Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Machado (2002)
Title Use of the sensitive/less-sensitive (detuned) EIA strategy for targeting genetic analysis of HIV-1 to recently infected blood donors.
Citation AIDS
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 31
NumPts 31
Subtype B, CRF02_AG

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
122 cdpol122 None None   K20R, K102Q, K122E, R211K  
141 cdpol141 None None  E138A K20R, V60I, K166R, I178M, V245K  
171 cdpol171 None None   I31L, S68G, K102E, K166R, Q174H, I178L D192S 
174 cdpol174 None None   R83K, D123E, Q207R, R211G  
176 cdpol176 None None   V35M, T39A, S48E, V60I, R83K, G196E, T200A, E204T, E224A  
178 cdpol178 None None   P14PQ, R83K, T107A, G196E, T200A, V245E  
183 cdpol183 None None  V108I K20R, K49R, V60I, K64R, I135T, Q174N  
184 cdpol184 None None   K122E, D177E, I178M, G196E, Q197K, R211K  
185 cdpol185 None None   V35T, E40D, V60I, V118I, D123E, D177E  
187 cdpol187 None None   A98S, D123E, D177E, G196E, V245I, D250E  
191 cdpol191 None None   I50V, V60I, R83K, K122P, D177E, V179I, G196E  
203 cdpol203 None None   T27S, R83K, D123E, D177E, T200E, R211K, V245E  
206 cdpol206 None None   E29G, V60I, D121Y, K122E, L210F  
213 cdpol213 None None   R83K, R211K, V245K H235Q 
220 cdpol220 None None   R83K, K122E, Q207R, R211K  
233 cdpol233 None None   P4S, K122E  
258 cdpol258 None None   K20R, K122E, D123N, I135T, R211K  
267 cdpol267 None None   K43Q, I50V, K102Q, K173Q P14LR, G18P 
271 cdpol271 None None   R83K, A98S, Q174R, D177E, T200A, I202V, R211S  
314 cdpol314 None None   G45E, R83K, I135T, T200A, R211K  
315 cdpol315 None None   G45E, R83K, I135T, T200A, R211K  
331 cdpol331 None None  F227I S162A, D177E, Q207E, R211K  
343 cdpol343 None None   K13N, E28G, E29G, K122E, K173E, Q174R, I178L, I202V, Q207E, R211K, V245E  
346 cdpol346 None None   D123E, I142V, T200V, R211K, V245M, P247A, E248D  
348 cdpol348 None None   R83K, K122E, D123E, T200A, Q207E, R211K  
355 cdpol355 None None  E138A V35T, T200A, R211K  
360 cdpol360 None None   R83K, V90I, D123E, D177E, R211E  
365 cdpol365 None None K70R  I50V, K122E, S162N, Q197K, Q207E, R211K, P247Q  
383 cdpol383 None None  V106I V35L, S68G, K122E, I135R, I178M, R211K, T240A, V245M L26M 
384 cdpol384 None None   V35I, R83K, K166R, I178M  
Pt1 AF314198 None None   I31L, V35T, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, Q207E, P243T, V245Q  

Database

Resources

Team