Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Mo (2005)
Title Selection of resistance in protease inhibitor-experienced, human immunodeficiency virus type 1-infected subjects failing lopinavir- and ritonavir-based therapy: mutation patterns and baseline correlates.
Citation J Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 87
NumPts 54
Subtype B

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
8256 8256_d1 NRTI None M41ML, A62AV, F116FY, Q151M, M184V  K20KR, V60I, K64KR, S68SR, V118VI, I142V, F214FL, E248X, D250DN, T286A, I293V  
  8256_d1v NRTI None M41ML, A62AV, Q151M, M184V E138K V60I, K64KR, I142V, F214FL, E248X, D250DN, T286A  
  8256_d510 NRTI NVP Q151QL K103N V60I, K64KR, I142V, F214FL, V245VM, E248X, T286A, I293V, M357T, A400S  
  8256_d678 NRTI NVP  K103KN, V108VI V60I, I142V, V245M, E248DN, T286A, I293V, M357T, A400S  
  8256_d841 NRTI NVP  K103N V60I, I142V, V245VM, E248X, D250DN, T286A  
  8256_d1097 NRTI NVP  K103KN V60I, I142V, P243PS, V245X, E248X, D250DN, T286A  
8265 8265_d1 NRTI None M184V V179D E28EK, D123E, I135IM, K166R, T200I, I202V, R211K, A272P, Q278E, L283I, E298A  
  8265_d776 NRTI NVP  K103N, Y181YC D123E, I135IM, D177E, T200I, I202V, R211K, A272P, Q278E, L283I, E297EG, E298A  
  8265_d1104 NRTI NVP  K103N, Y181YC D123E, D177E, T200I, I202V, R211K, A272P, Q278E, L283I, E297EG, E298A  
8985 8985_d1 NRTI None M41L, D67N, K70R, V75M, L210W, T215FY, K219HQ K103N, V106A, F227L T39A, K43E, E44A, V60I, T69N, K102KR, V118I, K122E, I135V, I142V, D177N, I178M, G196E, E203X, H208Y, D218E, V245K  
  8985_d330 NRTI NVP M41L, D67N, K70R, V75M, L210W, T215Y, K219HQ K103N, V106A, F227L T39A, K43E, E44A, V60I, T69N, K102KR, V118I, K122E, I135V, I142V, D177N, I178M, G196E, E203EA, H208Y, D218E, V245K  
9004 9004_d1 NRTI None M184V  R83K, K122Q, K166R, Q174E, D177E, T286A, I293V  
  9004_d337 NRTI NVP  Y181C R83K, K122Q, K166R, Q174X, D177E, A272P, Q278QH, T286A  
9014 9014_d1 NRTI None M41L, M184V, T215F  K20KR, K49KR, V60I, I142V, T200TI, Q207E, R211K, V245E, A272P, L283I, V292I, E297A  
  9014_d315 NRTI NVP M41L, M184V, T215F K103KN, Y181YC T7TP, K20KR, K49KR, V60I, I142V, T200I, Q207E, R211K, V245E, A272P, L283I, V292I, E297A  
9019 9019_d1 NRTI None   V60I, T69TN, K101R, K122E, I135T, S162SN, T200TI, V245M, A272P, A288S  
  9019_d349 NRTI NVP M184MV Y181YC, G190GA V60I, T69TN, K101R, K122KE, I135T, T200TI, V245M, A272P, A288AS  
9035 9035_d334 NRTI NVP K65R, V75A V106VI, Y181C, G190GA, H221HY L34LI, V60VI, S68G, K73M, K122E, D123DN, I135T, S162D, T165TI, Q174H, T200A, Q207E, R211K, V245VE, A272AT, L283I, T296S  
9049 9049_d221 NRTI NVP  K103N, Y181YC V35T, V90VI, D121H, K122E, I135IV, P170PT, Q174E, Q197QR, T200A, Q207E, L228LR, V245MT, E248N, A272P, T286TA  
9053 9053_d1 NRTI None D67HN, K70KR, M184V, T215FV, K219E  K20KR, T69TN, W88C, V118VI, A158S, S162D, K166R, E169D, R211K, F214L, V245M, E297K  
  9053_d233 NRTI NVP D67N, K70R, M184V, T215F, K219E K101KE, K103KN, G190GA E6EK, K20KR, V35VA, K49KR, T69TN, W88C, V118VI, T139TI, A158S, S162D, K166R, E169D, R211K, F214L, V245M, E297K  
9079 9079_d1 NRTI None   K20R, E28D, G196E, T200A, E204D, E297A  
  9079_d344 NRTI NVP  Y181YC K20R, E28D, G196E, T200A, E204D, E297A  
9085 9085_d1 NRTI None M41L, M184V, T215Y  K122E, I135IL, K166KR, T200TA, Q207E, R211RK, A272P, L283I, R284K, E297EQ  
  9085_d316 NRTI NVP M41L, A62AV, T215Y K103N K122E, Q207E, R211K, A272P, L283I, R284K, E297EQ  
9086 9086_d356 NRTI NVP   E6ED, V35T, K49R, V60VI, R83RK, D123E, T200TA, Q207QE, R211RK, D250E, A272AS, K277KR, K281KR, T286TA, E297K  
9095 9095_d1 NRTI None M184V  K20R, T165I, Q174QR, G196E, F214FL, L228LH, T286A, E297K  
  9095_d337 NRTI NVP L74LV, M184V K103N K20R, T165M, G196E, F214L, T286A, E297K  
9113 9113_d1 NRTI None D67DN, M184V  V21I, D123E, E169D, Q174K, D177E, Q207E, R211K, D218E, A272P, E297A  
  9113_d339 NRTI NVP D67N, K70KR, M184MV K103KN, Y181YC V21I, D123E, E169D, Q174K, D177E, Q207E, R211K, D218E, A272P, E297A  
9124 9124_d1 NRTI None M41L, D67N, T69DN, K70KR, V75I, F77L, F116Y, Q151M, M184V, T215FV, K219Q  K20R, S162D, K166R, G196E, I202V, Q207E, R211RK, A272P, K277KR, A288AS, E297EKQ  
  9124_d59 NRTI NVP M41L, D67N, K70R, V75I, F77L, F116Y, Q151M, M184V, T215V, K219Q Y181YC, G190GA, H221HY K20R, K32KE, K49KR, T69N, K101KQ, S162D, K166R, G196E, I202V, Q207E, R211RK, A272P, A288AS  
  9124_d164 NRTI NVP M41L, D67N, K70R, V75I, F77L, F116Y, Q151M, M184V, T215V, K219Q Y181C, G190GA, H221HY K20R, K49R, T69N, K101Q, S162D, K166R, G196E, I202V, Q207E, R211RK, A272P, A288AS, E297EK  
  9124_d339 NRTI NVP M41ML, D67NS, K70R, V75I, F77L, F116Y, Q151M, M184V, T215V, K219Q Y181C, G190GE K20R, K49R, T58TN, T69N, K101Q, S162D, K166R, K173KE, G196E, I202V, Q207E, R211RK, A272P, A288S, E297K  
9126 9126_d299 NRTI NVP A62AV, M184V K101KE, K103KN, G190A, H221HY E28EG, K102KE, I195K, G196E, E248N, T286A  
9154 9154_d1 NRTI None D67DN, M184V  V35T, V60I, R83RK, K122I, D123E, T200A, Q207E, V245Q, E248N, T286A  
  9154_d168 NRTI NVP D67DN, M184V K103KN, Y181YC, G190GA V35T, V60I, R83RK, K122I, D123E, K126KR, T200A, Q207E, V245Q, E248N, T286A, A288AT  
9163 9163_d1 NRTI None M41L, M184V, T215Y  R83K, D123E, G196E, R211K, A272P, E297K  
  9163_d358 NRTI NVP M41L, L74V, M184V, T215Y Y181C R83K, D123DE, V179VI, G196E, T200TA, R211RK, A272P, E297K  
9172 9172_d1 NRTI None M41L, M184V, L210LW, T215Y  T39TA, D121Y, K122E, I135T, I142IT, Q174QK, T200A, R211RK, V245EK, A272P  
  9172_d330 NRTI NVP M41L, M184MV, L210LW, T215SY K103N V8VI, T39TA, D121DY, K122E, I135T, I142T, T200A, R211K, V245EK, A272P  
9182 9182_d1 NRTI None M41L, T69D, M184V, L210W, T215Y, K219R K103KN, V106VA, Y181YC T39A, E44D, V118I, K122E, I142V, S162FY, E203K, Q207E, H208HY, R211K, K223E, E224K, L228LH, Q242K, A288AS, E297K  
  9182_d359 NRTI NVP M41L, T69D, L74V, L210W, T215Y, K219R K103N, Y181C, F227FL T39A, E44D, V118I, K122E, I135IMT, I142V, S162Y, E203K, Q207E, H208Y, R211K, K223E, E224K, L228H, Q242K, A288S, E297K  
9189 9189_d1 NRTI None D67N, K70R, M184V, T215F, K219Q  E28A, K64H, T69N, D121Y, K122E, R211K, D218E, V245K, A272P, Q278QH, L283LI, R284RK, E297EK  
  9189_d175 NRTI NVP D67N, K70R, L74V, M184V, T215F, K219Q K103KN, Y181C, G190GA E28A, K64H, T69N, D121Y, K122E, T200TA, R211K, D218E, V245EK, A272P, L283I  
9200 9200_d340 NRTI NVP M184MV E138A A98S, D121Y, K122E, I135L, V179I, Q207E, R211K, P243S, V245E, E297A  
9208 9208_d362 NRTI NVP M184MV  V35I, T39TA, R83K, D121DY, K122KE, D123DE, R211K, P243PS, I257IT, V292VI, E297Q L80LF 
9226 9226_d1 NRTI None   I135V, T200TA  
  9226_d167 NRTI NVP  V106VA, Y181YC A98AS, I135V, V189VI, T200TA  
9231 9231_d1 NRTI None M184V  V35T, T39EK, S48T, V60VI, D121H, K122E, I135T, S162SC, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211RK, V245Q, A272P, T286TA, E291D, V292I  
  9231_d268 NRTI NVP L74V, M184V K103KN, Y181C V35T, T39EK, S48T, V60VI, D121H, K122E, I135T, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, V245Q, A272P, E291D, V292I  
9246 9246_d1 NRTI None M184V  V60I, K102Q, D121H, I135T, I142V, G196E, V245K, I293V  
  9246_d344 NRTI NVP M184MV  V21VI, V60I, D121H, K122E, I135T, I142V, G196E, V245K  
9255 9255_d1 NRTI None M41ML, D67DN, M184MV, K219KE  K70X, I135T, S162SC, E194EA, G196GE, T200S, I202V, T215X, A272P, K275Q, V276X, K277KR, E291ED, V292I  
  9255_d279 NRTI NVP M41ML, D67DN, M184MV K103N, G190GA K70X, I135T, S162SC, G196GE, T200S, I202V, T215X, A272P, K275QR, V276X, K277KR, E291ED, V292I  
9287 9287_d1 NRTI None M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y, K219KR  K20KR, V35L, T39TA, K43E, E44D, K49R, R83K, V118VI, K122P, S162SN, D177E, G196GE, T200I, R211K, D218E, K281R, R284RK, T286A, E297K  
  9287_d337 NRTI NVP M41L, D67N, L210W, T215Y, K219R Y181C K20KR, V35L, T39A, K43E, E44D, K49R, R83K, V118I, K122P, S162D, E169D, D177E, T200I, R211K, D218E, K281R, T286A, E297K  
DK-125 DK-125 RTI RTI M41L, D67N, T69D, M184V, L210W, T215Y  K20KR, V35L, T39A, E40F, K43E, V118I, K122P, D177E, I178IM, G196E, H208YF, R211K, V245T, Q278E, T296S, E297K M230MV 
  6376_d427 RTI, NRTI RTI, NVP M41L, D67N, T69D, M184V, L210W, T215Y K103N, V108I K43Q, K122P, Q174QR, D177E, H208Y, R211K, V245T, Q278E, T296S, E297K  
  6376_d508 RTI, NRTI RTI, NVP M41L, D67N, T69D, M184V, L210W, T215Y K103N, V108I K43Q, K122P, Q174QR, D177E, H208Y, R211K, V245T, Q278E, T296S, E297K  
DK-1584 DK-1584 RTI RTI K65R V106VI V35M, S68G, K82R, K122E, I135T, G196E, R211G, V245Q, A272P, V292I, I293IV  
  6325_d342 RTI, NRTI RTI, NVP  V179VD V35M, T39TA, I50IV, S68G, K122E, I135T, G196E, R211RG, V245Q, A272P, K277KR, V292I  
  6325_d430 RTI, NRTI RTI, NVP  V106I, V179D, Y181YC V35M, S68G, K82KR, K122E, I135T, G196E, R211G, V245Q, A272P, K277KR, V292I  
DK-2314 DK-2314 RTI RTI L74LV, V75A, M184V, T215Y K103N, G190GC K73M, R83K, L100X, K101KQ, V118I, D123G, I135IM, S162X, I178L, T286A, I293V, E297A, D324E, R358K  
DK-294 DK-294 RTI RTI M41L, A62AV, K70KT, V75I, M184V  K20KR, V21VI, K43KN, W88S, D123E, D177E, I178L, G196E, V245VE, D250E, A272P, K281R, A288S, I293IV, P294S, E297K  
DK-3443 DK-3443 RTI RTI M184V  V21I, D123E, S162A, D177E, V245K, A272AP, T286A, A288S, I293V, K311R, G333D, Q334QH, T338TS, Q343QH, M357T, A360AT, T377L, S379C, K390R, E399D  
DK-3494 DK-3494 RTI RTI M184V, T215Y M230L A98AS, V118VI, K122KE, D177E, Q207E, R211K, D250E, A272P, I274V  
DK-354 DK-354 RTI RTI M184V  A98S, I135IL, S162X, T200EA, V245E, E297K, S379G, K390R  
DK-3705 DK-3705 RTI RTI M41L, D67N, T215Y E138EK, V179ED K122E, I135V, I142X, S162SC, R211S, S251H, T286A  
DK-3914 DK-3914 RTI RTI M184V  V35I, E40ED, I135T, R211K, V245K, T286A, E297K, V317VA, I326IV, Q334L, T377Q, K390R  
DK-4094 DK-4094 RTI RTI M41L, D67N, K70R, T215F, K219E  V60VI, V75X, D123E, S162SN, G196E, Q207H, A272P, Q278H, E297K  
DK-4214 DK-4214 RTI RTI M184V, L210W, T215Y  V35M, R83K, A158S, E169D, T200I, R211K, I293V, G333E, Q334QH, M357T, K390R, K395R, A400L  
DK-4305 DK-4305 RTI RTI M41L, D67N, T69D, M184V, T215Y  K30KR, V35T, V60VI, V111X, K122P, I135T, I178M, A272P, E297A N147NT, W252WC, I274IT 
DK-4784 DK-4784 RTI RTI M41L, L74LI, M184MV, L210W, T215Y  K122E, R172RK, Q174R, G196E, R211K, A272P, E297R  
DK-5204 DK-5204 RTI RTI M184V  E6D, R83K, D177E, T200A, E203K, Q207E, R211K, K277KR, E297K, K311R, I329V, G333E, R356K, A371V, K390R  
DK-5973 DK-5973 RTI RTI M184V  K43QE, A98S, I142V, E203K, R211S, V245T, E297K, I329L, M357MV, K366KR, A376S, K390R, K395R  
DK-6333 DK-6333 RTI RTI M41L, M184V, L210W, T215Y  D123G, I135T, E203K, Q207E, R211K, T286A, I329V, M357MR, G359GS, A360T, A371V  
DK-6804 DK-6804 RTI RTI D67G, K70R, T215F, K219Q  K20R, S68G, R211S, E224ED, K281R, I293V, E297K, I329IL, Q334P, R356RK, G359GS, T369X, A371AV, I375V  
DK-6905 DK-6905 RTI RTI M41L, D67N, K70R, M184V, T215F, K219E  V35T, T39K, K43Q, V60I, V118I, D121H, K122E, I135V, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211RK, F214L, V245Q, E248D, D250E, A272P, K275R, Q278N, T286A, A288V, V292I, E297A  
DK-7623 DK-7623 RTI RTI D67N, M184V  V35T, A158S, Q207K, R211K, V245T, T286A, A288S, E297K, K311R, V317A, I329V, G333E, Q334N, Q367L, E399D  
DK-7815 DK-7815 RTI RTI D67N, K70G, F116Y, Q151M, L210LW, T215Y  P1PL, K11KT, K20R, V35VI, K122E, D123X, I135T, I167IV, P170PL, V179I, I202V, E204EK, H208HY, R211K, T286A, E297K  
DK-815 DK-815 RTI RTI M41L, D67N, V75M, L210W, T215Y A98G, K103N V35M, T39A, K43E, E44D, V118I, K122E, I178L, H208HY, R211K, A272P, T286A, V292I, E297EA  
DK-873 DK-873 RTI RTI M41L, D67N, K70R, T215F, K219E  I178M, T200A, E204D, S251T, R284K, T286A, I293V, S322T, Q334E, A355AT, M357S, A360T, K390R  
DK-8805 DK-8805 RTI RTI M41L, D67N, T69D, M184V, L210W, T215Y  T39A, K43KQ, E44D, R83RK, V118VI, K122E, I135T, E169D, D177DG, T200E, E203K, Q207QE, H208Y, R211K, A272P, V276T, K277KR  
DK-8873 DK-8873 RTI RTI M184V  K11KT, R83K, R211K, T286A, E297K, I329L, Q334H, F346Y, V365VI, L368LV, T369IV, K390R  
DK-9014 DK-9014 RTI RTI   K104KN, D177DE, Q207X, R211K, V245M, I293V, K311R, V317A, Q334L, R358K, G359S  
DK-9415 DK-9415 RTI RTI D67N, T69D, K70R, T215VF, K219Q  V35T, V60VI, K102KR, I135V, E169D, K173A, Q174K, I178L, Q207A, R211K, L228LH, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, E297T F124FS, N136NS