Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Park (2003)
Title Genotypic resistance of antiretroviral drugs among drug-naive HIV type 1 patients with the background of long-term access-easy zidovudine therapy.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 47
NumPts 47
Subtype B, CRF01_AE, CRF02_AG

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
PSW_Pat1 98KR_RT01 None None   K122E, T200I  
PSW_Pat10 99KR_RT05 None None   D121H, K122E, Q174L, T200I, Q207E, R211K  
PSW_Pat11 99KR_RT06 None None   D177E, R211K  
PSW_Pat12 99KR_RT07 None None   K122E, T200I, Q207E I159IM 
PSW_Pat13 99KR_RT08 None None   S162A, Q207E, R211K  
PSW_Pat14 00KR_RT01 None None   K122E, I178L, I202V  
PSW_Pat15 00KR_RT02 None None K219Q V179D W88C, V118I, D121H, K122E, G196E, T200I, Q207E, F214L  
PSW_Pat16 00KR_RT03 None None   E42X, T69AP, D76X, Q91X, T107P, V111X, D113DE, R125*, N136T, Y144F, A158P, S162A, K173E, Q207E I135P, Y146F, V148A 
PSW_Pat17 00KR_RT04 None None   K102R, K173Q, R211K  
PSW_Pat18 00KR_RT05 None None   K122E, I135V, I178IM, T200I  
PSW_Pat19 00KR_RT06 None None   K43E, K122E, D123S, I135T, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211K  
PSW_Pat2 98KR_RT02 None None   K154X, I159ILV, Q161QH, S162X, E169X, R211K  
PSW_Pat20 00KR_RT07 None None   K122E, K166R, Q197H, I202V, R211K  
PSW_Pat21 00KR_RT08 None None   S105A, T200S, E204D, R211G  
PSW_Pat22 01KR_RT01 None None   K122E, D123N, G196E, T200I  
PSW_Pat23 01KR_RT02 None None   D123E, D177E, E194K, T200I  
PSW_Pat24 01KR_RT03 None None   E79D, I180V, G196E, T200I, Q207E  
PSW_Pat25 01KR_RT04 None None   V90I, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K Y56Y* 
PSW_Pat26 01KR_RT05 None None   K73X, D121H, K122X, R172X, D177X, E194K, T200I, W212WGR  
PSW_Pat27 01KR_RT06 None None   D121H, K122E, T200I L209Q 
PSW_Pat28 01KR_RT07 None None   T200I, R211K  
PSW_Pat29 01KR_RT08 None None   K122E, I135T, G196E, T200I, Q207E, F214L  
PSW_Pat3 98KR_RT03 None None D67N, K70R, T215F, K219Q  K122E, I178V, T200I, R211K  
PSW_Pat30 01KR_RT09 None None  V179D K122A, S162C, T200I, Q207E  
PSW_Pat31 02KR_RT01 None None   K102R, D121N, D123E, S162*, R172K, D177E, I178M, E194K, T200I  
PSW_Pat32 02KR_RT02 None None   I135R, T200I, E203D, Q207E, R211K, F214L Q161R 
PSW_Pat33 02KR_RT03 None None   V118I, D121H, K122E, V179I, G196E, T200I, E204K, Q207E, F214L  
PSW_Pat34 02KR_RT04 None None   K122E, D123N, T165I, T200I, R211K  
PSW_Pat35 02KR_RT05 None None   K43E, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, E194K, G196A, T200I, Q207A, R211S  
PSW_Pat36 02KR_RT06 None None F77FL  K43R, K82R, K104N, T107S, D123E, D177E, G196E, T200I K64E 
PSW_Pat37 02KR_RT07 None None   K49X, D123E, E194X, T200I, R211K  
PSW_Pat38 02KR_RT08 None None   K122E, T200I, R211K  
PSW_Pat39 02KR_RT09 None None   D121Y, K122E, I135V, S162C, T200I, R211G  
PSW_Pat4 98KR_RT04 None None   K122E, T200I  
PSW_Pat40 02KR_RT10 None None   K122Q, I178M, T200I, Q207E  
PSW_Pat41 02KR_RT11 None None   S162A, E169D, Q207N, R211K, K219KT V148E 
PSW_Pat42 02KR_RT12 None None   K122E, I135V, S162C, T165I, G196E, T200I, K201R  
PSW_Pat43 02KR_RT13 None None  V179D D121H, K122E, I135T, G196E, Q207E, F214L  
PSW_Pat44 02KR_RT14 None None   K122*, K166R, G196E, I202V, E203Q, Q207D, R211K  
PSW_Pat45 02KR_RT15 None None T215A  S68G, D121X, K122E, Q207E, R211K  
PSW_Pat46 02KR_RT16 None None   K104R, K122E, G196E, T200I  
PSW_Pat47 02KR_RT17 None None   R83K, D123E, Q207K, R211G  
PSW_Pat5 98KR_RT05 None None  V106I K122E, E169D, I202V, E204K, R211G, F214L  
PSW_Pat6 99KR_RT01 None None   S68G, K122E, Q207E, R211X  
PSW_Pat7 99KR_RT02 None None   K122E, F171Y  
PSW_Pat8 99KR_RT03 None None   T69N, K122E, I135T  
PSW_Pat9 99KR_RT04 None None   K122E, P150X, I178M, G196E, T200I, R211A I159Y 

Database

Resources

Team