Positions with mixtures: Not Excluded
Numbers represent: Absolute numbers
Single occurences: Included
Total number of isolates shown beneath consensus
Legend:    Red >=5%    Blue 1-4.5%    Grey <1%

         10         20
P
391		 Q
391		 I
391		 T
392		 L
395		 W
395		 Q
396		 R
399		 P
400		 L
414		 V
420		 T
446		 I
462		 K
479		 I
484		 G
487		 G
492		 Q
493		 L
497		 K
502


 E2

 L1







 H1
R1
E1



 S1
L1

 I50
V16
T2
F1
H1
M1

 I5

 S45
P16
A12
N3
I3
R2
Q1
M1

 V91
L1

 R50
M2
E2
T1

 V85
L3
K1

 E30
A2
D1

 E2

 H5
L5
E4
I1

 I37
V17
Q11
T10
M2

 R17
I6
V2
M1

         30         40
E
502		 A
506		 L
510		 L
511		 D
515		 T
515		 G
516		 A
517		 D
517		 D
517		 T
518		 V
518		 L
518		 E
518		 E
518		 M
518		 N
518		 L
518		 P
518		 G
519




 I2



 V1

 Q1













 V12
I5
F2



 D166
N6
K1

 I101
L7
V3
T2

 S78
D64
E19
T9
Y8
H6
C6
A1
R1



 S19
T7
Q4



         50         60
R
519		 W
519		 K
521		 P
521		 K
521		 M
522		 I
522		 G
522		 G
522		 I
522		 G
522		 G
522		 F
522		 I
522		 K
522		 V
522		 R
522		 Q
522		 Y
522		 D
522
K151



 R15
T2



 R18

 I4
L2

 V2













 V2

 R3



 K113

 E8

 F1

 E39

         70         80
Q
522		 I
522		 L
522		 I
522		 E
522		 I
522		 C
522		 G
522		 H
522		 K
522		 A
522		 I
522		 G
522		 T
522		 V
522		 L
522		 V
522		 G
522		 P
522		 T
522
E27

 V128
M2

 P262
S50
A47
T30
Q17
H15
C6
N2
D2
R2
G2

 V89
L27
M9

 D34
K2



 S12
E6
Y4
W1



 Q32
Y24
K18
C6
R4

 R34
T2

 T49
V39

 V55
T32
E11
M6
L4
K2

 A1
T1

 A2

 I3

 V2

 I194
L2

 R1

 Q2
D2



         90          
P
522		 V
522		 N
522		 I
522		 I
522		 G
522		 R
522		 N
522		 L
522		 L
522		 T
522		 Q
522		 I
522		 G
522		 C
522		 T
522		 L
522		 N
522		 F
522		  
 


 I11
A2







 E1

 K1

 S1

 M24

 M6

 N1

 K11
H2

 L181







 S1



 L1