Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Balotta (2000)
Title Prevalence of transmitted nucleoside analogue-resistant HIV-1 strains and pre-existing mutations in pol reverse transcriptase and protease region, outcome after treatment in recently infected individuals.
Citation Antivir Ther
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 38
NumPts 38
Subtype B, CRF02_AG

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
CB_10 CB_10 None None   V35T, K102R, I135V, S162A, K173T, Q174R, T200A, Q207E  
CB_AR CB_AR None None K70KR, K219Q  K20R, T39A, V60I, T69N, K103R, V118I, K122E, I135T, T200A, F214L  
CB_BJ CB_BJ None None K70KR, T215Y  K20R, I142V  
CB_BL CB_BL None None   K49R, R83K, I135T, T165I  
CB_BM CB_BM None None   K11R, R83K, A98S, D123E, D177E, I178L, R211K  
CB_BUL CB_BUL None None   I5M, I31IR, V35T, S48SP, V60I, I135T, T165I Y56D 
CB_CA CB_CA None None   E6D, I135T, K166R, E169G, K173E, D177E, T200I, I202V, R211K, F214L  
CB_CC CB_CC None None   K49R, K122E, I135T, K173Q, D177E, Q207E  
CB_CD CB_CD None None   E53D, D121H, K122E, I178L, I202V, K223KE  
CB_CHD CB_CHD None None K70R  D123E, K173Q, D177E, I202V, Q207E E169V, Q174P 
CB_CIA CB_CIA None None   R83K, S162C, I178L, R211K  
CB_CM CB_CM None None   R83K, D123E, K166R, I195L, G196E  
CB_COD CB_COD None None   S48T  
CB_CR CB_CR None None K70R  D123E, I135L, S162C  
CB_DA CB_DA None None   V35I, D123E, I135T, I142V, K166R, T200I  
CB_DMD CB_DMD None None M41L, T215D  I135L, K166R, I178L, I202V, E204D, L210S  
CB_DPC CB_DPC None None   K11R, V60I, R83K, D121H, K122E, I135T, I178L, R211K  
CB_FC CB_FC None None   V35M, T39A, R83K, I135V, S162C, T200A  
CB_FE CB_FE None None   K49*, R83K, I135V, I178L, T200A R72S 
CB_FS CB_FS None None   V35I, Q197H, Q207E, R211K  
CB_GA CB_GA None None   I142V  
CB_GM CB_GM None None   R83K, D123E, I142T, D177E, I178V  
CB_LB CB_LB None None   V35I, R83K, T200E, Q207H, R211K  
CB_LM CB_LM None None K70R  D123E  
CB_MA CB_MA None None   I142T, D177E, R211G  
CB_ME CB_ME None None   D113Y, A158S, F214L, E224K  
CB_MG CB_MG None None  K101E, P225H K20R, R83K, I142T, T165I, I202V  
CB_MIG CB_MIG None None T215Y G190A I135T, R211K G99V 
CB_MM CB_MM None None K70R  E6D, S48E, D123E, I178L, R211K  
CB_PV CB_PV None None   K49R, K122E, D123G, I135T, K173Q, D177E, Q207E  
CB_RA CB_RA None None   S162C, E169D, G196E  
CB_RM CB_RM None None   K122E, D123K, D177E, Q207R, R211K  
CB_SL CB_SL None None   K20R, G196E, T200A, R211V, F214L  
CB_SR CB_SR None None   I135T, T200I, Q207*, F214L  
CB_SS CB_SS None None   E44D, D86E, V118I, D123E, I142K, T200A, F214L  
CB_SV CB_SV None None   R211G  
CB_TI CB_TI None None   K49R, K122E, D123G, K173Q, D177E, Q207E  
CB_ZL CB_ZL None None   V118I, D121Y, K122E, R211K, F214L  

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