Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Vicenti (2007)
Title Use of peripheral blood DNA for genotype antiretroviral resistance testing in drug-naive HIV-infected subjects.
Citation Clin Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 338
NumPts 169
Subtype B, CRF02_AG, F, A, C, CRF12_BF, CRF13_cpx, CRF01_AE, G, CRF45_cpx, CRF49_cpx

 

  Page 1 of 4    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 338 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
2878 33472 None None D67N, T215L, K219Q  V60I, T69N, K103R, V118I, K166KR, I195IL, G196E, Q207E, R211K, F214L  
  33472R None None D67N, T215L, K219Q  V60I, T69N, K103R, V118I, G196E, Q207E, R211K, F214L  
3162 37971 None None   D123E, G196E  
  37971R None None F77FL  D123E, G196GE  
3225 39216 None None   A98S, I135V, S162C, E169EA, D177E, R211K  
  39216R None None   A98S, I135V, A158AS, S162C, D177EG, R211K  
3228 39210 None None   D123E, I135T, D177E, R211K  
  39210R None None   D123E, I135T, D177E, R211K I47IM, F171FV 
3240 39502 None None   R83K, R211RK  
  39502R None None   R83K, R211RK  
3247 39699 None None   K32R, V35I, K122E, K166KR, I178M, T200TA  
  39699R None None   K32R, V35I, K122KE, D123DE, I178IM  
3288 40110 None None   A98S, K122E, D123E, I135T, S162C, D177E  
  40110R None None   A98S, K122E, D123E, I135T, S162C, D177E  
3412 45351 None None   V60I, I135T, R211K  
  45351R None None   K49KR, V60I, I135T, R211RK  
3514 46886 None None   D123E, D177E, T200A  
  46886R None None   D123E, P170PL, D177E, T200A  
3558 47794 None None   R83RK, K122KE, D123E, S162C, D177E, I178V, G196E  
  47794R None None   K122KE, D123E, S162C, D177E, I178V, G196E  
3623 48847 None None   V35T, E36D, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, R211K, E224D  
  48847R None None   V35T, E36D, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, R211K, E224D  
3684 49703 None None M41L, M184V, T215Y K103N, M230MI E29K, V35M, T39A, E42EK, E44EG, R83K, G93R, K122P, I135V, V179I, T200A, R211K  
  49703R None None M41L, M184MV, T215Y K103N Q23H, V35M, T39A, R83K, K122P, I135V, D177DG, V179I, T200A, R211K  
3727 50612 None None   K20R, V35I, I142IV, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177DE, T200A, Q207N, R211K  
  50612R None None   V35I, K122KE, I142IV, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177DE, T200A, Q207N, R211K K82E 
3791 51694 None None   V60VI, K122KE, I142IT, K166R, Q207E, R211RK  
  51694R None None   K20R, V60VI, K122E, I142IT, K166R, Q207QE, R211RK  
3819 52420 None None  E138A R83K, D123E, S162C  
  52420R None None  E138A R83K, D123E, S162C  
3871 53376 None None   E6D, I135IT, I178M, Q207K, R211RK  
  53376R None None   E6D, I178M, Q207K  
3962 54686 None None   V35T, T39A, D123E, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
  54686R None None   V35T, T39A, D123E, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
4134 57245 None None  V106VI K122KE, I135T, I178L, T200A, E204N, R211S K201IV 
  57245R None None  V106I K122E, I135T, I178L, T200A, E204N, R211S K201V 
4151 57625 None None   V35I, E36Q, R83K, K166R, D177E, T200A  
  57625R None None   K32KN, V35I, E36Q, R83K, K166R, D177E, T200A, R211RK  
4154 57716 None None   E6D, D123E, I135T, I142IT, D177E, I178M, I180V, L210F  
  57716R None None   E6D, D123DE, I135T, I142T, D177E, I178M, I180V, L210F  
4169 57869 None None   I50V, V118I, D123E, I135T, T165I, D177E, I178V, F214L  
  57869R None None   K49R, I50V, V118I, D123E, I135T, T165I, D177E, I178V, F214L  
4299 59342 None None   A98S, Q207E, R211K  
  59342R None None   Q207E, R211RK A98PS 
4300 59332 None None   V35VI, R83RK, D123E, K166KR, D177DE, I178M, T200A  
  59332R None None   R83RK, D123E, K166KR, D177E, I178M, T200A  
4317 59415 None None   K20R, K166R, D177E, I178M, R211K  
  59415R None None   K20R, T39P, K166R, D177E, I178M, R211K  
4333 59691 None None   S162C, R211K  
  59691R None None   S162C, Q207QH, R211K  
4348 59719 None None   S68G, K103R, K122E, I135T, K173R, R211K, F214L  
  59719R None None  E138EK S68G, K103R, K122E, I135T, S162C, K173R, R211K, F214L  
4365 60000 None None   V35K, T39AD, K122E, D123GS, I135IT, T200TK, Q207AP, R211RS K173*S 
  60000R None None   V35K, T39D, K122E, D123S, I135T, K173S, T200K, Q207A, R211S  
4367 59992 None None   V35T, T39A, I135V, S162A, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K  
  59992R None None   V35T, T39A, I135V, S162A, K173T, Q174KT, T200A, Q207E, R211RK  
4413 60605 None None   Q207E, R211K  
  60605R None None   Q207E, R211K  
4502 61614 None None   K20R, A98S, K122E, I135T, T165I, F214L  
  61614R None None   K20R, A98S, K122E, I135T, T165I, F214L  
4617 65291 None None   V35T, K122Q, D177E, Q207E  
  65291R None None   V35T, K122Q, D177E, Q207E  
4692 66019 None None   S105A, I135T  
  66019R None None   V35VI, S105A, I135T  
4722 66351 None None   V60I, S68G, I135T, D177DG, T200A, R211RK  
  66351R None None   V60I, S68G, I135T, T200A, R211K  
4726 66349 None None   I2V, I135T, K166KR, T200TA, R211K  
  66349R None None   I2V, I135T, K166KR, T200TA, R211K  
4758 66790 None None   D121H, K122E, P176PS, Q197K, T200E, I202V  
  66790R None None   D121H, K122E, T165I, P176PS, Q197K, T200E, I202V  
4765 66855 None None   K64R, K122E, T200I  
  66855R None None   K64R, K122E, T200I  
4790 67108 None None D67N, K219Q  V35M, K101R, D123E, I135T, S162Y, K173KE, Q174QR, D177E, F214L  
  67108R None None D67N, K219Q  E28EA, V35M, K101R, D123E, I135T, S162Y, K173KN, Q174R, D177E, F214L S3K 
4976 69156 None None T215D Y188H K20R, V60I, Q145C, S162H, D177E, V179I, T200A, Q207D, R211K  
  69156R None None T215D Y188H K20R, V60I, Q145C, S162H, D177E, V179I, T200A, Q207D, R211K  
5001 69511 None None  V106VI K22KR, T27S, D177E, I178L  
  69511R None None  V106I K22KR, T27S, D177E, I178L, R211RK  
5145 70958 None None   K122P, I135T, I202V  
  70958R None None   K122P, I135T, I202IV  
5150 71166 None None T215S  V35M, V60I, D123E, I132V, S162A, D177E, V179I, T200I, Q207E, R211K  
  71166R None None T215S  V35M, V60I, D123E, I132V, S162A, D177E, V179I, T200I, Q207EK, R211K  
5305 72639 None None   V35I, S48E, V60I, R83K, D123E, I135T, T139K, S162C, I195L, T200A, R211K  
  72639R None None   V35I, S48E, V60I, R83K, D123E, I135T, T139K, S162C, I195L, T200A, R211K  
LR_100 LR_100 None None   T69S, I135T, Q182H, F214L  
LR_102 LR_102 None None   D123E, I135V, D177E, I178V, R211K  
LR_103 LR_103 None None   K49R, V60I, D123E, I135T, S162SC, R211S  
  36542 None None   K49R, V60I, D123E, I135T, R211S  
LR_105 LR_105 None None   V35I, S68N, V90I, S162Y, I180L, Q207E, R211K  
LR_106 LR_106 None None   V35T, D121H, K122E, I135T, I142IV, D177E, Q207N, R211K, F214L  
LR_113 LR_113 None None T215S  V35I, T39A, E53EG, V60I, A62P, K122E, I132V, I135T, D177DE, Q207E, R211K F61L 
LR_116 LR_116 None None   K122E, I142V, K173V, D177DE, I178IM, Q207K, R211G  
LR_6 LR_6 None None K70R, M184I  V60I, R83K, D123E  
  6944R None None K70R  V60I, R83K, D123E  
LR_65 LR_65 None None K70R  E36D, K122A, I135T, Q174H, D177E, T200K  
  7667R None None   E36D, K122A, I135T, Q174H, D177E, T200K, R211RK  
LR_95 LR_95 None None D67N, T215S, K219Q  V60I, T69N, V118I, K166R, G196E, Q207E, R211K, F214L S156A 
LR_97 LR_97 None None   K82R, I135T, I142T, F214L  
LR_98 LR_98 None None   V35T, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, E203ED, E204Q, Q207D, R211K  
LR_99 LR_99 None None   V35T, V60I, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, E203D, E204K, Q207D, R211K