Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Eyzaguirre (2007)
Title Genetic characterization of HIV-1 strains circulating in Kazakhstan.
Citation JAIDS
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 85
NumPts 85
Subtype A, CRF02_AG, C

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
KZ300215 03KZ300215 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V60I, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZ300235 03KZ300235 None None A62V  V10I, K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
KZ300243 03KZ300243 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V60I, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZALM300210 03A300210 None None   V8I, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K166R, K173L, Q174K, D177E, Q207T, R211S  
KZALM300216 03A300216 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZALM300218 03A300218 None None   P4T, P14K, V35T, E36D, D121Y, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K  
KZALM300219 03A300219 None None   K11T, E28K, V35T, E36D, T39N, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZALM300220 03A300220 None None   K11T, E28K, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZALM300222 03A300222 None None   P4T, P14K, V35T, E36D, L100X, D121Y, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K K101~ 
KZALM300225 03A300225 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K104R, D121Y, K122E, I135T, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
KZALM300230 03A300230 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZALM300239 03A300239 None None   P14K, V35T, E36D, D121Y, K122E, S134N, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K  
KZKAR300435 02K300435 None None   K11T, V35T, E36D, T39M, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V, G335D, R356K, M357K, R358G, G359S, E370A, A371V, K374R, I375V, K390R, T403M, L452I, R463K, S468P, D471E, Q480H, L491S, K512R, L517I, S519N, Q520K, Q524K, K527E, K530R, A534S, A554N, K558R  
KZKAR300438 02K300438 None None   K11T, T27P, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S T216TI 
KZKAR300439 02K300439 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZKAR300441 02K300441 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K101R, K122E, D123S, I135IM, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZKAR300442 02K300442 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZKAR300443 02K300443 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, I142V, A158S, E169G, K173S, Q174K, D177E, V189I, Q207A, R211S  
KZKAR300444 02K300444 None None   K11T, V35T, E36D, T39M, D123S, A158S, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S  
KZKAR300445 02K300445 None None   K11T, V35T, E36D, T39M, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, Q197K, Q207A, R211S  
KZKAR300446 02K300446 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, I142S, A158S, K173L, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S  
KZKAR300449 02K300449 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K102Q, K122E, D123S, A158S, S162C, K173L, Q174K, D177E, E194A, T200A, Q207A, R211S  
KZKAR300451 02K300451 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, S162SC, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
KZKAR300453 02K300453 None None   K11T, V35T, E36D, T39TM, K122E, D123S, A158AS, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S K73KT, I94IM 
KZKAR300454 02K300454 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, Q207A, R211S  
KZKAR300455 02K300455 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122A, D123S, I135V, K173L, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S  
KZKAR300457 02K300457 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, D121H, K122E, D123DN, A158S, K173I, Q174K, D177E, I180V, Q207A, R211S  
KZKAR300459 02K300459 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S  
KZKAR300460 02K300460 None None   K11T, V35T, E36D, T39M, D123S, A158S, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S  
KZKAR300462 02K300462 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZKAR300464 02K300464 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZKAR300465 02K300465 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, R211S  
KZKAR300466 02K300466 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZKAR300467 02K300467 None None   K11T, V35T, E36D, T39N, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174R, D177E, Q207A, R211S  
KZMAN300232 03M300232 None None   K11T, V35T, E36D, T39N, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZPAV300480 02P300480 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272T, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V, G335D, R356K, M357K, R358G, G359S, E370A, A371V, I375V, A376T, K390R, T403M, L452I, S468P, D471E, Q480H, L491S, K512R, L517I, S519N, Q520K, Q524K, K527E, K530R, A534S, A554N, K558R  
KZPAV300484 02P300484 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZPAV300487 02P300487 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K102Q, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZPAV300493 02P300493 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZPAV300497 02P300497 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E308A, I326V, G335D, F346C, R356K, M357K, R358G, G359S, E370A, A371V, I375V, S379G, V381I, K390R, T403M, L452I, S468P, D471E, Q480H, L491S, K512R, L517I, S519N, Q520K, Q524K, K527E, A534S, A554N, K558R  
KZPAV300502 02P300502 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V, G335D, R356K, M357K, R358G, G359S, E370A, A371V, I375V, A376T, K390R, T403M, L452I, S468P, D471E, Q480H, L491A, K512R, L517I, S519N, Q520K, Q524K, K527E, K530R, A534S, A554N, K558R  
KZVOS300245 03V300245 None None A62V  K11T, V35I, E36N, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZVOS300246 03V300246 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, D121H, K122E, D123S, I135V, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S H198Q 
KZVOS300248 03V300248 None None A62V  K11T, V35I, E36N, T39K, K122E, D123S, A158S, S162C, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZVOS300249 03V300249 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, I135R, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZVOS300254 03V300254 None None A62V  K11T, V35I, E36N, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, P176S, D177E, Q207A, R211S  
KZVOS300255 03V300255 None None A62V  K11T, V35I, E36N, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZVOS300256 03V300256 None None A62V  K11T, V35I, E36N, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZVOS300259 03V300259 None None A62V  K11T, V35I, E36N, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, P176S, D177E, Q207A, R211S  
KZVOS300260 03V300260 None None A62V  K11T, V35I, E36N, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, P176S, D177E, Q207A, R211S  
KZVOS300261 03V300261 None None A62V  K11T, V35I, E36N, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, D218G  
KZVOS300262 03V300262 None None A62V  K11T, V35I, E36N, T39K, E53X, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, P176S, D177E, Q207A, R211S N81S 
KZVOS300263 03V300263 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, Q151X, A158S, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZVOS300264 03V300264 None None A62V  K11T, V35I, E36N, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZVOS300265 03V300265 None None A62V  K11T, V35I, E36N, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, P176S, D177E, Q207A, R211S  
KZVOS300267 03V300267 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, I135R, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZYUZ300273 03Y300273 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, D177E, Q207A, R211S  
KZYUZ300278 03Y300278 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, Q207A, R211S  
KZYUZ300279 03Y300279 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V60I, K102R, K122E, D123S, I135V, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZYUZ300280 03Y300280 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZYUZ300281 03Y300281 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZYUZ300282 03Y300282 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123N, I135T, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZYUZ300283 03Y300283 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S A33T 
KZYUZ300284 03Y300284 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V60I, K122E, D123S, I135T, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZYUZ300285 03Y300285 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, G45E, K122E, D123S, I135M, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZYUZ300287 03Y300287 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZYUZ300288 03Y300288 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, Q207A, R211S  
KZYUZ300290 03Y300290 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V60I, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, I178L, Q207A, R211S  
KZYUZ300291 03Y300291 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZYUZ300292 03Y300292 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZYUZ300293 03Y300293 None None A62V  I5IL, K11T, K32Q, V35I, E36D, I37L, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, E203G, Q207A, R211S R206RT 
KZYUZ300295 03Y300295 None None   P14K, V35T, E36D, T39K, D121Y, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K  
KZYUZ300296 03Y300296 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V60I, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZYUZ300300 03Y300300 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, Q207A, R211S  
KZYUZ300302 03Y300302 None None A62V  K11T, I31R, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZYUZ300408 02Y300408 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V60I, K122E, D123NS, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZYUZ300412 02Y300412 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V60I, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174KN, D177E, Q207A, R211S  
KZYUZ300413 02Y300413 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V, G335D, R356K, M357K, R358G, G359S, E370A, A371V, I375V, V381I, K390R, T403M, V417I, N447T, L452I, S468P, D471E, Q480H, L491A, K512R, L517I, S519N, Q520K, Q524K, K527E, K530R, A534S, A554Y, K558R  
KZYUZ300414 02Y300414 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZYUZ300415 02Y300415 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V60I, K64KN, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZYUZ300418 02Y300418 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, I135IV, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZYUZ300420 02Y300420 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V60I, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KZYUZ300421 02Y300421 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, Q207A, R211S  
KZYUZ300425 02Y300425 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E312K, I326V, G335D, R356K, M357K, R358G, G359S, E370A, A371V, I375V, V381I, K390R, T403M, L452I, S468P, D471E, Q480H, L491S, K512R, L517I, S519N, Q520K, Q524K, K527E, K530R, A534S, A554Y, K558R  
KZYUZ300426 02Y300426 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V60I, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  

Database

Resources

Team