Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Shang (2007)
Title Genotypic resistance mutation to antiretroviral drugs in treatment-naive HIV/AIDS patients in the northeast of China.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 54
NumPts 54
Subtype B, CRF07_BC, A

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
CNJL12 CNJL12 None None   K20R, D123E, I135V, S162C, D177E  
CNJL13 CNJL13 None None   I135V, S162C  
CNJL14 CNJL14 None None   D123E, S162C, I178L  
CNJL16 CNJL16 None None  E138A V21I, I135V, S162C  
CNJL18 CNJL18 None None  V179D I135V, S162C  
CNJL19 CNJL19 None None   I135V, S162C Q182R 
CNJL20 CNJL20 None None   I135V, S162C  
CNJL21 CNJL21 None None   E6D, K20Q, K30R, K32*, S162C K22I 
CNJL22 CNJL22 None None   I135V, S162C  
CNJL27 CNJL27 None None   G15*, K20E, K22R, K32T, I37V, I135T, S162C L12S, E28V, K30I 
CNJL29 CNJL29 None None   S3I, L12F, S162C K30N 
CNJL3 CNJL3 None None   K102R, S162C, K173R  
CNJL30 CNJL30 None None   K122E, I135V, S162C  
CNJL31 CNJL31 None None   I135V, S162C, E169G  
CNJL33 CNJL33 None None   K82R, I135V, S162C  
CNJL35 CNJL35 None None   I135V, S162C  
CNJL36 CNJL36 None None   I135V, S162C  
CNJL38 CNJL38 None None   I135V, S162C  
CNJL4 CNJL4 None None   I135V, S162C, V189I  
CNJL40 CNJL40 None None   I135V, S162C, S163T  
CNJL41 CNJL41 None None   I135V, S162C  
CNJL43 CNJL43 None None  V179D T107S, S162C, S163G  
CNJL44 CNJL44 None None   K103R, I135V, S162C, V179I  
CNJL46 CNJL46 None None   V35I, I135L, S162C  
CNJL48 CNJL48 None None   I135V, S162C  
CNJL50 CNJL50 None None   E6D, V35L, I135V, S162C  
CNJL51 CNJL51 None None   I135V, S162C  
CNJL53 CNJL53 None None   I135V, S162C  
CNJL54 CNJL54 None None  Y188F I135V, N136T, I142F, Q145H, S162C Y144S, N147C, F160S, I167L 
CNJL55 CNJL55 None None   I135V, S162C  
CNJL56 CNJL56 None None   D123E, I135V  
CNJL57 CNJL57 None None  V179D I135L, S162C  
CNJL59 CNJL59 None None   K102Q, I135V, S162C, Q174H  
CNJL6 CNJL6 None None   I135V, S162C  
CNJL60 CNJL60 None None   I135V, S162C  
CNJL61 CNJL61 None None   V111I, I135V, S162C, E169D  
CNJL7 CNJL7 None None  V106I V35L, I135V, S162C, K173T, Q174K  
CNJL8 CNJL8 None None   S162C  
CNJL9 CNJL9 None None   I135V, S162C  
CNLN1 CNLN1 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, Q182H R199I 
CNLN10 CNLN10 None None   S162C  
CNLN11 CNLN11 None None   S162C  
CNLN13 CNLN13 None None   V35T, E40D, E44G, K49R, V60I, K64R, V75L, D121H, K122E, D123S, E138D, Q145H, N147H, K173S, D177E, I178M, V179I, Q197P I63M 
CNLN19 CNLN19 None None   I5V, S162C  
CNLN2 CNLN2 None None M41L, L74I V179D S68G, D86N, D121H, I135V, E138D, S162G R172I, D186H 
CNLN21 CNLN21 None None   K11T, K122E, I135V, S162C Q23L 
CNLN26 CNLN26 None None   S162C  
CNLN28 CNLN28 None None   I135V, S162C  
CNLN29 CNLN29 None None   E6D, S162C  
CNLN30 CNLN30 None None   E6D, D123E, I135V, S162C, D177E  
CNLN38 CNLN38 None None   V35I, D121H, K122E, K166R, E169D  
CNLN4 CNLN4 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I195M  
CNLN41 CNLN41 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, S163I  
CNXJ21 CNXJ21 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123E, I135R, R199T