Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Shafer (2003)
Title Comparison of four-drug regimens and pairs of sequential three-drug regimens as initial therapy for HIV-1 infection.
Citation N Engl J Med
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 1256
NumPts 902
Subtype B, C, A, F, CRF45_cpx, CRF02_AG, CRF01_AE, D


  Page 1 of 13    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 1256 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
A384_0242 0242a None None   D123DE, I142V, D177DE, G196E, R211KQ, F214L  
A384_0243 0243a None None   S68SG, A98S, K166R, D177N, G196E, R211K, V245E  
A384_0244 0244a None None   A158S, I202V, Q207E, F214L, V245K  
A384_0245 0245a None None   I37X, A98S, K122P, D177E, I178LM, T200TS, Q207QE, R211RK, F214FL, P243S  
  0245b D4T, DDI EFV   I37X, A98S, K122AP, D177E, I178LM, T200TS, Q207QE, R211RK, P243S  
A384_0246 0246a None None   T39E, E40D, D121HY, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, T200A, V245Q  
A384_0247 0247a None None   I37X, A98AS, E169D, G196GE, I202V, E204D, R211RK  
A384_0248 0248a None None   D121DH, K122E, D123S, R172RK, K173IM, Q174EK, D177E, I178ILM, Q207A, R211S, K238R, V245E  
A384_0250 0250a None None  V179VD R83K, V118VI, D121DH, K122E, S162C, G196E, R211G  
A384_0251 0251a None None   T39E, S48T, K122E, D123G, K173AV, D177E, I178IM, T200A, I202IV, Q207E, V245Q H96HN 
A384_0253 0253a None None D67N, K219Q  T39A, V60VI, D121H, K122E, I178L, V179I, Q207E, V245I  
A384_0255 0255a None None   I37X, V90I, K173KE, I178IM, Q207E, R211K  
  0255b D4T, DDI, 3TC, AZT EFV M184V K103N V90I, I135L, I178M, Q207E, R211K  
  0255c D4T, DDI, 3TC, AZT EFV M184MIV K103KN I37X, V90VI, K101KQ, K122KE, I135IL, R172RK, I178IM, Q207QE, R211RK, F214FL H208HR 
A384_0259 0259a None None   K64R, K122E, D123E, I135T, I178M, G196E, I244V  
A384_0261 0261a None None   T39TA, D121X, K122E, I135T, I142T, T165I, I178L, R211RK, F214L, V245E  
A384_0267 0267a None None   A98S, D123E, S162SN, R211G, V245VE  
A384_0301 0301a None None   D123N, I135T, I142V, K166R, D177E, Q197K, V245E  
A384_0302 0302a None None   I37X, K104KR, D121H, K122E, S162C, D177E, I178M, T200X, V245M  
  0302b AZT, 3TC, D4T, DDI EFV M184V  I37X, D121H, K122E, S162C, D177E, I178M, T200R, V245M G112GV, I167IM, Y183YH, L205LM 
  0302c AZT, 3TC, D4T, DDI EFV  K103N, Y188YC I37X, D121H, K122E, S162C, D177E, I178M, T200R, L228LR, V245M  
A384_0303 0303a None None   V60I, K122E, I142V, D177E, I178L, T200I, Q207E, R211K, V245N  
A384_0304 0304a None None   T39E, S48T, K122E, D123GS, I142IT, A158AS, K166R, K173A, Q174QK, D177E, V189VI, G196KR, T200A, I202V, Q207EG, R211K, V245Q  
A384_0305 0305a None None   K49R, V60I, R83K, I135T, R211RK  
  0305b AZT, 3TC None M184V  K49R, V60I, R83K, I135T, R211RK  
A384_0306 0306a None None   V60I, G196E, Q207G, R211K, V245EK  
A384_0307 0307a None None   K49R, D110DN, V111VL, K122E, I135T, E169D, I202V, R211K, V245M  
A384_0308 0308a AZT, 3TC, D4T, Unknown Unknown  V108I I37X, S48T, K122Q, T139A, I142T, S162A, D177G, V179I, R211K H235HY 
  0308b AZT, 3TC, D4T, Unknown, DDI Unknown, EFV M184V K103N, V108I I37X, S48T, K122Q, I135L, T139A, I142T, S162A, D177G, V179I, R211K  
A384_0309 0309a None None   I37X, K104KR, I142V, R211K  
A384_0328 0328a None None   T39A, V60I, D123G, I132V, T200A, Q207E, R211K  
A384_0606 0606a None None   V35M, K49R, R83K, E169D, R211K, V245E, E248T, D250E, K281X, A288T  
A384_0608 0608a None None   S48Q, I50X, V60VI, S162SC, D177DE, I178IL, I195IL, T200TI, R211KT, L228LR, V245X  
  0608b AZT, 3TC EFV   V60I, I135L, R143RK, T200I, R211T  
A384_0621 0621a None None   K64R, I135R, E169D, D177E, G196GR, T200A, K201R, I202V, E204EK, R211K, F214L, V245T  
A384_0623 0623a None None   D123E, I142V, S162C, E194X, I195IL, G196E, T200I  
  0623b AZT, 3TC None M184V, T215TS E138EA V60VI, S68SG, R83RK, K102KQ, V118VI, K122KE, D123DE, I135IT, S162C, E194DN, G196GE, T200I  
A384_0625 0625a None None   I135R, E169D, D177E, T200A, K201R, I202V, R211K, F214L, V245T  
A384_0963 0963a None None  V106VI I37X, T69N, K102KQ, I135IV, S162C, Q174H, D177DE, I202V, E203Q, R211K, V245X  
  0963b D4T, DDI, Unknown Unknown  L100LI, V106VI, Y188YH I37X, T69TN, K102KQ, I135IV, S162C, Q174H, I202V, E203Q, R211K, V245LQ  
A384_0964 0964a None None   D86E, K173E, T200EG, I202V, R211K, V245VE  
A384_0965 0965a None None   R83K, K122E, I178M, R211K, V245E  
A384_0966 0966a None None   I37X, V118I, D121C, K122E, S162SC, T165I, K173KN, Q174QK, D177E, G196E, Q207E, F214L  
  0966b AZT, 3TC EFV  K103N I37X, V118I, D121C, K122E, D123DE, T165I, K173N, Q174QK, D177E, G196E, Q207E, R211RK, F214L I63IK 
A384_0968 0968a None None   I142T, I178L, Q207E, H208HY, R211RK, V245M  
A384_0969 0969a None None M41L, T215E  T39A, V60I, R83K, K122KE, D123X, V245E  
A384_0973 0973a None None   T39K, K43E, A98S, K122E, E169EK, K173A, Q174QK, D177E, I178IL, T200A, Q207E, R211RK, V245Q  
  0973b D4T, DDI, Unknown, ABC EFV, Unknown, NVP   T39K, K43E, A98S, K122E, E169EK, K173A, Q174QK, D177E, I178IL, T200A, Q207E, V245Q  
A384_0977 0977a None None   K122KE  
A384_0978 0978a None None   V111VL, K122KE, D123DN, V189VI, G196Q, V245M  
A384_0983 0983a None None   T39TA, E44D, V60I, D121H, K122E, D123S, I135IT, I142V, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211KN, F214FL  
  0983b AZT, 3TC None M184V  T39A, E44D, V60I, D121H, K122E, D123S, I142V, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211K  
A384_1175 1175a None None   V60I, R83K, S162H, T200A, Q207E, A272P, K277R, T286A, E297K  
  1175b AZT, 3TC EFV  K103KN V60VI, R83K, S162H, T200A, Q207E, A272P  
A384_1205 1205a None None   A98S, V245I  
A384_1208 1208a None None   R83K, S162C, G196E, Q197QH, T200TI, Q207QR, R211RS V90VIM 
A384_1227 1227a None None   K173N, R211K  
A384_1381 1381a None None   V60I, R83K, K122KE, I135V, S162C, V245E  
A384_1382 1382a None None   K102KR, V179VI, T200TA, Q207E, R211K  
A384_1383 1383a None None   R83K, D123E, I135T, P170PS, G196E, T200TK  
  1383b D4T, DDI EFV   R83K, D123E, I135T, G196E, T200K  
A384_1384 1384a None None   I37X, K173N, F214L, V245E  
  1384b D4T, DDI None   I37X, V118VI, K173N, Q174QK, T200TI, F214L, V245E  
A384_1386 1386a None None   R83K, K122KE, D123E, D177E, R211RK  
A384_1387 1387a None None   G196GE, V245VM  
A384_1388 1388a None None   D123A, F171Y, D177E, R211K, V245Q  
  1388b AZT, 3TC EFV  K103N I37X, D123A, F171Y, D177E, R211K, V245Q  
  1388c AZT, 3TC, D4T, DDI EFV   I37X, D123A, F171Y, D177E, R211K, V245Q  
A384_1389 1389a None None   R83RK, D123DE, K166KI, D177DE, T200TA, I202IV, R211RK, V245VM  
A384_1390 1390a None None   K122KE, I142IV, E169ED, Q174QH, T200A, P243PS, I244V, V245EK  
A384_1391 1391a None None   I37X, V60I, K122E, F171FY, D177X, G196E, T200A, Q207QR, V245E  
  1391b AZT, 3TC None M184MV  I37X, V60I, K122KE, D177DE, G196E, T200A, Q207QR, V245E  
A384_1392 1392a None None   R83K, I178M  
A384_1394 1394a None None   R83K, K122KE, S162Y, R211K K223KI 
A384_1396 1396a None None   R83K, I135T, T165I, I178L, G196E, R211G  
A384_1398 1398a None None   I37X, R83RK, D123E, D177DE, I178IL, R211K, V245M  
  1398b D4T, DDI EFV  K103N V35I, R83K, D123E, I178L, R211K  
  1398c D4T, DDI EFV  K103N, V108VI, H221HY, P225PH I37X, R83K, D123E, I178L, R211K, V245M  
  1398d D4T, DDI, AZT, 3TC EFV M184V K103N, H221HY, P225PH R83K, D123E, I178L, R211K, V245M  
  1398e D4T, DDI, AZT, 3TC EFV M184V K103N, P225PH R83K, D113DN, D123E, I178L, R211K, V245M  
A384_1399 1399a None None  E138A K103R, I135T, I178M, G196E, R211K, F214L, E224EG  
A384_1404 1404a None None   E40EK, S48SP, E79ED, R83K, T200A, R211K, V245I  
A384_1406 1406a None None   A98S, D121H, K122E, D177E, Q207QH, R211K  
  1406b D4T, DDI EFV  K101KE A98S, D121H, K122E, D177E, Q207QH, R211K  
  1406c D4T, DDI, AZT, 3TC EFV M184V K101E, G190A A98S, D121H, K122E, S134SG, E169EA, D177E, Q207H, R211K  
A384_1411 1411a None None   S68G, D123E, K166R, Q174H, G196E, T200A, V245VM  
A384_3098 3098a None None   R83K, I135IT, E169D, G196E, T200IV, L210F  
A384_3519 3519a None None   I37X, V60VI, K166KR, D177E, T200A, I202V K122S 
  3519b AZT, 3TC None M184V  I37X, V60I, D177E, T200A, I202V, Q207E  
A384_3521 3521a None None   A98S, K122KE, D123DN, I135T  
A384_3522 3522a None None   I37X, R83K, D123E, I135T, R211K  
  3522b D4T, DDI, 3TC EFV   I37X, R83K, D123E, I135T, R211K  
A384_3523 3523a None None     
A384_3524 3524a None None   V60I, A98S, K122E, D123N, D177E, L210F, R211K, V245K  
A384_3525 3525a None None   K122E, I135T, T200I, R211K  
A384_3526 3526a None None   I135T, K166R, K173KE, I178IM  
A384_3527 3527a None None   I37X, S68G, K166R, I178M, R211K, K223KR  
  3527b AZT, 3TC EFV  K103N, V108VI I37X, S68G, V90VI, K166R, I178M, T200TI, R211K  
A384_3530 3530a None None   S48T, K49KR, V60I, R83K, K122KE, D123E, T200TA, R211RK, P243H, V245E  
A384_8151 8151a None None   K49R, E53D, S162C, Q174H, I178M