Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Derache (2007)
Title Genetic diversity and drug resistance mutations in HIV type 1 from untreated patients in Bamako, Mali.
Citation Antivir Ther
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 96
NumPts 96
Subtype CRF02_AG, CRF06_cpx, A, G, B, C

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
1155 1155 None None   E28K, K32E, V35T, E40D, V60I, D123E, I135V, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
1156 1156 None None   V35T, V90I, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207N  
1158 1158 None None   E36D, E40G, D121Y, K122E, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
1159 1159 None None   V35T, E36A, T39K, K43E, K122P, I135V, S162A, T165I, D177E, T200A, Q207A, R211K  
1160 1160 None None   E28K, K32E, V35T, V60I, K122E, D123E, D177E, Q197H, T200S, Q207E, R211K  
1163 1163 None None   K20R, V35T, E40D, K49R, V60I, K102Q, S162A, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207E, R211G  
1164 1164 None None   E28A, V35T, E36D, I135T, S162A, K173T, Q174T, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207E  
1166 1166 None None   V35T, E36D, T39I, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, Q207D, R211E  
1169 1169 None None   V35T, E36D, I135V, S162A, K173A, Q174E, D177E, I178M, T200A, E204R, Q207E  
1171 1171 None None   K22N, K30R, V35T, E36G, T39A, K43Q, S48A, K49R, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, R211K  
1172 1172 None None   V35R, A98S, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E  
1173 1173 None None   V35R, D86E, A98S, D123N, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, R211K  
1174 1174 None None   V35T, T39K, K43E, S162A, K173T, Q174K, T200A, I202V, Q207E, R211K  
1175 1175 None None   V35T, E40D, K122E, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
1176 1176 None None   V35T, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211T  
1177 1177 None None   V35T, T39N, E40D, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
1178 1178 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, D121H, K122E, I135T, S162Y, K173S, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211K, F214L  
1179 1179 None None   V35T, E36D, V60I, K122E, I135V, A158S, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
1180 1180 None None   E28R, K32E, V35T, E36D, T39N, V60I, V90I, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
1181 1181 None None   V35T, V60I, D121H, K122E, I135V, Q174R, D177E, I178V, G196E, T200A, Q207E, R211K N175V 
1191 1191 None None  E138A V35T, T39A, E40D, S68G, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K  
1192 1192 None None   V35T, I135V, S162A, T165I, K173T, Q174K, D177E, I178L, Q207E  
1193 1193 None None   V35T, V60I, K102Q, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
1194 1194 None None   V35T, E36A, T39K, K43E, D121H, K122E, D123G, I135T, I142V, S162H, K173S, D177E, V179I, Q207A  
1196 1196 None None   V35T, K49R, I50V, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E V241F 
1198 1198 None None   K22N, V35T, E36D, T39K, K43E, K49R, F171Y, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, F214L  
1201 1201 None None  V106I V35T, T39K, K43E, E53D, D121H, K122E, D123S, I142V, S162Y, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L K20G 
1203 1203 None None   V35T, E36D, T39M, V90I, D121H, K122E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
1204 1204 None None   V35T, T39S, V60I, S68G, D123N, I135K, S162C, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K  
1206 1206 None None   V35T, E36D, D121H, K122E, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
1207 1207 None None   V35S, E36D, V60I, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207E  
1210 1210 None None   V35T, E36D, T39A, E40D, K49R, D123N, I135T, S162A, K173T, Q174E, D177E, Q207A, R211K, F214L  
1211 1211 None None   V35T, V60I, I135L, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
1212 1212 None None   E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K P176E 
1213 1213 None None   V35T, V60I, K122E, I135V, K173A, Q174K, D177E, Q207E, R211S  
1215 1215 None None   K20R, V35T, E36D, K49R, V60I, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, D177E, T200A, E203D, Q207E  
1219 1219 None None   V35K, E36D, V60I, K102E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
1225 1225 None None   V35T, I135V, S162A, S163G, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, R211N K66N 
1226 1226 None None   V35T, E36D, K49R, V60I, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
1227 1227 None None   V35T, E36D, K102N, K122E, D123N, I135V, S162A, K166R, E169R, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K  
1228 1228 None None   V35T, T39L, K122P, I135T, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
1229 1229 None None   V35E, E36D, V60I, S68G, D123E, I135T, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
1234 1234 None None   K20R, V35T, T39S, E40D, K49R, V60I, S162A, K173T, T200A, Q207E  
1237 1237 None None   K32R, V35T, E36D, T39M, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207N, R211K  
1239 1239 None None   V35T, V60I, D121H, K122E, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
1241 1241 None None   V35T, E36D, T39S, K64R, I135R, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E  
1242 1242 None None   V35T, K49R, V60I, K122E, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
1243 1243 None None   V21I, K32R, V35T, T39K, S48T, V60I, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211T  
1244 1244 None None   V35T, E36D, L109I, K122E, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
1245 1245 None None   V60I, I135T, I142V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I195L, T200A, Q207E, R211K  
1246 1246 None None   K20R, V35T, T39M, V60I, K102Q, I135V, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, R211K  
1247 1247 None None   V35T, E36A, T39K, K43E, K122E, D123N, I135T, S162G, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207D H221A 
1248 1248 None None  V179E K20R, V35T, E36D, A98S, K122P, D123E, I135V, T165I, Q174A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
1252 1252 None None   V35T, E36D, K49R, V60I, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
1254 1254 None None   V35T, E36A, T39K, K43E, V60I, I135T, S162Y, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A  
1258 1258 None None   V35T, V60I, I135V, A158S, S162A, K173A, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E, W212R  
1259 1259 None None   V21I, K32R, V35T, T39A, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207K, R211K, F214L  
1260 1260 None None   V35T, K122E, I135V, S162A, S163G, Q174E, D177E, T200A, Q207E, R211K  
1266 1266 None None   V35T, E36A, T39K, K43E, K49R, D121H, K122E, I142V, K173L, Q174K, D177E, V179I, I180V, Q197E, T200A, I202V, Q207A, R211K  
1267 1267 None None   K22N, V35T, V90I, K122E, I135V, S162A, K173A, Q174A, D177E, T200A, Q207E, R211K, Q222P  
1268 1268 None None   V35T, E36D, T39A, S162A, E169Q, K173V, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
1269 1269 None None   V35A, T39A, E40D, D121Y, K122E, A158S, I159V, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
1270 1270 None None   V21I, V35T, V60I, D121H, K122E, S162C, Q174E, D177E, I178L, T200A, Q207E D17V 
1271 1271 None None   V35T, T39K, K43E, S162Y, K173S, Q174R, D177E, V179I, Q207E, R211K  
1272 1272 None None   E36D, D123E, I135T, A158S, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
1273 1273 None None   V60I, D123E, I135T, I142V, S162A, K173T, Q174R, D177E, I195L, T200A, Q207E, R211K  
1274 1274 None None   V35P, E36D, E40D, K49R, V60I, D121H, K122E, I135V, S162A, T165I, K173A, Q174R, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207E, R211K  
1275 1275 None None   V21G, V35T, V60I, D123E, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207P, R211K  
1276 1276 None None   V35T, V60I, D121H, K122E, K173D, Q174K, D177E, V179I, Q207A  
1278 1278 None None  H221Y V35T, I37V, K122E, D123N, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, Q222P  
1279 1279 None None   T27S, K32R, V35T, T39P, V60I, K122E, D123N, K173E, Q174K, D177E, I178M, T200A, I202V, Q207N, R211K  
1280 1280 None None   V21I, T27S, K32N, V35T, T39R, V60I, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, F214L, Q242H K30Q 
1282 1282 None None   V35T, E36D, V60I, K102Q, I142V, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
1283 1283 None None   V21I, V35T, V60I, W88C, D123N, K173I, Q174K, D177E, Q197H, T200E, Q207E, R211K  
1284 1284 None None   K20R, V35T, T39R, V60I, K102R, K104R, D123N, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, E224D  
1296 1296 None None   V21I, V35T, E36D, T39L, V60I, V90I, I135V, T139L, S162A, K173T, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211S  
1297 1297 None None   V35T, E36D, V60I, I135L, S162A, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202L, Q207D  
1298 1298 None None   V35T, T39I, E40D, K49R, I135V, S162A, E169A, K173T, Q174R, D177E, I178M, V189I, T200A, Q207E, R211K, W212G  
1301 1301 None None   V35T, E36D, V60I, K122E, D123N, I135L, S162A, K173A, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, T240P  
1304 1304 None None   V35T, E36D, V60I, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207E, R211K  
1306 1306 None None   K30E, V35T, T39P, V60I, D121Y, K122E, I142V, Q174R, D177E, I178M, I195L, Q207E, R211K, D218E  
1309 1309 None None   V35T, E36A, T39K, K43E, K122E, D123N, I135T, I142V, S162N, K173S, Q174R, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211K, F214L  
1310 1310 None None   V35T, V60I, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207D, R211K  
1311 1311 None None   E28A, K32Q, V35T, T39K, K122E, D123N, I135T, I142V, S162Y, K173S, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211K, F214L  
1312 1312 None None   K20R, V21I, K22R, K30E, V35P, T39P, V60I, K122E, I135V, S162C, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
1314 1314 None None   V21I, V35T, T39S, V60I, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
1320 1320 None None   V21I, V35T, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
1322 1322 None None   V35T, E36D, K122E, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
1323 1323 None None   V35T, V60I, V90I, K122E, I135V, S162A, T165I, F171Y, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
1325 1325 None None   V35T, E36D, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
1327 1327 None None   V21I, V35T, K49R, V60I, D121A, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K  
1329 1329 None None   V35T, E36A, T39K, K43E, I135V, S162A, F171Y, K173S, D177E, V179I, T200A, I202V, R211K  
1330 1330 None None   K20R, V21I, V35I, V60I, W88C, K122A, D123S, I135T, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
1333 1333 None None   V21I, V35P, E36D, V60I, V90I, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
1338 1338 None None   V21I, V35T, T39K, K43E, V60I, D123E, Q174K, I178L, G196E, T200A, Q207E, R211Q N175A 
1341 1341 None None   K32T, V35K, T39A, V60I, S68G, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V241I  

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