Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Venturi (2002)
Title Divergent distribution of HIV-1 drug-resistant variants on and off antiretroviral therapy.
Citation Antivir Ther
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 66
NumPts 57
Subtype B, CRF02_AG

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
GV-1 GV-1.1 AZT, 3TC None M184V  V60I, R83K, I142V, T200A, R211K  
  GV-1.2 AZT, 3TC None M184V  V60I, R83K, T200A, R211K  
GV-10 GV-10.1 DDC, AZT None M41L, T215Y  R83K, D123E, I135T  
GV-11 GV-11.1 D4T, DDI None   V35VM, I135T, S162CY, D177E  
GV-12 GV-12.1 3TC, D4T None M41L, D67N, T69D, L210W, T215D V106I E44D, V118I, K122E, D123E, I135IT, Q207EK, H208HY, R211K  
GV-13 GV-13.1 AZT, 3TC None A62V, T69S_SS, M184V, L210W, T215Y  D123E, K166R, R211K  
GV-14 GV-14.1 AZT, 3TC None M184V  D123E, I135L, K166KR, K173KE  
GV-15 GV-15.1 AZT, 3TC None A62AV, M184V  K122P, I135T, K166KR, K173KN, Q207E, R211K  
GV-16 GV-16.1 AZT, 3TC None M184V  I5N, M16MI, A98S, K122E, D123E, I142V, R211K  
GV-17 GV-17.1 AZT, 3TC None M41ML, F77L, M184V, T215Y  E6ED, I142V, D177DE, I178IM, R211K  
GV-18 GV-18.1 AZT, 3TC None M184V  K122E, K173N, Q207E  
GV-19 GV-19.1 AZT, 3TC None M41L, M184V, T215Y E138EK K20R, V21VD, K104KR, D123E, I135T, S162C, F171FY, V179I, I202V, R211K  
GV-2 GV-2.1 AZT, 3TC None  E138A V35I, R83K, D123E, D177E, T200A, R211G  
  GV-2.2 AZT, 3TC None  E138AV V35I, R83K, D123E, D177E, T200TA, I202V, R211G  
GV-20 GV-20.1 AZT, 3TC None   D123E, G196E, R211K, F214L  
GV-21 GV-21.1 DDC, AZT None K70R  K20R, T69S, K122E, I135T, K166R, D177X, F214L  
GV-22 GV-22.1 3TC, D4T None   D86E, I142IV, T200Q, E204D  
GV-23 GV-23.1 AZT, 3TC None M184V  R83K, D123E, I142IV, K166R  
GV-24 GV-24.1 DDC, AZT None D67N, K70R, K219Q  D123E, S162C, D177E, G196E, R211G, L228R  
GV-25 GV-25.1 3TC, D4T None A62V, M184V  I31L, R83K, V118VI, K122P, I132L, I135T, I142V, D177E, T200I, F214L  
GV-26 GV-26.1 D4T, DDI None   D123E, S162X, D177E  
GV-27 GV-27.1 3TC, D4T None M184V  V35I, Q207E, R211RK  
GV-28 GV-28.1 AZT, 3TC None M41L, M184V, L210LW, T215Y  K32R, V35T, T39TA, R83K, T200A, R211K, F227FS  
GV-29 GV-29.1 AZT, 3TC None M41ML, M184V, T215FY  V35IT, S68G, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174NS, D177E, T200A, Q207E S156P 
GV-3 GV-3.1 3TC, D4T None  F227L A98AS, D123E, R211K P226F, L228W 
  GV-3.2 3TC, D4T None   A98AS, D123E, R211K  
GV-30 GV-30.1 D4T, DDI None   K20R, V60VI, V118I, K122KE, I135T, T165I, G196E, T200A, R211G, F214L  
GV-31 GV-31.1 3TC, D4T None   R83K, A98S, K102Q, T200I K103G 
GV-32 GV-32.1 3TC, D4T None M184V  R83K, D123E, I195K, T200A  
GV-33 GV-33.1 DDI None M41L, K70R  I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, G196EV, T200A, E204K  
GV-34 GV-34.1 AZT, 3TC None M184V  K49R, D123E, I135T, E169D, D177DE, I178IM, R211Q, F214L  
GV-35 GV-35.1 D4T, DDI None K70R  I135T, S162C, D177E, R211K N175NK 
GV-36 GV-36.1 3TC, D4T NVP  K103N S48E, I135T, T165I, T200A, E203EK, Q207E, R211K N136ND, P150PL 
GV-37 GV-37.1 DDC, AZT None   V8I, V35T, K43R, V60I, R83K, K122P, I135T, E203D  
GV-38 GV-38.1 AZT, 3TC None M184V  K49R, D123N, I142IT, V179I  
GV-39 GV-39.1 AZT, 3TC None M41L, M184V  V35R, I195IT, R211K  
GV-4 GV-4.1 3TC, D4T None   V35I, R83K, I135T, D177E, I178IV, T200A, Q207E, R211RK  
  GV-4.2 3TC, D4T None   V35I, R83K, I135T, D177E, T200A, Q207E, R211K  
GV-40 GV-40.1 3TC, D4T None M184V  K20KR, R83K, D123E  
GV-41 GV-41.1 3TC, D4T None M41L, T215D  V60I, D123E, I135T, Q197L, K223KT  
GV-42 GV-42.1 D4T, DDI None D67N, T215F  T39A, R83K, D123E, G196E  
GV-43 GV-43.1 AZT, DDI None D67N, K70R, T215I, K219Q  K32R, V60I, I135T, G196E, I202V, Q207H  
GV-44 GV-44.1 D4T, DDI None D67N, K70R  V35T, T39L, D86E, K166KR, R211K  
GV-45 GV-45.1 3TC, D4T None M184V, T215Y  K49R, A158T, T200A, R211K R83KN 
GV-47 GV-47.1 DDC, AZT None D67N, M184V  T39A, I50V, K64R, Q207E, R211K, F214L, K219H  
GV-48 GV-48.1 3TC, D4T NVP M41L, D67E, M184V, L210W, T215Y K103N K20KR, V35I, S68G, V118I, A158S, I178M, V189I, R211K  
GV-49 GV-49.1 AZT, 3TC None M184V  V60I, D123N, I142V, I178L, T200A T58TP 
GV-5 GV-5.1 DDC, AZT None  V108I V35M, R83K, K122P, D123E, D177E, I178L, G196E, T200I  
  GV-5.2 DDC, AZT None   R83K, D123DE, K173KQ, D177E, I178L, T200I  
GV-50 GV-50.1 AZT, DDI None   D123E, V179I, I202V G18GA 
GV-51 GV-51.1 DDC, AZT None   I135V, T200A  
GV-52 GV-52.1 D4T, DDI None   L26LF, A158T, S162C, T200I, R211K  
GV-53 GV-53.1 3TC, D4T None M184V  K20R, S48T, K122E, I135T, T200K, R211K  
GV-54 GV-54.1 AZT, 3TC None M184V  K49KR, T69N, R83K, A158S, S162C, D177E, I178M, V179I, Q207E  
GV-55 GV-55.1 3TC, D4T None M184MI  I31IL, D123E, I135T, E204EA, R211RG, F214L  
GV-56 GV-56.1 AZT, 3TC None M184V  S68G, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, I195L, G196E, Q197K, T200A, Q207E  
GV-57 GV-57.1 AZT, 3TC None M41L, K70R, M184V, T215Y  K20R, V60I, T69N, R83K, K122E, I135T  
GV-58 GV-58.1 AZT, 3TC None M184V  K122E, K166R, I202V  
GV-6 GV-6.1 AZT, 3TC None M184V  V35R, R83K, D123E, S162C  
  GV-6.2 AZT, 3TC None M184V  V35M, T39A, R83K, D123E, I135L, S162C  
GV-7 GV-7.1 AZT, 3TC None A62AV, M184V  K102Q, I135V, T139TK, I142L, Y144F, I178L, V179I, R211K  
  GV-7.2 AZT, 3TC None   E36ED, K102Q, I135V, Y144YF, S162SC, I178L, V179I, R211K Q145LV 
GV-8 GV-8.1 DDC, AZT None  E138A E6ED, K20KR, V118VI, D123E, K166R, K173KT, G196E, F214L  
  GV-8.2 DDC, AZT None  E138A E6ED, K20KR, V118VI, D123E, K166R, K173KT, G196E, F214L  
GV-9 GV-9.1 AZT, 3TC None M184V  D123E, S162C, D177E  
  GV-9.2 AZT, 3TC None   D123E, S162C, D177E  

Database

Resources

Team