Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Rhee (2004)
Title Distribution of human immunodeficiency virus type 1 protease and reverse transcriptase mutation patterns in 4,183 persons undergoing genotypic resistance testing.
Citation AAC
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 257
NumPts 226
Subtype B, C


  Page 1 of 3    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 257 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
CA1137 CA3126 AZT, DDC, D4T, DDI, 3TC None M41L, M184V, T215Y  T39A, R83K, V90I, S162Y, A272P, K277KR, Q278H  
  CA3203 AZT, DDC, D4T, DDI, 3TC None M41L, M184V, T215Y  T39A, K43KQ, R83K, V90I, S162Y  
CA1171 CA2660 AZT, 3TC NVP M184V K103N E6D, R83K, K102Q, K122E, S162A, I178L, Q207E, R211K, A272P, K277R, I293V  
CA1254 CA3015 3TC, D4T None M41L, M184V, T215Y  S48T, K64KR, K122E, Q207E, H235HN, V245VG, A272P, K277R, T286A, P294S, E297R P226PQ 
CA1391 CA9918 AZT, ADV, 3TC, D4T, DDI None M184V  K102Q, K122E, D177E, I178M, V245E, A272P, K277R  
CA1413 CA3787 Unknown Unknown D67N, K70R  E28EK, V35I, R83K, T200A, E203K, Q207E, A272P, K277R, I293V  
CA1439 CA10989 AZT, D4T, NRTI, 3TC, DDI NVP M184V K103N K122E, I142V, R211K, Q269QH, I293V  
CA1465 4676-2 AZT, DDI, 3TC, D4T None M41L, M184V, L210W, T215Y  W88C, V111I, K122E, K275R, K277R, Q278N, L283I, I293V  
CA1577 CA11722 DDC, AZT, 3TC, D4T EFV   V60I, R83K, K102Q, K277T, I293V, E297A, A304G  
CA1827 CA4919 3TC, D4T, AZT, DDI None M41L, D67N, L210W, T215Y  K20R, K43E, K122E, D123N, I178L, E203K, R211RK, V245M  
CA3886 CA9078 AZT, 3TC None M184V K103N I135V, S162C, I178L, R211K, P243PH L234LH 
CA3948 CA9173 None None   K11KR, K20R, K32KN, V35I, R83K, A98S, K102KQ, K122E, I135T, E169ED, T200A, I202V, V245E, E248D, D250E  
CA4010 CA9268 Unknown Unknown   T39A, V111I, K122E, I135V, I142T, Q207E, F214L, L228R  
CA4164 CA14784 AZT, 3TC None M184V V179E R83K, K102R, S163T, K173N, Q174K, Q207E, R211K, V245T, A272P  
CA4312 CA14143 AZT, 3TC, D4T, DDI EFV M41L, M184V, T215Y  R83RK, G196E, T200A, Q207K, R211A, A272P, K277R, T286A, E297KR K287KN 
CA4473 4463-1 AZT, DDI, D4T, 3TC, DDC EFV   A98S, K122E, Q207E  
CA4725 CA11587 AZT, D4T, DDI, 3TC None M41L, D67N, T69D, M184V, L210W, T215Y A98G V35I, E44D, V60I, R83K, V118I, K122E, D123N, I135M, D177E, I178L, R211K, V245E, A272P, K277R, I293V, E297A L295LP, E300EV 
CA4827 CA11742 AZT, 3TC, D4T, DDI None M41L, M184V, T215Y  S162C, E169D, T200A, R211K  
CA4876 CA11979 AZT, 3TC None M184V  E6D, I135T, S162C, Q207E, F214FL, K277R  
CA5002 CA12270 AZT, 3TC, D4T, DDI None M41L, D67N, L210W, T215Y  K43Q, I50V, V60I, D123E, D177E, G196E, T200R, R211K, A272P, I293V  
CA5048 CA12326 3TC, D4T None M184V  D121H, K122E, I135IT, I142IV, D177E, I178M, A272P  
CA5239 CA12831 AZT, 3TC, DDI, D4T None M184V  E6K, R72RG, K122E, D123S, I135T, D177E, G196E, F214L, N265ND, A272P, A288AG  
CA5702 CA14471 Unknown Unknown   K122KE, T165I, Q207E  
CA5721 CA14494 Unknown Unknown   K166R, T200A, R211RK, F214L, V245M, V276T, K277R, I293V  
CA5941 CA14704 Unknown Unknown  V106I K20KR, V60I, K122A, I135T, S162C, V179I, T200A, R211K, A272P, K277KR  
CA6007 CA14788 AZT, 3TC, D4T, DDI None D67N, K70R  K64R, K122E, I135T, I178M, A272T, A288S, I293V, E297A  
CA606 CA10474 AZT, DDI, D4T, 3TC None M41L, M184V, T215Y  K20R, A98S, K122E, A158S, Q197E, L228LH, V245EK  
CA628 CA1197 AZT, DDC, D4T, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y  K20R, V35I, K43KN, A272P, K277R, I293V, E297K  
CA632 CA3135 AZT, DDC, DDI, D4T, 3TC None M41L, D67N, T69D, M184V, L210W, T215Y  T39A, K43A, E44D, V118I, K122E, I142V, Q207E, R211K K126KE 
  4755-5 AZT, DDC, DDI, D4T, 3TC None M41L, D67N, T69D, M184V, L210W, T215Y  T39A, K43A, E44D, V118I, K122E, I142V, Q207E, R211K, K287R, I293V, E297A  
  CA9435 AZT, DDC, DDI, D4T, 3TC None M41L, D67N, T69D, M184V, L210W, T215Y  T39A, K43A, E44D, V118I, K122E, I142V, Q207E, R211K, I293V, E297A  
CA637 CA9928 AZT, DDI, 3TC, D4T None M41L, M184V, T215Y  K20R, K122E, I135T, T200A, R211K, A272P, I293V, E297K  
CA640 CA9944 AZT, 3TC, D4T, DDI NVP M41L, M184V, L210W, T215Y  D123E, I135T, I142T, D177E, V179I, G196E, L228R  
CA7085 CA17425 3TC, D4T None M184V  K11KT, D123E, Q174K, D177E, Q207E, R211K, V245M, A272P, K277R L283LR 
DK-1014 DK-1014 RTI RTI M184V  D123E, I135T, K173N, T200A, V245M, T286TA, I293IV, E297A, T377Q K126KE 
DK-1324 DK-1324 RTI RTI M184V E138EQ E6ED, K32KR, V35T, I135IM, S162X, E169ED, I202V, Q207E, Q278H, K281R, V292VI, I293V, P294T, D324DE, K366R  
DK-1543 DK-1543 RTI RTI M184V  K102E, I135T, S162C, R211K, I293V, Q334L, M357S, T369V  
DK-2105 DK-2105 RTI RTI   V8VI, V35VI, R83K, K104KR, D123E, I135T, A272P, K281R, E297K  
DK-2194 DK-2194 RTI RTI   R83K, T200TA, V245E, K281R, E297EA  
DK-2405 DK-2405 RTI RTI M184V  V21VI, K102KE, D123E, D177E, I178IL, V179VI, T200TA, A272P, K277KR, T286A, E297K A304AS 
DK-243 DK-243 RTI RTI M184V  V60I, V90I, K122Q, D123E, I178L, R211K, D237DN, I293V, I326V, Q334L, R356K, M357T, T397TI  
DK-3015 DK-3015 RTI RTI D67N, K70R, M184V  T27S, T39A, K102KR, D123E, I142T, D177E, G196E, Q207QE, V245K, A272AP  
DK-3083 DK-3083 RTI RTI M184V  K20KR, V35VA, T139X, I142X, G196GE, R211K, V245K, V292I, I293V, S322T, Y342YF, F346FS, M357V, T369TI, K390R, A400S  
DK-3133 DK-3133 RTI RTI D67N, K70R, M184V N348I R83K, D123E, Q197E, R211K, I329L, R356K, G359S, V365I, A376S, K390R  
DK-3443 DK-3443 RTI RTI M184V  V21I, D123E, S162A, D177E, V245K, A272AP, T286A, A288S, I293V, K311R, G333D, Q334QH, T338TS, Q343QH, M357T, A360AT, T377L, S379C, K390R, E399D  
DK-354 DK-354 RTI RTI M184V  A98S, I135IL, S162X, T200EA, V245E, E297K, S379G, K390R  
DK-3823 DK-3823 RTI RTI     
DK-3914 DK-3914 RTI RTI M184V  V35I, E40ED, I135T, R211K, V245K, T286A, E297K, V317VA, I326IV, Q334L, T377Q, K390R  
DK-4224 DK-4224 RTI RTI M41L, M184V, L210W, T215Y  K11R, I178M, T200A, Q278H, I293V, F346L, G359S, A371V, A376S  
DK-4433 DK-4433 RTI RTI D67N, K70R  V35I, K122P, I135R, D177E, T200R, P294T, E297K  
DK-5204 DK-5204 RTI RTI M184V  E6D, R83K, D177E, T200A, E203K, Q207E, R211K, K277KR, E297K, K311R, I329V, G333E, R356K, A371V, K390R  
DK-5394 DK-5394 RTI RTI M41L, M184V, T215Y  E28ED, T39A, K49R, K122E, D123N, I135T, I142V, S251I, I257L, A272P, Q278QH, T286TA, E297A F130FC, R143RI, N147NT 
DK-5454 DK-5454 RTI RTI M41L, M184V, T215Y  T39TA, I142V, F171FY, V245K, R358RK, G359GS, A360AT, A376AT  
DK-5673 DK-5673 RTI RTI M184V  T39A, I142V, I178M, Q207H, R211K, V245MT, I293V, E297EK, V317A, I329L, R356K, A360V  
DK-5814 DK-5814 RTI RTI M41L, M184V, T215Y N348I R83K, Q207R, V245E, I293V, M357T, K366KR  
DK-5973 DK-5973 RTI RTI M184V  K43QE, A98S, I142V, E203K, R211S, V245T, E297K, I329L, M357MV, K366KR, A376S, K390R, K395R  
DK-6333 DK-6333 RTI RTI M41L, M184V, L210W, T215Y  D123G, I135T, E203K, Q207E, R211K, T286A, I329V, M357MR, G359GS, A360T, A371V  
DK-7294 DK-7294 RTI RTI M184V  D121DY, K122E, E203D, R211K, L283I, E297A N136ND 
DK-7515 DK-7515 RTI RTI  E138A A98S, D123DE, I202V, R211K, A272P, K281R, T286A, E297K N147NT 
DK-8873 DK-8873 RTI RTI M184V  K11KT, R83K, R211K, T286A, E297K, I329L, Q334H, F346Y, V365VI, L368LV, T369IV, K390R  
DK-9014 DK-9014 RTI RTI   K104KN, D177DE, Q207X, R211K, V245M, I293V, K311R, V317A, Q334L, R358K, G359S  
DK-9105 DK-9105 RTI RTI M184V  N137NS, V245E, T286A, E297K  
DK-9233 DK-9233 RTI RTI M184V N348I R83K, I178L, R211K, I293V, E297A, S322T, K353R, K366R, K390R  
DK-9314 DK-9314 RTI RTI M41L, M184V, L210W, T215Y  T39TA, I142IV, A158S, I178IM, Q207E, R211K, V245K, R284K, T286A, E297K, V317A, M357T, K366R, K390R  
DK-9324 DK-9324 RTI RTI M184V  D123DE, K173KQ, D177DE, I178M, I202IV, R211K, E224ED, V245E, D250E, K281R, I293V, T296TS, E297KT, G316GR, G333D, S379G, V381I, T386I, K390R  
DK-9473 DK-9473 RTI RTI M41L, M184V, T215Y  R83K, Q207E, R211K, R284K, T286A, E297K, S322T, D324E, I329L, R358K, A360AV, V365I, E399D  
MV-123 MV-123wk24 ABC None   K104X, S162C, T200A, Q207R T84TI, A98AP 
MV-136 MV-136wk36 ABC, AZT, 3TC None M184V  I31L, I37F, T39P, I178L, I202V C38G 
MV-138 MV-138wk48 ABC, AZT, 3TC None M184V  V35I P150PGR, K154KN 
MV-160 MV-160wk48 ABC, AZT, 3TC None M184V  K122E, S162C  
MV-163 MV-163wk36 ABC, AZT, 3TC None   K49R, V60I, T200A, E204D  
MV-172 MV-172wk16 ABC None K65R  V35I, R83K, D123E, A158AT, E169X, Q174L  
  MV-172wk48 ABC, AZT, 3TC None   V35I, R83K, D123E  
MV-175 MV-175wk48 ABC, AZT, 3TC None M184V  R83K, K122E, D123N, S162A, I195V, G196E, D218E  
MV-196 MV-196wk16 ABC None L74V, M184V  K122E, D123S, I159V  
MV-198 MV-198wk12 ABC None L74V, M184V  D123E, A158T, E169EK, D177E, I178L, I202X, R211RK, F214FL, D218X K154KN, R199RI 
MV-205 MV-205wk24 ABC None L74V, M184V  V60I, R83K, I135T, Q145X, Y146X, A158T, K166R, R199RK, T216P  
SD-10 SD-10 NRTI, AZT, 3TC None M184V  K102Q, D123E, S162C, T200A, Q207E, A272P, K277R, I293V  
  SD-10_13 NRTI, AZT, 3TC, ABC, D4T None M184V  K102Q, D123E, S162C, I178IL, V179VI, T200A, Q207E, A272P, K277R, I293V  
SD-13 SD-13 NRTI, 3TC, D4T None M41L, M184V, L210W, T215Y  K43Q, V60I, S68SG, T139M, R211K, V245Q, A272P, K277R, I293V, E297A  
SD-17 SD-17_2 NRTI, AZT, 3TC, ABC NVP M184V  K13N, V35T, T39A, K122E, T200A, L228LR, A272S, T286A  
SD-19 SD-19 NRTI, AZT, 3TC None M41L, M184V, T215Y  D123E, Q174K, T200A, R211K, V245VM, A272P, I293V, E297KR  
  SD-19_2 NRTI, AZT, 3TC, ABC NVP M41L, M184V, T215Y  D123E, Q174K, D177DE, T200A, R211KT, V245VM, A272P, I293V, E297KR  
SD-2 SD-2_10 NRTI, AZT, 3TC, ABC, D4T None M41L, M184V, L210W, T215Y A98G T39K, K43E, S68G, I135V, S162C, R211K, L228H, V245E, A272P, K277R, T286TA, V292I, I293IV  
  SD-2_18 NRTI, AZT, 3TC, ABC, D4T None M41L, M184V, L210W, T215Y A98G T39K, K43E, S68G, I135V, S162C, R211K, L228H, V245E, A272P, K277R, V292I, I293IV  
SD-20 SD-20 NRTI, 3TC, D4T None M41L, M184V, T215Y  I135V, K166R, A272P, K277R, E297KR P140Q 
  SD-20_12 NRTI, 3TC, D4T, ABC NVP M41L, M184V, T215Y  V21VI, I135V, K166R, V189VI, A272P, K277R, E297KR  
SD-5 SD-5 NRTI, AZT, 3TC None M184V  K20R, K122E, I142V, T165I, K277R, A288S, I293V  
  SD-5_16 NRTI, AZT, 3TC, ABC, D4T None M184V  K20R, K122E, I142V, T165I, K277R, A288S, I293V  
SD-7 SD-7 NRTI, 3TC, DDI None L74V, M184V  K122E, K173R, Q174K, I178M, Q207E, A272P, T286A  
  SD-7_8 NRTI, 3TC, DDI, DDC, ABC None L74V, M184V  P4PS, K122E, Q174K, I178M, Q207E, R211A, Q222QR, T240S, A272P, T286A  
SQ-150281 150281 Unknown Unknown   V35T, D123E, I135V, T165I, K173R, I178M, V179I, K277R, A288S, E297A, I326IM, R358K, V372I, K390R  
SQ-157091 157091 Unknown Unknown   D123E, I142T, D177E, V245I, D250E, I293V, A376T, A400S  
SQ-160624 160624 Unknown Unknown   R83K, K122KE, D177DG, I178IM, V245L, A272P, V276I, K277KR, A376T, A400T  
SQ-184052 184052 Unknown Unknown   R83K, D123E, V245M, D250E, A272P, I293V, V317A, M357T, A376T, E399D, A400T  
SQ-211183 211183 Unknown Unknown   R83K, R211S, A272P, K281R, E297K, S322L, A376T, V381I, A400T  
SQ-211746 211746 Unknown Unknown   I135T, G196E, V245E, A272P, K277R, I293V, P294Q, K311R, G335E, R356K, M357R, V365I, T369A, K374R, T386I, K390R, A400T  
SQ-214124 214124 Unknown Unknown   K166R, K173E, I178IV, R211K, F214L, A272P, K277R, A288S, G333E, G335S, M357T, A376T, K390R, A400T  
SQ-218805 218805 Unknown Unknown   I135T, T165I, T200A, F214L, A272T, I293V, K366R, A376T, A400T T128A 
WI004173 41731906 AZT, DDI, 3TC None M184V  E6D, K49KR, K122E, I135T, T200I, V245MT, I293V, E297K