Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Hanna (2003)
Title Drug-selected resistance mutations and non-B subtypes in antiretroviral-naive adults with established human immunodeficiency virus infection.
Citation J Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 88
NumPts 88
Subtype B, A, CRF02_AG, C, CRF01_AE

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
HG001 HG001 None None   R83K, K122KE, Q174R, G196E  
HG002 HG002 None None   S68G, D121H, K122E, A158AS, I178IM, R211G  
HG003 HG003 None None   K122E, K173KT, Q174QK, D177E, T200TA, V245M  
HG004 HG004 None None   D86E, K173E, T200G, I202V, R211K  
HG005 HG005 None None   D177E, T200GR, Q207E, V245L  
HG007 HG007 None None   D123E, I135V, I142IM, S162C, R211K, V245M  
HG008 HG008 None None   T39L, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, P243T, V245Q  
HG009 HG009 None None   T200G, Q207E, V245L  
HG010 HG010 None None   K64R, K122E, K173R, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211K, V241VI  
HG011 HG011 None None   V60VI, R83K, K122E, D123N  
HG012 HG012 None None M41L, L210W, T215DE V106I S105A, T200A, Q207E, R211K, V245E  
HG013 HG013 None None   S48T, K122E, T200I, V245T  
HG014 HG014 None None   V60I, D121Y, K122E, I142V, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245Q  
HG015 HG015 None None   T69N, K102KQ, I135IV, S162C, Q174H, I202V, E203Q, R211K, V245X  
HG016 HG016 None None   R83K, R211K, V245VE  
HG017 HG017 None None   T39K, K43E, A98S, K122E, E169EK, K173A, Q174QK, D177E, I178IL, T200A, Q207E, R211RK, V245Q  
HG018 HG018 None None   T69TN, K122E, I135T, I142IV, S162C, E169D, G196GE, Q197QE, T200X, Q207X, L210LF, R211K, V245M  
HG019 HG019 None None    S162AV 
HG030 HG030 None None   V60I, A98S, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
HG031 HG031 None None   A98S, V245E  
HG032 HG032 None None   D177DG, G196GE, Q207G, R211K, V245M  
HG033 HG033 None None   K104KR, K122KE, D123X, R211K, V245K  
HG034 HG034 None None  V108I, Y181C, H221HY T69N, D121H, K122E, I142V, S162C, Q174E, D177E, I178M, E204K, K238R  
HG035 HG035 None None   R83K, K122E, I135T  
HG036 HG036 None None   V179I, Q207E  
HG037 HG037 None None   E53D, K122E, I178M, G196E, Q197K, V245Q  
HG038 HG038 None None   K122P, I142V, S162A, E169D, D177E, T200EG, Q207E, R211K, I244V, V245M  
HG039 HG039 None None   A98S, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200TA, Q207E, R211K, V245Q  
HG040 HG040 None None   T39M, V60I, K122E, D123S, I135T, I142T, K173S, Q174K, T200A, Q207D, R211RK, V245E  
HG041 HG041 None None   K122KE  
HG043 HG043 None None   K122KE, N137NI, I178M, T200TA, Q207E  
HG044 HG044 None None   K122KE, T200A, R211S  
HG045 HG045 None None   S68G, K102KR, E194N, G196E, T200I, R211G, P243Q, V245K  
HG046 HG046 None None   K49KR, A98S, A158S, I159V, S162SA, E169ED, Q207E, R211K  
HG047 HG047 None None   A98S, I135V, S162C, T200I, Q207K, R211S, D237E  
HG048 HG048 None None   V60VI, T200V, R211RK, F214FL  
HG049 HG049 None None   R83RK, D123DE, I135T, E169D, T200I, R211K  
HG050 HG050 None None   S48T, K49KR, K122E, D123N, K166R, D177E, V245M  
HG051 HG051 None None   T39K, K43E, K122E, D123S, I135L, R172K, K173I, Q174K, D177E, T200TA, Q207A, R211NS, K238R, V245E  
HG052 HG052 None None Y115YF  K46X, K122E, D123N, I135V, I142IV, Q145M, Q207E, V245Q K49IR, D86DY, G112GV 
HG053 HG053 None None   R83K, V118VI, D123DE, I135T, Q174QE, R211X, F214FL, V245KM  
HG054 HG054 None None   A98AS, Q207EG, R211K, V245M  
HG055 HG055 None None   D113X, D123E, I135V, D177E, E204G, Q207QP  
HG056 HG056 None None   T200A, Q207E, V245M  
HG057 HG057 None None   K122E, Q207E, V245VM  
HG058 HG058 None None   R83K, A98S, K101R, K166R, I202IV, R211RG  
HG059 HG059 None None   I135IR, I142V, G196E, R211A  
HG060 HG060 None None  K103N V60I, K104R, K122E, D123S, G196E, R211K  
HG061 HG061 None None  K101KE R83K, K102KQ, K122E, N137NI, T165I, D177E, I178M, G196E, V245E  
HG062 HG062 None None   K103KR, K122P, D123DE, Q174DH, D177E, G196E, R211RK, F214L, I244IV, V245M  
HG063 HG063 None None   K64KR, K122E, K173KE, I178M, V245K  
HG064 HG064 None None   K122KE, D123GS, K173S, D177G, V179I, I202V, Q207A, R211S, V245Q  
HG065 HG065 None None   V60I, I135V, I178IM, T200A, R211K, V245K  
HG066 HG066 None None   D123E, I135IV, D177E, R211RK  
HG067 HG067 None None   D123DE, I135V, D177DE, I178IM, I244IV, V245E  
HG068 HG068 None None   I135T, I142T, R211K  
HG069 HG069 None None   D121H, K122E, I142V, D177DE, I178IMV, T200TI, Q207QK, R211Q  
HG070 HG070 None None   K122E, I135T, T200A, R211RK, F214L, V245M  
HG071 HG071 None None   K122Q, D177E, R211K, F214L  
HG072 HG072 None None   E40ED, K49KR, K122KE, Q174H, G196E, T200A, Q207EG, V245M  
HG073 HG073 None None   I135IV, I178M, T200A, Q207E, V245E  
HG074 HG074 None None   T69S, I142V, G196DE, I202V, V245VM  
HG075 HG075 None None   K43Q, T69A, V118I, K122P, D123E, Q174H, D177E, Q207E, R211K, F214L, V245I  
HG076 HG076 None None T215TA V106VI T69TN, R83K, K122KE, I135V, S162C, R172RK, I178L, R211K  
HG077 HG077 None None   E44D, Q174L, T200AV, F214L, V245M  
HG078 HG078 None None   R83K, K122KE, N175NH, D177DE, I178M, I195IL, G196E  
HG079 HG079 None None   K122P, A158S, K173R, V179I, R211K  
HG080 HG080 None None   K122P, V179I  
HG081 HG081 None None   K64KR, D121C, K122E, D123E, K173Q, Q207E, R211K, V245VL  
HG082 HG082 None None   K122P, D123DE, I142V, S162A, E169D, Q174K, D177E, T200EK, Q207E, R211K, I244IV, V245M  
HG083 HG083 None None  E138A S68G, R211EK  
HG084 HG084 None None   E53D, K64KR, Q174K, D177E, I178L, G196E, F214L  
HG085 HG085 None None   R83K, K122E, R211RK, V245T  
HG086 HG086 None None   R83K, D123E, K166R, Q174QH  
HG087 HG087 None None M41L, L74V, T215C Y181C K122KE, R211K  
HG088 HG088 None None   D121Y, K122E, S162C, I178L, Q207QE, R211RK  
HG090 HG090 None None   V90I, V118I, K122E, D123Q, I135T, I142M, T165I, E169D, D177E, I202V, R211K, F214L  
HG091 HG091 None None   K49R, K122E, S162A, E169D, T200A, R211K, V245M  
HG092 HG092 None None   R83K, K101Q, V106L, I135V, E169D, V245K  
HG093 HG093 None None   K122KR, D123E, I135T, I178L  
HG094 HG094 None None   R83RK, R211K P95Q 
HG095 HG095 None None   K49R, K104KQ, T200IV, R211K  
HG096 HG096 None None   K49R, I50IV, K122E, D123AT, T165TI, E169K, K173E, R211RK, V245K  
HG097 HG097 None None   K104KR, K122E, E169D, V245K  
HG099 HG099 None None   T39A, R83K, V90I, K122KE, I135IT, T139X, I142X, S162C, T200E, R211RK, V245VE  
HG100 HG100 None None   T39N, E40D, K122E, D123S, I135T, I142V, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211RS, V245Q  
HG101 HG101 None None  V179E A98S, K102KQ, D123DE, D177E, T200TA, Q207E, R211K  
HG102 HG102 None None   D123E, I135T, D177E, I178IMV, R211K, V245M