Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Ishizaki (2009)
Title Profile of HIV type 1 infection and genotypic resistance mutations to antiretroviral drugs in treatment-naive HIV type 1-infected individuals in Hai Phong, Viet Nam.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 271
NumPts 271
Subtype CRF01_AE, CRF07_BC, B

 
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Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 271 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
A2_101 A2_101 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177G, Q207R, R211S, K238R, V245K  
A2_103 A2_103t None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207N, R211S, K238R, V245E  
A2_114 A2_114gaa None None   E6D, V35T, T39K, V60I, T107S, K122E, D123S, I132L, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_122 A2_122 None None   E6D, K11T, V35A, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, E224K, K238R, V245E  
A2_129 A2_129 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, Q207G, R211S, V245K  
A2_135 A2_135a None None   E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_145 A2_145t None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123N, I142V, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207N, R211S, K238R, V245E  
A2_154 A2_154 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43Q, K122E, D123S, L149P, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E P150A, I257M 
A2_157 A2_157a None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K101R, K122E, D123S, I132L, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E, V254I  
A2_162 A2_162 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_164 A2_164t None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43Q, D121H, K122E, D123S, I132L, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207N, R211S, K238R, V245E  
A2_168 A2_168ta None None   E6D, K11T, V35T, E36D, T39N, K122E, D123S, Y127X, S162C, K173V, Q174K, D177E, E203D, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_174 A2_174ta None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_177 A2_177 None None  V106I E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211N, V245E  
A2_178 A2_178 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, S68G, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_179 A2_179 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_187 A2_187 None None   E6D, K20R, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207G, R211S, K238R, V245E  
A2_188 A2_188t None None   E6D, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173V, Q174K, T200Q, K201R, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_190 A2_190aagg None None   E6D, K11T, V35T, K122E, D123N, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211G, K238R, V245E  
A2_191 A2_191 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207K, R211S, K238R, V245E  
A2_195 A2_195 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E, K249R  
A2_20 A2_20 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E, N265I F61L 
A2_200 A2_200aag None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
A2_206 A2_206 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_211 A2_211 None None   E6D, V35T, T69S, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211T, K238R, V245E, K249R  
A2_215 A2_215 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, I135T, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E T128P 
A2_22 A2_22tc None None  K103N E6D, K11T, V35T, K122E, D123N, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207G, R211S  
A2_223 A2_223 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_225 A2_225 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_231 A2_231 None None   E6D, K11T, V35T, T39S, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174N, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S, V245E Q258E 
A2_232 A2_232 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_236 A2_236aa None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207S, R211S, E224D, K238R, V245E  
A2_239 A2_239c None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_241 A2_241g None None  V106I E6D, K11T, V35I, T39E, T107S, K122E, D123S, I132L, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S, V245E  
A2_243 A2_243a None None  V179D E6D, V35T, T39K, V90I, V111I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E, P247L  
A2_245 A2_245g None None   E6D, V35R, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
A2_263 A2_263 None None   E6D, K11T, E28K, K32E, V35T, T39K, E40D, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E, I257V  
A2_264 A2_264 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, V245E  
A2_275 A2_275 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_281 A2_281t None None   E6D, K11T, V35T, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174N, D177E, T200V, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_285 A2_285 None None   E6D, K11T, V35T, T39Q, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207N, R211S, K238R  
A2_294 A2_294a None None  V179D E6D, K11T, V35T, T39K, V111I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211S, K238R, V245E  
A2_314 A2_314g None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43Q, K102Q, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S, V245E, Q258R V75G 
A2_323 A2_323 None None   E6D, K11T, V21I, V35T, T39K, V111I, K122E, D123S, K173M, Q174K, D177E, V189I, Q207N, R211S, K238R, V245E  
A2_324 A2_324 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_326 A2_326 None None   E6D, K11T, V35M, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200I, I202V, Q207S, R211S  
A2_336 A2_336 None None   E6D, V35T, T39N, D121H, K122E, I142V, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_340 A2_340 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K102E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S  
A2_345 A2_345t None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123N, S162C, K173M, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_349 A2_349aaat None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, I142V, S162C, K173T, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_362 A2_362a None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, V245E  
A2_365 A2_365 None None   E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200R, Q207S, R211S, V245E  
A2_374 A2_374a None None   V8I, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E, Q258R, K259E, L260I V261S, L264T, W266F 
A2_376 A2_376 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207G, R211S  
A2_383 A2_383 None None   E6D, K11A, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207D, V245E  
A2_387 A2_387 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43Q, K102Q, K122E, D123K, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_389 A2_389 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207N, R211S, K238R, V245E  
A2_395 A2_395 None None  V106I E6D, K11T, V35T, T39Q, T107S, V118I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_398 A2_398 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211N, K238R, V245E  
A2_399 A2_399g None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, G196K, T200A, Q207S, R211S  
A2_41 A2_41 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, K126R, I142V, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_418 A2_418c None None   E6D, K11T, V35T, T39N, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_419 A2_419 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K102Q, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207N, R211S, K238R, V245E  
A2_420 A2_420a None None   E6D, K11T, V35T, T39E, D121H, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_422 A2_422aag None None   E6D, V35T, E36K, T39K, K122E, D123S, S162C, K173A, Q174N, D177E, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_424 A2_424 None None  V106I E6D, K11T, V35T, T39L, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200E, I202V, Q207K, R211S, P236S, K238R, V245E  
A2_425 A2_425gag None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207N, R211K, K238R, V245E, E248D  
A2_426 A2_426 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207G, R211S, K238R, V245E  
A2_441 A2_441 None None   E6D, V35T, T39N, K122E, D123S, I135T, I142V, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207N, L210M, R211S, K238R, V245E  
A2_51 A2_51g None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S  
A2_56 A2_56tt None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207S, R211S, V245E  
A2_58 A2_58a None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207S, R211S  
A2_61 A2_61c None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S  
A2_67 A2_67 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S, K238R  
A2_84 A2_84ca None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E  
A2_89 A2_89g None None   E6N, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E Y144C 
A2_92 A2_92 None None   K11T, V35T, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S  
C11 C11g None None   E6D, V35T, T39N, T69S, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R  
C14 C14 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
C15 C15 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, V245E  
C16 C16g None None   E6D, K11T, V35T, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V189I, Q207S, R211S, V245E  
C19 C19 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E  
C2 C2g None None   E6D, K20R, V35T, T39G, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207N, R211S, K238R, V245E  
C20 C20c None None   E6D, K11T, V35T, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, V245E  
C22 C22a None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
C25 C25 None None   K11T, K20R, V35T, T39N, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S  
C29 C29 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174R, D177E, I178M, Q207N, R211S, K238R, V245E  
C39 C39 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173V, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E  
C42 C42g None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, Q145H, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E  
C47 C47a None None   E6D, K11T, V35T, T39K, D123N, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179A, Q207S, R211S, K238R, V245E, S251I S191Y 
C51 C51g None None   V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211S, K238R, V245E, K249R  
C58 C58a None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162Y, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E, E248D  
C68 C68 None None   I5V, V35T, T39N, K122E, D123S, I135R, I142V, S162C, K173R, Q174K, I178M, G196E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
C78 C78ca None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207N, R211S, V245E  
C80 C80aag None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245Q  
C89 C89ag None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E  
C9 C9g None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173V, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E, K249R  
C95 C95a None None   E6D, K11T, D17G, V35T, T39K, K102R, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207S, R211S, K238R, V245E, D256E  
E14 E14g None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, I195T, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
E33 E33 None None   K11R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V189I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  

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