Positions with mixtures: Not Excluded
Numbers represent: Absolute numbers
Single occurences: Included
Total number of isolates shown beneath consensus
Legend:    Red >=5%    Blue 1-4.5%    Grey <1%

         10         20
P
1625		 Q
1631		 I
1631		 T
1631		 L
1631		 W
1631		 Q
1631		 R
1631		 P
1631		 L
1631		 V
1631		 T
1631		 I
1631		 K
1631		 I
1631		 G
1631		 G
1631		 Q
1631		 L
1631		 K
1631


 R3
H1

 V5
T4

 S17
A2

 P6
F1
H1

 R7
C1

 R3
E2
K1
*1





 I596
V51
F4
T3
R2
P1

 A5
I2
G2

 P47
Q27
S22
A20
I2

 V208
M5
T3

 R176
*2
T1
E1
V1

 V383
T3
M2
A1
L1

 E67
Q11
A4

 R1

 R11
P1
*1

 I146
E29
P6
V1

 M112
R90
I88
L6
E3
T1
*1
G1

         30         40
E
1631		 A
1631		 L
1631		 L
1631		 D
1631		 T
1631		 G
1631		 A
1631		 D
1631		 D
1631		 T
1631		 V
1631		 L
1631		 E
1631		 E
1631		 M
1631		 N
1631		 L
1631		 P
1631		 G
1631
G4
D1
K1



 P4

 S2
F1
*1

 G10
N2
A1

 I3
A1
K1

 R3
E1

 S1
T1
V1

 G4
E1
V1

 G9
N4
A1
V1

 A2
I1
P1

 A3

 F23
I1

 G7
K2

 D338
G8
V1

 I425
T6
V5
L1

 D225
S153
Q46
E35
C32
A24
T15
I1

 S5
M1

 S23
T10
A2
Q1

 E3
R1

         50         60
R
1631		 W
1631		 K
1631		 P
1631		 K
1631		 M
1631		 I
1631		 G
1631		 G
1631		 I
1631		 G
1631		 G
1631		 F
1631		 I
1631		 K
1631		 V
1631		 R
1631		 Q
1631		 Y
1631		 D
1631
K238
G5
I1

 R3
*2

 R80
E7
N2

 L4
S1

 R29
Q1
N1
*1

 L39
I35
V4
T2

 V6
T2
M2
K1

 V203
M1
R1

 E2
R1

 V10
T1

 R1
E1

 D2
S1
C1
V1

 L34
S4

 V52
L19
T16
A15

 E4
R3
I1

 A2
I1

 K67
G5

 E103
R2
K1
P1
L1

 C6
F4
S1
H1
N1
D1
*1

 E166
G4
N3
H1

         70         80
Q
1631		 I
1631		 L
1631		 I
1631		 E
1631		 I
1631		 C
1631		 G
1631		 H
1631		 K
1631		 A
1631		 I
1631		 G
1631		 T
1631		 V
1631		 L
1631		 V
1631		 G
1631		 P
1631		 T
1631
E58
D6
R3
*2
H1
P1

 V450
T5
M3

 P1077
S101
T72
A71
H35
C29
E20
R20
V13
Q13
N2
D1
I1

 V352
L25
M19
T5
A1

 D5
G2
K1

 V8
T1

 W7
R3

 R1
E1

 Q65
Y17
K5
R5

 R42
V12
I10
E3
M2
T1
N1

 V439
T292
I21

 T112
V76
M20
K17
E13
L3
R1

 S213
C40
T24
A1
N1

 S121
A101
P39
I2

 I5
A2

 S3

 I414
A2
M1
T1

 R1
E1
V1

 D14
N12
S2
H1

 A7
P1
R1
I1

         90          
P
1631		 V
1631		 N
1631		 I
1631		 I
1631		 G
1631		 R
1631		 N
1631		 L
1631		 L
1631		 T
1631		 Q
1631		 I
1631		 G
1631		 C
1631		 T
1631		 L
1631		 N
1631		 F
1625		  
 
L2

 A124
I56
C24
T1
G1

 S2
D2
T1

 V121
M2
T1

 V27
T4

 E1

 G9
K6
I1

 D20
S4

 P6
M5
Q1

 M935
I3
R2
S1
*1
V1

 A20

 R40
K1
*1

 L600
M24
V4
T3
P3

 S1

 R6
Y2

 A2
I1

 S3

 D3
S1