Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Dumans (2004)
Title Synonymous genetic polymorphisms within Brazilian human immunodeficiency virus Type 1 subtypes may influence mutational routes to drug resistance.
Citation J Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 128
NumPts 128
Subtype B, F, C, B + C, CRF31_BC, D

 
  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 128 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
081 081 Unknown Unknown   T39D, K43R, S48T, K173A, D177E, T200S, Q207E, R211K  
10019 10019 Unknown Unknown   T39E, K122E, D123S, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
144 144 Unknown Unknown  V106VIL E40EA, M41V, K43KT, K49KE, K66KE, T128X, I135T, N136NT, I142IT, K166R, D177E, G190X, I202V, E204ED K46IR, I132IM, S191SC, D192DH, G196GW 
1475 1475 Unknown Unknown   S48T, I50IM, R78RK, D113DE, D121DN, K122KE, D123N, T131P, R143RK, Y146YS, A158P, I159IL, S162A, T165P, I167F, E169X, Q174K, Q207E, F214L V118VL, T128P, I132FL, T139TP, Y144YS, G152GE, K173P, W212WS 
153 153 Unknown Unknown M41L, D67N, K70R, M184V, L210W, T215Y  T39S, D123N, D177E, T200A, E203K, Q207D, H208Y, R211K  
155 155 Unknown Unknown T215A, K219R  T39E, S48T, K122E, D123S, I135V, I142M, A158S, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, I202V, Q207K, R211K, F214L, K220X, H221X D218A, E224S 
1575 1575 AZT, DDI None D67N, K70R, K219Q  T39A, D177E, T200Q  
158 158 AZT, DDI, 3TC None M41L, M184V, T215Y  K122E, D123N, I135T, I142V, I178M, T200A, Q207E  
159 159 AZT, DDI, 3TC NVP M41L, T215Y K103N, G190A K43Q, E44D, K122P, I135T, D177E, H208Y, R211K  
162 162 Unknown Unknown M41L, D67N, L210W, T215Y V108I T39A, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178L, V189I, R211K  
165 165 Unknown Unknown   M41V, K122E, E194G, F214L  
166 166 AZT, DDI None M41L, T215Y  I135T, S163A, D177E, I178M  
167 167 AZT, DDI, 3TC None D67N, K70R, M184V, T215F, K219Q A98G I135T, V179I, T200A, F214L, D218E  
169 169 AZT, DDI, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y  K102Q, I142V, K166R, I178L, E204K, Q207E  
170 170 AZT, DDI None L210W, T215Y, K219R  G196E, K220E  
171 171 AZT, DDI, 3TC, D4T EFV M41L, D67N, K70R, V75M, M184V, T215Y, K219E K103N T39A, K122E, I135T, D177E, I178V, I202V  
172 172 AZT, DDI None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, I135T, S162C, R211K  
173 173 AZT, DDI None T215Y  K49R, I135T, S162C  
174 174 AZT, DDI None M41L, L210W, T215Y  V118I, K122E, I135T, K166R, G196K, I202V, Q207E, R211K  
177 177 Unknown Unknown   D113N, D123E, S162C, T200I, R211K, E224K  
179 179 AZT, DDI, 3TC, D4T None M41L, M184V, T215F  I135T, I142V, D177E  
180 180 AZT, DDI None V75I, Y115F, F116Y, Q151M, K219Q  S68G, D177E, R211K  
182 182 AZT, DDI None D67N, K70R  K122E, D123S, I135T, Q174K, D177E, T200I, F214L  
184 184 AZT, DDI, 3TC None   K102Q, K122E, I135T, S162C, T200A  
185 185 Unknown Unknown D67N  V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, Q207E, R211K  
186 186 AZT, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y  V60I, K122E, I135T, R211K  
187 187 AZT, DDI None M41L, D67N, L210W, T215Y  K43E, E44A, K49R, K104N, V118I, K122E, D123N, D177E, I178M, V179I, T200I, R211K  
191 191 AZT, DDI None D67N, K70R  D121Y, K122E, E169D, T200A, I202V, E204D  
192 192 AZT, DDI None   I135T, S162C, T200N  
194 194 AZT, DDI None M41L, L210W, T215Y  T39K, K43E, K49R, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, R211K  
210 210 AZT, DDI None M41L, T215F  V60I, K122P, I135T, I142T, D177E, R211Q  
211 211 AZT, DDI None L210W  D123E, I135T, I178M, R211K  
212 212 AZT, DDI None   K102Q, D123E, I135T, D177E, F214L  
213 213 3TC, D4T None D67N, T69D, K70R, M184V, K219Q  T39A, V60I, W88C, K122E, I135T, F214L  
214 214 AZT, DDI, 3TC, D4T NVP L74V, M184V, T215F Y181C, G190A S68G, I135T, D177E, Q197K, T200A, F214L  
215 215 AZT, DDI, 3TC, D4T, ABC NVP K65R, K70T, M184V K103N, Y181C, H221Y S68G, D123E, I135T, G196E, T200A, F214L  
216 216 AZT, DDI, D4T None   D123E, I135T, T165I, E169D, K173Q, F214L  
217 217 AZT, DDI None M41L, L210W, T215Y  K49R, V60I, D123E, I135T, A158S, T165I, E169D, I178M, G196E, R211K  
218 218 AZT, DDI, 3TC, D4T NVP T215S  I135T, D177E, T200A  
219 219 AZT, DDI, 3TC, D4T NVP M41L, D67N, K70T, L210W, T215Y, K219R Y181C, G190A T39A, E40F, K43E, K101Q, L109I, V118I, K122E, D123X, I135T, D177E, E194A, G196E, T200A, H208Y, R211K, D218E  
220 220 AZT, DDI, 3TC, D4T NVP, EFV  K103N I142V, R211G  
221 221 AZT, DDI, 3TC NVP D67N, L210W, T215Y V106A K122E, I135T, I142T, G196E, R211K  
222 222 AZT, DDI None   K122E, I135T, S162F, K173E, Q174K, I202V, R211K, K223R  
223 223 AZT, DDI, 3TC None M41L, D67N, M184I, L210W, T215C Y181V E44D, V118I, D123E, I135V, S162C, K173A, Q174K, N175Y, V179I, T200A, E203K, Q207E, H208Y, R211K  
225 225 AZT, DDI, 3TC, D4T, ABC EFV L210W, T215S  K122E, D177N, G196E  
227 227 DDI, AZT, 3TC None M41L, D67N, M184V, L210W A98G E44D, K102Q, V118I, K122X, I135T, G196E, E203D, H208Y, R211K  
228 228 Unknown Unknown M41L, M184V, T215D  I135T T216R 
229 229 DDI, AZT None M41L, L210W, T215Y A98G E44D, E79D, V118I, I135M, R211K  
230 230 AZT, DDI, 3TC, D4T None M184V, T215Y  K43R, K122E, D123S, I135T, D177E, T200A, R211T  
231 231 AZT, DDI, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y  K43N, K104R, V118I, K122E, I142V, Q207E, R211K  
233 233 AZT, DDI, 3TC, D4T NVP, EFV M41L, D67N, L74V, M184V, L210W, T215Y A98G, K101E, V108I, Y181V, G190A K43Q, E44D, V118I, D123E, I135T, E203K, Q207E, H208Y, R211K, K223Q  
234 234 AZT, DDI None D67N, K70R, K219Q  F214L  
235 235 AZT, DDI None D67N, L210W, T215Y E138A K49R, K122E, D123N, I135T, I142T, E169D, I202V  
237 237 AZT, DDI, 3TC None M41L, D67N, V75M, L210W, T215Y A98G K43N, E44D, K82R, K122E, D123E, I167V, D177E, H208Y, R211K, D218E  
238 238 AZT, DDI, 3TC None D67N, V75M, M184V, L210W, T215Y  V60I, K122P, I135T, I142V, K166R, D177E, T200I, R211K  
239 239 Unknown Unknown M41L, D67N, M184I, L210W, T215Y, K219N Y181V E44D, V118I, D123E, I135V, S162C, K173A, Q174K, N175Y, V179I, T200A, E203K, Q207E, R211K, K223Q  
240 240 AZT, DDI, 3TC None M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y  K43E, E44A, K104N, V118I, I142V, G196E, R211K  
241 241 AZT, DDI, 3TC, D4T None M184V  D123E, I135V, A158S, D177E, R211K H221T 
242 242 AZT, DDI, 3TC, D4T None   D123E, I135V, S162C, D177E, I178V  
243 243 AZT, 3TC None M41L, M184V, T215Y  A98S, K122E, Q174R, Q207E  
244 244 AZT, DDI None M41L, T215F  T39A, D121Y, K122E, K166R, D177E, G196E, R211K  
246 246 AZT, DDI, 3TC, D4T None M184V, K219Q  V118I, K122E, I135T, I178V, F214L  
248 248 AZT, DDI None D67N, K70R, T215Y  V90I, V189I, Q197P  
249 249 AZT, DDI None M41L, T215Y  I135T, I195T  
250 250 AZT, DDI None D67N, K70R, K219Q  K122E, T200A, R211K  
251 251 AZT, DDI, 3TC None M41L, T215C  V60I, I135T, D177E, G196E, T200A  
252 252 AZT, DDI, 3TC, D4T NVP D67N, K70R, M184V, T215I, K219E K101E, Y181C, G190A E44D, V118I, K122E, I135T, T200I, F214L  
253 253 AZT, DDI, 3TC, D4T None M41L, M184V, T215F  K43Q, S68G, V118I, I135T, D177E, R211K, F214L  
256 256 AZT, DDI None D67N, K70R, L210W, T215Y, K219E  K122E, D123N, T139V, Q174R  
258 258 AZT, DDI None M41L, D67N, L210W, T215Y  K43E, K104N, V118I, D121H, K122E, K173Q, D177E, T200A, Q207E  
259 259 AZT, DDI None T215S  K122E, I135T, S162C, D177E, S191F, G196E, Q207H  
260 260 AZT, DDI None M41L, L210W, T215S K103N V118I, D121Y, K122E, D123E, I135T, S162C, D177E, G196E, Q207H, R211K  
261 261 AZT, DDI, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y  K43N, D123E, I135T, F171Y, D177E, T200A, R211K  
262 262 AZT, DDI None D67N, K70R  T200S, F214L  
263 263 AZT, DDI, 3TC None   K102Q, S162C  
264 264 AZT, DDI None   K104R, I135T, K166Q, I202V, R211K  
265 265 AZT, DDI, 3TC None D67N, K70R, M184V, T215F, K219E  D123E, A158S, K173Q, Q174R, F214L  
266 266 AZT, DDI None M41L, D67N, K70R, L210W, T215Y  E44D, K49R, K104E, V118I, D123E, I135T, S162C, D177E, I202V  
2668 2668 AZT, DDI None D67N, K70R, T215F, K219Q  V118I, D123E, A158S, S162D, K173R, Q207E, R211K, F214L  
267 267 AZT, DDI, 3TC, D4T None M41L, D67N, K70R, M184V, T215Y, K219E  S68G, I135T, E169K, K173E, T200I, H208X, R211K  
268 268 AZT, DDI, 3TC, D4T NVP   E40D, K49R, I50V, V60I, Q174L, D177E, I178V, Q207E  
9312 9312 Unknown Unknown D67N, K70R, T215Y  T39E, D121H, K122E, I135T, S162A, K173A, D177E, T200A, I202V, Q207K, R211K, D218E, K219T, K220R H221N 
9344 9344 Unknown Unknown   T39D, S48T, K173A, T200A, Q207E, R211K  
C073 C073 Unknown Unknown   V35T, E36A, T39D, K122E, D123S, T128X, I135R, S156X, S162C, K173A, T200A, Q207E, R211K  
C125 C125 Unknown Unknown M184I K101E, G190A V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, T215P, V245T D186G, P217~, D218S, L246E 
c135 c135 Unknown Unknown M184V K103S, G190A V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123N, I135T, E169A, K173A, D177E, T200A, E203D, Q207E, R211K, V245Q  
N026 N026 Unknown Unknown M41L, T69T_SA  K49R, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, Q207K  
N036 N036 Unknown Unknown   T39G, I135T, S162Y, E169D, K173A, Q174K  
res037 res037 Unknown Unknown   T27P, V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, S68X, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200X, Q207E, R211K, V245Q, K263E  
RES045 RES045 Unknown Unknown D67N, K70R, T215F, K219Q  V35T, T39L, K64Y, I135V, S162Y, E169D, K173A, Q174K, T200TA, Q207E, R211K, F214L, D218E, V245Q, E248D Y144S 
RES050 RES050 Unknown Unknown M41L, D67N, K70R, T215F, K219KQ  V35T, T39IM, V60I, V118VI, K122KE, D123DN, I135V, S162C, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211T, D218DE  
RES083 RES083 Unknown Unknown M41L, M184V, T215F  V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, I135T, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q V111VG 
RES093 RES093 AZT, 3TC, DDI, Unknown EFV, Unknown M41L, L74I, M184V, L210W, T215Y A98G, K103N, V108I K20KR, V35T, E44D, V118I, K122E, I135L, S162F, E169D, K173A, Q174K, T200A, E203K, Q207E, R211Q, K223E, V245Q, E248D  
RES40 RES40 AZT, DDI, 3TC, D4T, Unknown EFV, Unknown D67N, K219Q K101KE, K103N, E138A, K238T I135V, S162C, E169D, K173T, Q174K, D185X, D186DN, T200A, I202V, Q207E, F214L, V245Q  
RG008 RG008 AZT, 3TC, D4T, DDI, Unknown EFV, Unknown D67N, K70R, M184V, T215F, K219E A98G, Y181C V35T, T39G, K49R, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, P247A, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A, S322T, I329L  
RG033 RG033 Unknown Unknown A62V, K65R, V75I, F77L, Y115F, F116Y, Q151M, M184I, K219Q K103N, Y181C, G190A V35T, E36A, T39E, S48T, S68K, K122E, D123S, I135T, S162Y, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, Q334E  
RG034 RG034 AZT, 3TC None D67N, K70R, M184V, L210LW, T215Y, K219KQ  K30R, K122E, I135T, E169D, I202V, Q207E, R211K, A272P, K277R, V292I, I293V, E297A, K311R, V317A, I329V, G333E, Q334L  
RG046 RG046 AZT, 3TC, D4T None M41L, D67DE, L74I, M184V, T215Y  V35T, T39TA, K43Q, S68SG, V118VI, K122KE, I135V, S162X, E169D, K173A, Q174K, I178L, Q207A, H208Y, R211K, P243S, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
RG059 RG059 Unknown Unknown M184V  V60I, R83K, D123E, K166R, D177E, R211K, D250T, A272P, K277R, I293V, E297K  
RG070 RG070 AZT, DDI, 3TC, Unknown Unknown M41L, D67N, K70R, V75M, M184V, L210W, T215Y, K219Q  P4S, K20KR, V35VI, T39A, K43KN, E44D, D123E, S162Y, K173T, Q174K, T200A, Q207A, H208Y, R211K, W212C, D218E, L228H, V245Q, E248D, A272P, Q278H, T286A, V292VI, I293V, P294T, E297A  

Database

Resources

Team