Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Apetrei (2003)
Title HIV type 1 diversity in northeastern Romania in 2000-2001 based on phylogenetic analysis of pol sequences from patients failing antiretroviral therapy.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 86
NumPts 67
Subtype F, C

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
AC_Pat1 RO.00.IS.01 AZT, 3TC, Unknown Unknown M41L, T69D, L74V, M184V, L210W, T215C L100I, K103N V35T, T39A, E44D, D123E, I135L, I142T, S162H, K173T, Q174K, I195L, T200A, E203K, Q207A, H208Y, R211E, K223Q, L228R  
  RO.01.IS.01 AZT, 3TC, Unknown, D4T Unknown M41L, T69G, L210W, T215C L100I, K103N V35T, T39A, E44D, D123E, I135L, I142T, S162H, K173T, Q174K, I195L, T200A, E203K, Q207A, H208Y, R211E, K223Q, L228R  
AC_Pat1_a RO.00.IS.11 Unknown Unknown  K103N V35P, T39A, E40D, D123E, I135L, T139A, S162H, K173A, Q174K, I195L, Q207D, R211K  
  RO.01.IS.11 Unknown Unknown  K103N, P225H V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, T139A, S162H, K173A, Q174K, Q207D, R211K  
AC_Pat2 RO.00.IS.02 AZT, 3TC None   V35T, T39A, D123E, I135L, S162Y, K173T, Q174K, I195L, T200A, Q207T, R211K  
AC_Pat20 RO.00.IS.20 AZT, 3TC, D4T EFV  K103N V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162H, K173A, Q174K, T200A, Q207A, R211K  
  RO.01.IS.20 AZT, 3TC, D4T EFV  K103N, P225H V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162H, K173A, Q174K, T200A, Q207A, R211K  
AC_Pat21 RO.00.IS.21 AZT, 3TC None K70R  V35T, T39A, E40D, K49R, D123E, I135L, S162Y, E169A, K173A, Q174K, I178M, I195L, Q207E, R211K  
  RO.01.IS.21 AZT, 3TC None K70R  V35T, T39A, E40D, K49R, E53G, D123E, I135L, S162Y, E169A, K173T, Q174K, I195L, Q207E, R211K  
AC_Pat22 RO.00.IS.22 AZT, 3TC, D4T NVP  Y181C V35P, T39A, E40D, D123E, I135L, S162H, K173A, Q174R, D177E, I195L, T200A, Q207E, R211K  
AC_Pat23 RO.00.IS.23 AZT, 3TC NVP D67N, T69D, K70R, K219Q K103N, Y181C V35T, T39A, E40D, V60I, D123E, I135L, S162H, K173A, Q174K, I195L, Q197K, T200A, Q207T, R211K, L228H  
  RO.01.IS.23 AZT, 3TC, DDI NVP D67N, T69D, K70R, K219Q K103N, Y181C V35T, T39A, E40D, V60I, V90I, D123E, I135L, T139S, S162H, K173A, Q174K, I195L, G196E, Q197K, T200E, E203D, Q207E, R211K, E224D, L228H  
AC_Pat24 RO.00.IS.24 AZT, 3TC, D4T EFV  K103N V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162H, K173A, Q174K, Q207E, R211K  
AC_Pat25 RO.00.IS.25 AZT, 3TC, D4T EFV  K103N, E138G V35T, T39A, K101Q, D123E, I135L, S162H, K166Q, Q174R, D177E, I195L, G196K, T200A, Q207A, R211K  
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AC_Pat26 RO.00.IS.26 AZT, 3TC, D4T EFV D67N, T69D, K70R, K219Q V179D, Y188L V35T, T39A, V60I, K103R, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, I195L, Q207V, H208Y, R211K  
  RO.01.IS.26 AZT, 3TC, D4T EFV D67N, T69D, K70R, K219Q V179D, Y188L V35T, T39A, V60I, K103R, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, I195L, Q207V, R211K  
AC_Pat27 RO.00.IS.27 AZT, 3TC, D4T EFV K219Q K103N V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162H, K173A, Q174K, I195L, Q207T, R211K  
  RO.01.IS.27 AZT, 3TC, D4T EFV K219Q K103N V35T, T39A, E40D, V60I, D123E, I135L, S162H, K173A, Q174K, D177E, I195L, Q207A, R211K  
AC_Pat28 RO.00.IS.28 AZT, 3TC, D4T EFV  K103N V35T, T39A, E40D, V60I, D123E, I135L, S162H, K166R, F171L, K173A, Q174R, I195L, T200A, Q207A, R211K  
AC_Pat29 RO.00.IS.29 AZT, 3TC, D4T EFV   V35T, T39A, E40D, T69S, D123E, I135L, S162Y, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K  
AC_Pat3 RO.00.IS.03 AZT, 3TC None  K103N V35T, T39A, E40D, K122E, D123G, I135L, S162H, K173T, Q174K, I195L, T200A, Q207A, R211K  
AC_Pat30 RO.00.IS.30 AZT, 3TC, D4T NVP   V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162Y, K173T, Q174R, I195L, T200A, Q207A, R211K  
AC_Pat31 RO.00.IS.31 AZT, 3TC, D4T EFV D67G, T215I, K219E Y188L V35T, T39A, E40D, S68G, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, N175Y, I195L, Q207A, R211K  
  RO.01.IS.31 AZT, 3TC, D4T, ABC, DDI EFV D67G, T215I, K219E Y188L V35T, T39A, E40D, S68G, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, N175Y, I195L, G196R, Q207A, R211K  
AC_Pat32 RO.00.IS.32 AZT, 3TC None   V35T, T39A, E40D, T69S, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, T200A, Q207A, R211K  
  RO.01.IS.32 AZT, 3TC, D4T NVP   V35T, T39A, E40D, T69S, D123E, I135L, S162H, E169D, K173T, Q174K, T200A, Q207A, R211K  
AC_Pat33 RO.00.IS.33 AZT, 3TC None   V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K  
  RO.01.IS.33 AZT, 3TC, D4T NVP  K103N V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162Y, K173T, Q174K, D177E, I178V, I195L, T200A, Q207T, R211K  
AC_Pat34 RO.00.IS.34 AZT, 3TC, D4T EFV  K103N V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162H, K173A, Q174R, I195L, T200A, Q207A, R211K  
AC_Pat35 RO.00.IS.35 AZT, 3TC NVP  K103N V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162H, K173I, Q174K, T200A, Q207A, R211K  
AC_Pat36 RO.00.IS.36 AZT, 3TC, D4T NVP K70R K103N V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162Y, K173I, Q174K, T200A, Q207E, R211K, Y232H  
AC_Pat37 RO.00.IS.37 AZT, 3TC, D4T NVP   V35P, T39A, E40D, K49R, D123E, I135L, S162H, K173A, Q174K, P176Q, D177E, I195L, T200A, Q207T, R211K  
  RO.01.IS.37 AZT, 3TC, D4T NVP K70R Y181C, H221Y V35T, T39A, E40A, K46Q, K49R, D123E, I135L, S162H, K173A, Q174K, P176Q, D177E, I195L, T200A, Q207T, R211K  
AC_Pat39 RO.00.IS.39 AZT, 3TC EFV  K103N V35T, T39A, F87L, I135L, S162H, K173T, Q174K, D177G, I195L, T200A, Q207A, R211K  
AC_Pat3_a RO.00.IS.13 Unknown Unknown T215D K103N V35T, T39A, V60I, D123E, I135L, S162H, K173I, Q174R, I195L, T200A, Q207T, R211K  
  RO.01.IS.13 Unknown Unknown T215D K103N V35T, T39A, V60I, D123E, I135L, S162Y, K173T, Q174R, I195L, T200A, Q207T, R211K  
AC_Pat4 RO.00.IS.04 AZT, 3TC, D4T None M41L, T215C  V35I, T39A, E40D, D123E, I135L, K173T, Q174K, D177E, T200E, Q207A, R211K  
AC_Pat40 RO.00.IS.40 AZT, 3TC EFV D67N, T69D, K70R, K219Q K103N, P225H T39A, I135L, S162Y, K173T, Q174K, I195L, T200A, Q207T, R211K  
AC_Pat41 RO.00.IS.41 3TC EFV  K103N V35T, T39A, D123E, I135L, S162H, K173V, Q174K, N175Y, I195L, T200A, Q207E, R211K  
AC_Pat43 RO.00.IS.43 AZT, 3TC EFV K219Q K103N V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, I195L, T200A, Q207A, R211K  
AC_Pat44 RO.00.IS.44 AZT, 3TC, D4T NVP   V35T, T39A, E40D, D121N, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, I195L, T200A, Q207A, R211K  
AC_Pat45 RO.00.IS.45 AZT, 3TC None K70R, M184V  V35T, T39A, E40D, E53G, D123E, I135L, S162H, K166R, K173A, Q174R, I195L, T200A, Q207A, R211K  
AC_Pat46 RO.00.IS.46 AZT, 3TC, Unknown, ABC Unknown  K103N V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162H, K173L, Q174R, I195L, T200A, Q207A, R211T  
AC_Pat47 RO.00.IS.47 AZT, 3TC None K70R  V35T, T39A, K102Q, D123E, I135L, S162H, K173A, Q174R, D177N, I195L, T200A, Q207A, R211K  
AC_Pat49 RO.00.IS.49 Unknown Unknown T215Y, K219E K103N, Y181C V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162H, K166R, K173T, Q174R, I195L, T200A, Q207E, R211K  
AC_Pat4_a RO.00.IS.14 Unknown Unknown D67N, K219Q K103N V35T, T39A, E40D, K49R, V60I, D123E, I135L, S162H, K166T, K173T, Q174K, I195L, G196E, T200A, Q207A, R211K  
AC_Pat5 RO.00.IS.05 AZT, 3TC NVP D67N, T69D, K70R, T215F, K219Q K103N V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162Y, K173I, Q174K, T200E, Q207A, R211K  
AC_Pat50 RO.00.IS.50 Unknown Unknown  V106M, V179D V35T, T39A, D123E, I135L, S162Y, K173M, Q174R, T200A, Q207A, R211K  
  RO.01.IS.50 Unknown Unknown  V106M, V179D V35T, T39A, V60I, K103R, D123E, I135L, S162N, K173M, Q174R, T200A, Q207E, R211K T240V 
AC_Pat51 RO.01.IS.51 Unknown Unknown  K103N, Y181C V35T, T39A, E40D, L109M, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, T200A, Q207A, R211K  
AC_Pat52 RO.01.IS.52 Unknown Unknown M184V K103N, P225H V35T, T39A, I50V, K122E, D123E, I135L, S162C, K173A, Q174K, T200A, Q207N, R211K, L228N K82E 
AC_Pat53 RO.01.IS.53 Unknown Unknown  K103N, K238T V35M, T39E, S48T, K122E, D123G, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
AC_Pat56 RO.01.IS.56 Unknown Unknown M184V V106A, G190A, F227L V35T, T39A, E40D, V90I, D123E, I135L, S162H, K173A, Q174K, D177E, V179I, I195L, T200A, Q207T, R211K  
AC_Pat57 RO.01.IS.57 Unknown Unknown  K103N, E138G V35T, T39A, E40D, K122R, D123E, I135L, I142T, S162Y, K173A, Q174R, D177E, I178L, I195L, T200A, Q207T, R211K  
AC_Pat59 RO.01.IS.59 Unknown Unknown  V179D, P225H V35T, K49R, K103R, D123E, I135L, S162H, K166Q, K173V, Q174K, N175Y, I178M, I195L, T200A, E203D, Q207A, R211K N54H 
AC_Pat5_a RO.00.IS.15 Unknown Unknown  K103N, Y181C V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, I195L, T200A, Q207E, R211K  
AC_Pat6 RO.00.IS.06 AZT, 3TC, D4T NVP   V35T, D123E, I135L, S162Y, K166R, K173T, Q174K, I195L, T200A, Q207T, R211K  
  RO.01.IS.06 AZT, 3TC, D4T, Unknown NVP, Unknown T215C K103N V35T, D123E, I135L, S162Y, K166R, K173T, Q174R, I195L, T200A, Q207T, R211K  
AC_Pat60 RO.01.IS.60 Unknown Unknown M41L, K70R, L74V, K219N L100I, K103N, E138K V35T, T39A, V60I, K64R, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, I195L, T200A, Q207T, R211T  
AC_Pat62 RO.01.IS.62 Unknown Unknown  K103N, E138A, Y188F V35T, T39A, E40D, E53D, K102Q, D123E, I135L, S162H, K173A, Q174K, T200A, E203D, Q207A, R211K  
AC_Pat63 RO.01.IS.63 Unknown Unknown D67N, T69D, K70R, M184V, T215Y A98G, K103N, V108I V35T, T39L, V60I, I135L, S162H, K173A, Q174K, I195L, T200A, E203D, Q207E, R211T  
AC_Pat64 RO.01.IS.64 Unknown Unknown  K103N, E138G, V179E, P225H V35T, T39G, D86E, V90I, D123E, I135L, S162H, K166R, K173T, Q174A, I195L, Q197K, T200A, Q207A, R211K, D237E  
AC_Pat65 RO.01.IS.65 Unknown Unknown T215I, K219E L100I, V106I, Y188L V35T, T39L, D123E, S162Q, K173T, Q174K, P176K, I195L, T200A, Q207A, R211K  
AC_Pat69 RO.01.IS.69 Unknown Unknown  K101E, E138G, G190S V35T, E40D, K49R, V60I, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, I195L, T200A, Q207A, R211K  
AC_Pat6_a RO.00.IS.16 Unknown Unknown D67N, T69D, K70R, K219Q K103N, Y181C V35T, T39A, E40D, K43R, D123E, I135L, T139K, S162H, K173A, Q174K, D177N, T200A, Q207A, R211K, L228Q  
AC_Pat7 RO.00.IS.07 AZT, 3TC, Unknown Unknown D67N, K70R, T215I, K219Q K103N, E138Q, Y181C V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, I195L, T200A, I202V, Q207A, R211K  
  RO.01.IS.07 AZT, 3TC, Unknown Unknown K70R, T215I, K219E K103N, E138Q, Y181C V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, I142T, S162H, K173A, Q174K, I195L, T200A, I202V, Q207A, H208Y, R211K, L228H  
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AC_Pat9_a RO.00.IS.19 Unknown Unknown  K103N V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162H, K173I, Q174K, N175Y, I195L, T200A, Q207A, R211K  

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