Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Brennan (2009)
Title Identification of human immunodeficiency virus type 1 non-B subtypes and antiretroviral drug-resistant strains in United States blood donors.
Citation Transfusion
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 62
NumPts 62
Subtype B, CRF01_AE, CRF02_AG


Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
084K60957 084K60957 None None   V35I, K122E, D123E, I135L, I178L, L193F, G196E, I244V, A272P, K277R, T286A, E297K, E298EK, V317A, D324E, Q334L  
A1 ARC-A1 None None   P4S, K32R, I135V, I178M, V245VM, V292VI, P294PQ  
A10 ARC-A10 None None   S48T, K122E, D123S, T200A, V245M, K281R, E291D, V292I, I293V, I329L  
A11 ARC-A11 None None   K104R, V118I, D123E, I135R, G196E, T200I, F214L, A272P, K277R, K281R, L283I, Q334K  
A12 ARC-A12 None None   E28EK, V35I, S48T, D123E, S162C, D177E, E194D, T200I, Q207A, R211E, E248D, A272P, I293V, K311R, G333E, Q334HL  
A13 ARC-A13 None None   E44D, S68G, V118I, I135V, K166R, E169G, K173KR, I178IM, G196E, Q207E, R211K, F214L, V245E, A272P, K277R, L283I, V292I, I293V, D324A  
A14 ARC-A14 None None   K49KR, R83K, R211K, A272P, I329L W153W* 
A15 ARC-A15 None None   V60I, K104R, K122KR, D123E, D177E, T200A, R211K, F214L, V245I, E248D, A272P, K281KR, T286A, E297EK  
A16 ARC-A16 None None T215C  K20R, V21VI, V35T, V60I, K122E, I178L, T200A, Q207A, R211T, D250E, I293V  
A17 ARC-A17 None None   E36EK, E44EK, R72RK, D121DN, D123E, D192DN, R211K, V245A, E248D, K277R, T286A, E297K, E298EK, I326V W71W*, V148VM 
A18 ARC-A18 None None   V35M, V60VI, R83K, K103R, T200A, R211K, V245T, D250E, K277R, K281R, L283I, I293V, S322A  
A19 ARC-A19 None None   S48T, K122E, D123S, G196E, Q197K, V245I, D250E, K281R, I293V, E297K  
A2 ARC-A2 None None   V35L, R83K, G196E, R211K, V245M, D250S, T286A, E297K, S322T, G333E, Q334H  
A20 ARC-A20 None None   V21I, K32KN, V35I, V60I, K101Q, K103R, I135KR, A158AS, S162SC, S163ST, T165TI, K173E, D177E, R211K, V245KM, D250E, A272P, K277R, I293V, I326V  
A21 ARC-A21 None None   R83K, K122E, D123E, K166KR, E169D, G196E, T200A, A272P, K275Q, V276I, K277R, T286A, A288AS, I293V, E297K, D324DE  
A22 ARC-A22 None None   A98S, K122E, I142V, T165I, T200I, R211K, V245E, K281R, I329V, Q334H  
A23 ARC-A23 None None   A98S, K101R, I135T, K166T, K277R, T286A, D324E  
A24 ARC-A24 None None M41L, D67N, V75M, M184V, L210W, T215Y, K219KN A98G K20R, V21I, V35I, T39A, K43Q, E44D, V60I, V90VI, K102R, V118VI, D123E, I135T, S162C, G196E, E203K, H208Y, R211K, K223E, A272P, K277R, A288AS, I293V, E297A, K311KR, I329V, Q334E  
A25 ARC-A25 None None   E6D, E28A, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I135T, I142N, K173I, Q174K, D177E, I178M, I202V, Q207A, R211S, V245E, K249Q, V276VI, T286A, A288T, E291D, V292I, I293V, K311R, E312T, I326V, I329V Y144N 
A26 ARC-A26 None None   I135T, R211K, F214L, A272P, K281R, L283I, R284K, I293V, P294Q, E297K, K311R, I329L, Q334Y  
A27 ARC-A27 None None   V35M, T39A, Q174QK, I178M, R211K, P243H, V245Q, A272P, K277R, I293V, G333E  
A28 ARC-A28 None None   K20R, V60I, D123E, I135T, T200I, Q207A, R211K, Q278QH, T286A, A288S, I293V, E297R, I329L, Q334K  
A29 ARC-A29 None None   R83K, E89EK, S162A, Q207E, R211K, V245K, A272PS, T286A, E297K, R307S, V317A, I329V, G333GE  
A3 ARC-A3 None None   V35T, E36D, V60VI, V90I, K122KR, I135V, S162A, K173IV, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K, P243T, V245Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, S322T  
A30 ARC-A30 None None   A98S, D123E, I135T, D177E, V189A, T200A, R211K, K223R, A272P, K277R, P294T, K311R, D324E, I329L  
A31 ARC-A31 None None   K20R, K49R, I50V, V60I, I135T, S162SN, K166R, E169D, Q197E, T200TA, R211RK, A272AT, V276VI, K277R, I293V, P294T, D324E  
A32 ARC-A32 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, I142V, K173I, Q174K, V179I, I202IV, Q207A, L210LM, R211S, K238R, V245E, L283I, E291D, V292I, I293V, A304E, E312T, I326V, I329V  
A33 ARC-A33 None None   P9PT, V10A, T39TS, K82KR, K102Q, K122P, D177EK, S251V, A272P, K277KR, T286A, I293IV  
A34 ARC-A34 None None   K103R, K122E, D123DN, I135T, I202V, F214L, A272P, T286A, V292I, E297KR, I326V  
A36 ARC-A36 None None   R83K, I135V, R211K, V245L, V276I, V317A  
A37 ARC-A37 None None   D121Y, K122E, I135T, S162A, D177E, E248D, K277KN, K281R, T286A, P294T, D324E  
A38 ARC-A38 None None   K32KR, V35T, K122E, D123E, I135R, Q207E, R211K, V245M, E248D, D250E, S251SG, A272P, K277R, T286A, S322L, Q334H P97T 
A39 ARC-A39 None None   I135V, I142V, T165I, G196E, V245Q, D250E, I257L, I293V, K311R  
A4 ARC-A4 None None   K43R, R83K, D123E, K166R, K173KR, Q207K, A272P, I293V, E297A, V317A  
A40 ARC-A40 None None  V106I V21I, F87L, K101A, V118VI, D121H, K122E, V148VG, S162A, D177E, I202IT, R211T, F214L, A272P, R284K, I293V, E298EK, A299AT, I329L  
A41 ARC-A41 None None   I5V, R83K, I135T, S162C, S163T, K173T, D177DN, I178M, T200A, R211T, A272S, K281R, T296S, E297A, V317A, I326V  
A43 ARC-A43 None None   D123E, I135V, S162C, G196E, P243S, V245E, A272P, K277R, I293V, E297K  
A44 ARC-A44 None None   V35I, R83RK, K122KE, A158AS, S162SN, K166R, D177E, I178M, V241I, D250E, A272S, K277R, V292I, I293V, D324E, G333E, Q334H  
A45 ARC-A45 None None   V21VI, E40D, K122E, D123E, K173E, D177E, I178V, I202V, A272P, E291ED, I293V, P294X, V317A  
A46 ARC-A46 None None   R83K, K122E, I178M, V245VM, S251X, Q334R  
A5 ARC-A5 None None   R83K, R211K, V245K, W252*, K281R, T286A, Q334H  
A6 ARC-A6 None None   V35I, R83K, D86E, K122E, I135V, K173KQ, R211RK, V245VM, E248X, A272AP, T286A, E297K, E298EK  
A7 ARC-A7 None None   S48T, K102Q, K122E, D123X, S162C, E203D, V245IM, A272P, K277R, T286A, I293V, S322SA Q334Q* 
A9 ARC-A9 None None   K49KR, I135T, S162SN, K166R, D177EK, I178M, V245M, A272P, E291D, K311KR, I329L, G333E  
N1 ARC-N1 None None   T27S, I135T, S162C, I195L, E248D, A272P, T286A, V317A, Q334N  
N10 ARC-N10 None None T215I  K32R, A98S, D121DN, R172RK, Q197E, R211K, V245Q, L246LV, T286A, P294T, K311R, I326T, Q334L  
N11 ARC-N11 None None   S48T, K64KR, K122E, I142T, Q207H, R211K, V292I, P294S, E312A, I329V  
N12 ARC-N12 None None   V35T, K49KR, V60I, D123E, I135T, S162A, E169EG, D177E, I202V, R211K, V245E, E248N, A272P, I293V  
N13 ARC-N13 None None   V60VI, D121H, K122E, D123DE, I135T, D177EK, I178IM, V179VI, I202V, R206RK, Q207E, R211K, V245Q, A272P, I293V, D324DE, I329L K259KQ 
N14 ARC-N14 None None   K11R, V60I, K122E, D123E, I135T, V189I, T200K, E204K, F214L, D250N, A272P, V276I, K281R, V292I, I293V, E297K  
N15 ARC-N15 None None   I5T, K173Q, N175H, I180V, T200I, R211K, F214L, A272P, K277R  
N17 ARC-N17 None None   T39A, T139L, I142V, Q145V, S162C, E169D, G196E, T200A, R211G, E248S, A272P, A288S, Q334H  
N18 ARC-N18 None None   K49R, K122E, I135T, E169D, V189I, Q207E, R211K, P243S, A272P, I293V, I329L  
N19 ARC-N19 None None   K11R, T39A, S48E, D123E, S162C, T200TI, Q207K, K277R, T286A, V317A, D324E, I326V  
N2 ARC-N2 None None   D121H, K122E, I135T, D177E, T200A, E204D, Q207E, I244V, V245M, A272P, L283I, S322T, I329L  
N3 ARC-N3 None None  Y188YH E29EK, T58S, I135L, K173E, E204EK, R206RK, R211K, V241I, A272P, K277R, E297T, I329L N175K 
N4 ARC-N4 None None   I142T, S162A, V245K, D250E, A272P, K277R, T286A, I326V  
N5 ARC-N5 None None   K20R, V35I, R83K, K122E, T139A, S162Y, T200A, I202V, R211K  
N6 ARC-N6 None None   T39S, K122P, I135T, I142V, K173E, V245I, D250N, A272P, I293V, Q334Y  
N7 ARC-N7 None None   I135T, S162C, T200A, R211K, V245Q, A288S, I293V, P294Q, I326L, E328D  
N8 ARC-N8 None None   K49R, R83K, K122E, T200A, E248D, K277R, K281R  
N9 ARC-N9 None None   D121DN, K122E, D123N, I135T, I202V, R211K, E248N, A272P, K323KE, I326V, Q334E