Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Babic (2006)
Title Prevalence of antiretroviral drug resistance mutations and HIV-1 non-B subtypes in newly diagnosed drug-naive patients in Slovenia, 2000-2004.
Citation Virus Res
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 76
NumPts 76
Subtype B, A, CRF02_AG, CRF01_AE, F, CRF09_cpx


Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
DB_SI10311-03 SI10311-03 None None   E6ED, K20R, V35M, T39A, K122E, I178L, T200A, I202V, E204EK, R211G, A272P, T286A, P294Q, A304E  
DB_SI10858-04 SI10858-04 None None   V35T, K49R, V60I, K122E, D123N, T139K, I142V, T200I, Q207X, R211K, A272S, Q278E, E297A, Q334H  
DB_SI11518-04 SI11518-04 None None   K20R, V35I, R83K, K104KN, I178L, I195L, T200A, I202V, A272P, K277R, P294S, D324N, Q334H  
DB_SI1305-01 SI1305-01 None None   D123E, S162C, T200A, V245E, V276VI, Q278H, I293V, E297M, K311R  
DB_SI1321-04 SI1321-04 None None   V60I, K122E, D123N, T139K, I142V, S162C, Q174K, T200I, Q207D, R211K  
DB_SI1329-04 SI1329-04 None None T215D  R83K, I142T, S162C, I178L, I202V  
DB_SI1339-04 SI1339-04 None None   V60I, K122E, D123N, T139K, I142V, Q174QK, T200I, Q207D, L210X, R211K  
DB_SI156-04 SI156-04 None None   V60I, K122E, D123N, T139K, I142V, T200I, Q207N, R211K  
DB_SI1661-04 SI1661-04 None None   K122Q, T139V, D177E, R211K  
DB_SI1761-01 SI1761-01 None None   V60I, D123E, I135T, I142IM, D177E, I202V, F214L, V245Q, A272P, K277R, A288S, I293V, E297Q, L325I, Q334L  
DB_SI18-04 SI18-04 None None   V35I, I135M, R211K, P294Q, V317A  
DB_SI1916-04 SI1916-04 None None   T39M, V60I, K102E, I135T, K173T, Q174K, T200A, Q207N, R211K, V245Q  
DB_SI1994-00 SI1994-00 None None   E53D, S68G, S162C, K166R, D177E, T200A, R211K, A288S, I293V, E312EQ, I326V  
DB_SI2002-02 SI2002-02 Unknown Unknown M41L, D67N, M184MIV, L210W, T215Y, K219N L100I, K103N V35L, K43E, E44A, V118I, K122E, I142V, V179VI, V245T, A272P, K277KR, I293V, E297A, G333E  
DB_SI2063-00 SI2063-00 None None   K102KQ, K122E, D123E, S162C, Q174K, I178L, G196E, Q197K, T200S, R211RK, V245E, A272P, K277R, I293V, P294S, E297K  
DB_SI209-00 SI209-00 None None   K122E, I142IT, I178M, Q207E, V245K, A272P, I329L, Q334N  
DB_SI2113-03 SI2113-03 None None  V179D T200I, V245E, K277R, A288S, V292I, I293V, P294T, I326V  
DB_SI2338-00 SI2338-00 None None   K20R, V35I, E53D, S68G, I135T, S162C, K166KR, D177E, T200A, R211K, I293V, I326V  
DB_SI2394-04 SI2394-04 None None   D123N, I135M, R211K  
DB_SI2663-04 SI2663-04 None None   K104N, K166R, Q207E, R211K, F214L  
DB_SI2704-00 SI2704-00 None None A62V, M184V  S162A, I202V, R211K, F214L, L228R  
DB_SI3076-00 SI3076-00 None None   K49R, V60I, R83K, I135T, E169D, G196GE, A272P  
DB_SI3099-01 SI3099-01 None None   V35I, R83K, K101R, K173R, T200A, A272P, K277R, P294S, E297R, I329V  
DB_SI3266-02 SI3266-02 None None   T39K, D123G, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200K, Q207AV, R211K, F214L, V245Q  
DB_SI3347-02 SI3347-02 None None   R211K, V245M, D250DE, A272P, K277R, I293V  
DB_SI3418-01 SI3418-01 None None   V60I, K122E, D123N, T139K, I142V, T200I, Q207D, R211K, A272S, E297A  
DB_SI3458-02 SI3458-02 None None   V60VI, D121HY, K122E, I135T, G196E, T200I, L283I, I293V  
DB_SI3493-03 SI3493-03 None None  V179D I5V, E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43EQ, V60I, S68G, V111I, K122E, D123N, S163T, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, L282C, T286A, E291D, V292I, I293V, P294Q, E312T, V314A, S322L, I329V, K331N  
DB_SI376-02 SI376-02 None None   V35T, E40D, V60I, K102Q, K122E, D123E, I135V, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207E, V245Q, K281KR, T286A, E291D, V292VI, I293V, P294T, S322P, K331N  
DB_SI378-02 SI378-02 None None   V35T, E40D, V60I, K102Q, K122E, D123E, I135V, S162A, K173T, D177E, T200A, E204K, Q207E, V245Q, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, S322A  
DB_SI3927-04 SI3927-04 None None   V60I, K122E, D123N, I135T, T139K, I142V, T200I, Q207D, R211K  
DB_SI3942-02 SI3942-02 None None   R83K, Q174K, D177E, R211E, A272P, K277R, L283I, Q334QL  
DB_SI3943-02 SI3943-02 None None   R83K, Q174K, D177E, I202ILV, Q207R, R211E, A272P, K277R, L283I  
DB_SI4037-02 SI4037-02 None None   K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, I132V, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277S, T286A, V292L, I293V, P294T, K323Q, I326V  
DB_SI4314-03 SI4314-03 None None   V60I, K122E, D123N, T139K, I142V, T200I, Q207N, L210F, R211K, A272S, E297A  
DB_SI444-01 SI444-01 None None   S68G, K122P, I135T, D177E, I178V, T200A, Q207E, K277KR, T286A, Q334L  
DB_SI4688-03 SI4688-03 None None   E6ED, K49R, R211K, T286A, I293V, E297A, K311R, D324E, A327V, I329L V292E 
DB_SI4715-01 SI4715-01 None None   K20R, V35I, R83K, T165TI, I178L, G196E, I202V, R211RG, A272P, P294Q, A304E, E308EQ, I329V  
DB_SI4736-03 SI4736-03 None None   V60I, K122E, D123N, T139K, I142V, T200I, Q207D, L210F, R211K, A272S, E297A I329R 
DB_SI4982-04 SI4982-04 None None   V60I, S68G, I135T, R211H, I293V, P294A, E297K, I329L, K331N, Q332R, Q334E  
DB_SI4993-02 SI4993-02 None None   K46Q, T69A, K122E, I135L, Q197K, A272P, L283I, I293V, P294PS, E297T, L301M  
DB_SI5191-04 SI5191-04 None None   K20R, K49R, K122Q, I135V, S162C, K173R, D177E, R211S, E291D, I293V  
DB_SI5275-01 SI5275-01 None None T215D  K64R, R83K, I178L, I202V, V245M  
DB_SI53-05 SI53-05 None None   T39N, K122E, D123G, A158AS, K173L, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207A, R211S, V245M  
DB_SI5301-03 SI5301-03 None None   V35I, Q207D, R211K, V245T, I293V, I329L, Q334N E300G 
DB_SI5335-02 SI5335-02 None None   K22R, D123E, I135T, I142V, T165I, G196E, F214L, V245E, A272P, V276I, T286A, I293V, D324E  
DB_SI5336-02 SI5336-02 None None   V35I, D121HY, K122E, I135T, G196E, T200TI, L283I, V292I, I293V K66KN 
DB_SI548-03 SI548-03 None None  V179VD I178IMV, T200TI, V245EK, K277R, A288S, V292I, I293V, P294T, I326V, G335A  
DB_SI6145-02 SI6145-02 None None  E138A V60VI, S68G, K102Q, K122P, D123E, I135T, D177E, T200A, H221Q, A272P, T286A, V292I, K311R, H315P, I326LV D86G, F87S, T165LQ 
DB_SI6198-03 SI6198-03 None None   K122E, D123E, I135V, S162C, T200A, R211RK, V245E, K277R, I293V, E297K  
DB_SI6422-02 SI6422-02 None None   V60I, K122E, D123N, T139K, I142V, S162C, T200I, Q207D, R211K, A272S, E297A  
DB_SI6423-02 SI6423-02 None None   K122E, D123G, S162C, Q174K, I178L, G196E, Q197K, T200S, R211K, V245E, A272P, K277R, I293V, P294S, E297R, I329V  
DB_SI6424-02 SI6424-02 None None   K64R, K122E, S162C, K173N, Q174K, I178L, G196E, Q197K, T200S, R211K, V245E, A272P, K277R, I293V, P294Q, E297R, I329V  
DB_SI6439-02 SI6439-02 None None   V35I, K122E, D123N, T139K, I142V, T200I, Q207D, L210F, R211K, A272S, E297A  
DB_SI6515-04 SI6515-04 None None   R83K, D123E, G196E, Q197K, R211K, V245E, A272P, V276I, K281R, L283I, I293V, P294S, E297K  
DB_SI6645-00 SI6645-00 None None   T39A, V60I, D121H, K122E, D123DG, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245L  
DB_SI6663-03 SI6663-03 None None   V60I, K122E, D123N, T139K, I142V, T200I, Q207A, L210F, R211K, A272S, E297A  
DB_SI6826-01 SI6826-01 None None   V35I, V60I, K122E, D123N, T139K, I142V, T200I, Q207D, R211K, A272S, E297A  
DB_SI7097-04 SI7097-04 None None   K49R, I135T, Q174QH, I178IM, G196E, R211G  
DB_SI7123-04 SI7123-04 None None   K49R, K102R, S105SA, I135T, D177DN, G196E, R211G  
DB_SI7124-02 SI7124-02 None None   K122E, S162C, I178M, T200I, Q207DE, R211K, V245K  
DB_SI7136-03 SI7136-03 None None   S117P, K122E, A272P, K277R  
DB_SI7655-04 SI7655-04 None None   V35VI, V60I, A98AS, K122E, D123N, T139K, I142V, T200I, Q207E, L210F, R211K, A272S, E297A  
DB_SI7658-01 SI7658-01 None None   V60I, S68SG, K102Q, S162A, K173T, D177E, T200A, E204K, Q207E, R211K, V245Q  
DB_SI7918-02 SI7918-02 None None   R83K, D123E, I135T, S162C, Q174K, G196E, Q197K, E204D, R211K, V245K, A272P, K281R, V292I, I293V, E297K, Q334N  
DB_SI8213-02 SI8213-02 None None   K122E, D123N, I142T, K166R, Q197P, Q207D, R211K, A272S, K277KR  
DB_SI8266-04 SI8266-04 None None   R83K, K104N, I135RT, I195L, T200A, I202V  
DB_SI8421-02 SI8421-02 None None   V35T, E40D, K49R, D123E, I135L, S162C, K173A, Q174KR, I178IL, T200IV, Q207A, R211K, L228H, V245Q, E248D, A272P, L283I, T286V, E291D, V292I, I293V, E297T, K323R, Q334L  
DB_SI8427-04 SI8427-04 None None   V35T, E36D, T39M, K43N, K49R, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174K, P176S, D177E, I178IM, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297K, V317A  
DB_SI8504-04 SI8504-04 None None   A98S, K166R, L210F, R211K, V245E  
DB_SI879-00 SI879-00 None None   K20R, V35I, R83K, Q197K, T200I, I202V, R211K, A272P, K277R, L303LW, I329V, Q334L  
DB_SI900-02 SI900-02 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, I244V, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V, E312T, I326V, I329V  
DB_SI9180-04 SI9180-04 None None   I135T, K173KE, D177E, A272P, K277KR, I293V, I326V  
DB_SI9192-04 SI9192-04 None None   D121Y, K122E, I135T, T200I  
DB_SI943-00 SI943-00 None None   V60I, R83K, D123E, I135T, K166R, I178L  
DB_SI990-02 SI990-02 None None   K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, K323Q, I326V