Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Sirivichayakul (2008)
Title HIV drug resistance transmission threshold survey in Bangkok, Thailand.
Citation Antivir Ther
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 84
NumPts 84
Subtype CRF01_AE, B, CRF02_AG

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
BED-1 BED-1RT None None   V35T, T39K, K43E, K101R, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, E203D, Q207A, R211S, K238R  
BED-10 BED-10RT None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E, L246M  
BED-11 BED-11RT None None   V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, V245E  
BED-12 BED-12RT None None  V106I V118I, K122E, I135T, E169D, N175H, R211S, F214L T27G 
BED-15 BED-15RT None None   V21I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135R, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S  
BED-18 BED-18RT None None   V35I, I135V, S162C, Q207H, R211K, V245L  
BED-19 BED-19RT None None   K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
BED-2 BED-2RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, G196T, Q207A, R211N, V245E  
BED-20 BED-20RT None None   K122Q, I135L, K166R, K173T, D177E, I178M, T200A, R211S, V245E  
BED-21 BED-21RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, T200V, Q207A, R211S, K238R  
BED-22 BED-22RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E Q23R 
BED-23 BED-23RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245K  
BED-25 BED-25RT None None   E28A, E29K, V35T, T39R, D123N, S162C, K173R, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, V245E, S251R  
BED-26 BED-26RT None None   V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
BED-28 BED-28RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
BED-29 BED-29RT None None   K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
BED-3 BED-3RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, G196E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
BED-31 BED-31RT None None   V35T, T39K, K43E, K102Q, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, V189I, T200I, Q207A, R211S, V245E, K249Q, S251R  
BED-32 BED-32RT None None   V35T, T39K, V60I, K122E, D123S, T165I, K173I, Q174K, T200I, I202V, Q207A, R211S, V245E  
BED-33 BED-33RT None None   E42K, V60I, S68G, K122E, D123N, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245E  
BED-34 BED-34RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, E248V V241C 
BED-36 BED-36RT None None   V35T, T39K, V60I, K122E, D123S, T165I, K173I, Q174K, T200I, I202V, Q207A, R211S  
BED-37 BED-37RT None None   K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178V, T200I, Q207A, R211S, K238R  
BED-38 BED-38RT None None K219N E138A V35T, T39K, K49E, V60I, S68G, K122E, D123S, I142T, K173R, Q174K, V179I, G196E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
BED-39 BED-39RT None None  K238N K103R, V118I, K122E, I135T, S162C, R211S, F214L H235Y 
BED-4 BED-4RT None None   K103R, V118I, K122E, I135T, S162C, R211S, F214L, P236L, V245E  
BED-40 BED-40RT None None   V35T, V60I, D121H, K122E, D177E, T200I, R211K  
BED-41 BED-41RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E  
BED-42 BED-42RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E Q23R 
BED-44 BED-44RT None None   T39Q, K43E, K64R, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, D192N, T200A, Q207A, L210F, R211S, V245E  
BED-48 BED-48RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245K, L246V  
BED-49 BED-49RT None None   V35T, T39K, K43E, K102E, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, V179T, I202V, Q207A, L210M, R211S, F214L, D237E, V245E I244D 
BED-5 BED-5RT None None   V35T, T39K, M41T, K43E, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245D I63T 
BED-50 BED-50RT None None  V179E R83K, K102Q, K166R, R211Q  
BED-6 BED-6RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R  
BED-7 BED-7RT None None   K122E, D123S, I135L, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, G196E, Q207A P236Q 
BED-8 BED-8RT None None   I142T  
BED-9 BED-9RT None None   V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, H221Q  
NBC-1 NBC-1RT None None   V35T, V60I, D121H, K122E, D123N, D177E, T200I, R211K  
NBC-10 NBC-10RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NBC-11 NBC-11RT None None   V35T, E40D, K122E, D123S, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NBC-12 NBC-12RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173L, Q174K, Q207A, R211S, K238R, V245E V21N 
NBC-13 NBC-13RT None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, V245K  
NBC-14 NBC-14RT None None   V35T, T39K, K43E, V111I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, V179A, T200I, I202V, Q207D, R211S, K238R, V245E, D250E, S251H  
NBC-15 NBC-15RT None None  V106I V35T, T39K, K43E, D121Y, K122E, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NBC-16 NBC-16RT None None   V35T, T39K, K43Q, T69S, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178V, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E, S251R  
NBC-17 NBC-17RT None None   K20R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, Q174E, Q207A, R211K, K238R, V245E, E248D  
NBC-18 NBC-18RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NBC-19 NBC-19RT None None  V106I T107S, K122E, I135V, S162C, F171Y, K173E, Q174K  
NBC-2 NBC-2RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245K  
NBC-20 NBC-20RT None None   R83K, D123E, I142T, K166R, G196E, L210F W252C 
NBC-21 NBC-21RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NBC-22 NBC-22RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162T, K173I, Q174K, D177E, I178V, E194D, T200A, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NBC-23 NBC-23RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178V, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NBC-24 NBC-24RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245A  
NBC-25 NBC-25RT None None   V35T, E36D, T39R, D123E, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q  
NBC-26 NBC-26RT None None   D123E, I135T, K173E, D177E, T200I, K238R  
NBC-27 NBC-27RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135R, K173L, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NBC-28 NBC-28RT None None   V35T, T39K, K43A, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207E, R211S, K238R, V245E  
NBC-29 NBC-29RT None None   V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NBC-3 NBC-3RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245K  
NBC-30 NBC-30RT None None   V35T, T39K, V60I, K122E, D123S, T165I, K173T, Q174K, D177E, T200I, I202V, Q207A, R211S, V245E V118E, I135G 
NBC-31 NBC-31RT None None   K22R, V35T, T39K, K43E, K102R, D123E, K173V, Q174N, D177E, V179T, T200A, Q207A, R211K, K238R, V245E, E248D  
NBC-32 NBC-32RT None None   L34F, V35L, K103R, V118I, D121Y, K122E, I135T, S162C, E169D, D177E, R211S, F214L, K238R  
NBC-33 NBC-33RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, E203D, Q207A, R211S, K238R, S251H  
NBC-34 NBC-34RT None None   V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211N, K238R, V245E  
NBC-35 NBC-35RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NBC-36 NBC-36RT None None   V35T, T39E, K122E, D123N, I135R, S162C, K173M, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NBC-37 NBC-37RT None None   V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, P236H, K238R, Q242R, V245E  
NBC-38 NBC-38RT None None   V35T, T39N, V60I, K122E, D123S, K173I, Q174K, G196E, T200A, I202V, Q207A, R211S, D237E, K238R H235R 
NBC-39 NBC-39RT None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, S162N, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, E224D  
NBC-4 NBC-4RT None None   V35T, V60I, D121H, K122E, D177E, T200I, R211K  
NBC-40 NBC-40RT None None   I135V, S162C, V245E  
NBC-41 NBC-41RT None None  V179D V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178V, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NBC-44 NBC-44RT None None   V35T, T39A, I135V, S162C, V245M  
NBC-45 NBC-45RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, S251R  
NBC-47 NBC-47RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I135T, K166R, K173I, Q174K, I178V, V179I, T200I, Q207A, K238R, V245Q  
NBC-49 NBC-49RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135V, S162C, K173I, Q174K, D177E, E203G, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NBC-5 NBC-5RT None None   V35T, V60I, K104R, K122E, I135T, I142V, E169D, T200E, K238I I202K 
NBC-50 NBC-50RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245E  
NBC-6 NBC-6RT None None   V35T, T39K, K43E, D121H, K122E, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207G, R211S, K238R, I244V, V245E  
NBC-7 NBC-7RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E, E248D  
NBC-8 NBC-8RT None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NBC-9 NBC-9RT None None   V35T, E40D, K122E, D123N, I142V, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S  

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