Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Lwembe (2007)
Title Anti-retroviral drug resistance-associated mutations among non-subtype B HIV-1-infected Kenyan children with treatment failure.
Citation J Med Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 35
NumPts 12
Subtype A, D, CRF02_AG, B, C

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
NYU30 30FMAR03
Consensus 
AZT, 3TC EFV L74LI, F77L K103N V35T, T39TA, V60I, W88WL, K122E, D123S, K126KR, I135T, W153WR, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S V75E, D76I 
  clone: 12 AZT, 3TC EFV L74I, F77L K103N V35T, V60I, W88L, K122E, D123S, K126R, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S V75E, D76I 
  clone: 3 AZT, 3TC EFV F77L K103N V35T, T39A, V60I, K122E, D123S, I135T, W153R, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S V75E, D76I 
  30FJAN04 AZT, 3TC, DDI EFV D67G, K70R, F77L, K219Q L100I, K103N K20R, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S V75E, D76I 
  30FAPR04 AZT, 3TC, DDI EFV D67G, K70R, K219Q L100I, K103N, E138Q V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
NYU33 33FMAR03
Consensus 
AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R, K219KQ K103N E6EA, K11Q, K20KR, V35T, K49KR, V60I, F87FL, I94IL, K101KQ, V111X, D121H, K122E, I135T, T139TM, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S K66KT, N81NY, Q85QH, D86DG 
  clone: 10 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R K103N E6A, K11Q, V35T, V60I, V111X, D121H, K122E, I135T, T139M, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S Q85H 
  clone: 13 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R, K219Q K103N K11Q, V35T, V60I, D121H, K122E, I135T, T139M, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 15 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R K103N K11Q, V35T, V60I, F87L, K101Q, D121H, K122E, I135T, T139M, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S K66T, D86G 
  clone: 16 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R K103N K11Q, K20R, V35T, V60I, D121H, K122E, I135T, T139M, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 17 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R, K219Q K103N K11Q, K20R, V35T, V60I, D121H, K122E, I135T, T139M, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S N81Y 
  clone: 18 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R K103N K11Q, K20R, V35T, V60I, K101Q, D121H, K122E, I135T, T139M, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 19 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R K103N K11Q, V35T, K49R, V60I, I94L, K101Q, D121H, K122E, I135T, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 20 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R K103N K11Q, V35T, K49R, V60I, K101Q, D121H, K122E, I135T, T139M, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 21 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R K103N K11Q, V35T, V60I, K101Q, D121H, K122E, I135T, T139M, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 23 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R, K219Q K103N K11Q, V35T, V60I, K101Q, D121H, K122E, I135T, T139M, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 8 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R, K219Q K103N K11Q, K20R, V35T, V60I, D121H, K122E, I135T, T139M, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
  33FFEB04
Consensus 
AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R, Y115YF, K219Q A98ATG, K103N K11Q, V35T, E44EG, G45GR, V60VI, K101KQ, D121H, K122E, I135T, T139TM, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, E194EG, T200A, Q207A, R211S, D218E D76DV, E79EG, R206RG 
  clone: 1 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R, K219Q K103N K11Q, V35T, V60I, K101Q, D121H, K122E, I135T, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, D218E R206G 
  clone: 11 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R, Y115F, K219Q K103N K11Q, V35T, V60I, K101Q, D121H, K122E, I135T, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, E194G, T200A, Q207A, R211S, D218E  
  clone: 12 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R, K219Q K103N K11Q, V35T, V60I, K101Q, D121H, K122E, I135T, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, D218E  
  clone: 13 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R, K219Q K103N K11Q, V35T, V60I, K101Q, D121H, K122E, I135T, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, D218E  
  clone: 14 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R, K219Q K103N K11Q, V35T, V60I, K101Q, D121H, K122E, I135T, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, E194G, T200A, Q207A, R211S, D218E A98T 
  clone: 16 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R, K219Q K103N K11Q, V35T, E44G, V60I, K101Q, D121H, K122E, I135T, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, D218E D76V, E79G 
  clone: 19 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R, K219Q A98G, K103N K11Q, V35T, V60I, K101Q, D121H, K122E, I135T, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, D218E  
  clone: 20 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R, K219Q K103N K11Q, V35T, V60I, K101Q, D121H, K122E, I135T, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, E194G, T200A, Q207A, R211S, D218E  
  clone: 3 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R, K219Q K103N K11Q, V35T, V60I, K101Q, D121H, K122E, I135T, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, D218E  
  clone: 5 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R, K219Q K103N K11Q, V35T, G45R, V60I, D121H, K122E, I135T, T139M, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, D218E  
  clone: 6 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R, K219Q K103N K11Q, V35T, K101Q, D121H, K122E, I135T, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, D218E  
  clone: 7 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R, K219Q K103N K11Q, V35T, V60I, K101Q, D121H, K122E, I135T, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, D218E  
  clone: 8 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R, K219Q K103N K11Q, V35T, V60I, K101Q, D121H, K122E, I135T, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, E194G, T200A, Q207A, R211S, D218E  
  clone: 9 AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R, K219Q K103N K11Q, V35T, V60I, K101Q, D121H, K122E, I135T, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, D218E  
NYU36 36MOCT01
Consensus 
RTI, ABC, 3TC, DDI RTI D67DN, K70KR, M184MV, K219KQ K103N K11KQ, K13KR, I31IT, V35T, E40ED, K49KR, E53EK, V60I, K82KR, W88WL, E89EK, K101KQI, D121DH, K122E, I135X, S162SN, K173KS, Q174QK, D177E, V179VI, E194EG, T200X, Q207X, R211RS, D218DE N81NY, A98AT, L100LP 
  clone: 1 RTI, ABC, 3TC, DDI RTI M184V K103N V35T, E40D, K49R, V60I, W88L, K101Q, K122E, I135M, D177E, T200I, Q207E  
  clone: 17 RTI, ABC, 3TC, DDI RTI D67N, K70R, K219Q K103N K11Q, V35T, E53K, V60I, K101Q, D121H, K122E, I135T, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, D218E N81Y 
  clone: 18 RTI, ABC, 3TC, DDI RTI D67N, K70R, K219Q K103N K11Q, V35T, V60I, K101Q, D121H, K122E, I135T, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, E194G, T200A, Q207A, R211S, D218E A98T 
  clone: 2 RTI, ABC, 3TC, DDI RTI M184V K103N K13R, V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D177E, T200I, Q207E  
  clone: 4 RTI, ABC, 3TC, DDI RTI M184V K103N K13R, I31T, V35T, K49R, V60I, K82R, K101I, K122E, D177E, T200I, Q207E L100P 
  clone: 5 RTI, ABC, 3TC, DDI RTI M184V K103N V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, D177E, T200I, Q207E L100P 
  clone: 6 RTI, ABC, 3TC, DDI RTI M184V K103N K13R, V35T, E40D, K49R, V60I, E89K, K122E, I135M, D177E, T200I, Q207E  
  clone: 7 RTI, ABC, 3TC, DDI RTI M184V K103N K13R, V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135M, D177E, T200I, Q207E  
  36MMAY02
Consensus 
RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT RTI, EFV K70KR, M184MV, T215TF K103KN, V108VI T7TA, V35T, E40ED, K49R, V60I, T69TN, R72RK, K122E, I135IMT, K166KR, D177E, I178IM, T200X, Q207E N81NY, Q85QP, I94IN, D110DG 
  clone: 1 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT RTI, EFV  K103N V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D177E, I178M, T200A, Q207E  
  clone: 10 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT RTI, EFV   V35T, K49R, V60I, R72K, K122E, K166R, D177E, I178M, T200I, Q207E D110G 
  clone: 11 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT RTI, EFV K70R K103N V35T, E40D, K49R, V60I, T69N, K122E, D177E, I178M, T200A, Q207E  
  clone: 14 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT RTI, EFV  K103N V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135M, D177E, T200I, Q207E I94N 
  clone: 15 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT RTI, EFV   V35T, K49R, V60I, K122E, K166R, D177E, I178M, T200I, Q207E  
  clone: 2 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT RTI, EFV   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, K166R, D177E, I178M, T200A, Q207E Q85P, D110G 
  clone: 3 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT RTI, EFV   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, K166R, D177E, I178M, T200I, Q207E N81Y 
  clone: 4 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT RTI, EFV M184V, T215F K103N, V108I V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, D177E, T200R, Q207E  
  clone: 5 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT RTI, EFV M184V K103N T7A, V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135M, D177E, T200I, Q207E Q85P 
  clone: 6 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT RTI, EFV  K103N V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, K166R, D177E, T200I, Q207E  
  36MAUG02
Consensus 
RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT RTI, EFV M184MV, T215TF V108VI P14PS, V35T, E40D, K49R, V60I, F87FL, K103X, T107TA, K122E, D123DE, I135X, W153WR, S162SN, D177E, I195IM, T200X, Q207E V75VG, N81NY 
  clone: 12 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT RTI, EFV M184V K103N V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, S162N, D177E, T200M, Q207E  
  clone: 13 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT RTI, EFV M184V K103N, V108I V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135M, D177E, T200M, Q207E  
  clone: 14 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT RTI, EFV M184V K103N P14S, V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135M, D177E, I195M, T200M, Q207E  
  clone: 2 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT RTI, EFV  K103N V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135M, D177E, T200I, Q207E  
  clone: 4 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT RTI, EFV M184V K103N V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, W153R, D177E, T200R, Q207E V75G, N81Y 
  clone: 5 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT RTI, EFV M184V K103T V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, W153R, D177E, T200R, Q207E  
  clone: 7 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT RTI, EFV M184V, T215F K103N V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123E, I135T, D177E, T200R, Q207E  
  clone: 8 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT RTI, EFV M184V K103N V35T, E40D, K49R, V60I, F87L, K122E, I135M, D177E, T200M, Q207E  
  clone: 9 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT RTI, EFV M184V K103T V35T, E40D, K49R, V60I, T107A, K122E, I135M, D177E, T200M, Q207E  
  36MAPR03
Consensus 
RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT, D4T RTI, EFV T215F K103N, G190GA V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135IT, D177E, T200R, Q207E V90VG, L109LP, P140PS 
  clone: 10 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT, D4T RTI, EFV T215F K103N, G190A V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D177E, T200R, Q207E  
  clone: 13 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT, D4T RTI, EFV T215F K103N, G190A V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D177E, T200R, Q207E P140S 
  clone: 18 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT, D4T RTI, EFV T215F K103N V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, D177E, T200R, Q207E  
  clone: 2 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT, D4T RTI, EFV T215F K103N, G190A V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D177E, T200R, Q207E  
  clone: 3 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT, D4T RTI, EFV T215F K103N, G190A V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D177E, T200R, Q207E  
  clone: 4 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT, D4T RTI, EFV T215F K103N, G190A V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D177E, T200R, Q207E  
  clone: 5 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT, D4T RTI, EFV T215F K103N, G190A V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D177E, T200R, Q207E  
  clone: 7 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT, D4T RTI, EFV T215F K103N, G190A V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D177E, T200R, Q207E L109P 
  clone: 9 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT, D4T RTI, EFV T215F K103N, G190A V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D177E, T200R, Q207E V90G, P140S 
  36MFEB04
Consensus 
RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT, D4T RTI, EFV T215F K103N, V106VA, G190A V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, D177E, T200R, Q207E  
  clone: 7 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT, D4T RTI, EFV T215F K103N, G190A V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, D177E, T200R, Q207E  
  clone: 8 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT, D4T RTI, EFV T215F K103N, V106A, G190A V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, D177E, T200R, Q207E  
  36MAUG04
Consensus 
RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT, D4T RTI, EFV M41ML, T215F K103N, G190A V35T, E40ED, K49R, V60I, T69TI, K82KR, R83RG, K122E, I135T, S162SD, K166KR, D177E, T200R, Q207E, W212WR K70KY, D76DV 
  clone: 11 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT, D4T RTI, EFV T215F K103N, G190A V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, S162D, D177E, T200R, Q207E  
  clone: 13 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT, D4T RTI, EFV T215F K103N, G190A V35T, E40D, K49R, V60I, K82R, R83G, K122E, I135T, D177E, T200R, Q207E  
  clone: 14 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT, D4T RTI, EFV T215F K103N, G190A V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, S162D, D177E, T200R, Q207E K70Y 
  clone: 15 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT, D4T RTI, EFV T215F K103N, G190A V35T, K49R, V60I, K122E, I135T, S162D, D177E, T200R, Q207E, W212R  
  clone: 3 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT, D4T RTI, EFV M41L, T215F K103N, G190A V35T, K49R, V60I, T69I, K122E, I135T, D177E, T200R, Q207E  
  clone: 4 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT, D4T RTI, EFV T215F K103N, G190A V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, K166R, D177E, T200R, Q207E  
  clone: 6 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT, D4T RTI, EFV T215F K103N, G190A V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, D177E, T200R, Q207E D76V 
  clone: 9 RTI, ABC, 3TC, DDI, AZT, D4T RTI, EFV T215F K103N, G190A V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, D177E, T200R, Q207E  
NYU38 38MAUG04
Consensus 
AZT, 3TC, DDI NVP, EFV M41LT, D67N, K70R, M184V, L210W, T215Y, K219E K101KP, V106VI, Y188L V35T, E36ED, T39MA, V60I, L109LI, K122KR, K173KE, D177EG, G196E, T200A, Q207E, R211K, D218E E89EG 
  clone: 01 AZT, 3TC, DDI NVP, EFV M41L, D67N, K70R, M184V, L210W, T215Y, K219E V106I, Y188L V35T, T39M, V60I, L109I, K173E, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K, D218E E89G 
  clone: 03 AZT, 3TC, DDI NVP, EFV M41L, D67N, K70R, M184V, L210W, T215Y, K219E V106I, Y188L V35T, T39M, V60I, L109I, K173E, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K, D218E  
  clone: 04 AZT, 3TC, DDI NVP, EFV D67N, K70R, M184V, L210W, T215Y, K219E V106I, Y188L V35T, T39M, M41T, V60I, L109I, K173E, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K, D218E  
  clone: 05 AZT, 3TC, DDI NVP, EFV M41L, D67N, K70R, M184V, L210W, T215Y, K219E V106I, Y188L V35T, T39M, V60I, L109I, K173E, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K, D218E  
  clone: 06 AZT, 3TC, DDI NVP, EFV M41L, D67N, K70R, M184V, L210W, T215Y, K219E V106I, Y188L V35T, T39M, V60I, L109I, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K, D218E  
  clone: 09 AZT, 3TC, DDI NVP, EFV M41L, D67N, K70R, M184V, L210W, T215Y, K219E K101P, Y188L V35T, E36D, T39A, V60I, K122R, K173E, D177G, G196E, T200A, Q207E, R211K, D218E  
NYU44 44MFEB02
Consensus 
None NVP  K103N V35T, T39A, S48T, V60I, G99X, D121H, K122E, D123DSE, I135T, K173LV, Q174K, D177E, Q197QR, T200TA, Q207A, R211K, F214L N81NY 
  clone: 1 None NVP  K103N V35T, T39A, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, F214L  
  clone: 2 None NVP  K103N V35T, T39A, S48T, V60I, D121H, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211K, F214L  
  clone: 3 None NVP  K103N V35T, T39A, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, F214L  
  clone: 4 None NVP  K103N V35T, T39A, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, F214L  
  clone: 7 None NVP  K103N V35T, T39A, S48T, V60I, D121H, K122E, D123E, I135T, K173V, Q174K, D177E, Q197R, T200A, Q207A, R211K, F214L  
  clone: 8 None NVP  K103N V35T, T39A, S48T, V60I, G99X, D121H, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, F214L N81Y 
  44MMAR03
Consensus 
AZT, DDI NVP, EFV D67N, K70R, K219Q K103N, V108I, G190A E29EG, V35T, T39A, S48T, V60I, S117SP, D121H, K122E, F124FL, K126KR, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, F214L, T215X Y115YI, L120LS, R125RE 
  clone: 10 AZT, DDI NVP, EFV D67N, K70R, T215F, K219Q K103N, V108I, G190A V35T, T39A, S48T, V60I, D121H, K122E, F124L, K126R, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, F214L Y115I, L120S, R125E 
  clone: 13 AZT, DDI NVP, EFV D67N, K70R, T215I, K219Q K103N, V108I, G190A E29G, V35T, T39A, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, F214L  
  clone: 8 AZT, DDI NVP, EFV D67N, K70R, T215I, K219Q K103N, V108I, G190A V35T, T39A, S48T, V60I, S117P, D121H, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, F214L  
  clone: 9 AZT, DDI NVP, EFV D67N, K70R, T215I, K219Q K103N, V108I, G190A V35T, T39A, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, F214L  
  44MDEC03
Consensus 
AZT, DDI NVP, EFV M41MLI, D67N, K70R, V75VM, T215F, K219Q K103N, V108I, G190A P4PS, E29EK, V35T, T39A, E42EK, S48T, V60I, E79EK, D110DN, D121H, K122KE, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, E204EK, Q207AT, R211K, F214L T128TS, Y144YC 
  clone: 1 AZT, DDI NVP, EFV M41L, D67N, K70R, V75M, T215F, K219Q K103N, V108I, G190A V35T, T39A, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, F214L  
  clone: 2 AZT, DDI NVP, EFV D67N, K70R, V75M, T215F, K219Q K103N, V108I, G190A V35T, T39A, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, E204K, Q207A, R211K, F214L T128S 
  clone: 3 AZT, DDI NVP, EFV D67N, K70R, T215F, K219Q K103N, V108I, G190A V35T, T39A, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207T, R211K, F214L  
  clone: 4 AZT, DDI NVP, EFV D67N, K70R, T215F, K219Q K103N, V108I, G190A P4S, E29K, V35T, T39A, M41I, E42K, S48T, V60I, E79K, D110N, D121H, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, F214L  
  clone: 6 AZT, DDI NVP, EFV M41L, D67N, K70R, V75M, T215F, K219Q K103N, V108I, G190A V35T, T39A, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, F214L Y144C 
  clone: 7 AZT, DDI NVP, EFV D67N, K70R, V75M, T215F, K219Q K103N, V108I, G190A V35T, T39A, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, F214L  
NYU62 62MFEB01
Consensus 
None None  V106I V35T, E40D, K49KR, V60I, V90X, K102KR, K122E, D123X, S163ST, K173S, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S K70KI, I94IV 
  clone: 1 None None  V106I V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, S163T, K173S, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 4 None None  V106I V35T, E40D, K49R, V60I, V90X, K102R, K122E, D123G, K173S, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S I94V 
  clone: 5 None None  V106I V35T, E40D, V60I, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S K70I, V90S 
  clone: 7 None None  V106I V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S  
  62MSEP02
Consensus 
None None K65KN, D67DN, K70KR V106I, G190A V35T, E40D, K49KR, V60I, F77FS, W88WL, K101X, Y115X, K122E, D123DG, K173L, Q174K, D177E, I178IM, V179I, T200TA, Q207A, R211S N54NK 
  clone: 1 None None  K101E, V106I, G190A V35T, E40D, V60I, K122E, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S N54K 
  clone: 2 None None  V106I, G190A V35T, E40D, K49R, V60I, K101Q, Y115X, K122E, D123G, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 3 None None  K101E, V106I, G190A V35T, E40D, V60I, F77S, K122E, K173L, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S  
  clone: 4 None None  V106I, G190A V35T, E40D, V60I, W88L, K122E, D123G, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
  clone: 6 None None K65N, D67N, K70R V106I, G190A V35T, E40D, V60I, K101Q, K122E, D123G, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 8 None None  V106I, G190A V35T, E40D, V60I, K101Q, K122E, D123G, K173L, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S  
  62MMAR03
Consensus 
AZT, 3TC NVP D67N, K70R, K219E V106I, G190A G15GE, K20KR, V35T, E40D, V60I, K66KR, K101Q, K122E, D123G, K173X, Q174K, D177E, I178IM, V179I, T200A, Q207A, R211S, T215X P95PR 
  clone: 2 AZT, 3TC NVP D67N, K70R, T215F, K219E V106I, G190A V35T, E40D, V60I, K101Q, K122E, D123G, K173S, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 3 AZT, 3TC NVP D67N, K70R, T215I, K219E V106I, G190A G15E, V35T, E40D, V60I, K66R, K101Q, K122E, D123G, K173S, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S P95R 
  clone: 4 AZT, 3TC NVP D67N, K70R, T215I, K219E V106I, G190A V35T, E40D, V60I, K101Q, K122E, D123G, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 5 AZT, 3TC NVP D67N, K70R, T215F, K219E V106I, G190A K20R, V35T, E40D, V60I, K101Q, K122E, D123G, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
  62MMAY04
Consensus 
AZT, 3TC NVP D67N, K70R, K219E V106I, Y181YC, G190A V35T, E40D, V60I, F87FL, K101KQ, K102KR, K122E, D123G, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, T215X D76DG, V90VG, S156SA 
  clone: 1 AZT, 3TC NVP D67N, K70R, T215I, K219E V106I, G190A V35T, E40D, V60I, F87L, K102R, K122E, D123G, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 2 AZT, 3TC NVP D67N, K70R, T215I, K219E V106I, Y181C, G190A V35T, E40D, V60I, K101Q, K122E, D123G, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S V90G, S156A 
  clone: 3 AZT, 3TC NVP D67N, K70R, T215F, K219E V106I, Y181C, G190A V35T, E40D, V60I, K101Q, K122E, D123G, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S D76G 
NYU69 69MMAR03
Consensus 
AZT, 3TC NVP F77FL K103KN I5V, E6K, K11Q, K20R, V35T, E40ED, V60I, W88WL, K122E, D123S, D177E, I178M, E194D, T200I, Q207X, R211K E79EG 
  clone: 13 AZT, 3TC NVP   I5V, E6K, K11Q, K20R, V35T, V60I, K122E, D123S, D177E, I178M, E194D, T200I, Q207G, R211K  
  clone: 17 AZT, 3TC NVP   I5V, E6K, K11Q, K20R, V35T, V60I, K122E, D123S, D177E, I178M, E194D, T200I, Q207E, R211K E79G 
  clone: 2 AZT, 3TC NVP  K103N I5V, E6K, K11Q, K20R, V35T, E40D, V60I, K122E, D123S, D177E, I178M, E194D, T200I, Q207E, R211K  
  clone: 4 AZT, 3TC NVP   I5V, E6K, K11Q, K20R, V35T, V60I, W88L, K122E, D123S, D177E, I178M, E194D, T200I, Q207G, R211K  
  clone: 5 AZT, 3TC NVP F77L  I5V, E6K, K11Q, K20R, V35T, V60I, K122E, D123S, D177E, I178M, E194D, T200I, Q207E, R211K  
  69MMAY04
Consensus 
AZT, 3TC NVP L74LV, M184V K103N I5IV, E6K, K11Q, K20R, E28EK, V35T, G45GE, V60I, V118VA, K122E, D123S, I135T, D177E, I178M, E194D, T200I, Q207X, R211K L80LF, P97PL 
  clone: 01 AZT, 3TC NVP L74V, M184V K103N I5V, E6K, K11Q, K20R, E28K, V35T, G45E, V60I, K122E, D123S, I135T, D177E, I178M, E194D, T200I, Q207E, R211K  
  clone: 02 AZT, 3TC NVP M184V K103N I5V, E6K, K11Q, K20R, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, D177E, I178M, E194D, T200I, Q207G, R211K  
  clone: 06 AZT, 3TC NVP M184V K103N I5V, E6K, K11Q, K20R, V35T, V60I, V118A, K122E, D123S, I135T, D177E, I178M, E194D, T200I, Q207E, R211K  
  clone: 08 AZT, 3TC NVP M184V K103N I5V, E6K, K11Q, K20R, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, D177E, I178M, E194D, T200I, Q207E, R211K P97L 
  clone: 09 AZT, 3TC NVP M184V K103N I5V, E6K, K11Q, K20R, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, D177E, I178M, E194D, T200I, Q207E, R211K L80F 
  clone: 10 AZT, 3TC NVP M184V K103N I5V, E6K, K11Q, K20R, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, D177E, I178M, E194D, T200I, Q207G, R211K  
  clone: 12 AZT, 3TC NVP M184V K103N E6K, K11Q, K20R, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, D177E, I178M, E194D, T200I, Q207G, R211K  
NYU70 70MSEP02
Consensus 
None NVP  K103N K32X, V35X, T39X, K49R, V60I, K122KE, I135R, S162C, T200I, Q207X, R211K T58TA 
  clone: 1 None NVP  K103N K32E, V35M, T39S, K49R, V60I, K122E, I135R, S162C, T200I, Q207E, R211K  
  clone: 3 None NVP  K103N K32N, V35M, T39A, K49R, V60I, I135R, S162C, T200I, Q207E, R211K T58A 
  clone: 4 None NVP  K103N K32E, V35I, K49R, V60I, I135R, S162C, T200I, Q207E, R211K  
  clone: 5 None NVP  K103N K32N, V35M, T39A, K49R, V60I, I135R, S162C, T200I, Q207K, R211K  
  clone: 6 None NVP  K103N K32N, V35M, T39A, K49R, V60I, I135R, S162C, T200I, Q207E, R211K  
  70MJUN03
Consensus 
None NVP  L100LV, K103N K32X, V35X, E36ET, T39TS, K49R, I135R, S162C, V179VI, D186DN, T200TI, Q207E, R211K V60IS, F61FI, A62AS, F116FL 
  clone: 1 None NVP  K103N K32N, V35I, T39S, K49R, I135R, S162C, D186N, T200I, Q207E, R211K V60S, F61I, A62S 
  clone: 2 None NVP  L100V, K103N K32E, V35M, T39S, K49R, V60I, I135R, S162C, T200I, Q207E, R211K F116L 
  clone: 5 None NVP  K103N K32N, V35I, T39S, K49R, V60I, I135R, S162C, D186N, T200I, Q207E, R211K  
  clone: 6 None NVP  K103N K32E, V35M, T39S, K49R, V60I, I135R, S162C, Q207E, R211K  
  clone: 7 None NVP  K103N K32E, V35M, E36T, K49R, V60I, I135R, S162C, Q207E, R211K  
  clone: 8 None NVP  K103N K32E, V35M, K49R, V60I, I135R, S162C, V179I, T200I, Q207E, R211K  
  70MDEC03
Consensus 
AZT, 3TC NVP K70KR, F77FL, M184V K103N, E138EK I31IL, K32X, V35VM, T39X, K49R, V60I, T69TN, I135R, S162C, T200TI, Q207E, R211K E89ED 
  clone: 01 AZT, 3TC NVP M184V K103N K32N, V35M, T39A, K49R, V60I, I135R, S162C, T200I, Q207E, R211K  
  clone: 02 AZT, 3TC NVP M184V K103N, E138K K32N, V35M, T39A, K49R, V60I, I135R, S162C, T200I, Q207E, R211K  
  clone: 05 AZT, 3TC NVP K70R, M184V K103N I31L, K32E, V35M, T39S, K49R, V60I, T69N, I135R, S162C, T200I, Q207E, R211K  
  clone: 06 AZT, 3TC NVP K70R, M184V K103N I31L, K32E, V35M, T39S, K49R, V60I, T69N, I135R, S162C, Q207E, R211K E89D 
  clone: 07 AZT, 3TC NVP F77L, M184V K103N, E138K K32N, V35M, T39A, K49R, V60I, I135R, S162C, Q207E, R211K  
  clone: 08 AZT, 3TC NVP K70R, M184V K103N, E138K K32N, K49R, V60I, I135R, S162C, Q207E, R211K  
NYU79 79MFEB03
Consensus 
None None   E28EA, V35T, T39TA, E40ED, V60VI, T69S, D121H, K122E, I135T, K173X, Q174K, D177DE, I178IV, V179I, T200TA, Q207A, R211S  
  clone: 01 None None   V35T, V60I, T69S, D121H, K122E, I135T, K173A, Q174K, V179I, Q207A, R211S  
  clone: 19 None None   E28A, V35T, T39A, E40D, T69S, D121H, K122E, I135T, K173S, Q174K, V179I, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 22 None None   E28A, V35T, T69S, D121H, K122E, I135T, K173A, Q174K, V179I, Q207A, R211S  
  clone: 23 None None   V35T, T39A, E40D, T69S, D121H, K122E, I135T, K173A, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200A, Q207A, R211S  
  79MFEB04
Consensus 
AZT, 3TC NVP V75VM, M184V K101KE, K103KN, G190GA K13KR, E28EA, V35T, T39TA, E40D, E42EK, K49KR, V60VI, T69TS, R83RG, D121DH, K122E, I135X, K173KS, Q174QK, D177E, I178IV, V179VI, T200X, Q207X, R211RS  
  clone: 10 AZT, 3TC NVP T69S_VG, V75M, M184V K101E, G190A E28A, V35T, T39A, E40D, R83G, D121H, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 11 AZT, 3TC NVP T69S_VG, V75M, M184V K101E, G190A E28A, V35T, T39A, E40D, E42K, R83G, D121H, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 12 AZT, 3TC NVP T69S_VG, V75M, M184V K101E, G190A E28A, V35T, T39A, E40D, D121H, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 13 AZT, 3TC NVP M184V K103N K13R, V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135M, D177E, T200I, Q207E  
  79MJUN04
Consensus 
AZT, 3TC, DDI NVP, EFV V75M, M184V K101E, Y181YC, G190A T7TI, E28A, V35T, T39A, E40D, T69S, D121H, K122E, I135T, T139TI, K173S, Q174K, D177E, I178V, V179I, E194EQ, T200A, Q207A, R211S K13KE, R83RS 
  clone: 1 AZT, 3TC, DDI NVP, EFV T69S_VG, V75M, M184V K101E, Y181C, G190A E28A, V35T, T39A, E40D, D121H, K122E, I135T, T139I, K173S, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 12 AZT, 3TC, DDI NVP, EFV T69S_VG, V75M, M184V K101E, G190A T7I, E28A, V35T, T39A, E40D, D121H, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, I178V, V179I, E194Q, T200A, Q207A, R211S R83S 
  clone: 2 AZT, 3TC, DDI NVP, EFV T69S_VG, V75M, M184V K101E, G190A E28A, V35T, T39A, E40D, D121H, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200A, Q207A, R211S K13E 
  clone: 22 AZT, 3TC, DDI NVP, EFV T69S_VG, V75M, M184V K101E, Y181C, G190A E28A, V35T, T39A, E40D, D121H, K122E, I135T, T139I, K173S, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200A, Q207A, R211S  
NYU83 83MMAY01
Consensus 
None None   K11Q, T27TI, V35M, V60I, S68SG, T69TN, I94X, D121H, K122E, D123X, I135T, K173S, Q174K, D177E, I178IM, T200TA, Q207A, R211S R72RW, L209LP 
  clone: 09 None None   K11Q, V35M, V60I, D121H, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 11 None None   K11Q, V35M, V60I, S68G, T69N, I94X, D121H, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S L209P 
  clone: 13 None None   K11Q, V35M, V60I, T69N, I94X, D121H, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
  clone: 14 None None   K11Q, T27I, V35M, V60I, D121H, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S R72W 
  clone: 15 None None   K11Q, V35M, V60I, S68G, T69N, D121H, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 16 None None   K11Q, V35M, V60I, D121H, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
  clone: 17 None None   K11Q, V35M, V60I, D121H, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
  clone: 20 None None   K11Q, V35M, V60I, D121H, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
  83MJUL02
Consensus 
None None M184V K103N K11X, V35M, V60I, S68SG, T69TN, R72RK, D121H, K122E, D123X, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S K73KE, E79EG, G99GS 
  clone: 03 None None M184V K103N K11N, V35M, V60I, D121H, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 04 None None M184V K103N K11N, V35M, V60I, S68G, T69N, D121H, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 07 None None M184V K103N K11Q, V35M, V60I, D121H, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S E79G 
  clone: 08 None None M184V K103N K11N, V35M, V60I, S68G, T69N, R72K, D121H, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S K73E 
  clone: 10 None None M184V K103N K11N, V35M, V60I, S68G, T69N, D121H, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S G99S 
  83MAPR03
Consensus 
None None M184MV K103N K11X, V35M, V60I, S68G, T69N, K101KR, D121H, K122E, D123X, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200TA, Q207A, R211S Y127YL 
  clone: 01 None None M184V K103N K11N, V35M, V60I, S68G, T69N, D121H, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 02 None None M184V K103N K11Q, V35M, V60I, S68G, T69N, D121H, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 05 None None  K103N K11Q, V35M, V60I, S68G, T69N, K101R, D121H, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S Y127L 
  clone: 09 None None M184V K103N K11N, V35M, V60I, S68G, T69N, D121H, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
  83MAUG04
Consensus 
AZT, 3TC EFV M184V, T215TY K103N K11KN, K20KR, V35MR, V60I, S68G, T69TN, D121H, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S Q91QE, G93GV 
  clone: 01 AZT, 3TC EFV M184V, T215Y K103N V35R, V60I, S68G, T69N, D121H, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S G93V 
  clone: 06 AZT, 3TC EFV M184V, T215Y K103N K20R, V35M, V60I, S68G, T69N, D121H, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 07 AZT, 3TC EFV M184V, T215Y K103N K20R, V35M, V60I, S68G, T69N, D121H, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 09 AZT, 3TC EFV M184V K103N K20R, V35M, V60I, S68G, T69N, D121H, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S Q91E 
  clone: 10 AZT, 3TC EFV M184V K103N K20R, V35M, V60I, S68G, T69N, D121H, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
  clone: 12 AZT, 3TC EFV M184V K103N K11N, V35M, V60I, S68G, D121H, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
NYU85 85FFEB03
Consensus 
None None D67DN, M184MV L100LI, K103KN P14PSQ, K32KI, V35T, E36ED, K43KR, K49KR, V60VI, D121X, K122KE, D123DE, I135IT, T139TK, I142IV, S162AC, K173X, Q174QKE, D177E, I178IV, I180IV, T200TAI, I202IV, Q207EG, R211K F61FL, E89EV 
  clone: 07 None None   V35T, E36D, K49R, V60I, D123E, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K  
  clone: 13 None None   P14S, V35T, E36D, K49R, D121H, K122E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
  clone: 15 None None   P14S, V35T, E36D, K43R, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K  
  clone: 18 None None   V35T, E36D, K49R, V60I, D121H, K122E, S162A, K173I, Q174K, D177E, I180V, T200A, Q207E, R211K E89V 
  clone: 19 None None D67N  V35T, E36D, K49R, V60I, D121H, K122E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K  
  clone: 2 None None M184V L100I, K103N K32I, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, T139K, S162C, D177E, T200I, Q207G, R211K  
  clone: 20 None None   P14S, V35T, E36D, V60I, D123E, I142V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K  
  clone: 21 None None   P14S, V35T, E36D, K49R, D123E, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K  
  clone: 22 None None   P14Q, V35T, E36D, V60I, D121H, K122E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K E89V 
  clone: 23 None None   V35T, E36D, K49R, D123E, S162A, K173I, Q174K, D177E, I202V, Q207E, R211K F61L 
  clone: 24 None None   P14S, V35T, E36D, K49R, V60I, D121H, K122E, S162A, K173M, Q174E, D177E, I178V, T200A, I202V, Q207E, R211K  
  clone: 6 None None   P14S, V35T, E36D, K49R, D121A, K122E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K  
  85FDEC03
Consensus 
AZT, 3TC NVP A62AV, D67DN, M184V L100LI, K103N, V106VI P14S, I31IL, V35T, E36D, S68ST, D121H, K122E, I135X, S162X, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K  
  clone: 07 AZT, 3TC NVP D67N, M184V K103N P14S, I31L, V35T, E36D, S68T, D121H, K122E, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K  
  clone: 11 AZT, 3TC NVP D67N, M184V K103N, V106I P14S, I31L, V35T, E36D, D121H, K122E, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K  
  clone: 12 AZT, 3TC NVP A62V, M184V K103N P14S, I31L, V35T, E36D, D121H, K122E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K  
  clone: 14 AZT, 3TC NVP D67N, M184V L100I, K103N P14S, V35T, E36D, D121H, K122E, I135M, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K  
  clone: 16 AZT, 3TC NVP D67N, M184V K103N P14S, V35T, E36D, D121H, K122E, I135M, S162T, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K  
NYU90 90FAPR03
Consensus 
None NVP  V179VD, Y181YC V35T, K49R, V60I, K103KR, L109LM, D121Y, K122E, I135R, S162C, D177E, I178IM, T200I, Q207G, R211K K32IV 
  clone: 07 None NVP  Y181C V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162C, D177E, T200I, Q207G, R211K K32V 
  clone: 09 None NVP  V179D K32I, V35T, K49R, V60I, K103R, D121Y, K122E, I135R, S162C, D177E, T200I, Q207G, R211K  
  clone: 10 None NVP  Y181C K32I, V35T, K49R, V60I, L109M, D121Y, K122E, I135R, S162C, D177E, T200I, Q207G, R211K  
  clone: 11 None NVP  Y181C K32I, V35T, K49R, V60I, L109M, D121Y, K122E, I135R, S162C, D177E, T200I, Q207G, R211K  
  clone: 12 None NVP  Y181C K32I, V35T, K49R, V60I, L109M, D121Y, K122E, I135R, S162C, D177E, I178M, T200I, Q207G, R211K  
  clone: 15 None NVP  Y181C K32I, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162C, D177E, T200I, Q207G, R211K  
  clone: 17 None NVP  Y181C K32I, V35T, K49R, V60I, L109M, D121Y, K122E, I135R, S162C, D177E, T200I, Q207G, R211K  
  clone: 20 None NVP   K32I, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162C, D177E, T200I, Q207G, R211K  
  90FMAR04
Consensus 
AZT, 3TC NVP M184V K103N K32I, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135TR, T139K, S162C, D177E, T200I, Q207G, R211K F160FL 
  clone: 01 AZT, 3TC NVP M184V K103N K32I, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, T139K, S162C, D177E, T200I, Q207G, R211K  
  clone: 03 AZT, 3TC NVP M184V K103N K32I, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, T139K, S162C, D177E, T200I, Q207G, R211K  
  clone: 07 AZT, 3TC NVP M184V K103N K32I, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, T139K, S162C, D177E, T200I, Q207G, R211K  
  clone: 12 AZT, 3TC NVP M184V K103N K32I, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135R, T139K, S162C, D177E, T200I, Q207G, R211K  
  clone: 15 AZT, 3TC NVP M184V K103N K32I, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, T139K, S162C, D177E, T200I, Q207G, R211K F160L 
  clone: 16 AZT, 3TC NVP M184V K103N K32I, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, T139K, S162C, D177E, T200I, Q207G, R211K  
  clone: 17 AZT, 3TC NVP M184V K103N K32I, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, T139K, S162C, D177E, T200I, Q207G, R211K  
  clone: 18 AZT, 3TC NVP M184V K103N K32I, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, T139K, S162C, D177E, T200I, Q207G, R211K  
  clone: 19 AZT, 3TC NVP M184V K103N K32I, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, T139K, S162C, D177E, T200I, Q207G, R211K