Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Eyer-Silva (2007)
Title Autochthonous horizontal transmission of a CRF02_AG strain revealed by a human immunodeficiency virus type 1 diversity survey in a small city in inner state of Rio de Janeiro, Southeast Brazil.
Citation Mem Ins Oswaldo Cruz
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 94
NumPts 94
Subtype B, F, CRF02_AG, CRF40_BF

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
BRSAP01 04BRSAP01 AZT, 3TC None M184V  I135T, E169D, D177E, T200K, R211G  
BRSAP02 04BRSAP02 AZT, DDI, 3TC, D4T NVP M41L Y181C T7P, K122E, I135T, K166R, E169D, D177E  
BRSAP03 04BRSAP03 DDI, AZT, 3TC EFV   K104T, D123E, I135T, I178M, V189I, R211K  
BRSAP04 04BRSAP04 AZT, 3TC EFV   I135T, E169D, D177E, T200A  
BRSAP05 04BRSAP05 None None  E138A P4S, V60I, S68G, I135T, K166R, D177E, I178M, G196E, R211K, F214L  
BRSAP06 04BRSAP06 None None   K122E, D123G, K166R, I178M, V179I  
BRSAP07 04BRSAP07 AZT, 3TC None T215Y  V35T, D123E, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200R, Q207A, R211K T216S, P217T 
BRSAP08 04BRSAP08 AZT, DDI, 3TC, D4T NVP, EFV M41L, T215Y K103N K20R, T39A, D123E, I135T, I178L, G196E  
BRSAP09 05BRSAP09 None None   V35M, V60I, K122KE, K173R, T200A  
BRSAP09_PED 05BRSAP09P None None   K22R, V35M, V60I, K64R, D123E, K166R  
BRSAP10 05BRSAP10 None None   D123E, I135T, D177E, R211K  
BRSAP13 04BRSAP13 AZT, 3TC, D4T EFV   E6D, K20R, V35T, E36A, T39K, K43E, K122E, I135V, S162C, K173A, Q174K, Q207E, R211K, M230R  
BRSAP18 04BRSAP18 DDI, AZT, 3TC EFV M41L, M184V, T215Y K103N, G190A V35M, K102N, K122E, I135T, E169D, D177E, T200A  
BRSAP23 05BRSAP23 AZT, 3TC None   V35M, V60I, D121HY, K173R, D177E  
BRSAP24 04BRSAP24 None None   K20R, K122E, I135T, E169D, D177E, F214L  
BRSAP25 04BRSAP25 None None   K20R, K122E, I135T, E169D, D177E, F214L  
BRSAP26 05BRSAP26 None None  V179D K20R, K49R, D123E, I135T, K166R, D177E, T200A  
BRSAP27 05BRSAP27 None None   K122E, I135T, T200I, R211K, F214L  
BRSAP28 05BRSAP28 None None  V179D K20R, V35I, D123E, I135M, D177E  
BRSAP29 06BRSAP29 None None   K122E, I135T, T200I, R211K, F214L  
BRSAP30 06BRSAP30 None None   S68G, T69N, K102Q, K122E, T200A  
BRSAP31 06BRSAP31 None None  V106I, V179D K20R, I135T, D177E  
BRSAP33 06BRSAP33 None None  V179D K20R, D123E, I135T, K166R, D177E  
BRSQ01 04BRSQ01 AZT, 3TC NVP M184V K103N K49KR, K122E, I132L, D177E, I178M, Q207E  
BRSQ02 04BRSQ02 None None   P4S, D123E, K166R, D177E, Q197P, Q207E, F214L  
BRSQ03 04BRSQ03 None None   K20R, K122E, D123E, I135T, Q197P, T200S  
BRSQ05 05BRSQ05 AZT, 3TC NVP   V35T, K49R, V60I, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211K  
BRSQ06 04BRSQ06 AZT, 3TC, D4T NVP   D123E, I135T, D177E  
BRSQ07 04BRSQ07 3TC, D4T EFV   K122P, I135T, S162C, Q197E, R211K  
BRSQ08 06BRSQ08 None None   S48T, K122E, D123N, I135T, D177E, G196E  
BRSQ09 04BRSQ09 None None   E6K, V35I, K122A, K166I, Q207D, F214L  
BRSQ12 05BRSQ12 None None   K20R, A98S, K102Q, K122E, A158S, S162A, Q207E, R211K  
BRSQ14 05BRSQ14 3TC, D4T None M41L, M184V, T215Y  K122E, D123E, I135T, S162C, D177E, Q207E, R211K  
BRSQ15 05BRSQ15 ABC, AZT, 3TC NVP  G190A S68G, K122E, D123E, I135T, I178L  
BRSQ20 04BRSQ20 3TC, D4T EFV   S68G, I135T, I178L, Q207H, R211K, F214X, E224X  
BRSQ21 05BRSQ21 AZT, 3TC NVP  K103N D123E, I135T, K166R, D177E, I202V  
BRSQ24 05BRSQ24 AZT, 3TC, D4T EFV M41L, M184V, L210W, T215Y  N175H, R211K  
BRSQ25 04BRSQ25 AZT, 3TC NVP   K101R, D121Y, K122E, I135T, D177E  
BRSQ26 06BRSQ26 AZT, 3TC EFV  V106I I178L, R211K, F214L  
BRSQ27 06BRSQ27 AZT, 3TC EFV   K20R, D123E, T165I, D177E, I202V, R211K  
BRSQ29 06BRSQ29 AZT, 3TC NVP   S162C, Q174E, Q207E  
BRSQ30 04BRSQ30 None None   I135T  
BRSQ31 05BRSQ31 AZT, 3TC EFV   D121Y, K122E, I135T, D177E, R211K  
BRSQ32 04BRSQ32 AZT, 3TC None   V35I, I135IT, Q174H, D177E, T200E, E203A, R211K, F214V D185H 
BRSQ32a 05BRSQ32 None None   K49R, I135T, E169D, D177E, I178M, T200A, R211K  
BRSQ33 05BRSQ33 AZT, 3TC None M184V  T200A  
BRSQ35 06BRSQ35 None None   K122E, D123N, I135V, D177E  
BRSQ36 05BRSQ36 None None   S105A, I135T, R211K  
BRSQ39 04BRSQ39 AZT, 3TC, D4T None   V35T, K49R, I50V, V60I, D121A, K122E, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
BRSQ40 04BRSQ40 AZT, 3TC EFV  Y188*L S48T, K122E, D123N, I135T, D177E, G196E K220KQ 
BRSQ41 04BRSQ41 AZT, 3TC EFV   K20R, V60I, E79D, K122P, I135T, I142V, K166KR, D177E, I178M, V179T  
BRSQ42 05BRSQ42 AZT, 3TC EFV   V35T, E40D, S162C, E169D, K173A, Q174K, Q207E, R211K  
BRSQ43 05BRSQ43 AZT, 3TC EFV   S68G, T69N, I135T, S162C, R211Q  
BRSQ44 05BRSQ44 AZT, 3TC EFV   V35T, K49R, D123E, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207E  
BRSQ46 04BRSQ46 AZT, 3TC EFV   V35T, D123E, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207N  
BRSQ47 04BRSQ47 None None   K122E, D123N, I135T, D177E, F214L  
BRSQ48 04BRSQ48 AZT, 3TC None   K122E, D123N, I135T, D177E, T200A, F214L L209V 
BRSQ49 06BRSQ49 None None   D123E, I135T, I142V, S162C, D177E, I202V  
BRSQ50 04BRSQ50 None None   K20R, A98S, K122E, T139TK, Q197E  
BRSQ53 05BRSQ53 AZT, 3TC None   V35I, D123E, I135T, D177E, I178M, Q207E  
BRSQ54 04BRSQ54 AZT, 3TC EFV   V35T, K122E, D123E, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K  
BRSQ56 04BRSQ56 None None   V35T, F214I  
BRSQ57 04BRSQ57 None None   S48T, K122E, I135T, F214L  
BRSQ58 04BRSQ58 None None   D123E, D177E, G196E, T200I, F214L  
BRSQ60 05BRSQ60 AZT, 3TC EFV   D123E, I135T, S162G, Q174R, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K  
BRSQ61 04BRSQ61 None None   D123E, I135T, D177E, F214L  
BRSQ65 05BRSQ65 AZT, 3TC EFV   K122A, I142V, D177E, R211K  
BRSQ66 05BRSQ66 ABC, AZT, 3TC EFV   K20R, K49R, I135T, K173R, R211K  
BRSQ67 05BRSQ67 AZT, 3TC NVP   I135T  
BRSQ68 05BRSQ68 AZT, 3TC EFV   K20R, R211K  
BRSQ69 05BRSQ69 AZT, 3TC EFV   V35T, K49R, V60I, I135L, S162C, E169N, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K  
BRSQ70 05BRSQ70 AZT, 3TC None   R83K, D123E, I135V, I178L L205G 
BRSQ71 05BRSQ71 None None  A98G K20R, V35I, K102Q, K166I, I178M, T200A  
BRSQ72 05BRSQ72 None None   V60I, D123E, I142V, T200A  
BRSQ73 05BRSQ73 None None   K32R, V60I, K122E, I142V, E169D, I178L  
BRSQ74 05BRSQ74 None None   K20R, A98S, K104R, D123E, T139K, K173E, Q197E, Q207H  
BRSQ75 05BRSQ75 None None   S105A, D123E, S162A, D177E, I202V, R211K  
BRSQ76 05BRSQ76 None None   K122E, D123N, I135T, E169D, K173Q, Q174K, D177E, I178M, T200A  
BRSQ77 05BRSQ77 None None   A98S, K122E, T200S  
BRSQ78 05BRSQ78 None None   V35I, Q207E  
BRSQ80 05BRSQ80 None None   K122E, I135T, G196E, E204K  
BRSQ81 06BRSQ81 None None   K122E, D123N, I135T, T165I, D177E, F214L  
BRSQ82 05BRSQ82 None None   K122E, D123N, I135T, D177E, F214L  
BRSQ83 05BRSQ83 None None   V118I, D123E, I135T, T139A, T165I, D177E, I178L, G196E, F214L  
BRSQ84 05BRSQ84 None None   K20R, K32N, A98S, T139K, G196E, Q197K  
BRSQ86 06BRSQ86 None None   V35M, E40D, S48T, V60I, K122E, I178M, V189I, R211K  
BRSQ87 06BRSQ87 None None   V60I, K122E, I135V, G196E, T200A  
BRSQ88 06BRSQ88 None None   V35T, E36A, T39D, V60I, D123E, I135L, S162A, E169D, K173T, Q174R, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K  
BRSQ89 06BRSQ89 None None   V35T, T39L, K122E, D123E, S162A, E169D, K173A, Q174K, T200A, I202V, R211K  
BRSQ90 06BRSQ90 None None   V35T, E36A, T39D, V60I, D123E, I135L, S162A, K173T, Q174R, D177E, G196E, T200A, Q207E, V245Q, D250E, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, S322T, I326V, G335D  
BRSQ91 06BRSQ91 None None   K122E, D123N, I135T, D177E, V189I, T200I, F214L  
BRSQ92 06BRSQ92 None None   V35T, T39A, K43R, S48T, K104R, D123E, S162C, E169D, K173T, Q174K, D177E, T200K, Q207E, R211A  
BRSQ93 06BRSQ93 None None   K32R, K49R, K122E, I135T, T139I, E169K, K173E, Q207E  
BRSQ94 06BRSQ94 None None D67N, K70S, T215D  K20R, V35I, D177E, G196E, I202V, Q207K  

Database

Resources

Team