Positions with mixtures: Not Excluded
Numbers represent: Absolute numbers
Single occurences: Included
Total number of isolates shown beneath consensus
Legend:    Red >=5%    Blue 1-4.5%    Grey <1%

         10         20
P
261		 Q
261		 I
262		 T
267		 L
278		 W
291		 Q
309		 R
318		 P
324		 L
333		 V
340		 T
344		 I
349		 K
351		 I
352		 G
352		 G
353		 Q
353		 L
353		 K
354






 P1



 G1

 D1





 I31
V14



 S17
A11
I6
N4
E3
R1
D1
P1
V1
Q1
K1

 V42

 R33
E1

 V59
M1

 E7
A1

 E2

 L5
H1
K1
M1

 I24
Q6
V4
T4
M2
S1

 R12

         30         40
E
354		 A
356		 L
356		 L
356		 D
356		 T
356		 G
356		 A
356		 D
356		 D
356		 T
356		 V
356		 L
356		 E
356		 E
356		 M
356		 N
356		 L
356		 P
356		 G
356


 T2







 I1













 V14
I8
F2



 D83

 I44
V1
R1
L1

 S58
D30
T17
E8
H5
A3
P2
Q2
C2
Y2
I2
R1
K1



 S7
Q3
T2
A1



         50         60
R
356		 W
356		 K
356		 P
356		 K
356		 M
356		 I
356		 G
356		 G
356		 I
356		 G
356		 G
356		 F
356		 I
356		 K
356		 V
356		 R
356		 Q
356		 Y
356		 D
356
K102



 R11
N1



 R3















 L1



 R1



 K24
S1

 E1



 E11

         70         80
Q
356		 I
356		 L
356		 I
356		 E
356		 I
356		 C
356		 G
356		 H
356		 K
356		 A
356		 I
356		 G
356		 T
356		 V
356		 L
356		 V
356		 G
356		 P
356		 T
356
E7
H2
N1
D1

 V76

 P217
S22
A10
T9
Q7
C6
V3
H3
N1
I1

 V72
M9
L8

 D10
K1



 S2
E1

 E1

 Q7
K4
Y2
R1

 R7
E3

 T16
V12

 V28
T15
E2
M1



 A1





 I118



 S1



         90          
P
356		 V
356		 N
356		 I
356		 I
356		 G
356		 R
356		 N
356		 L
356		 L
356		 T
356		 Q
356		 I
356		 G
356		 C
356		 T
356		 L
356		 N
356		 F
356		  
 


 I6













 M6



 V1

 R1
K1
E1

 L88
M1