Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Deho (2008)
Title Subtype assignment and phylogenetic analysis of HIV type 1 strains in patients from Swaziland.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 47
NumPts 47
Subtype C

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
120 120 None None   V35M, E36A, T39E, S48T, K122E, D123A, A158S, K173A, D177E, G196K, T200A, Q207N, R211K  
121 121 None None   V35T, E36A, T39D, K104R, K122E, D123S, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211K  
123 123 None None   V35R, T39E, S48T, K122E, K173T, T200A, Q207E  
124 124 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E  
125 125 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162C, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K  
126 126 None None  E138A V35T, T39E, V60I, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174R, T200A, Q207E, R211K, F214L  
127 127 None None   K20R, V35T, T39E, S48T, V60I, K104R, K122E, D123N, T200A, Q207E, R211K, F214L  
129 129 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, I135V, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
130 130 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, E138D, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
131 131 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
132 132 None None  E138A V35T, E36A, T39E, S48T, K104T, K122E, D123S, K173I, Q174K, Y183*, T200A, Q207E, R211K, F214L  
134 134 None None   V35T, T39E, K104R, K122E, D123N, T139A, Q174K, I178M, T200A, Q207E, R211K  
135 135 None None  E138A V35T, T39E, S48T, K104R, K122E, D123G, K173I, Q174K, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L  
136 136 None None   V35T, I37L, T39E, S48T, K122E, D123S, S162Y, K173T, Q174K, D177G, T200E, Q207E, R211K  
137 137 None None   V21I, V35T, T39K, S48T, W88S, V118I, K122E, D123S, E138S, K173T, Q174R, T200A, Q207E, R211K, F214L  
140 140 None None   V35T, T39E, S48T, K104R, K122E, D123S, E138S, K166R, K173T, Q174R, V179A, T200E, I202V, Q207E, R211K, F214L  
142 142 None None   P4S, K11Q, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K  
145 145 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123A, K173A, D177E, D186E, Q207A, R211K  
146 146 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, S162N, K173T, Q174K, N175Y, T200A, Q207E, R211K  
147 147 None None   V35T, E36A, T39E, K122E, D123G, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
148 148 None None   P4S, V35T, E36A, T39E, S48T, K49R, K104R, K122E, D123S, K126R, T200A, Q207E, R211K, F214L  
151 151 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, A158S, T165I, K173A, Q174K, D177E, G196E, T200A, I202V, Q207K  
152 152 None None  E138A, Y181I I31R, V35I, E36A, T39E, S48T, K104R, V118I, K122E, D123N, F130L, T131P, T139S, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K, F214L Q182K 
153 153 None None   V21I, V35T, E36A, T39E, S48T, K49R, V60I, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A  
156 156 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, S162C, T165I, K173A, D177E, G196Q, T200A, I202V, Q207E, R211K  
157 157 None None   V35A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211K  
158 158 None None   V8A, V35T, T39E, E40K, S48T, K104R, V118I, E138S, T139A, K173T, Q174K, V179I, T200A, I202V, Q207E, F214L  
159 159 None None  E138A V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, K173T, Q174K, T200A, Q207E  
161 161 None None   V35T, T39E, S48T, D121C, K122E, D123N, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L  
162 162 None None  E138A V35T, E36A, T39D, S48T, K104R, V118I, K122E, D123S, T139A, S162A, K173T, Q174K, N175Y, T200A, Q207E, F214L  
163 163 None None   K11T, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, F130L, K173A, D177E, T200A, Q207D, R211K  
165 165 None None   P4S, V8I, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207N, R211K  
166 166 None None  E138A V35T, T39E, S48T, K104R, V118I, K122E, D123S, T139V, K173I, Q174K, T200A, Q207E, R211K, F214L  
167 167 None None  E138A V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, I142V, A158S, K173A, T200A, Q207N, R211K  
169 169 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, A158S, K173A, D177E, I178M, T200A, Q207N, R211K  
17 17 None None  V179D T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, A158S, S162C, T165I, K173A, Q174K, D177E, G196K, Q197E, T200A, Q207E, R211K  
170 170 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, K173A, Q174K, D177E, T200A, E203D, Q207A, R211K  
173 173 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, I142L, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
174 174 None None   K32R, V35T, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
188 188 None None   V35T, E36AV, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, K173T, D177E, S191F, T200A, Q207K  
189 189 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, A158S, K173T, D177E, T200A, Q207D, R211K D192I 
191 191 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, A158S, L168*, K173E, D177E, T200A, Q207N, R211K I167S 
192 192 None None  E138A V35T, E36A, T39E, E40D, K104R, K122E, D123N, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K, F214L  
193 193 None None   E6K, V35T, E36A, T39E, K64R, K122E, D123G, K173A, D177E, I195M, T200A, Q207N  
2 2 None None   K22R, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, T139A, T200A, Q207E, R211K, F214L  
3 3 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, K173A, D177E, T200A, Q207D, R211K  
5 5 None None   P4H, V35T, T39E, S48T, K122E, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207E I5F 

Database

Resources

Team