Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Machado (2004)
Title Overview of genotypic and clinical profiles of human immunodeficiency virus type 1-infected children in Rio de Janeiro, Brazil.
Citation An Acad Bras Cienc
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 68
NumPts 68
Subtype B, F, CRF45_cpx

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
CS183 CS183 AZT, DDI, 3TC EFV D67N, K70R, T215F, K219Q K103N, V106M T69N, I135T, S162C, F171Y, I178L, T200A  
CS226 CS226 AZT, DDI, 3TC, D4T None M184V  K43T, V118I, G196R  
CS257 CS257 AZT, DDI, 3TC None D67N, K70R, M184V  D121A, K122E, I135V, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L  
N01 N01 None None   V60I, K122P, I135T, I142T, D177E  
N02 N02 None None   G45R, V60I, K122P, I135T, I142T, D177E  
N03 N03 None None   D123N, D177E, R211K, F214L  
N04 N04 None None   F214L  
N06 N06 None None   D123E, I135T, I178M, R211K  
N07 N07 None None   K122E, T200A, R211K  
N08 N08 None None   K102Q, D123E, I135T, D177E, F214L  
N09 N09 None None   I135T  
N10 N10 None None   D123N, I135T, I178M  
n11 n11 None None   K102Q, D123E, I135T, D177E, F214L  
n12 n12 None None  V106I I47L, K49R, I50L, I63L, I178L, I202V, R211K I37T 
n13 n13 None None   I135T, S162C, I178M  
n14 n14 None None   K122E, I135T, Q197K, T200E  
n15 n15 None None   D123E, S162C, T200I  
n16 n16 None None   K122E, D123N, I135T, D177E, I178L, I202V, Q207K, R211K  
n17 n17 None None  E138A K122E, K173N, R211K  
n18 n18 None None   V60I, D121Y, K122E, D177E, Q207E, R211K  
n19 n19 None None   E36D, I37X, K122E, D123N, I135T, E224D  
n20 n20 None None K70R  S48E, I135V, K173E, R211S, F214L  
n21 n21 None None   V60I, D121Y, K122E, D123E, I135V, S162C, K166R, K173T, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K  
n22 n22 None None   K122E, I135T, I142V, D177E, I202V, Q207E, R211K  
n23 n23 None None   I135V, I142V, S162A, T200A, R211K  
n24 n24 None None   S48L, D123E, I135T, I142V, S162C, D177E  
N25 N25 None None  E138A C38S, K49R, V60I, S68G, K122E, I135T, K173Q, T200S, R211E G93A 
N27 N27 None None   I135R, V179I, I202V, Q207E, R211K P217Q, D218K, K219L 
N28 N28 None None   V60I, K104R, D121H, K122E, I135T, D177E, Q207QH, R211K, P217X, K223R D218S 
N29 N29 None None   V60I, S68G, D121H, K122E, I135T, D177E, R211K  
N30 N30 None None  V106I K122E, I178M, T200A  
N31 N31 None None   K102Q, K103R, D123E, V179I, T200I, Q207E, R211K  
N32 N32 None None   E79D, K102Q, D123E, I135T, S162C, K173R, Q207E  
N33 N33 None None   E79D, K102Q, D123E, I135T, S162C, K173R, Q207E  
N34 N34 None None   I135T, Q207N, R211K, F214L  
N35 N35 None None   V60I, V118I, I135R, I202V, F214L  
N37 N37 None None   I135V, V179A  
N38 N38 None None   K49R, I135T, K173E, Q174H, D177E, G196E, T200A  
N39 N39 None None   T200E, R211K, F214L  
N40 N40 None None   K46Q, D121H, K122E, I135T, I142M, R211K  
N41 N41 None None   D123E, I135R, I202V, Q207H, R211K  
N42 N42 None None   I63L, V118I, I135T, I142M, R211K, F214L  
N43 N43 None None   T58S, R211K P59F, V60G, F61L, I63Y, K64E, K65L 
N44 N44 None None   K122E, D123S, I135T, G196E, Q197K, T200I, R211K  
N46 N46 None None   E36D, K122E, I135T, F171Y, T200A, K223R  
N47 N47 None None   T39S, S48A, E204Q, Q207E, R211K  
N48 N48 None None   K49R, K122E, I135T, Q174L, D177E, Q207E  
N50 N50 None None  K101E, E138A A98S, I135T, S162C, R172K, Q174K  
N52 N52 None None   K104R, K122E, A158S, R211K  
N53 N53 None None   I135T, S162C, T200A  
N55 N55 None None   V35M, K103R, I135T, Q174R, T200A, I202V, R211K, F214L  
N56 N56 None None   G45R, D123E, I135T, S162Y, E169D, K173T, Q174R, V179I, R211K, P225X  
N57 N57 None None  V106I K49R, I142T, S162C, E169D, K173T, Q174K, I178L, Q207A, R211K P52S 
N58 N58 None None T215S  S68G, K122E, I135T, I195L, G196E, R211S, E233D, H235P, P236S  
N60 N60 None None   D121H, K122E, D177E, G196E, R211K  
N62 N62 None None   G45R, V60I, I135K, R172K, E224D  
N63 N63 None None   K104R, V118I, D121H, K122E, I135T, D177E, I195L, G196E, I202V, F214L E194R 
N64 N64 None None   E36V, V60I, R83K, D123E, S162Y, T200A  
N65 N65 None None   I50V, S68G, K102E, K122E, I135T  
N66 N66 None None  V106I V35I, T107S, V111I, K122R, D123E, K166R, I178M  
N67 N67 None None   D123E, I135T, S162C, D177E, Q207A  
N69 N69 None None   K49R, D123E, A158S, D177E, I202V, R211K  
N70 N70 None None   E36X, E53D, V118I, K122E, I135T, E169D, G196E, F214L  
N72 N72 None None   E40D, V60I, K102Q, D121N, K122E, I135S, S162A, Q174K, D177E, V189I  
N74 N74 None None   S48P, K49R, K122E, D123E, I135T, E169D, G196E, I202V, R211K H221R 
N75 N75 None None A62V, V75I  R83K, D121H, K122E, D123E, I135V, S162C, D177E Y146C 
N76 N76 None None   K102Q, D123E, S162C, E169D, K173A, Q174K, I178L, Q207E, R211K  
N77 N77 None None   D123E, I135T, K173R, T200A, R211K