Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author McConnell (2008)
Title Molecular epidemiology of HIV type 1 in newly diagnosed patients in southern Spain.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 72
NumPts 72
Subtype B, CRF02_AG, G

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
NV01 NV01 None None   S68SG, A98AS, I178L, Q207E, R211RK, V245I  
NV02 NV02 None None   V60I, K122EQ, D123DEG, I142V, S162A, Q207E, E224ED H208HN 
NV03 NV03 None None   S68G, A98S, K122E, I135T, D177E, G196Q, Q197L, T200TA, E204D, R211K, V245N  
NV04 NV04 None None  V106VI E44G, D123E, I135T, K166R, K173E, Q174R, D177E, G196E, F214L, V245M  
NV05 NV05 None None   V60I, K122Q, I142V, S162A, Q207E I167IM 
NV06 NV06 None None   K43KN, I47IL, K49KR, I135T, S162C, R211K  
NV07 NV07 None None   K122E, I135T, P140PT, I142IF, S162C, D177E, I178M, R211K  
NV08 NV08 None None   K49KR, V60I, K64R, I135R, Q207E, V245M P140Q 
NV09 NV09 None None   V60I, K104R, I135T, I142V, S162A  
NV10 NV10 None None   D123E, S162C, R211K, V245M  
NV11 NV11 None None   V60I, D121H, I142V, R143K, S162A, D177E, Q207E  
NV12 NV12 None None   K49R, V118I, K122E, I135T, T165TI, E169D, R211K, F214L, V245T L149LV 
NV13 NV13 None None   V60I, K122Q, I142V, S162A, Q207E  
NV14 NV14 None None  E138A K64KR, K122E, I135V, S162C, D177E  
NV15 NV15 None None   V60I, D121H, I142V, D177E, Q207E  
NV16 NV16 None None V75M, T215L  I47N, P119PS, K122Q, I135T, K173KN, I178L, Q207E Q91P, K126S 
NV17 NV17 None None   V60I, K122N, T139R, S162G, E194ED, E224ED, E233K Q145D, L187LV, H198N, H235Y 
NV18 NV18 None None   T39K, K43Q, S48T, V60I, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207H Q85K, S191Y, D192R 
NV19 NV19 None None  K103N, Y188C I135T, T139K, G196E, R211S, F214L  
NV20 NV20 None None  V106I I47N, K49R, E53Q, D113N, K122E, I178L, T200I, F214L A114E 
NV21 NV21 None None   T39K, K43E, S48T, V60I, K122E, D123N, K126KR, I135V, S162A, K173T, Q174EK, D177E, T200A, Q207D, P243T, V245Q  
NV22 NV22 None None   V60I, D123E, I142V, S162A, Q207E K82K* 
NV23 NV23 None None  K101E, E138K R83K, D123E, I135T, G196E, I202IV, R211K, F214L, V245E  
NV24 NV24 None None   V60I, D123E, I142F, S162A, Q207E  
NV25 NV25 None None   T39N, S68SG, I135V, S162A, T165I, K173T, Q174T, D177E, I178IM, G196E, T200A, Q207E, V245Q  
NV26 NV26 None None   I178L, I244IV, V245I  
NV27 NV27 None None   I178L, I244IV, V245I  
NV28 NV28 None None   V90I, A98S, K102E, D123DG, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, D192N, T200A, Q207E, V245Q  
NV29 NV29 None None   T39R, I135T, S162C, T200E, I202V, E204D  
NV30 NV30 None None   V60I, K122Q, I142V, D177E, Q207E  
NV31 NV31 None None   V60I, V118I, I142V, S162A, Q207E R143RI, Y144YD, L149LF, P150PQ 
NV32 NV32 None None  V179VD S68G, K122E, D123N, I135T, D177E, I178V, G196Q, Q197L, T200A, E204D, R211K, V245N  
NV33 NV33 None None   K43R, V60VI, A98S, K102Q, K122E, D123G, I142IT, K173I, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207K, R211S, V241VL  
NV34 NV34 None None   E40ED, R83K, K104KR, P170PS, D177DE, I178L, T200S, F214L, P226PS, E233ED, W239WC K154N, T165S, T216TI, D218S, K220I, Q222Q*, G231GW 
NV35 NV35 None None   K49R, K122E, I135R, S162C, Q207A, R211S, V241VL  
NV36 NV36 None None   S68G, V90I, K126R, D177E, R211K, V245K  
NV37 NV37 None None  K103N T39K, K43Q, S48T, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207N T131TI 
NV38 NV38 None None   S48T, D123E, D177E, T200TA, Q207H L205S 
NV39 NV39 None None   R83K, K101R, F130FL, I135V, I178IL L120LI 
NV40 NV40 None None   K49R, K122E, I135T, E169D, I202V, R211K, F214L, V245K  
NV41 NV41 None None   V60I, K122Q, I142V, S162A, Q207E, F214FL, H235HP  
NV42 NV42 None None   K122E, D123N, R211K, V245E  
NV43 NV43 None None   V60I, K122KE, I142V, S162A, P170PS, Q207E  
NV44 NV44 None None   T39A, A98S, K122E, D123H, I178M, T200A, R211K, V245M P157PL 
NV45 NV45 None None   V90I, A98S, K102E, D123DG, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, D192N, T200A, Q207E, V245Q  
NV46 NV46 None None   V60I, K122Q, I142V, S162A, Q207E  
NV47 NV47 None None   I135V, S162C, R211K  
NV48 NV48 None None   T39TA, K82KR, R83RK, I135L, Q207QK, R211Q  
NV49 NV49 None None   I142T, I202IV, R211K, F214L  
NV50 NV50 None None   K122E, P140PT, K166KR, R211RK  
NV51 NV51 None None   I135T, Q182QH, D192DE, G196E, I202IV, R211RG, V245E C38CW, Y146N 
NV52 NV52 None None   E40EK, V60I, K122E, I142V, S162A, Q207E H235HL 
NV53 NV53 None None   V60I, D123E, I135R, I142V, S162A, Q207E  
NV54 NV54 None None   V60I, D121DH, K122P, I142V, S162A, P176PS, D177DE, T200TA, Q207E  
NV55 NV55 None None   V60I, S68G, I135T, I178M, T200A, Q207K, R211Q  
NV56 NV56 None None   V60I, K104R, I142V, S162A, E204EG, P236S E79EV, D237Y 
NV57 NV57 None None   A98AS, K122E, I135V, Q207N, R211K, F214FL, V245Q R83RS, T84TS 
NV58 NV58 None None   K49R, V60I, T107S, K122Q, F130FL, S134SN, I142V, S162A, Q207E P133PH, T139TP 
NV59 NV59 None None   D123DE, I135IT, G155GR, F214L  
NV60 NV60 None None   V118I, K122KE, I178L, V179I, G196E, I202IV, E204K, R211G, F214L  
NV61 NV61 None None   D123E, S162C, D177E, T200A, R211K, V245L  
NV62 NV62 None None   T39K, K43Q, S48T, V60I, D123E, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q Q145QR, H235HD 
NV63 NV63 None None   K49R, V60I, V118I, K122E, R125K, I135T, E169D, R211K, F214L  
NV64 NV64 None None   V60I, D121H, K122E, I135T, D177E, R211K  
NV65 NV65 None None   E53D, D123E, Y144YF, K173N, I178IM, S191F, T200A, I202V, R211K W153WC, L187S 
NV66 NV66 None None   V60I, K122E, I135T, I142IV, S162C, R211K, V245E  
NV67 NV67 None None   K122E, T165I, T200A, I202V, Q207H, R211K  
NV68 NV68 None None   K49R, R83K, T165I, T200A, I202V, Q207H, R211K  
NV69 NV69 None None   K49R, D121H, S162A, Q207E  
NV70 NV70 None None   S68G, T69N, D121H, K122E, I135T, D177E, G196Q, Q197L, T200A, E204D, R211K, P225T, V245N  
NV71 NV71 None None   V60I, I135L, K166R, Q174N  
NV72 NV72 None None   T39R, E40D, K43Q, S48T, V60I, K122E, D123E, S162A, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245Q  

Database

Resources

Team