Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Vaughan (2003)
Title Characterization of HIV type 1 clades in the Caribbean using pol gene sequences.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 71
NumPts 71
Subtype B, C

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
VHE_Pat1 VHE126prrt None None   D121H, K122E, I135IV, D177E, Q207E  
VHE_Pat10 VHE141prrt None None   S162A, K173EQ, Q207E, R211K  
VHE_Pat11 VHE097prrt None None   V35T, K122E, I135M, D177E, I178M, G196E, R211G  
VHE_Pat12 VHE042prrt None None   V35I, A98S, K122E, D123DN, I135V, S162C, I178IM, Q207E, R211K  
VHE_Pat13 VHE030prrt None None   V35T, K122Q, S162C, K173Q, Q174K, D177E, T200E, E204Q, Q207A, R211K  
VHE_Pat14 VHE038prrt None None   K20R, D177E, I178M, T200I, Q207D  
VHE_Pat15 VHE119prrt None None   K64R, K122Q, S162C, D177E, I178M, T200A, Q207E, Q222P  
VHE_Pat16 VHE011prrt None None   E6D, V35T, K122P, S162C, K173Q, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211RK  
VHE_Pat17 VHE021prrt None None   K20R, V35T, T39E, K122Q, I135V, S162C, K173Q, D177E, T200A, Q207A, R211G  
VHE_Pat18 VHE033prrt None None   V35I, V60I, S68G, F87L, I135V, S162C, G196E, T200A, Q207G, R211K  
VHE_Pat19 VHE013prrt None None   V35I, K64R, K122E, D123E, I135T, V179A, T200A, Q207E, R211K  
VHE_Pat2 VHE144prrt None None   S162C, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
VHE_Pat20 VHE026prrt None None   V35VI, K64R, K122E, D123E, I135T, V179A, T200A, Q207E, R211K, F214FL  
VHE_Pat21 VHE125prrt None None   E6K, V35I, K64R, K122E, S162C, T200A, Q207E  
VHE_Pat22 VHE113prrt None None   K49R, T200I, Q207D  
VHE_Pat23 VHE100prrt None None   D177E, I178V, G196E, T200I, Q207E  
VHE_Pat24 VHE143prrt None None   K32R, V35T, I142V, S162C, N175NH, I178L, V179I, Q197E, E204K, Q207E, R211K  
VHE_Pat25 VHE046prrt None None   V35T, K122P, S162C, K173Q, Q174N, D177E, T200A, Q207A  
VHE_Pat26 VHE106prrt None None   V35I, R83K, S162SC, K173KN, I178L, T200A, R211K  
VHE_Pat27 VHE140prrt None None   A158S, S162A, Q207E, R211K  
VHE_Pat28 VHE035prrt None None   V35M, R83K, K102Q, D123E, S162Y, D177E, R211K  
VHE_Pat29 VHE121prrt None None   V35I, V60I, K64R, K122E, I135R, D177E, T200A, Q207E  
VHE_Pat3 VHE041prrt None None   A98S, D123E, D177E, T200A, Q207A, R211K  
VHE_Pat30 VHE014prrt None None   R83K, I178L  
VHE_Pat31 VHE031prrt None None   V35T, T39L, K122Q, S162C, K173Q, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, F214L  
VHE_Pat32 VHE001prrt None None   V35T, A98S, D123E, I135R, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
VHE_Pat33 VHE018prrt None None   A98S, D121C, K122E, A158S, S162C, K166R, D177E, T200A, Q207A  
VHE_Pat34 VHE132prrt None None   V35I, I135T, G196E, Q207G  
VHE_Pat35 VHE136prrt None None   P4S, D123E, I135L, S162DG, Q174QR, D177E, T200A, Q207E  
VHE_Pat36 VHE004prrt None None   V35T, K122Q, D123E, S162C, K173Q, Q174R, D177E, T200AV, Q207A, R211K  
VHE_Pat37 VHE007prrt None None T215TN  K122P, D123N, I142V, D177E  
VHE_Pat38 VHE124prrt None None  V179D K20R, K122E, D123N, S162C, D177E, T200A, Q207G, R211K, F214L  
VHE_Pat39 VHE123prrt None None  V179D D121H, K122E, D177E, T200AE, Q207E  
VHE_Pat4 VHE101prrt None None   K122KE, I135T, S162C, K173E, T200R, R211K  
VHE_Pat40 VHE137prrt None None   K32R, V35T, I142V, S162C, I178L, V179I, T200A, Q207K, R211A  
VHE_Pat41 VHE111prrt None None   K49R, S162A, K173R, D177E, Q207A, R211K  
VHE_Pat42 VHE105prrt None None   V35I, R83K, A98AS, K122KE, I178L  
VHE_Pat43 VHE005prrt None None   V35I, K122E, I135V, S162C, Q174E, Q207E, P225L  
VHE_Pat44 VHE043prrt None None   A98S, K122Q, D123G, I135RT, D177E, T200E, Q207R, R211Q  
VHE_Pat45 VHE112prrt None None   K20R, V35VI, K102Q, D177E, I178V, Q207A, R211K  
VHE_Pat46 VHE117prrt None None   K64R, D123E, I135R, K166R, Q174E, D177E, V179A, T200A, Q207A, F214L  
VHE_Pat47 VHE034prrt None None   V35I, E40D, K122P, S162C, E169D, K173Q, Q174K, D177E, T200A, E204D, Q207A, R211K  
VHE_Pat48 VHE131prrt None None   D123E, S162C, V179I, T200A, K201R, I202V, E204K, Q207E  
VHE_Pat49 VHE135prrt None None   V35T, T39TA, K64R, K122E, S162C, T165I, Q174R, D177E, I178IM, G196E, T200A, Q207E, R211K  
VHE_Pat5 VHE104prrt None None  V179D K64R, K122E, D123E, I135R, D177E, I195L, T200A, Q207E  
VHE_Pat50 VHE037prrt None None   V35I, S68G, K122A, Q174QR, D177E, T200A, Q207V, R211K  
VHE_Pat51 VHE002prrt None None   A98S, D121H, K122E, D177E, G196E, T200A, Q207A, R211K  
VHE_Pat52 VHE129prrt None None   D177E, I178V, Q207A, F214L  
VHE_Pat53 VHE039prrt None None   V35T, V60I, K122P, S162C, D177E, I178M, T200E, Q207G  
VHE_Pat54 VHE027prrt None None   K122Q, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
VHE_Pat55 VHE139prrt None None   I135RT, S162C, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211Q  
VHE_Pat56 VHE032prrt None None   A98S, A158S, D177E, T200A, Q207E  
VHE_Pat57 VHE023prrt None None   V35I, S68G, K104N, D123E, I135T, S162C, T200A, Q207E, R211K, F214L  
VHE_Pat58 VHE108prrt None None   K122KE, T200A, Q207N, R211K, F214L  
VHE_Pat59 VHE109prrt None None   P4S, V35I, S48T, D123E, I135M, D177E, T200A, Q207E  
VHE_Pat6 VHE116prrt None None   V35I, E53ED, D121H, K122E, D177E, T200A, Q207E, L210S  
VHE_Pat60 VHE025prrt None None   A98S, K122V, D123E, D177E, Q197E, T200E, E204Q, Q207E  
VHE_Pat61 VHE006prrt None None   S48T, K122E, I135T, G196E, T200V, Q207E  
VHE_Pat62 VHE098prrt None None   D123E, S162Y, V179I, T200A, Q207G, F214L  
VHE_Pat63 VHE022prrt None None   A98S, K122E, D123N, A158S, D177E, G196E, T200A, Q207G  
VHE_Pat64 VHE040prrt None None  V106I K49KR, K122E, D123E, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
VHE_Pat65 VHE003prrt None None   P4S, K32R, A98S, D123E, I142T, D177E, T200A, I202V, Q207G  
VHE_Pat66 VHE133prrt None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, I135R, S162C, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K  
VHE_Pat67 VHE028prrt None None   K13R, A98S, D177E, T200E, Q207E, R211K  
VHE_Pat68 VHE045prrt None None   A98S, K102Q, I135T, S162A, D177E, T200A, Q207E  
VHE_Pat69 VHE128prrt None None   K122E, I135V, K166R, I178V, T200A, I202V, Q207E  
VHE_Pat7 VHE024prrt None None   V10A, V35T, K122P, K173Q, D177E, Q207A, R211K  
VHE_Pat70 VHE102prrt None None   V35M, R83K, K102KQ, K173KE  
VHE_Pat71 VHE017prrt None None   K49R, A98S, D121H, K122E, K166T, E169D, D177E, I178L, G196E, Q207A, R211K  
VHE_Pat8 VHE103prrt None None   D123E, D177E, Q207N, R211K  
VHE_Pat9 VHE130prrt None None   K49R, I50V, I135V, I159V, T200A, I202V, Q207E