Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Murphy (1999)
Title Treatment with amprenavir alone or amprenavir with zidovudine and lamivudine in adults with human immunodeficiency virus infection. AIDS Clinical Trials Group 347 Study Team.
Citation J Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 40
NumPts 24
Subtype B

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
ACTG347_0008 008_RT_w0 None None   V60I, S68G, D86E, K102Q, K104T, T107X, S117SP, D121Y, K122E, I135T, N136T, S162C, T200A, R211K, E248ED, A272P D192DH, K249KM 
  008_RT_w12 None None   K64X, S68G, D86E, D121Y, K122E, I135T, T200A, Q207X, R211K, I244K, A272P K73Q, S162*CW, Q269QK 
ACTG347_0009 009_RT_w0 None None   I2T, V8VA, M16MV, E40D, K46X, I47X, S48SPT, I50X, R83K, I94IL, D123E, N137NS, L149P, K154KR, S162SG, S163SG, L168X, Q197X, I244IL K22KI, P52V, E53EAG, K73KE, Q85H, N147NIS, Y232YF, S268SN 
  009_RT_w14 None None   R83K, D123E, A272P  
ACTG347_0035 035_RT_w0 None None  V179D I47IF, I142V, Q174A, P176PS, I202V, I257IL, A272P A129AG, S156SL 
  035_RT_w17 None None  V179D K102R, I142V, Q174A, I202V, Q269*, A272P, K277R, T286A C280L 
ACTG347_0039 039_RT_w13 AZT, DDI, 3TC, D4T NVP M41L, T215C V179D, F227FL A98S, K102Q, K122E, D123N, K219X, L228X  
ACTG347_0040 040_RT_w11 AZT, 3TC None M184V  E6ED, K32R, K49R, I50V, T165I, F214L, P226S S68SC 
ACTG347_0043 043_RT_w20 AZT, 3TC None M184V  I135V, K173KE, R211Q Q222QK 
ACTG347_0044 044_RT_w0 None None M41L, T215C V179D A98S, K102Q, K122E, D123N, A272P, T286A D110DV 
ACTG347_0068 068_RT_w21 AZT, 3TC None M184V  V35T, K122E, K166R, I202V, Q207E, L210F, R211K  
ACTG347_0070 070_RT_w0 AZT, DDI None T215Y, K219KQ  V35IMT, T39TA, R83K, K102KE, R125RK, I135V, N137NH, V179VG, Q207P, V254G V111VG, T128TS, Y188YD 
  070_RT_w16 AZT, DDI, 3TC None T215Y  V35IMT, T39TA, R83K, I135V  
ACTG347_0073 073_RT_w0 None None  V106I D121Y, K122E, D123E, S162T, I178L, T200A, R211K, V245I, D250T S268SR 
  073_RT_w22 AZT, 3TC None  V106I D121C, K122E, S162T, I178L, T200A, R211K, V245I, D250T  
ACTG347_0129 129_RT_w0 AZT, DDI None M41L, D67N, K70R, T215F, K219Q  T39TA, D123E, K166R, D177E, G196E, I202V  
  129_RT_w8 AZT, DDI None M41L, D67N, K70R, T215F, K219Q  I2T, I5L, K46E, F77FS, D123E, K166R, D177E, G196E, I202V, A272P, K277R, T286A D17Y, G18V, K32K*, P97PS 
  129_RT_w12 AZT, DDI None M41L, D67N, K70R, T215F, K219Q  T39A, D123E, K166R, D177E, G196E, I202V  
ACTG347_0131 131_RT_w0 DDI, AZT None   K20R, W24WR, W88F, T200V, Q207QH, R211K, F214L, V245M  
  131_RT_w12 DDI, AZT, 3TC None M184V Y188YH K11KE, K20R, N57ND, W88F, I135IL, T200V, R211K, F214L, V245M T58TA 
ACTG347_0132 132_RT_w0 AZT, DDI None K65KR  R83K, G152X, W153X, K154X, G155X, S156X, Q161H, S163G, F171L, K173T, Q182H, D186E, T200S, K223KR, A272S, K277KR, T286A, I293V, F346Y, M357V, S379G, V381I, A400T Y144H, Q151QH, N175T, D192DH, Y319YCF 
  132_RT_w8 AZT, DDI None   R83K, K103KR, I142IM, S162C, T200I, A272S  
ACTG347_0134 134_RT_w0 AZT, DDI None M41L, L210W, T215Y  V118VI, D123E, K166R, I178IM, E203ED, R211K, V245M, E248D, A272PS, K277GR, I293V E6E* 
  134_RT_w12 AZT, DDI None M41L, L210W, T215Y  D17E, Q23X, W24WR, P25X, T27X, E29EG, I31M, V35X, E36EG, T39X, K43Q, V118I, K122KR, D123E, K166R, D177E, E203D, R211K, L234X, V245M, E248ED, K263X, A272P K22ILV, L26LM, K30MT, C38C*W, Y56S, N57NI, D237DH 
ACTG347_0140 140_RT_w0 AZT None K70R  K22KR, L34LF, V35I, E36EA, E42X, K43KT, R83K, K103X, D123E, D177E, Q207E, R211K I47IM 
ACTG347_0193 193_RT_w0 AZT, DDI, DDC None M41L, D67N, L210W, T215Y  V118I, D123E, K166R, D177E, G196E, T200A, H208Y, R211K Q174QP, R199R* 
  193_RT_w12 AZT, DDI, DDC None M41L, D67N, L210W, T215Y Y181YS E28EG, S117P, F130FL, S134R, N136X, N137X, E138X, T139X, N147X, S162SR, S163C, M164L, K166R, D177E, G196E, T200AP, R211K, T216TP, Q222QR, Q242QP, L246LP E89ED, F116L, V118L, T128A, G141W, R143I, Y146Y*, L149S, Q161Q* 
ACTG347_0194 194_RT_w13 AZT, 3TC None   K122E, A158S, R211K, F214FL, V245E S268SR 
ACTG347_0195 195_RT_w9 AZT, 3TC, D4T None M184V  V8VA, K32KR, I135T, K166R, R211K, V245M  
ACTG347_0291 291_RT_w0 None None  E138EK A98AS, K102Q, K122KR, K126KR, S162SC, Q174QH, D177DE, E203EG, K277KR, A288AS, I293V, Q334QHR, G335GS, R356RK, R358RK, D364DG, T369TA, A371AV, I375IV, A376AT, T386TI, A400AT, V435I, S468P V90VF, D185DG 
  291_RT_w8 None None  E138G R72RG, A98S, K122E, I135V, Q174H, D177E, E248D, D250DE, I274V, T286TA, A288S, I293V, D324DN, G335D, K347*, T369A, A371AV, A376T, A400T Q258QH, V261VM, K281T, I375S 
ACTG347_0293 293_RT_w0 AZT, DDI None   K22KN, T27TP, T39TP, R83K, D123E, I159V, T200A, P236X, N265NK, A272P, K277R, K281R, T286A, I293L, E297K  
  293_RT_w22 AZT, DDI, 3TC None M184MIV  E28EA, R83K, D123E, I159V, V179A, T200A P59T 
ACTG347_0321 321_RT_w0 Unknown Unknown K65KR  K66KR, T69TA, Q91QH, D113DE, V118A, V245E, E248N, D250E F61FC, V148VA 
ACTG347_0323 323_RT_w0 None None   Y144X, S162C, E203D, R211K  
  323_RT_w12 None None   S162C, K166KR, E203D, R211K  
ACTG347_0386 386_RT_w0 None None   R83K, D123E, I135T, K173Q, R211K  
  386_RT_w25 AZT, 3TC None M184MV  E79D, K82KR, R83K, E89K, D123E, I135T, K173Q, R211K L80F, N81NI 
ACTG347_0391 391_RT_w0 AZT DLV D67DN, K70R, K219Q K103N V60VI, D121Y, K122E, S162C, E169EK, I178IL, T200I, R211K, F214L, K223KT, V245T, E248V, K249KQ, D250E K64KQ, L74L* 
  391_RT_w16 AZT, 3TC DLV K70R, M184V, K219Q K103N V60VI, T69N, D121Y, K122E, T139TI, A158AS, S162C, R211K K102KT