Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Balakrishnan (2005)
Title HIV type 1 genotypic variation in an antiretroviral treatment-naive population in southern India.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 50
NumPts 50
Subtype C

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
YRG1 YRG1 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, D123G, I135R, S162Y, K173T, D177E, T200A, Q207E, M230X  
YRG10 YRG10 None None   V35T, E36EA, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162A, K173A, Q174KR, D177E, T200A, Q207E, R211K  
YRG11 YRG11 None None   V35T, E36EA, T39E, S48T, V60I, K122E, I135T, K173A, D177E, T200A, I202V, Q207V, R211K, F214FL W239Y, T240R 
YRG12 YRG12 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173A, D177E, I178L, E194D, T200A, E204K, Q207D, R211K  
YRG13 YRG13 None None   V35T, T39D, S48T, E53ED, V60I, D121HY, K122E, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E  
YRG14 YRG14 None None   V35T, E36EA, T39D, V60I, D121Y, K122E, I135T, K166R, K173A, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
YRG15 YRG15 None None   V35T, E36EA, T39D, V60I, D121Y, K122E, A158S, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, R211K  
YRG16 YRG16 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122X, I135T, K173A, D177E, T200A, Q207EG, K238X  
YRG17 YRG17 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, S162A, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
YRG18 YRG18 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, K104N, D121H, K122E, S162C, E169A, K173A, I178L, Q197L, T200A, Q207E, R211K S105Q, K126KN 
YRG19 YRG19 None None   V35T, E36A, T39E, A98S, K122E, D123S, K173E, D177E, T200A, Q207E, R211K W239Y, T240R 
YRG2 YRG2 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, K122E, I135R, K173T, D177E, T200A, I202V, Q207G, H221L, Q222R Y146Y*, E224T 
YRG20 YRG20 None None   K32E, V35T, E36A, T39DN, S48T, V60I, K122E, I135R, K173A, D177E, Q197L, T200A, Q207D  
YRG21 YRG21 None None   K20KR, V35T, T39E, S48ST, V60I, K103E, V118VI, D121Y, K122E, I135RT, I159IV, K166KR, K173A, D177Q, T200A, Q207E, R211K, F214L  
YRG22 YRG22 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E  
YRG23 YRG23 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, D121H, K122E, I135V, I142V, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K  
YRG24 YRG24 None None   M16X, K30R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K I31N 
YRG25 YRG25 None None   V8I, K22KR, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K104R, T107S, K122E, D123S, I135T, I142T, K173A, E194EG, T200A, Q207E, L210LS, R211K, F214FL W239Y, T240R 
YRG26 YRG26 None None   L26LF, T27X, E28ED, I31IM, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, K166X, K173A, D177E, T200A, Q207A M16N 
YRG27 YRG27 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162H, T165I, K173T, D177E, I178L, T200A, E204Q, Q207E, R211K, F214L  
YRG28 YRG28 None None   V35T, E36ED, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E  
YRG29 YRG29 None None  E138A V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162A, K166R, K173T, Q174K, D177E, T200E, Q207E  
YRG3 YRG3 None None  K238N V35T, T39D, V60I, D121Y, K122E, K173A, D177E, I178IM, T200A, I202ILV, Q207N, R211K, T240A, Q242P I63IM, W239A, V241P 
YRG30 YRG30 None None   I2V, S3X, V35M, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135M, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207A  
YRG31 YRG31 None None   D17X, V35T, E36A, T39DE, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207K, R211G  
YRG32 YRG32 None None   K30R, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, T131X, K166R, K173A, D177E, Q197R, T200E, I202V, Q207A I31N 
YRG33 YRG33 None None   E6D, V35T, T39E, S48T, V60I, K122E, K173A, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K I167IM, R172RS 
YRG34 YRG34 None None   K30R, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, D123G, T139M, S162N, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E I31N 
YRG35 YRG35 None None   V35T, E36EA, T39E, S48T, V60I, K103R, K122E, I135IT, S162G, K173A, D177E, T200A, Q207E  
YRG36 YRG36 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K  
YRG37 YRG37 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K103R, D121H, K122E, D123DE, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E K201KN 
YRG38 YRG38 None None   V35K, E36EA, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162A, K173T, D177E, I178IV, Q197K, T200A, Q207E  
YRG39 YRG39 None None   K32E, V35T, E36A, T39D, S48ST, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E  
YRG4 YRG4 None None   V35M, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162Y, K166R, K173A, D177E, T200A, E204K, Q207E, F214L K102I 
YRG40 YRG40 None None   S48T, V60I, D121Y, K122E, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
YRG41 YRG41 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, S162Y, K173T, D177E, T200A, Q207G  
YRG42 YRG42 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, T165I, K173T, Q174K, D177E, I178M, Q197L, T200A, Q207E, R211K  
YRG43 YRG43 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162C, K166R, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, T240P  
YRG44 YRG44 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, D121Y, K122E, I159V, T165I, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
YRG45 YRG45 None None   V35T, T39N, S48T, E53D, V60I, K122E, K173A, Q174R, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, T240P  
YRG46 YRG46 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E  
YRG47 YRG47 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162A, K173T, D177E, T200A, I202V, Q207R, R211K  
YRG48 YRG48 None None D67DE  K22R, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K103E, D121Y, K122E, I135V, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E K126KN 
YRG49 YRG49 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, I142V, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
YRG5 YRG5 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, I135IT, K166R, K173E, D177E, T200A, Q207A  
YRG50 YRG50 None None   V35T, T39E, S48E, V60I, K102M, I135T, I142V, S162A, K173A, D177E, T200A, R211K, T240P  
YRG6 YRG6 None None   V8I, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, I135R, I142V, K173A, Q174R, D177E, Q197L, T200A, Q207E  
YRG7 YRG7 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, V60I, I135V, S162C, K173T, T200A, Q207E  
YRG8 YRG8 None None   V35T, E36EA, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, K173A, Q174R, D177E, E194Q, G196GE, T200A, Q207E, R211K  
YRG9 YRG9 None None   V35T, T39E, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207E, T240P W239Y