Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Rhee (2005)
Title HIV-1 protease and reverse transcriptase mutations: Correlations with antiretroviral therapy in subtype B isolates and implications for drug-resistance surveillance.
Citation J Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 8939
NumPts 5416
Subtype B, CRF12_BF, D, A, C, CRF17_BF, B + F, B + C, CRF02_AG, CRF45_cpx, CRF31_BC, CRF23_BG, CRF20_BG, B + CRF01_AE, H, G

 
  Page 1 of 90    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 8939 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
143P1 143P1W0 None None   D121H, K122E, I135T, S162C, D177E, R211K L168LF, R172RS 
  143P1W88 DDI None L74V, M184V  D121H, K122E, I135T, S162C, D177E, R211K  
143P10 143P10W0 AZT None   K49R, R83K, V90I, S162D, R211K  
  143P10W56 AZT, DDI None M41L, L74V, L210W, T215Y  K49R, R83K, V90I, S162D, R211K K220KT 
143P11 143P11W0 AZT None K70R  D121H, K122E, I142V, I178M, V179I, R211K  
  143P11W72 AZT, DDI None K65R, K70R, L74V, K219KQ  D121H, K122E, I142V, R172RK, I178M, V179I, R211K, K238KI Q174QP 
143P12 143P12W0 AZT None   I50V, R83K, Q207X, L228M  
  143P12W104 AZT, DDI None K65R  S68G, T69I, R83K, Q207E, R211K, L228K  
143P13 143P13W0 AZT None   V60I, R83K, D123E  
  143P13W104 AZT, DDI None K65R  V60I, S68G, R83K, D123E  
143P14 143P14W0 None None   I135T  
  143P14W104 DDI None M41L, T215Y  I135T  
143P15 143P15W0 None None   D123E, I142V, R211K  
  143P15W104 DDI None K70R  D123E, I142V, R211K, L228X  
143P16 143P16W0 None None   R83K, I135T  
  143P16W88 DDI None M41L, D67N, L210W, T215Y  T39A, E44D, V60VIL, R83K, K104KN, I135T, R211K  
143P17 143P17W0 AZT None K70R  V35I, E36X, N57D, V118I, K122E, I135T, Q207G, F214L  
  143P17W72 AZT, DDI None D67N, K70R, T215TI, K219Q  V35I, V118I, K122E, I135T, Q207G, F214L  
143P18 143P18W0 None None   I178M, Q207R R199S 
  143P18W72 DDI None   I178M, Q207R  
143P19 143P19W0 None None  E138A K166R E28EV 
  143P19W80 DDI None  E138A K122E, K166R, T200I  
143P2 143P2W0 None None   R83K, L100LF, I135V, S162A, R211A  
  143P2W88 DDI None L74V, M184V  R83K, S162A, R211A  
143P20 143P20W0 None None   I142V, K173R  
  143P20W88 DDI None   K49R, R83K, R211K  
143P21 143P21W0 None None   E28G, L34LF, E36EDG, I37IFL, D86E, R211K L80I 
  143P21W104 DDI None L210W, T215SY  E28G, S68G, D123E, K166R, D177E, T200A, Q207H, R211K  
143P22 143P22W0 AZT None   K122E, F214L K66KN 
  143P22W88 AZT, DDI None   K122E, R211K  
143P23 143P23W0 AZT None K70R  D121Y, K122E, K166R, D177E, I178M  
  143P23W96 AZT, DDI None   D121Y, K122E, K166R, D177E, I178LM  
143P3 143P3W0 AZT None K70R  R83K, K104N, D123E, S162A, T200I  
  143P3W104 AZT, DDI None L74V, M184V  R83K, D123E, S162A, T200I  
143P4 143P4W0 None None   D123E, S162C, T200I, Q207E, R211K  
  143P4W104 DDI None L74V  D123E, S162C, T200M, Q207E, R211K  
143P5 143P5W0 None None   R211K  
  143P5W72 DDI None L74V V179VD A98S, K122E, R211K  
143P6 143P6W0 None None   D123E, S162SC, D177E  
  143P6W88 DDI None L74V V106I D123E, I135T, S162W, D177E  
143P8 143P8W0 None None   R83K, K104KR, K166R, R211K, Q222QP, H235HP Y232YF 
  143P8W104 DDI None L74V  V60I, R83K, K166R, R211K  
143P9 143P9W0 AZT None   K122E, Q207E  
  143P9W104 AZT, DDI None L74V  K122E, K173Q, I178M, Q207E  
260-Pt1 260Pt1BC None None   R83K, I135V, Q174H, E194X, V245K  
  260Pt1W8P None DLV   R83K, I135V, Q174H, V245K  
260Pt10 260Pt10BC AZT None K70R  K122KE, I135T, G196K, R211K  
  260Pt10W8C AZT DLV K70R  V35VIL, D76DN, K122E, I135T, G196K, R211K  
260Pt11 260Pt11BC None None   E53D, V60I, D121DN, K122E, D123E, A158S, I178M  
  260Pt11W8C None DLV  K103N, Y181YC E36X, K49R, I50V, E53D, V60I, D76DN, D123E, A158S, I178M  
260Pt12 260Pt12BC AZT None T215Y  S68G, D123E, P140X, K166R, D177E, I178IM, G196E, Q207N, R211K  
  260Pt12W8P AZT DLV T215Y K103N, Y181C S68G, K82KR, D123E, P140X, A158AS, K166R, D177E, I178IM, G196E, E204ED, Q207KN, R211K  
260Pt13 260Pt13BC AZT None K70R  E29ED, K64KR, K122E, Q207X, R211K W239W*C 
  260Pt13W8P AZT DLV  K103N, Y181C V90I, K122X, R211K  
260Pt14 260Pt14BC AZT None D67N, K70R, K219Q  T69TN, K103R, Q174QH, G196E, Q207R, F214L  
  260Pt14W8C AZT DLV D67N, K70R, K219Q Y181C K103R, Q174QH, G196E, Q207R, F214L  
260Pt15 260Pt15BC AZT None   R83K, K103Q, K173KR, Q174X, Q207E  
  260Pt15W8P AZT DLV   K103Q, K173KR, Q207E, P236L  
260Pt16 260Pt16BC None None   A98S, D121Y, K122E, D123E, D177E, T200X, F214L C38C*W 
  260Pt16W8P None DLV  K103N A98S, D121Y, K122E, K166R, K173KN, Q174X, D177E, T200X, F214L  
260Pt17 260Pt17BC None None   D121Y, K122E, G196E, R211G, V245K  
  260Pt17W8C None DLV  K103N, Y181C D121Y, K122E, G196E, R211G, V245K  
260Pt18 260Pt18BC None None   K64R, I135T, G196E, E204D  
  260Pt18W8P None DLV  K103N, Y181C K64R, I135T, G196E, E204D  
260Pt19 260Pt19BC AZT None   R83K, Q174H, G196E, Q207X, V241X  
  260Pt19W8P AZT DLV  K103NT A62X, R83K, K102X, K104KN, Q174DH, G196E, Q207X  
260Pt2 260Pt2BC AZT None K70R  D123E, S162C, T200I, R211K  
  260Pt2W8P AZT DLV K70R K103N K73X, T84X, D123E, S162C, R211K Q85QH 
260Pt20 260Pt20BC AZT None   K122E, D123N, I178M, Q207X, R211K, V245E  
  260Pt20W8P AZT DLV  K103N, Y181C D121Y, K122E, G196E, R211G, V245K  
260Pt21 260Pt21BC AZT None   I135T, G196E, Q197K, Q207X, V245M  
  260Pt21W8P AZT DLV  K103N, Y181C K64KR, I135T, G196E, Q197K, Q207X, R211RK, Q242QR, I244IV, V245M  
260Pt22 260Pt22BC None None   R83K, S162C, G196GE, R211G  
  260Pt22W8P None DLV  K103N R83K, S162C, R211G  
260Pt23 260Pt23BC None None   K104KN, P176T, I178L, G196E  
  260Pt23W8P None DLV  K103N I178L, G196E  
260Pt24 260Pt24BC None None M41L  T200I, P243H, V245D  
  260Pt24W8C None DLV M41L K103N N57NK, T58X, T200I, P243H, V245D  
260Pt4 260Pt4BC None None   D123E, S162C, I178M, Q197QL, Q207E, R211K, I244X, V245E  
  260Pt4W8C None DLV  K103N T27X, D123E, S162C, I178M, Q207E, R211K, V245E  
260Pt5 260Pt5BC None None   S68G, K122E, I135T, V179A  
  260Pt5W8P None DLV  K103N, Y181C T27X, S68G, K122E, I135T, V179A  
260Pt6 260Pt6BC AZT None L210W, T215Y  S68G, D76DN, R83K, D123DE, T139TIM, S162C, T200TS, V245K  
  260Pt6W8C AZT DLV T215CY K103N, Y181C S68G, R83K, T139M, S162C, T200TI  
260Pt7 260Pt7BC AZT None   V35VIL, V60VIL, K64KN, R83K, S162Y  
  260Pt7W8C AZT DLV  K103N R83K, S162Y  
260Pt8 260Pt8BC None None   D76DN, K122E, F214L  
  260Pt8W8C None DLV  K103N V35L, E36K, E40ED, V60VIL, D76DN, K122E, I135T, F214L  
260Pt9 260Pt9W8C None DLV  Y181C K49R, I135V, S162C, T200A, R211K  
AAC-DDC AACPR
Consensus 		None None   K66KR, T69TN, R83K, V90VI, K122KI, D123DE, I135V, T165TI, P243PH, A272X W88W*, E233EV, N265NY 
  clone: 19 None None   R83K, I135V, P243H, A272P N265Y 
  clone: 28 None None   R83K, I135V, T165I, A272P  
  clone: 36 None None   K66R, R83K, I135V, A272P  
  clone: 40 None None   T69N, R83K, V90I, I135V, A272P  
  clone: 8 None None   R83K, D123E, I135V, A272P E233V 
  clone: A-37 None None   R83K, W88*, K122I, I135V, A272X  
  AACPO
Consensus 		DDC None T69TD, M184MV  R83K, K122KE, I135IV, T139TI, S163ST, T165TI, R211RK, K220KE, V245VA, E248EK, A272P, K277KR Q258Q* 
  clone: 12 DDC None T69D  R83K, I135V, T165I, A272P  
  clone: 16 DDC None   R83K, I135V, A272P  
  clone: 18 DDC None T69D  R83K, K122E, I135V, S163T, Q258*, A272P  
  clone: 21 DDC None T69D  R83K, I135V, T139I, T165I, K220E, A272P  
  clone: 25 DDC None T69D  R83K, I135V, T165I, V245A, E248K, A272P  
  clone: 28 DDC None T69D  R83K, I135V, T139I, T165I, K220E, A272P  
  clone: 30 DDC None T69D, M184V  R83K, K122E, A272P  
  clone: 32 DDC None T69D  R83K, R211K, A272P  
  clone: 41 DDC None T69D  R83K, I135V, T165I, A272P  
  clone: 47 DDC None T69D  R83K, T165I, A272P  
  clone: 5 DDC None T69D  R83K, I135V, A272P, K277R  
CAM-1 CAM1 None None   I135T, F214L, V245M, I293V, I329L, R356K, A360T, E399D, T403I, E404D, K451R, S468P, H483Y, Q524E  
PT-VE1 QMVE1 None None  L100V V35T, E40K, V60I, I135V, G196E, W212G, V245M, D250E, Q334D, M357T, A360T, S379G, A400T, E432D, L469V, E478K, L491S, Q524E  
PT-VE2 QMVE2 AZT None M41L, T215Y  I135V, S162C, R211K, S322T, A360T, A400T, L452S, D460N, R461K, H483Y, S519N, K558R  
PT-VE3 QMVE3 AZT None   Q207G, R211K, F214L, A272P, K281R, P294A, E297K, A360V, K366R, T369V, A376T, T377I, K390R, A400T, K512I, S519N, A554T Q258H 
PT-VE4 QMVE4 AZT None M41L  V35I, R83K, I135T, D250E, A272P, P294S, I375V, K390R, A437V, D460N, L469I, T470A, L491P, L517I, S519N, V559I  
PT-VE5 QMVE5 None None   D123E, S162C, D177G, Q207E, V245I, A272P, T286A, G335D, M357T, A400T, V435I, N447S, S468P, A554S  
PT-VE6 QMVE6 None None  V179D D123E, I142V, S162C, R211K, K249E, A272P, G285A, T286A, I293V, I329V, Q334E, A355T, M357S, A360T, A400T, V435I, N447S, R461K, L469I F160S, R284W 
PT-VE7 QMVE7 None None   K122E, D123G, R211K, S322T, K390R, A400T, V435A, K454R, D460N, R461K, S468T, K476R, L491S, L517I, V559I  
PT-VE8 QMVE8 None None   K122E, I135T, D177G, Q207E, V245E, K277R, S322T, I326V, Q334H, I375V, T386I, T403M, H483Q, L517I, A554T, K558R  

Database

Resources

Team