Positions with mixtures: Not Excluded Numbers represent: Absolute numbers Single occurences: Included Total number of isolates shown beneath consensus Legend:    Red >=5%    Blue 1-4.5%    Grey <1%

10

20

P

I

S

P 3

I 3

E 3

T 3

V 3

P 3

V 3

K 3

L 3

K 3

P 3

G 3

M 3

D 3

G 3

P 3

K 3

N1

D3

I3

E1

30

40

V 3

K 3

Q 3

W 3

P 3

L 3

T 3

E 3

E 3

K 3

I 3

K 3

A 3

L 3

V 3

E 3

I 399

C 403

T 407

E 407

V399

A15 S3 K3

V1

50

60

M 407

E 407

K 407

E 407

G 407

K 407

I 407

S 407

K 407

I 407

G 407

P 407

E 407

N 407

P 407

Y 407

N 407

T 407

P 407

V 407

L37 I2 R1

D1 G1

N1

G1

T1 N1

N1

T9 G1 L1 E1

R14

V8

Q1

I50

70

80

F 407

A 407

I 407

K 407

K 407

K 407

D 407

S 407

T 407

K 407

W 407

R 407

K 407

L 407

V 407

D 407

F 407

R 407

E 407

L 407

V7

R3

Q1

N12 G1 Y1

G21 N4

N3 P1

R52

I1

L2

F1

90

100

N 407

K 407

R 407

T 407

Q 407

D 407

F 407

W 407

E 407

V 407

Q 407

L 407

G 407

I 407

P 407

H 407

P 407

A 407

G 407

L 407

R2 *1

K119

Y1

I18

F1

S14 V1

110

120

K 407

K 407

K 407

K 407

S 407

V 407

T 407

V 407

L 407

D 407

V 407

G 407

D 407

A 407

Y 407

F 407

S 407

V 407

P 407

L 407

Q5 R4 E3 T1

Q13 R11 E1

R11

R10

I4

I1

Y2 N1

Y2 V1

L2

I5

130

140

D 407

K 407

D 407

F 407

R 407

K 407

Y 407

T 407

A 407

F 407

T 407

I 407

P 407

S 407

I 407

N 407

N 407

E 407

T 407

P 407

H18 Y6

E60 Q6 R5 V5 P4 A1

E114 N13

L1

C1

S1

V1

G1

T99 V54 L12 M8 R8

I2 K1

A8 K3

M4 R3 I2 A1 K1

150

160

G 407

I 407

R 407

Y 407

Q 407

Y 407

N 407

V 407

L 407

P 407

Q 407

G 407

W 407

K 407

G 407

S 407

P 406

A 406

I 406

F 406

V36 T9 S5 F1 M1

L1

A1 G1

M3

E2 D1

R1

S14

V2

170

180

Q 406

S 406

S 406

M 406

T 406

K 406

I 406

L 406

E 406

P 406

F 406

R 406

K 406

Q 406

N 406

P 406

D 406

I 406

V 406

I 406

C67 Y14 A9 N4 H2 D2 T1 G1

I1

I5 L3

R45 T4 N2

D28

L2 Y1

K1

R5 E3

H8 K7 L4 E3

H1

S5

E55 N2

M35 L24

I12 T2 E2 D1

V2

190

200

Y 406

Q 406

Y 406

M 406

D 406

D 406

L 406

Y 406

V 406

G 406

S 406

D 406

L 406

E 406

I 406

G 406

Q 406

H 406

R 406

T 406

V246

N1 Y1

I8

H1 N1

M2

G1

L3

E56

E5 P2

A72 I21 K5 E5 V4 R3

210

220

K 406

I 406

E 406

E 406

L 406

R 406

Q 406

H 406

L 406

L 406

R 406

W 406

G 406

F 406

T 406

T 406

P 406

D 406

K 406

K 406

R2

V33

K3 D1

D2 K2 G2 R1

E46 K14 H6 A5 G4 R2 D1

F8 W6

K198 G15 Q8 A7 T6 E6 S3 N1

L51

Y28 C7 F3 S3 D3 L1

E1

Q7

230

240

H 406

Q 406

K 406

E 406

P 406

P 406

F 406

L 406

W 406

M 406

G 406

Y 406

E 406

L 406

H 406

P 406

D 406

K 406

W 406

T 406

I11 T1 R1

*1

V 406

Q 406

P 406

I 406

V 2

L 2

P 2

L5

K1

T8 S2

V1