Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Katzenstein (2001)
Title Virologic and CD4 cell response to zidovudine or zidovudine and lamivudine following didanosine treatment of human immunodeficiency virus infection.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 83
NumPts 48
Subtype B

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
ACTG302_1062 1062RT_bl DDI None L74V  V35I, K122KE, I135T, S162C, I178M, S251I  
ACTG302_1320 1320RT_bl AZT, DDI None M41L, L210W, T215Y  E6D, T39A, K43E, K49R, K82R, R83K, V118I, E169D, R211K  
  1320RT_f1 AZT, DDI, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y  E6D, K11KR, T39A, K43E, K49R, K82R, R83K, V118I, E169D, F171FY, R211K, A272P, K277R, Q278H, T286A A267AS 
ACTG302_1444 1444RT_bl DDI None M41ML, L74LV, M184MV  K11KQ, K102KQ, I135M, I159L, S162SA, Q197R, R211RK, V245M, A288AS, I293V, E297K, E302ED F61FL, W71WC 
  1444RT_f1 DDI, AZT, 3TC None A62V, L74V, V75T, M184V  I37L, V90I, I135M, S162A, Q197R, V245M, A288S, I293V, E297K  
ACTG302_1508 1508RT_bl AZT, DDI None M41L, D67N, K70R, T215Y  K20R, V60VI, D123E, I135T, Q174QR, Q207E, R211K P133R 
  1508RT_f1 AZT, DDI, 3TC None M41L, D67N, K70R, M184V, T215Y  K20R, V60VI, V118VI, D123E, I135T, Q174R, N175NY, G196E, Q207E, R211K, T286A  
ACTG302_1521 1521RT_bl DDI None L74V, M184V  W24WC, K49R, T107P, D177DE, V245M, T286N, E297K V241VE, K275KN, K287KN 
  1521RT_f1 DDI, AZT, 3TC None L74V, M184V, T215Y  I31L, K49R, K102R, V118I, K122R, V245M, E297K, E300ED, L301LV E302E* 
ACTG302_1830 1830RT_bl AZT, DDI None   V35VI, A272P, T286A, I293V  
  1830RT_f1 AZT, DDI, 3TC None   V35VI, D123DE, D177DE, I178IM, R211RK  
ACTG302_1889 1889RT_bl AZT, DDI None M41L, L210W, T215Y  K20R, K22R, E44D, R83RK, V118I, K122E, I135V, E169D, R211RK, K223KQ, L228H, K277R  
  1889RT_f1 AZT, DDI, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y  K20R, E44D, R83K, V118I, K122E, I135V, E169D, K223Q, L228H  
ACTG302_1893 1893RT_bl AZT, DDI None D67DE, K70R, F116Y, T215Y  V35I, T69S, R83K, S162C, R211X, A272P, K277R  
  1893RT_f1 AZT, DDI, 3TC None M41ML, A62V, D67E, K70R, F116Y, M184I, L210W, T215Y  V35VI, T69S, R83RK, V90I, V118I, S162C, T165TI, R211S, L228H, A272P, K277R R284RI 
ACTG302_1894 1894RT_bl DDI None L74V  I142T, E194K, R211K, F214L, K223KR, K281R, I293V, E297K  
ACTG302_1955 1955RT_bl DDI None L74V Y181C, H221Y K122E, I135T, Q174H, G196E, I202V, Q207E, R211K, A272P  
ACTG302_2022 2022RT_bl AZT, DDI None K70R  K49R, T69A, R211K, V245K  
ACTG302_2086 2086RT_bl AZT, DDI None D67N, K70R, T215I, K219EQ  T39A, V60I, R83K, S162Y, Q207A, R211S  
  2086RT_f1 AZT, DDI, 3TC None D67N, K70R, M184MV, T215TI, K219Q  T39A, V60I, R83K, S162Y, Q207A, R211S, D218DE, E300ED E291R, V292S 
ACTG302_2090 2090RT_bl AZT, DDI None M41L, L74V, T215Y  T39A, R83K, D123E, I142IM, D177E, I178LM, G196GE, A272P, K277R, I293V  
ACTG302_2098 2098RT_bl AZT, DDI None L74V Y181C, H221Y T7P, R83K, V90I, K122P, S162C, I178M, A272P, I293V, P294T, E302D  
  2098RT_f1 AZT, DDI, 3TC None M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y, K219N  R83K, V90I, V118I, K122P, I135V, S162C, I178M, G196E, E203V, A272P, K277R, I293V, P294T T139HN, E300E* 
ACTG302_2099 2099RT_bl DDI None L74V  T27S, I135T, I178M, R211K V292VG 
ACTG302_2101 2101RT_bl AZT, DDI None T215TS  D123E, S162A, I293V  
  2101RT_f1 AZT, DDI, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y  D123E, I135IT, N136T, S162A, T286A, I293V  
ACTG302_2145 2145RT_bl DDI None   I37IM, R83RK, K104KQ, D123E, G196GE, G262E, A272P, K281R, E297R, E302ED E42EQ, E194E* 
  2145RT_f1 DDI, AZT, 3TC None M184V  V35M, T69N, A98S, D123E, G196E, R211RK, A272P, K281R, E297R  
ACTG302_2344 2344RT_bl AZT, DDI None   T69N, D177E, I178L, I180IV, G196E, I293V, P294Q  
  2344RT_f1 AZT, DDI, 3TC None M184V  K11N, T69N, D177E, I178L, V179VI, G196E, I293V, P294Q  
ACTG302_2437 2437RT_bl AZT, DDI None M41L, D67N, L210W, T215Y  V35L, R83K, V118I, A158S, K173R, R211K, V245M, D250E  
ACTG302_2439 2439RT_bl AZT, DDI None M41L, D67N, L210W, T215Y  K20R, K104N, V118I, R211K, K277R, T286P  
  2439RT_f1 AZT, DDI, 3TC None M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y  K20R, K22KN, K43KE, K104KN, V118I, R211K  
ACTG302_2468 2468RT_bl DDI None M41L, L74LV, T215Y Y181YC D123E, S134SR, I135A, D177E, R211K, V245M  
  2468RT_f1 DDI, AZT, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y  V21VI, T39TA, D123E, I135T, D177E, R211K, V245M, A272P  
ACTG302_2657 2657RT_bl DDI None L74V, L210W  K103R, K122P, F171FY, I178M, G196E, R211RK, F214L  
  2657RT_f1 DDI, AZT, 3TC None M41L, L74V, M184V, L210LW  E79EK, K103KR, K122P, I178M, E204A, F214L, K277R, T286A, E297A  
ACTG302_2854 2854RT_bl DDI None M41L, D67DN, M184MV, L210W, T215Y  V35VIM, T39TA, K43KE, V118VI, A158AS, Q207QE, H208HY, R211K  
  2854RT_f1 DDI, AZT, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y  V21I, E40ED, V118I, I135IV, A158S, R211K  
ACTG302_2950 2950RT_bl AZT, DDI None L74V, M184V  K11R, R83K, K122E, N147NY, K166R, G196E, A272S, T286A  
  2950RT_f1 AZT, DDI, 3TC None M41L, L74V, M184V  K11KR, R83K, K122E, S162SN, K166R, G196E, A272S, T286A, I293IL, E297K A299AG 
ACTG302_2951 2951RT_bl AZT, DDI None M41L, K70KE, L210LW, T215Y  K64R, A98S, I135T, S162C, K166R, D177E, I178L, A272P, K277R  
  2951RT_f1 AZT, DDI, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y  A98S, I135T, D177DE, I178L, A272P, K277R Y271Y* 
ACTG302_2979 2979RT_bl DDI None K65KR, V75AT  I37L, K173KR, T200TI, Q207E, R211K, F214FL, K277R  
  2979RT_f1 DDI, AZT, 3TC None A62AV, V75T, M184V  I37L, K49KR, K101KQ, S162X, T200I, Q207E, R211K, F214L K166K*R 
ACTG302_2982 2982RT_bl AZT, DDI None   V35I, R83K, I178L, R211K, V245VI, S251I, Q269QH, A272P R206RG 
  2982RT_f1 AZT, DDI, 3TC None M184V  V35I, R83K, I178L, R211K, S251I, A272P, K277R E28E*, G262GV, A267AS 
ACTG302_3044 3044RT_bl AZT, DDI None M41L, L74V, T215Y V179VD K20R, T39TA, E53ED, K122E, I178M, T200TI, Q207E, R211Q, V245M, A272P, L283I, I293V E28E* 
  3044RT_f1 AZT, DDI, 3TC None M41L, M184V, T215Y  T39TA, V118VI, K122E, I135M, Q207E, R211Q, V245T  
ACTG302_3046 3046RT_bl DDI None   S48T, T69TN, R211RK, V245M, E248D, A272P, I293V  
  3046RT_f1 DDI, AZT, 3TC, Unknown Unknown M184V  S48T, T69TN, K102E, V245M, E248D, A272P, I293V  
ACTG302_3142 3142RT_bl AZT, DDI None K70R E138EA K20R, V35I, T69N, R83K, K102Q, I135T, Q197QL, R211K  
  3142RT_f1 AZT, DDI, 3TC None K70R, M184MV, K219KQ E138A K20R, T39TA, T69TN, R83RK, K102Q, K104KN, I135T, K166KR, T200TA, R211RK, F214FL, I293V  
ACTG302_3143 3143RT_bl AZT, DDI None D67N, K70RS, L74LV, K219Q  L12LF, T39A, A98S, K104N, D123E, K166KR, N175Y, D177DE, I180V, T200E, R211RS, F214L, V245E, A272P, T286A K13KQ, T128P 
  3143RT_f1 AZT, DDI, 3TC None D67N, K70R, M184V, T215FI, K219Q  K20KR, T39A, A98S, K104N, D123E, K166R, D177E, T200E, F214L, D218E, T240TS, V245K, G262GR, N265ND, A272P, G273GR H208HQ, I244IT, T253TP, W266WC, K281KE 
ACTG302_3208 3208RT_bl DDI None   A98S, T200A, R211K  
  3208RT_f1 DDI, AZT, 3TC None   A98S, T200A, R211K, T286A  
ACTG302_3300 3300RT_bl AZT, DDI None M41L, D67N, K70R, T215Y  K11R, V35I, K43KE, S48T, R83K, V90I, K101R, K102KE, S134R, N137X, S162H, K166R, K173KI, G196E, A272P, V276VA, K277R, K281KR, A288AS, I293IV, E297R D76DE, K287KN 
ACTG302_3304 3304RT_bl AZT, DDI None M41L, D67N, K70R, T215Y, K219Q  K20R, K43Q, V60I, D218E, L228LH, K277R, A288T, I293V, E297A  
  3304RT_f1 AZT, DDI, 3TC None M41L, D67N, K70R, M184V, T215Y, K219Q  K20R, K43Q, V60I, D218E, L228H, K277R, A288T, I293V, E297A  
ACTG302_3329 3329RT_bl DDI None L74V, M184MV  T107TP, Q174H, R211RK, F214L, W239WC, K277R, I293V Y146YC, H198HR, K287KN 
  3329RT_f1 DDI, AZT, 3TC None K65R, L74LV  Q174QH, F214L, K277R, I293V, E302D  
ACTG302_3523 3523RT_bl AZT, DDI None   T200TP, Q207E T139TP 
  3523RT_f1 AZT, DDI, 3TC None   Q207E, K277KR, I293V, E297EA  
ACTG302_3585 3585RT_bl AZT, DDI None D67N, T69D, K70R, V75T, K219Q V106I K102R, K104R, D123E, S162Y, K173KE, A272S, I293V  
ACTG302_3586 3586RT_bl DDI None L74V, M184V  I135T, S162A, R211K, T286A, V292I, E297K A98APS 
ACTG302_3588 3588RT_bl AZT, DDI None A62V, K70R, T215F  V35I, T69S, R83K, I135T, A158AS, K173N, G196E, A272P, K277R, E297K, E302D  
  3588RT_f1 AZT, DDI, 3TC None A62V, D67E, K70R, T215F  V35I, T69S, I135T, A158AS, K173N, G196E, A272P, K277R, Q278H, E297K K20KT 
ACTG302_3620 3620RT_bl AZT, DDI None D67N, K70R, L74V, V75T, K219Q  V35I, R83K, K104N, D123E, S162C, I178L, G196E, Q207R, F214FL, A272P, K277R  
  3620RT_f1 AZT, DDI, 3TC None M41L, D67N, K70R, M184MV, L210LW, T215Y, K219Q  V35I, K104KN, D123E, S162C, K173KN, Q174R, I178L, V179I, Q207R, D218E  
ACTG302_3623 3623RT_bl AZT, DDI None M41ML, L74LV, M184MV, L210LW, T215Y  K11S, S68SG, D123DE, S162CY, Q197QH, T200I, A272P I135*L 
  3623RT_f1 AZT, DDI, 3TC None M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y, K219N  K11R, Q23QH, K43Q, E44D, V60I, L100LF, V118I, D123E, I135L, S162Y, Q207E, R211K  
ACTG302_3657 3657RT_bl AZT, DDI None M41L, L74LV, M184MV, L210LW, T215Y  V118VI, K122E, D123NS, I135T, T200A, A272S  
ACTG302_3665 3665RT_bl DDI None   V8I, L26LF, R83K, I135V, T165I, D177DH, I202V, E204EA, K220KN, A272P, T286A E44EV, W71WC, Y183YC, D185DA 
  3665RT_f1 DDI, AZT, 3TC None   V8I, R83K, I135V, T165I, I202V, A272P  
ACTG302_675 675RT_bl DDI None   K49R, F87FL, V90I, A158AS, S162X, E169ED, T286A  
ACTG302_745 745RT_bl AZT, DDI None M41L, L74LV, T215Y  K122E, K173KN, Q207E, A272P, I293V, E305G, E312ED  
  745RT_f1 AZT, DDI, 3TC None M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y  K43Q, E44D, T69TA, V118I, K122E, D123DE, I142V, G196GE, Q207QE, I293V  
ACTG302_806 806RT_bl AZT, DDI None L74V  R83K, K122P, I135T, S162A, T165I, D177E, G196E, A272P, K277R, E297K  
  806RT_f1 AZT, DDI, 3TC None A62AV, L74V, M184V  I31IL, E44ED, R83K, K122P, I135T, S162A, T165I, D177E, G196E, F214FL, A272P  
ACTG302_865 865RT_bl DDI None   V35I, I142T, K166KI, I178IL, V179VG, R211K  
  865RT_f1 DDI, AZT, 3TC, Unknown Unknown M184V  K20KR, V35I, I47IF, K101KQ, K102KR, I142T, R211K  
ACTG302_996 996RT_bl AZT, DDI None K65R H221HY A98S, K102Q, D123E, I135T, S162A, V245R D17DA, W24WG 

Database

Resources

Team