Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Ibe (2008)
Title Trend of drug-resistant HIV type 1 emergence among therapy-naive patients in Nagoya, Japan: An 8-year surveillance from 1999 to 2006.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 402
NumPts 402
Subtype B, CRF01_AE, A, C, D, F, CRF02_AG, CRF10_CD

 
  Page 1 of 5    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 402 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
101 101 None None   T200I, Q207E  
102 102 None None   E6D, V35I, D123E, I135L, S162C, G196E  
103 103 None None   V35I, I135L, S162C, G196E, R211G E28V 
105 105 None None   P4PS, E6D, V8VI, K11T, V35T, T39TK, K43E, V60VI, D123S, K173E, Q174R, D177E, V179A, I180IV, T200A, Q207A, R211S, F214FL  
106 106 None None   K102R, D123E, I135T, D177E, T200P, E204D, R211K  
107 107 None None   E28D, K102R, D123E, I135T, D177E, R211K  
108 108 None None   K20R, I135T  
109 109 None None   K20R, D123E, I135T, I178L, I202V, R211K  
111 111 None None   K20R, I135T, K166R, K173T, R211K  
112 112 None None  V179E E28ED, D123E, I135T, D177E, R211K  
115 115 None None   E6D, P14S, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, T165I, K173I, Q174K, D177E, I178M, H198P, Q207A, R211N  
116 116 None None K219KR  V35T, D123E, I135V, I142IV, S162C, T165TA, N175NY, Q207QH, R211RK, D218DG, K220KE, H221HQ  
117 117 None None   E6D, V35I, S68G, I135T, T139I, G196E, R211G  
120 120 None None T215DG  V35I, S68G, I135L, Y144F, S162C, G196E  
121 121 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43KE, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, T200I, Q207T, R211S  
122 122 None None   E6D, V60I, I142V, T200S, Q207E, L210M, R211K  
123 123 None None   K20R, V35I, T69A, I135V, Q207E, R211K  
124 124 None None   V35T, D123E, I135V, S162C  
125 125 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, T165I, K173A, D177E, T200A, Q207A  
126 126 None None   V8I, V35T, E36A, T39E, S48T, D121H, K122E, D123S, T139A, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K  
127 127 None None   V35I, I135V, S162C, T200I, Q207E  
129 129 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39K, E44D, V60I, K122E, D123S, K173S, D177E, I178V, V179I, I202V, Q207A, R211S  
130 130 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V60VI, K122E, D123S, I135T, I142V, K173V, Q174K, D177E, I202IV, Q207A, R211S  
132 132 None None   K20R, T39TP, I135T  
133 133 None None   E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, G196E, Q207A, R211S  
134 134 None None   S68G, K122KQ, D123DE, D177E, G196E, R211G  
135 135 None None  V179D K20R, I135T, S162C  
136 136 None None   V35I, D123E, I135L, S162C, G196E  
137 137 None None   K20R, I50V, I135T, T200TA  
138 138 None None   I5V, V35I, I135L, S162C, G196E, R211K I132IR 
139 139 None None   K20R, I135T  
140 140 None None   I5V, V35I, I135L, S162C, I178M, G196E, R211G  
141 141 None None   D123E, I135T, K173E, D177E, T200I  
142 142 None None   V35I, I135L, S162C, P176L, G196E  
143 143 None None   V35T, D123E, I135V, S162C  
146 146 None None   K20R, D123E, I135T, D177E, Q207E, R211K  
147 147 None None   K20R, V35I, K102KR, D123E, I135T, Q207E, R211K  
148 148 None None   K22R, V35T, E40ED, V60I, K122E, D123S, D177E, I178L, T200I, Q207G, R211K  
178 178 None None T215C  V35I, I135L, S162C, G196E T128P 
194 194 None None   V60I, S68G, G196E, R211G  
197 197 None None   T7TA, V60I, S68G, G196E, R211G L149LF 
203 203 None None M41L, D67N, L210W, T215Y E138Q E44D, V60I, R83K, K103R, V118I, K122E, S162Y, V179I, Q207D  
227 227 None None  M230MI E6D, S68G, K102KR, K122E, I135T, I142L, V179I, G196E, T200TI, I202IV, R211EG H198HD 
235 235 None None T215L  V35I, S68SG, K122E, I135L, S162C, I195IM, G196E, I202IL  
236 236 None None T215D  V35I, S68G, I135L, S162C, G196E, R211RK  
245 245 None None T215D  V35I, S68G, I135L, S162C, P170PL, D177DN, G196E, R211RK  
256 256 None None T215L  V35I, K43KT, I135L, S162C, G196E  
259 259 None None T215L  M16T, V35I, G45GR, S105A, I135L, S162C, G196E  
261 261 None None  V179D E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178IM, T200I, Q207T, R211S  
277 277 None None M41L V179E T39S, V60I, D86E, D123E, S163ST, E169ED, D177E, Q207A, R211K  
278 278 None None M41L V179D T39S, V60I, D86E, D123E, S163ST, D177E, Q207A, R211K  
279 279 None None T215TA V179VD K20R, K49KR, S68SG, E79ED, K102KR, S105SA, I135T, I142IT, S162C, I195IT, Q207QE, R211X  
285 285 None None  K103N V35I, K122E, I135L, S162C, G196E, Q197K, E204K  
293 293 None None  K103KN E6D, V8VI, V60I, K102Q, K104KR, I135IT, I142V, I180IV, T200S, Q207E, R211K  
300 300 None None T215L  V35I, S105A, I135L, S162C, G196E  
329 329 None None  K103N V35I, K122E, I135L, S162C, G196E, Q197K, E204K  
330 330 None None  V108VI V35I, K102KQR, K104KR, I135L, T139TA, S162C, E194EK, G196E, T200TA  
351 351 None None   V60I, S68G, G196E, R211G  
376 376 None None T215L  V35I, I135L, S162C, I178IM, G196E, R211RK  
386 386 None None T215L  V35I, I135L, S162C, G196E, R211RK  
398 398 None None  K103N V35I, K122E, I135L, S162C, G196E, Q197K  
402 402 None None  V108VI D121DH, K122KEQ, D123DE, I135V, K173Q, P176PT, D177DE, I178IL  
426 426 None None  V106I, V179D E6D, S68G, D123E, K166KR, G196E, R211G, F214L  
436 436 None None   E6D, V35I, K43KQ, S68G, T139L, G196E, T200I, R211G  
449 449 None None T215E  V35I, F87FL, D123E, I135L, S162C, D177E, G196E, T200A  
466 466 None None T215L  K11KR, V35I, S68SG, K102R, I135V, S162C, F171FY, I178IM, I195IT, G196E  
472 472 None None  K103N, P225PH E6ED, V35I, K122E, D123E, I135L, S162C, G196E, Q197K  
476 476 None None   E6D, V35I, S68G, T139TI, G196E, T200TA, R211G  
482 482 None None M41L, D67N, T215C  P4ST, E6A, V35VI, K43Q, V60I, V118I, I135IV, G196E, T200TA, I202V  
491 491 None None T215TS  V35T, T39A, K122E, I135T, I142IT, Q174H, D177E, I178M, G196E, I202V  
496 496 None None T215L  V35I, K122E, I135L, S162C, G196E, T200TI, I202V  
500 500 None None   E6D, V35I, S68G, I135IK, T139TI, G196E, R211G  
504 504 None None  V106I, V179D E6D, S68G, D123E, G196E, R211G, F214L  
514 514 None None T215S  V35I, I135L, S162C, G196E, R211S  
524 524 None None   V60I, S68G, N175Y, G196E, T200A, R211G  
525 525 None None T215D  V35I, I135L, S162C, G196E  
539 539 None None T215L  E6EK, V35I, D121Y, K122E, I135L, S162C, D177DE, I178IM, G196E, R211X  
545 545 None None T215D  I5IV, V35I, S68G, K122KT, D123DE, I135L, S162C, P176PQ, D177DE, I178IM, G196E  
547 547 None None T215L  V35I, S68G, K102R, I135L, S162C, G196E  
556 556 None None T215S  V35I, I135L, S162C, G196E, R211T  
574 574 None None  K103N V35I, T39TI, K102KR, D121DE, K122E, D123DN, I135L, S162C, V179VI, G196E, Q197K  
575 575 None None   I2IV, V60I, S68G, I135V, E194ED, G196E, T200A, R211G  
69 69 None None   D123E, I135T, S162C, D177E, G196E, Q207E  
77 77 None None   V35VI, I135T, F214L  
78 78 None None   V35IM, I142V, S162C  
79 79 None None   V35VM, I50IV, E53D, S68G, D123E, I135T, T165TI, K166R, D177E, I178L  
80 80 None None   R83K, K122E, D123E, I178L  
81 81 None None   K166R, E169D, I202V, Q207E, R211K  
83 83 None None   V35M, R83K, G196E, R211S  
84 84 None None   K20R, D123E, I135T, D177E, Q207E, R211K  
85 85 None None   V35I, I135L, S162C, G196E  
86 86 None None   V35L, R83K, D123E, I135IT, S162C, D177E, G196E, E204K, Q207E  
87 87 None None   F214L  
88 88 None None M184V  V35T, E40D, K49R, V60I, D177E, I178V, T200R, E204D, Q207D, R211K  
89 89 None None   E6G, A98S, R211K  
90 90 None None   D123E, I135V, D177E, I178M, T200TI, Q207E  
93 93 None None   V35I, K103R, I135L, S162C, V179I, G196E  
97 97 None None   V35T, E40ED, V60I, K122E, I135RT, I142T, D177E, I178L, I195L, T200I, Q207G, R211K, F214FL  
98 98 None None   V35L, R83K, D123E, S162C, D177E, G196E, T200A, Q207G I195Q 
99 99 None None   V35T, T39D, K43R, S48T, V60I, K122E, I135T, K173A, T200A, Q207G, R211K  

Database

Resources

Team