Positions with mixtures: Not Excluded
Numbers represent: Absolute numbers
Single occurences: Included
Total number of isolates shown beneath consensus
Legend:    Red >=5%    Blue 1-4.5%    Grey <1%

         10         20
P
 		 Q
 		 I
 		 T
392		 L
395		 W
397		 Q
401		 R
401		 P
401		 L
401		 V
402		 T
402		 I
402		 K
404		 I
404		 G
404		 G
404		 Q
404		 L
404		 K
404






 A1
S1

 F3
V2
P1
I1

 S6
R5
L4
*3
C1

 E6
H1
K1
*1

 A1
*1

 T2

 I22
V9
H1
F1
P1

 C1
L1

 S23
P19
A15
N5
I2
E2

 V82
T1
L1

 R50
N2
Q1
*1
E1

 V41
L2

 E12

 E6
V4
A1

 L8
I6

 I21
T5
Q4
V2

 R16
M4

         30         40
E
404		 A
404		 L
404		 L
404		 D
404		 T
404		 G
404		 A
404		 D
404		 D
404		 T
404		 V
404		 L
404		 E
405		 E
405		 M
405		 N
405		 L
405		 P
405		 G
405
G2
D1
K1



 F1

 V1

 N3









 N1





 V22
I7



 D118

 I67
L8

 S79
D33
T22
C10
E9
I1
G1

 M1
I1

 S6
Q5



         50         60
R
405		 W
405		 K
405		 P
405		 K
405		 M
405		 I
405		 G
405		 G
405		 I
405		 G
405		 G
405		 F
405		 I
405		 K
405		 V
405		 R
405		 Q
405		 Y
405		 D
405
K91



 R4

 L1

 R5

 I5
L3





 E1











 R6



 K45
G1



 F1
*1

 E25

         70         80
Q
405		 I
405		 L
405		 I
405		 E
405		 I
405		 C
405		 G
405		 H
405		 K
405		 A
405		 I
405		 G
405		 T
405		 V
405		 L
405		 V
405		 G
405		 P
405		 T
405
E18
H1
R1
*1

 V109

 P239
S19
T18
A12
H8
V7
C5
Q4
F1

 V76
L27
M3

 D11
K1

 N1

 Y4
D2

 R1

 Y16
Q9

 R13

 T21
V5
P1

 V26
T9
L5
M3
K3

 S1
V1







 I108



 A2
D1



         90          
P
405		 V
405		 N
405		 I
405		 I
405		 G
405		 R
405		 N
405		 L
405		 L
405		 T
405		 Q
405		 I
405		 G
405		 C
405		 T
405		 L
405		 N
405		 F
405		  
 


 I8





 N1



 I1

 D2

 M11
I2

 M2



 K2
H1
*1

 L119
M1









 I2

 L1