Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author McNulty (2007)
Title Evaluation of dried blood spots for human immunodeficiency virus type 1 drug resistance testing.
Citation J Clin Microbiol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 48
NumPts 24
Subtype CRF02_AG, A, CRF11_cpx, F, A + G

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
Cam10 Cam10PL None None   E6T, V35T, E36D, T39K, K43E, S48T, K49R, A62P, D123K, R125X, I135L, S162A, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207E M16MR, K122M, F124T, Y127N 
  Cam10DBS None None   E6T, V35T, E36D, T39K, K43E, K49R, K122E, D123N, I135LMV, N136X, R143RS, S162A, K173V, Q174K, D177E, T200X, K201X, E203X, E204K, Q207E, E224ED, E233EK, V245Q M230MKT, Y232YN, H235HL 
Cam11 Cam11PL None None   E6K, K11T, V35T, D121Y, K122E, I135T, E169X, K173S, D177E, Q207K, R211S, G231X  
  Cam11DBS None None   E6K, K11T, V35T, D121Y, K122E, I135T, K173S, D177E, Q207K, R211S, L234X E204E* 
Cam12 Cam12PL None None   V10A, V35T, V60I, V90I, I135V, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E K154KN 
  Cam12DBS None None   V8VG, V10A, K22KN, V35T, V60I, V90I, I135V, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E W71WS 
Cam16 Cam16PL None None   V35T, E36D, T39L, I135V, S162A, T165I, K173T, Q174K, D177DE, T200A, Q207E, R211K, V245Q E89ED, Q151QH 
  Cam16DBS None None   V35T, E36D, T39L, D86DE, I135IV, S162A, T165I, K173T, Q174K, D177E, T200A, L205LF, Q207E, R211K, V245Q  
Cam20 Cam20PL None None   K11A, V35M, T39K, K64X, D121Y, K122E, D123G, E169D, K173A, Q174K, D177E, G196E, Q207A, R211S  
  Cam20DBS None None M184MLV  K11A, V35M, T39K, K64R, D121Y, K122E, D123G, E169D, K173A, Q174K, D177E, Y188X, S191T, E194X, G196E, Q197QH, R199K, Q207A, H208X, R211X, Q222QH, L228X V189DE 
Cam23 Cam23PL None None   V35T, E36D, K49R, V60I, V90I, K104R, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
  Cam23DBS None None   V35T, E36D, K49R, V60I, V90I, K104R, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
Cam24 Cam24PL None None   K11T, V35T, T39N, K122P, S162A, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207E, V245Q  
  Cam24DBS None None D67DE  K11T, V35T, T39N, S68SR, K122P, S162A, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207E, V245Q Y56Y* 
Cam25 Cam25PL None None   V35T, E40D, I135V, S162A, K173X, Q174E, D177E, T200A, Q207E, V245K L168LIV 
  Cam25DBS None None   V35T, E40D, I135V, S162A, K173X, Q174E, D177E, T200A, Q207E, V245K L168LIV 
Cam26 Cam26PL None None   V35T, T39M, V60I, D121Y, K122E, I135T, I142V, S162A, K173A, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207D F116FC, L120V 
  Cam26DBS None None   V35T, T39M, V60I, D121Y, K122E, I135T, I142V, S162A, K173A, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207D  
Cam27 Cam27PL None None   V35T, E36D, D123E, I135IV, S162A, K173T, Q174KR, D177E, G196E, T200A, Q207G, R211E, V245Q  
  Cam27DBS None None   V35T, E36D, K43KN, D123E, S162A, K173AT, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207G, R211K, V245Q  
Cam28 Cam28PL None None  M230I V35T, S48T, V60I, L109LIV, D113X, Y115X, I135V, S162A, K173T, Q174G, D177E, G196E, T200A, E203X, Q207X, R211K, K220KN, E233K, H235X D17D_MD, D123D_L, I167IM, L234V 
  Cam28DBS None None   V35T, E40ED, S48T, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174G, D177E, G196E, T200A, Q207QH, R211K S117SF, I159IM, I167IM, L187LIV 
Cam29 Cam29PL None None   E6D, K11Q, V35T, T84X, S105SL, K122E, D123N, K173T, D177E, T200E, I202V, Q207S, R211K, F214L, P243T, V245Q I94N, P95T 
  Cam29DBS None None   E6D, K11Q, V35T, K122E, D123N, K173T, D177E, T200E, I202V, Q207S, R211K, F214L, P243T, V245Q  
Cam30 Cam30PL None None   V35T, T39L, D121A, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, G196E, T200A, K201R, Q207E, V245Q  
  Cam30DBS None None   V35T, T39L, D121A, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, G196E, T200A, K201R, Q207E, V245Q  
Cam32 Cam32PL None None   E6N, V8I, K11T, V35T, E40D, V118I, D121H, K122E, D123S, I142V, F171Y, K173S, D177E, I202V, Q207A, R211S, F214L  
  Cam32DBS None None   E6N, V8I, K11T, V35T, E40D, V118I, D121H, K122E, D123S, I142V, F171Y, K173S, D177E, I202V, Q207A, R211S, F214L  
Cam33 Cam33PL None None   V35T, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M  
  Cam33DBS None None   V35T, T39N, E40D, V60I, K104R, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M  
Cam35 Cam35PL None None   V35T, T39N, E40D, V60I, K104R, K122E, D123S, I135T, I142V, K173A, T200TA, Q207E, R211K, V245Q  
  Cam35DBS None None   V35T, E36D, K49R, V60I, V90VI, K104R, K122E, D123S, I135T, I142V, K173A, D177DE, T200TA, Q207E, R211K, V245Q  
Cam36 Cam36PL None None   P14L, V35T, K122E, D123N, I135V, S162A, K173IT, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, Q242QH, V245Q  
  Cam36DBS None None   V35T, K104KR, K122E, D123N, I135V, S162A, K173IT, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
Cam37 Cam37PL None None   V35T, E36D, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, L210LF, V245Q  
  Cam37DBS None None   V35T, E36D, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245Q  
Cam38 Cam38PL None None   V35T, K64KR, D121H, K122Q, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245K  
  Cam38DBS None None   V35T, K64KR, F116X, D121H, K122Q, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245K  
Cam39 Cam39PL None None   V35T, E36D, V60I, D123X, Q145QH, S162A, K173T, Q174K, D177E, Q207E, R211K, V245Q R199RS 
  Cam39DBS None None   V35T, E36D, T39K, V60I, V118X, P119X, D121N, K122R, D123T, F124X, R125X, S162A, K173T, Q174K, D177E, Q207E, R211K, V245Q K66KRT, Y127D 
Cam4 Cam4PL None None   V35T, E36D, T39L, K122X, D123S, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
  Cam4dbs None None   V35T, E36D, T39L, K122E, D123S, S162A, E169ED, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, L210LMV, R211X, P226X K20KN, D76DE 
Cam40 Cam40PL None None  E138A K32R, V35T, E36D, T39L, E40ED, K64X, P95X, K102KN, I135V, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, I178IM, T200A, Q207E, F214L R78RS 
  Cam40DBS None None  E138A K32R, V35T, E36D, T39L, K64KR, D86DE, I135ILV, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, I178IM, T200A, Q207E, F214L F77C, P97A 
Cam5 Cam5PL None None  H221Y E6D, V35T, T39L, S162C, K173T, Q174N, D177E, T200E, I202V, Q207G, P243A, V245Q  
  Cam5DBS None None  H221Y E6D, V35T, T39L, S162C, K173T, Q174N, D177E, T200E, I202V, Q207G, P243A, V245Q  
Cam8 Cam8PL None None   K32I, V35T, T39K, R83K, E169D, K173A, Q174K, T200E, I202V, R211A, V245Q Y146Y* 
  Cam8DBS None None   L12LF, V35T, E36ED, T39K, E79ED, R83K, V108X, E169D, K173A, Q174K, G196E, T200X, I202V, R211A, V245Q F160FL, I167IM 

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