Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Eshleman (2005)
Title Limited evolution in the HIV type 1 pol region among acute seroconverters in Pune, India.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 29
NumPts 12
Subtype C

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
00836 00836_2Y None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
12466 12466_BL None None   V35K, T39D, S48T, V60I, K122E, I135V, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207G, V245Q, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
  12466_1Y None None   V35K, T39D, S48T, V60I, K122E, I135V, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207G, V245Q, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
  12466_2Y None None   V35K, T39D, S48T, V60I, K122E, I135V, A158AS, S162A, T165TI, K173A, D177E, T200A, Q207G, V245Q, A272P, K277R, K281R, T286AV, E291D, V292I, I293V, E297A  
16055 16055_BL None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, S162A, K166R, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, V292I, I293V, V317A  
  16055_1Y None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, S162A, K166R, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, V292I, I293V, V317A  
  16055_2Y None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121HY, K122E, S162A, K166R, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, V292I, I293V, V317A  
16275 16275_BL None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
  16275_1Y None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
  16275_2Y None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294S, E297A  
16845 16845_BL None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297G  
  16845_6M None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, I159IV, T165TI, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297G  
16936 16936_BL None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K173A, D177E, I178L, T200A, E204K, Q207E, V245Q, A272P, K277R, K281R, E291D, V292I, I293V, V317I  
  16936_1Y None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173A, D177E, I178L, T200A, E204K, Q207E, V245Q, A272P, K277R, K281R, E291D, V292I, I293V  
  16936_2Y None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173A, D177E, I178L, T200A, E204K, Q207E, V245LQ, A272P, K277R, K281R, E291D, V292I, I293V, V317I  
16998 16998_BL None None   T27S, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162C, K173A, Q174K, D177E, T200A, E204K, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, V317A  
  16998_1Y None None   T27S, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162C, K173A, Q174K, D177E, T200A, E204K, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, V317A  
  16998_2Y None None   T27S, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162C, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, V317A  
18543 18543_BL None None   E28K, K32Q, V35T, T39D, S48T, V60I, K122E, I135T, S162A, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K, V245Q, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E312D  
  18543_1Y None None   E28K, K32Q, V35T, T39D, S48T, V60I, K122E, I135T, S162A, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K, V245Q, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E312D  
  18543_2Y None None   E28K, K32Q, V35T, T39D, S48T, V60I, K122E, I135T, S162A, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K, V245Q, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E312D  
21239 21239_6M None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, D123G, I135T, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292VI, I293V  
25710 25710_BL None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173A, D177E, T200A, Q207K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, V317A  
  25710_1Y None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173A, D177E, T200A, Q207K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, V317A  
  25710_2Y None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173A, D177E, T200A, Q207K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, V317A  
25711 25711_BL None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V L187V 
25925 25925_BL None None   V35T, T39D, S48T, V60I, W88C, D123E, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207G, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
  25925_1Y None None   V35T, T39D, S48T, V60I, W88C, D123E, S162A, K173A, D177E, I195IT, T200A, Q207G, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, V317VA  
  25925_2Y None None   E28EA, V35T, T39D, S48T, V60I, W88C, D123E, S162A, K166KR, K173A, D177E, I195IT, T200A, Q207G, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, V317A