Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Deshpande (2004)
Title Molecular characterization of HIV type 1 isolates from untreated patients of Mumbai (Bombay), India, and detection of rare resistance mutations.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 126
NumPts 126
Subtype C, A, CRF01_AE

 
  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 126 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
in10 in10 None None   K32KQ, V35K, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135M, S162Y, K166KR, K173A, Q174R, N175Y, D177E, E194D, T200V, K201R, Q207E, R211K, V245H  
in100 in100 None None   D17N, V35T, E36EA, T39D, S48T, V60I, K122E, D123DG, I135T, S162H, K173A, D177E, T200A, Q207N, V245Q, D250E E6V 
in101 in101 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173AV, D177E, T200A, Q207E, L210LS, R211RK, V245Q  
in102 in102 None None   V35IT, E36A, T39D, S48T, V60I, K101R, D121Y, K122E, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
in103 in103 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135R, S162H, K173A, D177E, I178IM, T200AV, Q207G, R211G, V245Q  
in105 in105 None None   V8I, V35T, T39D, S48ST, V60VI, K102KQ, D121HY, K122E, I135T, S162CG, S163ST, T165TI, K173AT, Q174R, D177G, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
in106 in106 None None   K30KE, V35T, E36A, T39D, E40D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, A158S, S162A, K166R, K173A, D177E, T200A, K201KR, Q207E, V245K  
in107 in107 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, K173T, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
in11 in11 None None   K30E, V35T, E36A, T39D, V60I, D121Y, K122E, S162A, K166KR, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q S48Y 
in110 in110 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121CY, K122E, K173E, Q174R, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
in111 in111 None None   V35T, E36EA, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, D177E, T200A, E203ED, Q207E, R211K, V245Q, L246V  
in112 in112 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49KR, V60I, K101R, D121Y, K122E, T165I, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
in113 in113 None None   G15E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, Q151R, S162A, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207G, R211RK, V245Q  
in116 in116 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162C, K173AT, Q174R, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
in117 in117 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, R72RK, D121H, K122E, S162D, K166R, Q174G, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q  
in12 in12 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162A, K173A, P176Q, D177E, T200A, Q207K, V245T  
in120 in120 None None   V21VI, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162A, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
in122 in122 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, I135V, S162A, K166R, K173AV, D177E, G196R, T200A, Q207E, V245Q  
in123 in123 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, I135V, S162A, K166R, K173A, D177E, G196R, T200A, Q207E  
in124 in124 None None   I31IL, V35T, E36A, I37M, C38S, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173E, D177E, I178L, E194D, G196K, T200A, I202V, E204K, Q207K, R211K, L228F, V245Q A33P, I47M 
in126 in126 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162A, K173AE, D177E, T200A, Q207A  
in127 in127 None None   E6D, V35T, E36EA, T39D, S48T, V60I, D121HY, K122E, I135T, K173A, D177E, T200A, Q207K, V245Q  
in128 in128 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162C, K166KR, K173A, Q174R, D177E, I178L, T200A, E204EK, Q207DE, R211K, V245Q  
in13 in13 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, I135IT, K166R, K173AT, D177E, T200A, Q207E, R211K  
in130 in130 None None M184V  K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60VI, K122E, D123S, I135T, K173A, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q  
in132 in132 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, T200A, Q207E, V245Q I47IM 
in133 in133 None None   V35K, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207G, R211K, V241I, V245Q  
in134 in134 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, I135R, A158S, S162A, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245H, L246V  
in135 in135 None None   G15R, K30KE, I31IT, V35Q, E36K, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162H, K173AT, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
in137 in137 None None   D17E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, S162A, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K L209LM 
in138 in138 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162A, K173T, Q174R, D177E, I178L, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245H  
in139 in139 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207EG, R211K, V245H  
in14 in14 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K101Q, D121H, K122E, D123E, I135T, S162C, K173A, D177E, I178V, T200A, Q207E, R211K, V245Q, L246V  
in141 in141 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, I135V, A158S, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245K F61FC 
in142 in142 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, K166R, K173T, D177E, T200A, I202V, Q207E, L210LS, R211RG  
in144 in144 None None   E6D, L34I, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, I135V, S162C, K166R, K173A, D177E, R211K  
in15 in15 None None   V35T, T39N, S48T, K49KR, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173T, D177E, T200A, E204ED, Q207DEG, R211RK, V245Q  
in16 in16 None None   K30E, I31IT, V35P, E36KT, T39D, V60I, E79ED, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q Q91P 
in19 in19 None None   K30KE, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162T, T165I, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
in21 in21 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, I135IT, K166R, K173AT, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
in22 in22 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, V60I, D76DN, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K V8D 
in23 in23 None None   T27S, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K173A, I178L, T200A, Q207N, R211K, V245Q  
in24 in24 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K102R, K122E, D123S, I135T, K166R, K173A, D177E, Q197H, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248T, K249R, D250N  
in27 in27 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, V245Q, W252R  
in28 in28 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
in30 in30 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
in31 in31 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135M, T139TA, K166R, K173A, Q174R, D177E, I178M, V179VI, I195IL, T200A, Q207E, L228LH  
in34 in34 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K101Q, D121Y, K122E, I135IR, A158AS, S162A, T165TI, K173A, D177E, T200A, Q207G  
in36 in36 None None   E29EG, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, K166R, K173V, D177E, T200S, Q207A, V245Q  
in37 in37 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q  
in38 in38 None None   T27S, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162A, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207EG, R211K, V245Q  
in39 in39 None None   V35M, E36A, T39D, S48T, V60I, R72K, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E, E224G, V245Q Q85QP, Q182QP 
in43 in43 None None   T27S, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162A, K166R, K173A, D177E, I178M, T200A, Q207G  
in44 in44 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207G, R211EK, V245Q  
in45 in45 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, D121HY, K122E, D123E, S162C, K173A, Q174R, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
in47 in47 None None   V21I, K30KE, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, I135T, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
in48 in48 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q S68SI 
in50 in50 None None   V35T, E36A, T39A, S48T, V60I, D121CY, K122E, I135M, T139A, S162H, K173A, D177E, T200A, Q207T, V245P  
in51 in51 None None   V35M, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207E  
in52 in52 None None   V35T, E36A, T39D, E40EG, S48T, V60I, K102E, K122E, I135R, S162A, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
in53 in53 None None   D17N, V35T, E36A, T39A, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135M, T139A, S162H, K173A, D177E, T200A, Q207T, V245Q S3G 
in54 in54 None None  V179VD V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135IV, K166R, K173A, T200A, I202IV, Q207E, R211K  
in55 in55 None None   V35T, T39K, K122E, D123T, I135IT, S162A, K173I, Q174K, D177E, I195IT, Q207D, K238R F116FI 
in56 in56 None None   V21VI, K32KT, V35K, E36A, T39D, E42EK, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162A, E169EQ, K173A, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207K, R211Q, K238R, V245Q  
in57 in57 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135K, S162N, K166R, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, V245R, K249Q  
in58 in58 None None   V35MT, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E  
in59 in59 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, I142V, S162A, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
in61 in61 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, D123N, I142V, T165I, K166R, K173A, Q174R, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
in62 in62 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122A, I135T, S162Y, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
in63 in63 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122A, I135T, S162Y, K173T, Q174K, D177EG, T200A, Q207E  
in65 in65 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K166KR, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
in67 in67 None None   T27S, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D86E, D121Y, K122E, S162A, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, P243A, V245Q  
in68 in68 None None   T27S, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D86E, D121Y, K122E, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
in69 in69 None None   V21I, V35T, T39N, S48T, V60I, D123E, S162Y, K173A, Q174R, D177E, E203EG, Q207E, R211K, V245D, K249Q  
in70 in70 None None   V21I, V35T, T39N, S48T, V60I, D123E, S162Y, K173A, Q174R, D177E, Q207E, R211K, V245E, K249Q  
in71 in71 None None   I5M, K11N, V35T, E36EA, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q Q91QR 
in73 in73 None None   T27S, V35T, E36EA, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135V, I159V, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211RK, V245H  
in74 in74 None None   P14L, V35T, T39E, S48T, V90VI, S105A, K122E, D123S, I135IV, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207A, R211RK  
in75 in75 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K104N, D121Y, K122E, I135T, S162A, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, D237N  
in76 in76 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49KR, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, T165I, K173AT, D177E, E194K, G196E, T200A, Q207E, V245Q  
in77 in77 None None   E6D, V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173AT, D177E, T200A, R211K  
in78 in78 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q  
in79 in79 None None  K103S V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K102R, K104R, D121Y, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207G, R211K  
in8 in8 None None   K30E, V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K  
in80 in80 None None   V35T, E36EA, T39E, S48T, V60I, D121DH, K122E, D123DG, I135K, K173A, D177E, T200A, Q207G, R211K  
in81 in81 None None   K11T, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173AT, D177E, T200A, Q207E, R211RK  
in82 in82 None None   P25A, V35T, E36EA, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135IV, S162A, K173A, D177E, I178IV, T200A, Q207E, V245Q  
in83 in83 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, K173T, D177E, I178L, T200A, Q207G, R211K, V245Q  
in84 in84 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
in85 in85 None None   K32E, V35K, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135K, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
in87 in87 None None T215TS  V35T, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, D123DE, I135R, K173A, D177E, T200TA, Q207K, R211K, T216TP  
in89 in89 None None   V35R, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K166R, K173T, D177G, T200A, Q207E, V245Q  
in90 in90 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121DY, K122KE, K173A, D177E, T200A, E204D, Q207A, V245Q  
in91 in91 None None   V35T, T39N, V60I, K102E, D121Y, K122E, I135R, S162H, K173E, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207G, R211K  
in93 in93 None None   T27S, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, D123G, I135R, S162A, K166R, K173A, D177E, T200A, I202IV, Q207G, R211RK, V245Q  
in94 in94 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, D177E, Q197K, T200A, Q207E, R211RK, V245Q, E248R  
in95 in95 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, I135A, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207N, V245Q  
in96 in96 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K102R, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
in98 in98 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49KR, V60I, D121Y, K122E, I135IV, I159V, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
in99 in99 None None   I5M, K20R, V35IT, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135K, P157PA, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, L246P  

Database

Resources

Team