Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Lan (2003)
Title HIV type 1 isolates from 200 untreated individuals in Ho Chi Minh city(Vietnam): ANRS 1257 study. Large predominance of CRF01_AE and presence of major resistance mutations to antiretroviral drugs.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 175
NumPts 175
Subtype CRF01_AE, B, A

 

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Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 175 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
NTHvr100 NTHvr100 None None K70KT  K11T, V35T, T39E, K122E, D123G, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr102 NTHvr102 None None  V106I E6D, V35T, T39K, K49R, V60I, K122E, D123S, I135V, S162C, K173T, Q174K, D177E, E203D, Q207A, R211S, K238R, I244V, V245E  
NTHvr103 NTHvr103 None None   E6D, V35T, T39N, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E T58TA 
NTHvr106 NTHvr106 None None   E6D, K11T, V21I, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207N, R211S, K238R  
NTHvr107 NTHvr107 None None   K11R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173IT, Q174K, D177E, I180V, T200I, Q207A, R211S, K238R  
NTHvr108 NTHvr108 None None   E6D, K11T, V35T, T39KN, K43KE, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211S, K238R  
NTHvr109 NTHvr109 None None   E6D, K11T, V35T, V60VI, K122E, D123NS, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R  
NTHvr11 NTHvr11 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr110 NTHvr110 None None   I5N, K11A, V35T, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211S, V245K I244Y 
NTHvr111 NTHvr111 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, T69TN, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr112 NTHvr112 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, R211S, K238R, V245E, K249E  
NTHvr113 NTHvr113 None None  V106I K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr114 NTHvr114 None None   V35T, T39K, K102KQ, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207N, R211S, V245E  
NTHvr115 NTHvr115 None None   E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173X, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr116 NTHvr116 None None   K11R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr117 NTHvr117 None None   E6D, K11T, K30KE, V35T, T39EK, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200TA, Q207A, R211S, K238R, V245E, S251C  
NTHvr118 NTHvr118 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200TI, E203ED, Q207A, R211S, V245E  
NTHvr119 NTHvr119 None None   E6D, T7I, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179VI, I180IV, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr120 NTHvr120 None None   K11R, K30KE, V35T, T39K, K43E, K102Q, K122E, D123S, T139TA, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, V179VI, I180IL, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr121 NTHvr121 None None   K11R, V35T, T39K, K43E, V60VI, K102KQ, T107TS, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr123 NTHvr123 None None K219KQ  K11T, V35T, T39EK, K101KR, K122E, D123S, S162SC, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr124 NTHvr124 None None   E6D, K11T, V35T, T39EK, K122E, D123NS, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, P236S, V245E  
NTHvr126 NTHvr126 None None   E6D, K11T, V35T, T39EK, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr127 NTHvr127 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200X, E203ED, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr128 NTHvr128 None None   E6D, K11T, K20R, V35I, T39E, E40D, K122E, D123NS, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr129 NTHvr129 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K102R, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr13 NTHvr13 None None M41ML  I2N, E6D, T7P, K11T, V35T, T39K, K82KR, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V189VI, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr130 NTHvr130 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, S68G, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207G, K238R, V245E  
NTHvr131 NTHvr131 None None   E6D, K11T, K20R, V35I, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, L210M, R211S, F214L, K238R, V245E V111VIM 
NTHvr132 NTHvr132 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, T165I, K173IT, Q174K, D177E, T200TA, Q207A, R211N, K238R, V245K  
NTHvr133 NTHvr133 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, D123S, S162C, K173IT, Q174K, D177E, I178M, V179I, I180V, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr134 NTHvr134 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K102KQ, K122E, D123S, S162SC, E169ED, K173IR, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr135 NTHvr135 None None   E6D, K11T, V35T, T39EK, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr136 NTHvr136 None None   E6D, K20KR, V21VI, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162SC, K173IT, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr137 NTHvr137 None None   V35T, T39K, K43E, K102Q, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr138 NTHvr138 None None   V35T, T39K, K43E, K102Q, K122E, D123S, S162C, K173IR, Q174K, D177E, I178M, T200TI, Q207AD, R211S, K238R, V245E, S251R  
NTHvr139 NTHvr139 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K102Q, K104R, K122E, D123S, S162SC, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200TI, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr14 NTHvr14 None None   E6D, K11T, V35MT, T39K, K43E, K122E, D123S, I142IV, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr140 NTHvr140 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K64KR, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211NS, K238R, V245E  
NTHvr142 NTHvr142 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr143 NTHvr143 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr145 NTHvr145 None None   V35T, T39K, K43E, K102Q, K122E, D123S, S162C, E169ED, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr146 NTHvr146 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr147 NTHvr147 None None   E6D, V21I, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123N, S162A, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E  
NTHvr148 NTHvr148 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E  
NTHvr149 NTHvr149 None None   E6D, K11T, V35T, K102E, K122E, D123NS, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr15 NTHvr15 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, V245E  
NTHvr150 NTHvr150 None None   K11T, V35T, T39K, K43E, T69I, K122E, D123K, I135M, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R  
NTHvr151 NTHvr151 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43R, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr152 NTHvr152 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr153 NTHvr153 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K102M, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr154 NTHvr154 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207N, R211S, K238R, V245E  
NTHvr156 NTHvr156 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr157 NTHvr157 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E D123R 
NTHvr158 NTHvr158 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr159 NTHvr159 None None   E6D, K11T, L12F, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207N, R211S, K238R, V245E  
NTHvr16 NTHvr16 None None   E6D, K11R, V35T, K102R, K122E, D123S, T165I, K173A, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
NTHvr160 NTHvr160 None None   V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, K238R, V245E K102KT 
NTHvr161 NTHvr161 None None  V106VI E6D, K11T, V35T, T39EK, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr162 NTHvr162 None None   E6D, V8VI, K11A, V35T, T39E, K122E, D123S, I135T, S162SC, K173I, Q174K, D177E, I178IM, T200TI, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr163 NTHvr163 None None   K11T, V35T, T39IK, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E  
NTHvr164 NTHvr164 None None   E6D, V8G, K11T, K30KE, V35T, T39K, K122E, D123S, I135V, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr165 NTHvr165 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207DN, R211S, K238R, V245E  
NTHvr166 NTHvr166 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K104KN, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr167 NTHvr167 None None   E6D, K11KT, V35T, T39N, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr168 NTHvr168 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123NS, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr169 NTHvr169 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39G, F116FS, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr17 NTHvr17 None None   V35T, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr170 NTHvr170 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr171 NTHvr171 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, T107TS, K122KE, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178IM, V179VI, Q207A, R211S, K238R, V245E V111IM 
NTHvr172 NTHvr172 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135M, S162C, K173M, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E  
NTHvr173 NTHvr173 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K102KQ, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200TA, Q207GS, R211S, K238R, V245E  
NTHvr174 NTHvr174 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200TI, Q207AD, R211S, K238R, V245E  
NTHvr175 NTHvr175 None None   E6D, K20R, V35IT, T39E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr176 NTHvr176 None None   E6D, K11T, V35T, T39EK, K122KE, D123S, K173T, Q174K, D177E, I178IM, T200I, Q207A, R211NS, K238R, V245K  
NTHvr177 NTHvr177 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174R, D177E, I178M, Q207D, R211S, K238R, V245E  
NTHvr178 NTHvr178 None None   K11T, V35T, T39N, D121H, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, L210LF, R211S, K238R, V245E  
NTHvr179 NTHvr179 None None   E6D, T7P, K11T, V35T, T39N, D121H, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr18 NTHvr18 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179VI, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr180 NTHvr180 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, K238R, V245E  
NTHvr181 NTHvr181 None None   V35T, T39K, E44K, S68G, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, E204K, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr183 NTHvr183 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200TI, I202IV, Q207DV, R211S, K238R, V245E  
NTHvr184 NTHvr184 None None K219KN  E6D, K11T, K20R, V35T, T39E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200TI, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr185 NTHvr185 None None   E6D, K11T, K30KE, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I202V, Q207V, R211S, K238R, V245E Q222QL 
NTHvr186 NTHvr186 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr187 NTHvr187 None None K219KN  E6D, K11T, V35T, T39EK, K122KE, D123S, S162C, K173IRT, Q174K, D177E, I178IM, V179I, I180IV, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
NTHvr188 NTHvr188 None None  M230I T7P, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, W229*, K238R, V245E  
NTHvr189 NTHvr189 None None M184MI M230I E6D, K11T, V35T, T39N, G45GR, G51R, R72RK, K122E, D123S, G141R, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E  
NTHvr19 NTHvr19 None None   E6D, K11T, V35T, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177A, I178M, T200A, Q207A, R211S, V245E  
NTHvr190 NTHvr190 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, R211NS, K238R, V245E K11C 
NTHvr191 NTHvr191 None None M184I E138K, M230I E6D, K11T, G15E, M16I, V35T, E36K, T39K, E40K, M41I, K43E, E53K, R72K, R83K, D86N, W88*, D123S, G141E, R172K, K173T, Q174K, D177E, G190R, D192N, G196R, I202V, E204K, R211S, W212*, E233K, K238R, V245E G18R, C38Y, G45K, G51K, G93K, G99S, G112K, G152R, G155K, Q207I, G213R, G231R 
NTHvr195 NTHvr195 None None   E6D, V35T, T39K, K102M, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, K238R, V245E  
NTHvr197 NTHvr197 None None M184I M230I K11T, G15E, M16I, E29K, V35T, T39K, E40K, M41I, E44K, G45R, E53K, D76N, R83K, G93R, G99R, K122E, D123S, R125K, G155R, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, G190R, G196R, Q207A, R211S, E224K, E233K, K238R, V245E G18R, G51K, G213K 
NTHvr198 NTHvr198 None None   E6N, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E  
NTHvr199 NTHvr199 None None  V179D V35I, S68G, K101KR, I135T, K166R, G196E, Q207H, R211IK, V245M N137NY 
NTHvr20 NTHvr20 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, I180V, T200TI, Q207A, R211S, K238R F116FV, Q222QL 
NTHvr200 NTHvr200 None None   V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, F171FY, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E, L246M M164MV 
NTHvr21 NTHvr21 None None   E6D, K11S, V35T, T39K, K43E, E89EK, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NTHvr22 NTHvr22 None None K219KQ  K30KE, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, M164MI, K166KR, K173I, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, R211S, K238R V118VF 
NTHvr23 NTHvr23 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200X, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E