Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Brumme (2007)
Title Evidence of differential HLA class I-mediated viral evolution in functional and accessory/regulatory genes of HIV-1.
Citation PLoS Pathog
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 824
NumPts 824
Subtype B, C, A, D, CRF01_AE, K, CRF10_CD, G


  Page 1 of 9    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 824 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
1064 RT_1064 None None   I50V, S68G, T69N, K122E, D123S, D177E, R211K  
1065 RT_1065 None None K65KN  D76DN, T200A, R211E  
1066 RT_1066 None None K65KN  L100LF, D123E, R125RG, I132IV, P133PL, T139TK, I142IV, I178M, G196E, Q207L, R211K N136ND, R143RG 
1067 RT_1067 None None   K122KE, T165TI, T200TA, Q207N, R211K  
1068 RT_1068 None None   D123E, S162C, K173E, R211HQ  
1069 RT_1069 None None K65KN  V35AT, E44D, D123E, T165I, D177E, T200I, R211K, F214L  
1070 RT_1070 None None   K49R, D123E, I135IT, S162C  
1071 RT_1071 None None   T69TP, K102KR, K173KE, I202V  
1072 RT_1072 None None   V60I, R83K, I135V, R211K M230MV 
1073 RT_1073 None None   V35I, R83K, V90I, Q207A, R211K  
1074 RT_1074 None None   R83K, K104R, N175H, Q207K, R211Q  
1075 RT_1075 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, D121DY, K122E, I159IV, D177E, T200I, Q207G, R211K  
1076 RT_1076 None None   I135R, S162C, R211K L149LF 
1077 RT_1077 None None   T39TA, K49R, D123E, K126R, I135T, Q151QR, S162C, R211K  
1078 RT_1078 None None   S162C, T200A  
1079 RT_1079 None None   V60VI, K122E, I135T, S162C, G196E, T200TI  
1080 RT_1080 None None K65KN  E169EK, K173E, R211RK  
1081 RT_1081 None None   V60I, S68G, D123E, I135T, I142IV, S162C, K173R, V189I, T200A, Q207E, R211K  
1082 RT_1082 None None K65KN  N175Y, T200A, E203D  
1083 RT_1083 None None   T58TI, D121H, I135KT, S162C, D177E, I178M T84TI 
1084 RT_1084 None None   D123E, S162C, D177E, R211RK  
1085 RT_1085 None None   D177E, I178IM, V179X, G196E, Q197K, T200A, K201KIT, E204ED, Q207K, R211RK  
1086 RT_1086 None None M184V  V35I, R83K, K122R, I135T, D177E, I178M, T200E, Q207H, R211K  
1087 RT_1087 None None   V35I, R83K, I142M L149LF 
1088 RT_1088 None None   K104Q, K122E  
1089 RT_1089 None None   V35I, S48T, I63IV, A98S, T200A  
1090 RT_1090 None None M41L, T215C  I135T  
1091 RT_1091 None None   D123E, I135T, K166R, R211K  
1092 RT_1092 None None  L100LV D121H, K122E, I135K, E169D, K173E, T200A, R211Q  
1093 RT_1093 None None   V35I, K49R, I142V, E169D, Q207R  
1094 RT_1094 None None   V60I, R83K, D123E, D177E, T200A, R211K  
1095 RT_1095 None None   I135T, S162C Q151QE 
1096 RT_1096 None None   D123E, R125RG, I135M, S162C  
1097 RT_1097 None None   I135R, S162C, R211K, F214L L149LF 
1098 RT_1098 None None   K122E, S162C, T200I, R211K  
1099 RT_1099 None None   D123E, R143RS, S162C, E169D, E204D, R211EK  
1100 RT_1100 None None   V35I, R83K, I135T, R211K  
1101 RT_1101 None None  V106I V35T, K49R, V60I, K122E, D177E, I178M, T200A, Q207G, H208Y, R211K L149LF 
1102 RT_1102 None None   D86E, T107S, D121H, K122E, Q151QR, S162C, D177E  
1103 RT_1103 None None   T39A, I50V, R83K, K122KE, I135T, S162C, R211K  
1104 RT_1104 None None   K104R, D123E  
1105 RT_1105 None None   I135T, N147NK, S162C, R211G, F214L  
1106 RT_1106 None None   K102R, G141X, R143S, S162C, I178L, Q207R, R211T  
1107 RT_1107 None None   V35L, W88C, K122E, G141X, R143S, T200A, I202V, R211K, F214L  
1108 RT_1108 None None   V35I, R83K, D123E, I135V, G141X, R143S, I178L  
1109 RT_1109 None None   V35I, I135T, E169D, G196GE, T200A, I202IV, R211KT, F214L  
1110 RT_1110 None None   D123E, I135V, G141X, R143S, S162C, T200A  
1111 RT_1111 None None   S68G, K122A, K166R, P176PT, D177DE, I178IV, G196E, F227FS  
1112 RT_1112 None None   K122E, D123S, I135T, S162C, R211K  
1113 RT_1113 None None   T200A, R211K  
1114 RT_1114 None None   D123N, I135T, S162C, R211S  
1115 RT_1115 None None   V60I, I135V, S162C, R211G  
1116 RT_1116 None None   D123E, I142T, V179VI, G196E, R211K  
1117 RT_1117 None None K70R, M184V  K49R, V60I, S68G, I142X, R143X, Y144X, T165L, E169D, T200E, I202V, Q207G D67I 
1118 RT_1118 None None   V60I, S68G, G141X, R143S, K166R, R211K  
1119 RT_1119 None None   D121Y, K122E, G141X, R143S, S162C, I178L, R211K  
1120 RT_1120 None None   V35I, D123E, I135T, G141X, R143S, F214L  
1121 RT_1121 None None   K122E, D123E, G141X, R143S, S162C, E204A, Q207E, R211K  
1122 RT_1122 None None   I31V, G141X, R143S, S162C, R211K Y232Y* 
1123 RT_1123 None None   K49R, K122E, I135T, S162C, T200I  
1124 RT_1124 None None  K101E K103R, S162C  
1125 RT_1125 None None   K32Q, I135R, G141X, R143S, E204K, Q207E, R211K, F214L  
1126 RT_1126 None None   D123E, I180V, T200I, Q207QE, R211K  
1127 RT_1127 None None  V179E G45E, S48E, V60I, V90I, D121H, K122E, G141X, R143S, K166R, Q207K, R211S  
1128 RT_1128 None None   V60I, S68G, I135T, K173R, T200A, Q207E  
1129 RT_1129 None None   K32R, K102R, G141X, R143S, S162C, K173E  
1130 RT_1130 None None M184V  D123E, Q197H, Q207E  
1131 RT_1131 None None   K32R, V60I, S162C  
1132 RT_1132 None None  Y188H I135T, G141X, R143S, S162C  
1133 RT_1133 None None   I135R, G141X, R143S, S162C, R211K  
1134 RT_1134 None None   K122E, Q174K, T200I, Q207E, H208Y, R211K  
1135 RT_1135 None None   E53D, S162Y, I178M, T200A, E203D, R211K L149LV 
1136 RT_1136 None None  V108VI D121HY, K122E, S162C, P176S, T200A  
1137 RT_1137 None None   K102Q, K103R, G141X, R143S, R211K  
1138 RT_1138 None None   K122E, D123S, S162C, R211K  
1139 RT_1139 None None   K122E, D123N, F214L  
1140 RT_1140 None None   D123E, S162C  
1141 RT_1141 None None   S162C, R211K  
1142 RT_1142 None None  E138A R83K, I135T, S162C, R211K L149LF 
1143 RT_1143 None None   V60I, R83K, S162H, Q174R, N175NY, G196E, R211G  
1144 RT_1144 None None   D123E, I135T, Q151QR, D177E, Q207R, R211K G152GV 
1145 RT_1145 None None   D123E, I142T  
1146 RT_1146 None None  K101KE K32N, D123DE, I135T, S162C, K173KE K122EG, K126KE, Y144S 
1147 RT_1147 None None   V35I, I135M, D177E, I178IM, T200X, Q207R  
1148 RT_1148 None None  F227FI V35I, R83K G231GA 
1149 RT_1149 None None   K102Q, K122KE, S162C, Q197K, Q207A, R211K, P225PT H96HP 
1150 RT_1150 None None   V35M, S162C, F171FY, Q174QR, I178M, Q207E, R211K L149LF 
1151 RT_1151 None None   I135T  
1152 RT_1152 None None   D123E, D177E, R211RK  
1153 RT_1153 None None   I178IM, G196E, Q207E  
1154 RT_1154 None None  E138A T39I, D123E, I135T, S162C  
1155 RT_1155 None None   V35VI, D121DH, K122E, D123DE, D177E  
1156 RT_1156 None None   D121H, K122E, I135T, S162C, R211K  
1157 RT_1157 None None   T69S, I135V, S162C, K173E, R211K  
1158 RT_1158 None None   T39TP, S134SC, I142IF, Y232D D218DH 
1159 RT_1159 None None   D123E, I135T, S162C  
1160 RT_1160 None None   I135T, S162C, R211S, F214L G152GDE 
1161 RT_1161 None None   D123E, I135T, I178M  
1162 RT_1162 None None   V60I, I135T, S162C, R211K  
1163 RT_1163 None None   T200I, R211K D185DV