Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Yang (2004)
Title Genetic diversity and high proportion of intersubtype recombinants among HIV type 1-infected pregnant women in Kisumu, western Kenya.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 38
NumPts 38
Subtype D, A, G, B, C

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
00KE553 00KE553 None None   K11Q, V35T, V60I, D121H, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, E248A  
00KE557 00KE557 None None   V35T, T39I, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135M, S162H, D177E, Q207A, R211K, V245Q, E248D  
00KE558 00KE558 None None   V35T, K49R, V60I, K103R, D123N, I142T, D177E, T200A, Q207E, V245K, D250E  
00KE561 00KE561 None None   K11A, V35T, K49R, V60I, D123G, I135T, K173S, D177Q, V179I, T200A, Q207S, R211S, V245Q  
96KE006 96KE006 None None   V35T, E40D, V60I, K122E, D123E, D177E, I178M, G196E, Q207E, R211K, V245K, D250E  
96KE011 96KE011 None None   K11I, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, D177E, T200I, Q207G, R211K, V245K, D250E  
96KE139 96KE139 None None   V35T, V60I, K122E, D123S, F171Y, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211K, V245T, D250E  
96KE449 96KE449 None None   E6D, V35T, T39M, V60I, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, V179I, I202V, Q207D, R211S, V245E, D250E  
97KE004 97KE004 None None   V35T, T39R, K43E, V60I, D121Y, K122E, I135T, I159V, D177E, I178M, Q207G, R211K, V245K, D250E, A272P  
97KE018 97KE018 None None   T27S, V35T, V60I, K122E, D123S, I135R, K166R, D177E, I178M, I195M, T200I, Q207G, R211K, I244V, V245K, D250E  
97KE047 97KE047 None None   V35T, V60I, D121Y, K122E, R125K, I135L, I142V, S162C, D177E, T200I, Q207E, R211K, V245M  
97KE051 97KE051 None None   V35T, T39R, K43E, N57H, V60I Q91N 
97KE099 97KE099 None None   K20R, K32I, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T  
97KE100 97KE100 None None   V35T, K49R, V60I, D121H, K122E, D123G Q151H, E169Y 
97KE104 97KE104 None None   V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, I178M, V179I, Q207A, R211S, E248D  
97KE114 97KE114 None None   E6K, V35T, T39K, K122E, D123E, D177E, I178M, G196E, Q207E, R211K, V245K  
97KE115 97KE115 None None   V35T, V60I, D121H, K122E, D123S, S162Y, F171Y, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245K, D250E  
97KE136 97KE136 None None   V35T, K43R, V60I, K122E, D123S, I135V, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207K, R211N, V245Q, D250E  
97KE140 97KE140 None None   E6D, K11H, V35M, K49R, V60I, K64R, D121Y, K122E, D177E, I178L, E194K, T200I, Q207G, R211K, T240P, P243Q, V245K, D250E  
97KE173 97KE173 None None   V35T, T39K, V60I, D121Y, K122E, D123G, I135T, K173S, Q174K, V179I, Q207A, R211S, I244V, D250E  
97KE486 97KE486 None None   I5V, K11Q, V35T, E36A, T39E, S48T, D123N, I135T, A158S, K173A, D177E, T200A, V245Q  
97KE491 97KE491 None None   V35T, T39A, E40D, K49R, V60I, K122E, D123G, A158S, D177E, I178M, V179I, Q207E, V245K  
98KE176 98KE176 None None  G190A E6D, V35T, T39S, V60I, K122E, D123G, D177E, V179I, T200I, Q207E, R211K, V245E, D250E  
98KE178 98KE178 None None   K20R, K32R, V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123S, I135T, T165I, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245Q, D250E  
98KE234 98KE234 None None   V35T, K49R, V60I, K122E, I135R  
98KE324 98KE324 None None   V35T, T39R, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K, V245K, D250E  
98KE335 98KE335 None None   V35T, K49R, V60I, K122E, D123G, I135T, D177E, T200I, Q207G, R211K, V245K, D250E  
98KE384 98KE384 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, D123S, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P  
98KE456 98KE456 None None   E6K, V35T, T39K, V60I, K122E, K173M, Q174K, D177E, I178M, T200A, I202V, Q207K, R211D, V245Q, D250E  
99KE432 99KE432 None None   K11R, V35K, V60I, D121H, K122E, I135T, K173L, Q174K, V179I, Q207A, R211S, P243S, I244V  
99KE504 99KE504 None None   P4T, V35T, E40D, K49R, V60I, K104R, K122E, D123S, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K, D250E  
99KE532 99KE532 None None   V35T, T39K, K49R, V60I, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207K, R211E, V245Q, E248D, T253N  
99KE570 99KE570 None None   I5V, V35T, T39N, K49R, V60I, K102Q, D121Y, K122E, A158S, E169G, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
99KE577 99KE577 None None   E6K, V21I, V35T, E40D, K49R, V60I, K102Q, K122E, D177E, I178L, Q207E, R211K, V245K, D250E  
99KE579 99KE579 None None   V35T, E40D, V60I, D121H, K122E, D123E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245K, D250E  
99KE588 99KE588 None None   V35T, T39A, V60I, D121Y, K122E, I142V, D177E, I178L, V179T, T200I, E204K, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
99KE591 99KE591 None None   V35T, V60I, K102R, D121H, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, D250E  
99KE593 99KE593 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123G, D177E, I178M, I195L, Q207A, R211S, V245K, D250E