Q207A, R211A, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294S, E297A, V317A, S322T  
31ini 31ini None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, N57T, D123E, S162C, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, V317A T58P 
32ini 32ini None None  V179D V35T, I135V, S162C, E169D, K173R, Q174K, D177Q, T200A, Q207E, R211Q, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, V317A, I329L  
33ini 33ini None None   K49R, F214L, K281R, K311R  
34ini 34ini None None   K101R, I135T, D177E, I178V, T200A, F214L, V245M, A272P, I293V  
35ini 35ini None None   D177E, R211K, V245K, I293V  
36ini 36ini None None   K104Q, S162C, T200A, R211K, V245M, A272P, K277R, Q278H, K281R, V292I, I293V, E297A, K311R, D324E, I329V  
37ini 37ini None None   E6D, D123N, I135T, S162C, D177E, V179I, G196E, E203D, R211K, V245M, E248D, A272P, V292I, I293V, E297V  
38ini 38ini None None   K122E, D123N, I135T, I142V, T200A, E204Q, R211K, V245M, A272P, K275R, I293V, P294T, E297A  
39ini 39ini None None   V35T, I135L, I142L, S162H, E169D, K173A, Q174K, Q207E, V245T, D250E, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T, S322T  
3ini 3ini None None  E138G N136T, D177N, F214L, V245M, I293V  
40ini 40ini None None   K20R, K122E, I135T, V276I, I293V, E297V  
41ini 41ini None None   K102Q, I135T, D177N, I178M, Q207E, V245K, A272P, I293V, V317A, S322T  
42ini 42ini None None   K122E, K166R, D177E, I202V, Q207E, V245M, A272S, I293V, D324E  
43ini 43ini None None   K11R, D121Y, K122E, D177E, V179I, H235N, A272S, K277R, I293V  
44ini 44ini None None   K20R, K64R, T165I, R211K, A272P, K277R, E297K, I329L  
45ini 45ini None None   K11R, K101R, I135T, I180V, T200R, R211K, V245M, A272P, T286A, E297R  
46ini 46ini None None   I135T, S162A, V245K, A272P, V276I, K277R, I293V, E297K  
47ini 47ini None None   T39S, S68G, K122E, I135T, K173R, V245K, A272P, K277R, I293V, E297K  
48ini 48ini None None   E6K, K122E, I135T, T200I, V245M, I293V  
49ini 49ini None None   K122E, D123N, T200A, Q207E, F214L, V245M, I293V, E297A, S322T  
4ini 4ini None None  E138A S68G, L100F, S162C, K173E, P243S, V245K, A288S  
50ini 50ini None None   A98S, K122E, I178M, I195L, A272P, I293V, E297K  
51ini 51ini None None   V35T, D123S, D177E, T200A, E203D, E204K, Q207E, R211K, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
52ini 52ini None None   V35T, E36A, T39E, K43R, S48T, K122E, D123N, A158S, K173A, T200A, Q207K, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
5ini 5ini None None   V35I, D123E, I132V, I135V, S162C, E169D, K173T, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297V  
6ini 6ini None None   K20R, D123E, I135T, D177E, R211K, V245I, K277R, E291Q, I293V Q197D 
7ini 7ini None None   A98S, D123E, I135T, D177E, V245M, I293V, E297K, D324E  
8ini 8ini None None   A98S, D123E, I135T, D177E, E204K, Q207E, R211K, F214L, V245I, A272P, K275Q, K277R, I293V, E297K  
9ini 9ini None None   D123E, I135T, S162A, D177E, I178V, F214L, P243S, V245K, A272P, K277R, V292I, I293V, E297R  

Database

Resources

Team