Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Eshleman (2002)
Title Survival of Ugandan infants with subtype A and D HIV-1 infection (HIVNET 012).
Citation JAIDS
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 86
NumPts 86
Subtype A, D, C, C + D, B

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
111982s 111982s AZT None   V35T, T39TK, K49R, V60I, D121Y, K122E, I142V, D177E, I178M, Q207E, V245K, D250E, A272P, T286AV, E297KR  
113913u 113913u AZT None   E6A, V35T, E40ED, K49R, V60I, K122E, I135T, S162H, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207D, R211RK, V245E, D250E, T286A, E291D, V292VI, I293V, E312D  
115106j 115106j AZT None   K11KT, V35T, T39A, E40D, K43R, K64R, K122E, D123S, I135R, K173AS, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L, V245Q, A272S, T286TA, E291D, I293V, P294T, L310LI, E312D  
117886a 117886a AZT None   K22KN, L34LF, V35T, T39TI, E40D, K49KR, V60I, K122E, I135V, D177E, I178M, Q207E, V245K, D250E, A272P, K277R, T286A, I293V  
121108v 121108v AZT None   E6K, V35T, E36A, T39E, K122E, D123G, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245K, D250E, A272P, K277KT, T286A, E291D, V292VI, I293V, E297IT  
123108n 123108n AZT None   V35I, K49R, V60I, K64R, D121Y, K122E, I135R, S162N, D177E, T200I, Q207G, R211K, V245I, D250E, I257L, A272P, K277R, L279I, L282C, T286A, I293V  
123208j 123208j AZT None   V35T, T39R, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177G, V179I, Q207A, R211S, V245K, D250E, A272Q, K277R, L282C, T286A, I293V  
123793k 123793k AZT None  K238KN K11T, K20R, V21I, V35T, T39KR, K122E, D123S, T165I, K173S, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211K, V245Q, E248X, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E312D  
123898b 123898b AZT None   K11T, V21I, V35T, T39S, K122E, D123G, S162SN, K173S, Q174R, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248NS, T286A, K287KR, E291D, I293V, P294AT, E312N  
124661e 124661e AZT None   E6T, T7P, K11T, V35T, V60I, D123N, I142IT, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207G, R211K, V245K, D250E, A272P, K275R, Q278QH, L279LI, L282C, T286A, I293V, S322A  
125636u 125636u AZT None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39R, D123DEG, K173S, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248N, T286A, E291D, V292I, I293V, E312D  
126083n 126083n AZT None   V35I, V60I, D121Y, K122E, I135R, V179I, Q207A, V245K, D250E, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
126533t 126533t AZT None   K20R, V21I, V35T, T39R, K43KE, K122E, D123N, K173S, D177G, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248D, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
127205r 127205r AZT None   V35T, T39I, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, D177E, I178M, T200IL, Q207G, R211K, P243AS, V245K, D250E, A272S, L282C, T286TA, I293V  
129425g 129425g AZT None   V35T, K49R, V60I, D121HY, K122E, I159IV, D177E, T200I, Q207E, R211K, V245KQ, D250E, K277R, L282C, L283I, T286A, I293V  
130526d 130526d AZT None   P4H, K11T, V35T, E40D, K43R, I50V, V118I, K122E, D123S, I135R, K173S, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S, F214L, V245K, A272P, V276I, K277R, L282C, L283I, R284RK, T286A, A288T, V292I, I293V, E297A  
131226r 131226r AZT None   E6D, V35T, K49R, V60I, I135T, D177E, I178MV, T200I, Q207G, R211K, E224ED, V245K, D250E, A272P, K277R, L282C, T286A, I293V  
132074m 132074m AZT None   K11T, K20KR, V21VI, V35T, T39TR, E40ED, K43KE, V60VI, K122E, D123N, I135IT, K173S, Q174K, D177EG, V179I, T200A, I202IV, R206RK, Q207RS, R211NS, F214FL, V245Q, E248ED, T286A, E291D, V292VI, I293V, E312D  
132318b 132318b AZT None   K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K166R, K173L, Q174K, D177E, I178IL, V179I, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248N, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E312D, S322A  
132591a 132591a AZT None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39R, K49KR, K122E, D123N, I135T, K173S, D177G, V179I, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248N, A272S, Q278QH, T286A, E291D, V292I, I293V, P294A, L295LM, E312D, S322L  
132685m 132685m AZT None   E6D, T7P, K11T, K20R, V35T, T39N, K122E, D123G, K173S, D177G, V179I, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248N, K281R, T286A, E291D, I293V, P294T, E312D, V317A  
134248p 134248p AZT None   E28K, V35T, V60I, K122E, D123S, I135IV, T139L, K173S, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245E, D250E, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E312D  
136288y 136288y AZT None   V35T, K49R, V60I, K122E, D123S, I135T, I142V, T165I, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K, V245K, A272P, K277R, L282C, L283I, I293V  
136600t 136600t AZT None   P4X, V35T, T39X, K49KR, V60I, D121Y, K122E, D123DE, S162SC, D177E, T200X, Q207E, R211K, V245KQ, E248ED, D250E, S251ST, A272Q, L282C, T286A, I293V  
136677c 136677c AZT None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39R, V60I, D123S, K173A, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248N, A272P, V276I, T286A, E291D, V292VI, I293V, P294A, E312D  
137499q 137499q AZT None   E6K, K11T, K20R, V35T, K122E, D123S, I135T, I142IV, S162C, K166KR, K173S, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L, V245Q, T286A, A288G, E291D, I293V, P294T, E312D, S322A  
137554u 137554u AZT None   V35T, K49R, V60I, A158S, S162T, D177E, Q207E, R211K, V245Q, D250E, L282C, A288T, E297A  
138162o 138162o AZT None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39R, V60I, K122KE, D123KN, I135KR, K173S, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245Q, E248N, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E312D  
138430v 138430v AZT None   E6EA, K11KT, V35T, T39R, K104R, K122E, D123S, I142IV, A158S, T165TI, K173S, D177E, Q207A, R211S, V245Q, K277Q, K281R, T286A, E291D, I293V, P294T, E297R, E312D  
138904n 138904n AZT None   K11T, K20R, V35T, T39K, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, V179I, I195IL, T200A, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248D, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, K311KR, E312D  
139177o 139177o AZT None   V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, I178IL, T200A, Q207E, R211S, F214L, V245E, D250E, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E312D  
139339y 139339y AZT None   K20R, V35T, T39KR, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135IT, D177E, I178M, V179I, G196KR, I202IV, Q207E, R211K, V245K, D250E, A272P, K277R, T286AV  
139367i 139367i AZT None   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123DG, T139A, I142V, D177E, I178M, T200I, Q207G, R211K, V245Q, A272S, K277R, Q278H, K281R, L282C, T286A, I293V  
139934b 139934b AZT None   V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I159IV, D177E, I178IMV, V179VI, Q207EG, R211K, V245K, D250E, A272S, K277R, L282C, L283I, I293V  
140727y 140727y AZT None   V8VA, K11T, K20R, V21I, E28EK, V35M, T39S, W88WC, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211KN, V245Q, E248D, A272AP, K281R, L283LI, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E312D  
141601a 141601a AZT None   E6D, V35T, T39M, K43R, V60I, K122E, D123G, I135T, S162F, K173S, Q174K, D177E, T200V, Q207A, R211S, V245M, E248D, D250E, A272P, T286A, V292I, I293V, P294T, E312D  
142181q 142181q AZT None   E6D, V35T, E40D, V60I, D121H, K122E, D123S, K173S, D177E, V179VI, T200TA, Q207A, R211S, V245Q, D250E, A272AS, K281KR, E291D, I293V, P294T, L295LM, E312D, V317VA  
144167x 144167x AZT None   E6R, V35T, K49R, V60I, K122E, D177E, I178M, T200V, Q207G, R211K, E224D, V245K, D250E, K277R, L282C, L283I, T286A, I293V  
144240v 144240v AZT None   V35VIM, E40D, K49KR, V60VI, K122E, D177E, I178IM, Q207EG, R211K, I244IV, V245K, D250DE, S251SC, A272P, K277R, L282C, L283I, T286A, I293V  
144449s 144449s AZT None   V35T, E40D, V60I, D121H, K122E, D123E, I135T, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, P243S, V245K, E248D, D250E, T286A, E291D, I293V, P294T, E312D  
145027t 145027t AZT None  E138A V21I, V35AT, T39A, E40ED, V60I, V90VI, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, V179I, T200TA, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292VI, I293V, P294T, E312D  
145350k 145350k AZT None   V35T, K49R, I50V, V60I, K122KE, D123DG, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K, V245K, P247T, D250E, A272P, K277R, L282C, T286A, I293V, E297K, A304E  
145484o 145484o AZT None  E138A V35T, E40D, V60I, D121H, K122E, I135T, I142V, K173A, Q174K, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245K, D250E, T286A, E291D, I293V, P294T, L295M, E312D  
146922v 146922v AZT None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, K173T, Q174R, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248N, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297D, E312N  
147143w 147143w AZT None   K32KR, V35T, E40ED, K43KN, S48ST, K49R, V60I, D121Y, K122E, T165I, D177E, T200M, Q207E, R211K, V245KT, D250E, A272S, K277R, L282C, L283I, I293V, E297A  
147521r 147521r AZT None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39R, K122E, D123S, S162C, K173S, D177EG, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248D, T286A, E291D, I293V, P294A  
147607q 147607q AZT None   V35T, T39L, E40ED, V60I, I142IV, D177E, T200TI, Q207E, R211K, V245X, D250DE, S251SN, A272P, K277R, L282C, I293V  
148154f 148154f AZT None   V35T, V60I, D121Y, K122E, K166KR, D177E, I178M, E194D, T200M, Q207E, R211K, V245K, A272P, K277R, L282C, L283I, T286A, I293V, P294S  
148838k 148838k AZT None   E6D, V35T, K43KR, S48A, V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200TA, Q207E, V245Q, T286A, E291D, V292VI, I293V, P294A, E312D Q182Q* 
149262u 149262u AZT None   V8I, K11Q, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, D123X, S162SN, D177E, I178M, T200LQ, Q207E, R211K, V245K, D250E, A272S, L282C, L283I, T286TA, I293V, V317I, S322T  
150014t 150014t AZT None   K11T, K20KR, V21I, V35T, E36ED, T39GR, V60I, D123DN, K173S, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248D, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E312N  
150140g 150140g AZT None   V8I, V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123S, I135R, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K, V245EK, D250E, A272P, K275R, K277R, Q278H, L282C, T286A, I293V  
151848f 151848f AZT None   K11T, V35T, K49KR, K122E, D123S, I135T, K173S, D177E, V179I, T200TA, Q207A, R211S, V245Q, T286A, E291D, I293V, P294T, P313T  
151857y 151857y AZT None   V35T, K49R, V60I, K122E, D123EG, D177E, I178IM, G196E, T200I, Q207E, R211K, V245EK, D250E, A272P, K277R, L282C, L283I, T286A, I293V  
SE13 SE13 None NVP   I5V, K32R, V35T, T39A, E40D, K43KR, K49R, K122E, D123N, N175NH, D177E, I178IM, V179I, I202V, Q207A, R211KQ, V245Q, E248N, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E312D  
SE173 SE173 None NVP   K11S, V35T, T39K, K122E, D123S, K173S, D177E, V179I, Q207A, R211S, F214L, V245Q, T286TA, E291D, I293V, E312D  
SE185 SE185 None NVP   K11T, K20R, V21I, V35T, T39K, V60I, K122E, D123N, I135T, K173T, D177G, T200K, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248D, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, V314M  
SE227 SE227 None NVP   V35T, K49R, V60I, V90I, D121Y, K122E, D177E, I178M, I180V, T200A, I202V, Q207D, R211K, V245K, D250E, A272P, K277R, L282C, T286A, I293V, E297V, E312R  
SE243 SE243 None NVP   E6EK, V35I, K49R, V60I, K166R, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, L282C G45N 
SE414 SE414 None NVP   V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, T200I, Q207G, R211K, V245Q, E248N, S251N, V261I, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E312D  
SE444 SE444 None NVP   K11T, V35T, K122E, D123S, I135T, K173S, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245K, I274IV, K281KR, T286A, E291D, I293V, P294T, E312D  
SE494 SE494 None NVP   K11R, V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123DEG, I135IRT, T139TA, D177E, I178IM, T200I, I202IV, Q207EG, R211K, V245Q, A272P, K277R, L282C, T286A, A288AG, I293V, K311R  
SE522 SE522 None NVP   K11T, K20KR, V21I, V35T, T39TR, F87L, D123N, K173S, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211K, V245KQ, E248X, D250DE, T286TA, E291D, I293V, P294T, E312D, G316V  
SE532 SE532 None NVP   K11T, K20R, V21I, V35T, T39K, K122E, D123N, K173S, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245Q, E248D, T286A, E291D, I293V, P294T, E312D  
SE534 SE534 None NVP   K20R, V21I, V35I, T39S, V60VI, K122E, D123S, I135T, A158AS, K173S, Q174QK, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248D, K281R, L283I, T286A, E291D, V292I, I293V, E312D  
SE537 SE537 None NVP  K103KN E6K, V35T, K49R, V60I, K122E, D177E, I178M, T200I, Q207G, R211K, V245K, K249KQ, D250E, A272P, K277R, L282C, L283I, T286V, I293V  
SE545 SE545 None NVP  K103KN, V106VA, Y181YC K11T, K20R, V21I, V35T, T39R, V60I, K122KE, D123S, T165I, K173S, D177E, V179I, G196GE, I202V, Q207A, R211K, V245Q, E248D, S251I, K277R, T286A, E291D, P294T  
SE549 SE549 None NVP   V35T, V60I, D121Y, K122E, D123E, D177E, T200I, Q207E, V245Q, D250E, K277R, K281R, T286A, E291D, I293V, P294A, E312D  
SE577 SE577 None NVP   P4PH, I5IV, K11T, K20R, V21I, V35T, T39K, K49R, V60VI, D123S, K173AS, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211RK, V245Q, E248N, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, A304AE, E312D, V317A  
SE592 SE592 None NVP   E6N, V21I, V35T, T39K, V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207E, R211RS, V245E, D250E, E291D, I293V, P294T  
SE602 SE602 None NVP   V35T, E40D, K49R, I50V, V60I, D121H, K122E, I135T, T165I, I178M, T200I, I202V, Q207G, R211K, V245K, D250E, A272P, K277R, L282C, L283I, T286A, I293V  
SE618 SE618 None NVP   V35T, T39M, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135T, K166KR, I178IM, T200I, Q207E, R211K, V245K, K249Q, D250E, A272P, K277R, L282C, L283I, I293V  
SE681 SE681 None NVP   V21I, V35T, E36A, T39E, K122E, D123G, A158S, K173T, D177E, T200A, Q207E, W212WGR, V245EQ, S251SI, K277KR, T286A, E291D, V292I, I293V  
SE699 SE699 None NVP   K11T, K20R, V21I, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, K173S, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S, V245T, D250E, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E312D  
SE710 SE710 None NVP   V21VI, V35T, T39K, K49R, V60VI, K122E, D123S, A158S, E169ED, K173S, N175H, T200A, Q207A, R211RS, V245Q, V261I, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297K, E312D  
SE73 SE73 None NVP  K103KN, E138A V35T, E36A, T39E, E40D, K43R, S48E, E53D, K101Q, K122E, D123G, S162Y, K173A, D177G, V179I, G196E, T200A, Q207D, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, K311R T253TP 
SE750 SE750 None NVP   E6KT, V35T, E40ED, K49R, V60I, S68SG, K122E, I135IV, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211RK, V245Q, D250E, A272P, K277R, T286A  
SE788 SE788 None NVP   V35I, K49R, V60I, K64KR, D121Y, K122E, D123DE, I135T, T200I, Q207E, R211K, V245K, D250E, A272P, K277R, L282C, L283I, T286A, I293V, P294T, E298D  
SE790 SE790 None NVP  K103KN K11T, K20R, V21I, V35T, K122E, D123S, K173S, D177G, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, V245Q, V261I, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E312D E248C 
SE816 SE816 None NVP   V35T, K49R, V60I, D121H, K122E, D123E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, I195M, T200A, Q207A, R211S, V245K, D250E, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E312D  
SE823 SE823 None NVP   V35I, E36A, T39E, S48T, A158S, K173A, D177E, I178L, T200A, Q207K, V245K, A272K, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, P321S  
SE827 SE827 None NVP   V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K, V245K, D250E, A272P, K277R, L282C, L283I, T286A, I293V  
SE830 SE830 None NVP  K103KN, Y181YC E29D, V35T, T39TM, K49R, K122E, S162C, E169D, D177E, I178IM, Q207E, V245T, D250E, K277R, T286A  
SE847 SE847 None NVP  K103KN V35T, V60I, D121H, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179VI, T200A, Q207A, R211RS, V245K, D250E, T286A, E291D, V292I, I293V, E312D  
SE851 SE851 None NVP   K32I, V35T, T39R, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135R, N175H, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211K, I244V, V245K, D250E, A272P, K277R, L282C, L283I, T286A, I293V  
SE871 SE871 None NVP   K20R, V35VA, E40D, V60I, D121H, K122E, I135T, P150S, K173S, Q174K, D177DE, V179I, T200A, Q207A, R211RS, V245E, D250E, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, K311R Y127D 

Database

Resources

Team