Positions with mixtures: Not Excluded Numbers represent: Absolute numbers Single occurences: Included Total number of isolates shown beneath consensus Legend:    Red >=5%    Blue 1-4.5%    Grey <1%

10

20

P 712

Q 712

I 712

T 712

L 713

W 713

Q 713

R 714

P 714

L 714

V 714

T 714

I 714

K 714

I 715

G 715

G 715

Q 715

L 715

K 715

S2

V29 T1

P2 S1 A1

F1

R2

H2 R2

I81 V66 F52 Y13 M5 R2 W1 Q1

I10 F1 L1

S224 P25 A18 N5 E3 V1 I1 Q1 M1

V249 A5 M2

R121 I2 Q2 E1 S1

V376 L1

E87 A22 R1

E11 D9 N1 S1

H8 E7 L2

I240 T64 V28 Q6 P5 E4 M4 W2 K1

R189 T38 M14 I13 V5

30

40

E 715

A 715

L 715

L 715

D 715

T 715

G 715

A 715

D 715

D 715

T 715

V 715

L 715

E 715

E 715

M 715

N 715

L 715

P 715

G 715

D2 Q1

V7

I30 V2

I16

N1

N3

A1 P1

I23 C2

F45 I28 V11

Q10 K4 A3 D2 R2 N2 G1

D324 N8 G8 K2

I520 L30 V14 A3 T2

D102 S60 E22 T15 K7 A3 C2 Q2 I2 P2

M2 W2

S15 Q5 T1

50

60

R 715

W 715

K 715

P 715

K 715

M 715

I 715

G 715

G 715

I 715

G 715

G 715

F 715

I 715

K 715

V 715

R 715

Q 715

Y 715

D 715

K516 N12 I1 P1 V1

T29 R13 I3 E1

R74 I4 N3 V3 Q2 A1

I106 L16

A12 V10

V2 A2 E1

L29 V10

A1

L19 I4 Y1

V92 L16 M5 A3

R29 N3 H2 E1

K173 G1

E40

F2

E132 N3 A1

70

80

Q 715

I 715

L 715

I 715

E 715

I 715

C 715

G 715

H 715

K 715

A 715

I 715

G 715

T 715

V 715

L 715

V 715

G 715

P 715

T 715

E59 H17 D15 N12

V126

P307 T63 A34 S29 Q26 V20 H19 C5 N3 R3 E3 I2 D1 K1

V92 L23 M10

D30

F5 V3 L2 M1

Y11 S5 F3 W2 E2 A1 G1 D1

E4

K487 Q27 Y10 R7 T1 N1

R53 T8 I2 E1 Q1

V70 T44 I17 L3

V66 T29 M17 L2 R1 E1 K1

S26 T4 D3 C2

S48 A20 P12

I9

V26 A1

I93 L2 M1

S7 D2 A2 H1

90

P 715

V 715

N 715

I 715

I 715

G 715

R 715

N 715

L 715

L 715

T 715

Q 715

I 715

G 715

C 715

T 715

L 715

N 715

F 715

L1

A85 I58 F10 T6 L6 M6 C3 S3

D7 S4

V40

V32

E1

K1

S13 D5

M315 T45 I34 V11 F1

M34

S13 A4 V3

K7 R1

L374 M1

S1

F3

S1 A1

I1

L1