Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Tee (2006)
Title Prevalence and pattern of drug resistance mutations among antiretroviral-treated HIV-1 patients with suboptimal virological response in Malaysia.
Citation Med Microbiol Immunol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 50
NumPts 36
Subtype CRF01_AE, B, B + CRF01_AE

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
MYKL1351 03MYKL1351 NRTI, AZT, 3TC EFV M184V K103N, P225H V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123S, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, K238R, V245E  
  04MYKL1351.1 NRTI, AZT, 3TC EFV M184V A98G, K103N, P225H K20R, V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123S, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MYKL1352 03MYKL1352 AZT, 3TC EFV   K20R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I159V, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, V245E T84I 
MYKL1356 03MYKL1356 D4T, DDI EFV M41L, D67G, L74V, T215F L100I, K103N V35K, T39K, K43E, I47F, T58I, V60I, S68G, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200E, Q207A, R211S, K223Q, K238R, V245E Y56S, T84I 
  03MYKL1356.1 D4T, DDI EFV M41L, D67G, L74V, L210W, T215F L100I, K103N V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, V118I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MYKL1364 03MYKL1364 NRTI, AZT, 3TC None M41L, D67N, K70R, V75I, T215Y, K219Q E138K V35T, T39E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MYKL1368 03MYKL1368 AZT, 3TC None  Y188L V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, E203D, Q207A, R211S, V245E  
MYKL1384 03MYKL1384 D4T, DDI NVP K219Q K101E, Y181C, G190A L34I, V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, I195V, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MYKL1392 03MYKL1392 AZT, 3TC EFV  K103N, Y188L K20R, V35T, T39K, K122E, D123S, I135L, R172K, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K, K238R, V245E  
  03MYKL1392.1 AZT, 3TC EFV  K103N, Y188L K122E, D123S, I135L, R172K, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K, K238R, V245E  
MYKL1395 03MYKL1395 NRTI, AZT, 3TC NVP   V35T, T39K, K43Q, I47F, D67A, T107P, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, V245E  
MYKL1399 03MYKL1399 NRTI, D4T, DDI EFV D67N, K70R K103N, H221Y, K238T K20R, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, V245E  
  04MYKL1399.1 NRTI, D4T, DDI EFV D67N, K70R, K219Q K103N, K238N K20R, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, D218E, V245E  
  04MYKL1399.2 NRTI, D4T, DDI EFV D67N, K70R, K219Q K103N, K238N K20R, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, D218E, V245E  
MYKL1402 03MYKL1402 AZT, 3TC EFV M184V K103N, V108I, K238T K20R, T27P, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200M, Q207A, R211S, V245E  
  04MYKL1402.1 AZT, 3TC EFV M184V A98G, K103N, V108I K20R, V35T, T39K, K43E, T69P, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, E224D, V245E  
  04MYKL1402.2 AZT, 3TC EFV M184V A98G, K103N, V108I K20R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, E224D, V245E  
MYKL1409 03MYKL1409 AZT, 3TC EFV   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211I, K238R, V245E  
MYKL1415 03MYKL1415 AZT, 3TC EFV   V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MYKL1439 03MYKL1439 AZT, 3TC EFV  K103N, Y181C, P225H K20R, V35T, T39N, V90I, K122E, D123S, K166R, K173I, Q174K, I178L, E194A, T200I, Q207A, R211S, L228R, K238R, V245E  
MYKL1450 03MYKL1450 AZT, 3TC EFV M184V K103N V35T, T39K, K43E, N54I, W88C, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E W24G 
  04MYKL1450.1 AZT, 3TC EFV M184V K103N V35T, T39K, K43E, W88C, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MYKL1477 03MYKL1477 AZT, 3TC EFV K70T  V35T, T39K, V60I, S68G, L109I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MYKL1482 03MYKL1482 NRTI, D4T, DDI None M184V, T215F A98G K20R, V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123S, I135V, K166R, K173I, Q174K, D177E, Q207T, L210M, R211S, F214L, K238R, V245E  
MYKL1509 03MYKL1509 D4T, DDI EFV D67N, K70R V106I, Y188L V35T, T39K, K43E, K101Q, K122E, D123S, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178V, Q207A, R211S, K238R, V245E V179N 
  04MYKL1509.1 D4T, DDI EFV D67N, K70R, K219Q V106I, Y188L V35T, T39K, K43E, K101Q, K122E, D123S, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178V, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MYKL1510 03MYKL1510 AZT, DDI, 3TC EFV  V106I V35T, T39K, K43E, V75L, K122E, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211N, K238R, V245E  
MYKL1518 03MYKL1518 D4T, DDI EFV M41L, D67N, L210W, T215Y A98G, V106I, Y188L V35T, T39K, K43E, E44D, V118I, K122E, D123S, I135V, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, I202V, Q207A, R211N, K238R, V245E  
  03MYKL1518.1 D4T, DDI EFV M41L, D67N, L210W, T215Y A98G, V106I, Y188L V35T, T39K, K43E, E44D, V118I, K122E, D123S, I135V, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, I202V, Q207A, R211N, K238R, V245E  
MYKL1531 03MYKL1531 NRTI, DDI EFV L74V K101P, K103N V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245T  
  04MYKL1531.1 NRTI, DDI EFV L74V K101P, K103N V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245T  
  04MYKL1531.2 NRTI, DDI EFV, NVP L74V K101P, K103N V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245T  
  04MYKL1531.3 NRTI, DDI EFV, NVP L74V K101P, K103N V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245T H208P 
MYKL1570 03MYKL1570 AZT, 3TC EFV M41L, D67N, M184V, L210W, T215F V179E, Y188L V35T, T39K, K43E, E44D, K64R, V111I, V118I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V189I, G196E, T200A, Q207A, H208Y, R211S, W212C, K238R, V245E  
MYKL1614 04MYKL1614 NRTI, DDI EFV M41L, D67N, K70R, L74V, M184V, T215Y, K219E L100I, Y188L T39P, D123E, S162A, Q207E, V245T C38F 
MYKL1620 04MYKL1620 AZT, 3TC NVP M184V, T215Y K103N, M230L V21G, T27P, V90I, S162C, T200A, R211K  
  04MYKL1620.1 AZT, 3TC, D4T NVP   V90I, K122E, S162C, E169D, T200A, R211K  
MYKL1623 04MYKL1623 None EFV  V179D, Y188L V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MYKL1652 04MYKL1652 AZT, 3TC EFV M41L, M184V L100I, K103N, H221Y L34I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, L228R, K238R, V245E  
MYKL1659 04MYKL1659 AZT, 3TC EFV M184V K103N V35T, T39K, I50V, K122E, D123N, S162N, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207D, R211K, K238R, V245E  
MYKL1664 04MYKL1664 AZT, 3TC EFV  V179D V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, S163T, T200I, Q207A, R211K, K238R, V245E V111M 
MYKL1665 04MYKL1665 AZT, 3TC EFV  V106I, V179D T27P, D123E, K166R, I180V, T200A  
MYKL1743 04MYKL1743 NRTI, D4T None   V35T, T39K, K43E, T107S, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MYKL1779 04MYKL1779 NRTI, AZT, DDI None   V35T, T39K, K43E, D121H, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I180V, Q207A, R211S, V245E  
MYKL1814 04MYKL1814 NRTI, AZT, 3TC None M41L, F116Y, Q151M, M184V  E28G, E29G, V35T, T39K, E40G, K43E, V60I, S68G, K122E, D123S, K173I, Q174K, Q207A, R211S, F214L, K238R, I244V, V245E L34M 
MYKL1822 04MYKL1822 NRTI EFV D67N, T215F, K219E K101E, Y181C, G190S L34I, V35T, T39E, V60I, W88C, K122E, D123S, S162Y, K173I, Q174K, D177E, I178L, R206K, Q207A, R211S, V245E  
MYKL1855 04MYKL1855 NRTI, 3TC, D4T None M41L, M184V, T215Y Y188L V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, I202V, V245E  
MYKL1870 04MYKL1870 NRTI, D4T, DDI EFV  K103N V35T, V60I, K122E, D123S, K173I, Q174K, I178M, G196E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MYKL1949 04MYKL1949 D4T, DDI None T215N  V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, T165I, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A, K238R, V245E P236R 
MYKL1958 04MYKL1958 NRTI, AZT, 3TC EFV L74V L100I, K103N, P225H V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245E